单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8261 - 8280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8261 | 2025-05-11 |
Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in EBV positive diffuse large B cell lymphoma
2025-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00410-x
PMID:40335578
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，研究EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境异质性及其与预后的关系 | 首次整合10X Visium空间转录组学和scRNA-seq技术，揭示EBV+DLBCL中PD-1/PD-L1信号通路的免疫抑制特性，并验证PD-1/PD-L1抑制剂BMS202的治疗潜力 | 研究样本量未明确说明，且功能验证仅限于EBV+Farage细胞系 | 探究EBV+DLBCL肿瘤微环境异质性及其对患者生存的影响 | EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤（EBV+DLBCL） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 10X Visium空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8262 | 2025-05-11 |
Immunodynamic axis of fibroblast-driven neutrophil infiltration in acute pancreatitis: NF-κB-HIF-1α-CXCL1
2025-May-07, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00734-6
PMID:40335899
|
研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞通过NF-κB-HIF-1α-CXCL1信号轴驱动中性粒细胞浸润在急性胰腺炎中的免疫动力学机制 | 首次证明成纤维细胞激活是中性粒细胞浸润的免疫驱动因素之一，并阐明NF-κB-HIF-1α通路驱动的糖酵解是成纤维细胞分泌CXCL1趋化中性粒细胞的内在分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证不足 | 阐明急性胰腺炎中成纤维细胞驱动中性粒细胞过度浸润的分子机制 | C57BL/6J小鼠模型和人类胰腺星状细胞 | 免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞迁移实验、细胞转染、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、共免疫沉淀(co-IP) | 小鼠急性胰腺炎模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用C57BL/6J小鼠和人类胰腺星状细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8263 | 2025-05-11 |
Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development
2025-May-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01213-6
PMID:40335909
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术探讨了手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响 | 首次在围手术期使用单细胞测序技术深入分析手术/麻醉对免疫细胞的影响，特别是发现单核细胞可能促进肿瘤发展 | 样本量较小（仅4名患者），观察时间较短（仅48小时） | 研究手术/麻醉对围手术期患者免疫系统的影响 | 接受大手术患者的围手术期外周血单个核细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序, RT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名手术患者 | NA | NA | NA | NA |
| 8264 | 2025-05-11 |
PAQR5 drives the malignant progression and shapes the immunosuppressive microenvironment of hepatocellular carcinoma by activating the NF-κB signaling
2025-May-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00785-z
PMID:40336138
|
研究论文 | 本研究揭示了PAQR5通过激活NF-κB信号通路促进肝细胞癌（HCC）恶性进展和免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次系统阐明了PAQR5在HCC中的致癌作用机制，并通过多组学分析和实验验证揭示了其通过ERK/NF-κB信号轴驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 阐明PAQR5在肝细胞癌进展中的作用机制及其对肿瘤免疫微环境的调控 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析（包括bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组）、体外实验和体内实验 | NA | 转录组数据、实验数据 | 未明确说明具体样本量，但涉及多个转录组队列和实验模型 | NA | NA | NA | NA |
| 8265 | 2025-05-11 |
Positive Prognostic Overall Survival Impacts of Methylated TGFB2 and MGMT in Adult Glioblastoma Patients
2025-Mar-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17071122
PMID:40338274
|
research paper | 探讨了TGFB2和MGMT基因甲基化对成人胶质母细胞瘤患者总体生存期的积极影响 | 首次发现TGFB2和MGMT基因甲基化水平升高可预测胶质母细胞瘤患者总体生存期改善，尤其在年轻成年男性患者中效果显著 | 研究基于TCGA数据集，可能需要更多独立数据集验证 | 评估TGFB2和MGMT基因甲基化对胶质母细胞瘤患者预后的影响 | 成人胶质母细胞瘤患者 | digital pathology | glioblastoma | 甲基化分析，单细胞RNA-seq | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8266 | 2025-05-11 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
|
review | 本文讨论了消除HIV持久性储存库的挑战，以及基于生物标志物表达的策略 | 探讨了识别定义所有HIV储存库细胞亚群的最小细胞表面蛋白集的需求，并提出了未来研究方向 | 目前缺乏定义HIV潜伏感染细胞的特定分子标志物或生物标志物，且生物标志物存在异质性 | 研究如何通过生物标志物表达来消除HIV持久性储存库，实现HIV治愈 | HIV持久性储存库及其生物标志物 | 传染病学 | HIV/AIDS | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8267 | 2025-10-06 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.19.563173
PMID:37905060
|
研究论文 | 开发了用于跨物种单细胞转录组数据插补和比较的神经网络框架Icebear | 首次实现了跨物种单细胞基因表达谱的准确预测，并揭示了哺乳动物X染色体上调的进化适应性 | 未明确说明样本规模和具体数据集限制 | 开发跨物种单细胞转录组比较和预测方法 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8268 | 2025-10-06 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (Class, Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.29.596006
PMID:38854132
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组测序技术，通过265个蛋白质编码基因进行系统基因组分析，揭示了该属中至少存在9个隐存种 | 样本仅来自韩国和美国地区，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫的25个物种群体（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 多物种溯祖模型 | 转录组数据 | 25个物种群体，37个种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8269 | 2025-10-06 |
Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
2024-May-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.029
PMID:38653236
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、空间蛋白质组学和计算方法，揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构 | 首次结合多种空间组学技术系统揭示胶质瘤细胞状态的三类组织模式，发现缺氧作为长程组织者的新功能 | 未明确说明样本规模和技术平台的详细参数 | 解析胶质瘤细胞状态的组织结构和空间分布规律 | 胶质瘤组织样本，包括高级别和低级别IDH突变胶质瘤 | 空间生物学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 计算分析 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 8270 | 2025-10-06 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
|
综述 | 探讨细胞类型进化研究的新机遇与方法学挑战 | 强调结合基因编辑工具和单细胞基因组学技术研究细胞类型进化，提出通过发育本体论准确识别同源细胞的新视角 | 未涉及具体实验验证，主要提出理论框架和研究方向 | 解析细胞类型进化机制及其在动物演化中的作用 | 多种研究生物体的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学，基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8271 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌肿瘤内异质性并建立预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌肿瘤内异质性，发现B细胞显著招募现象，建立跨队列验证的预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤内异质性及其临床意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD(n=503), GSE68465(n=442), GSE72094(n=398), GSE26939(n=115) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8272 | 2025-10-06 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
|
研究论文 | 本研究揭示了Tex10通过精细调控Wnt信号通路在原始生殖细胞特化和精子发生中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Wnt负调控基因来精细调控Wnt信号通路，影响PGC特化和精子发生 | NA | 探究Tex10在原始生殖细胞特化和精子发生中的发育功能 | 原始生殖细胞样细胞、条件性基因敲除小鼠模型 | 发育生物学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8273 | 2025-05-10 |
Loss of ADAP1/CentA1 Protects Against Autoimmune Demyelination
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403078R
PMID:40326762
|
研究论文 | 本文研究了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的作用，发现其缺失可以部分抵抗实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的发展 | 揭示了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的新功能，特别是在调节Tregs、单核细胞和NK细胞功能方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性的验证尚不充分 | 探究ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫疾病中的机制作用 | ADAP1/CentA1缺陷小鼠和实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型 | 神经免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | EAE小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8274 | 2025-05-10 |
Allometry of cell types in planarians by single-cell transcriptomics
2025-May-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7042
PMID:40333969
|
research paper | 研究通过单细胞RNA测序技术探索了涡虫中细胞类型的异速生长关系 | 首次利用scRNA-seq技术研究涡虫细胞类型的异速生长，揭示了不同大小涡虫中细胞类型比例的变化及其与能量储存的关系 | 研究仅针对无性繁殖的涡虫，结果可能不适用于其他生物 | 探索细胞类型异速生长的分子和细胞机制 | 无性繁殖的涡虫 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 不同大小的涡虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8275 | 2025-05-10 |
Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59591-8
PMID:40328805
|
研究论文 | 该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制 | 首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降，并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类睾丸衰老的类似机制仍需验证 | 探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 年轻与老年小鼠的Leydig细胞 | 生殖生物学 | 睾丸功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠衰老模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8276 | 2025-05-10 |
Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma
2025-May-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99017-5
PMID:40328901
|
research paper | 该研究通过整合生物信息学和机器学习技术，识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用 | 首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用，并利用机器学习算法筛选关键生物标志物 | 研究依赖于公开数据集，未进行实验验证 | 阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制，识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL) | 生物信息学 | 头颈癌, 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8277 | 2025-05-10 |
Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling
2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02220-0
PMID:40329299
|
研究论文 | 研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型，揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用 | 首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发，并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 探索哮喘复发的细胞和分子机制，寻找预防哮喘恶化的新治疗策略 | 急性过敏性哮喘小鼠模型 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8278 | 2025-05-10 |
Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer
2025-May-06, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01882-4
PMID:40329330
|
研究论文 | 研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制 | 揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用，并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，临床前和临床验证仍需进一步研究 | 评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用，寻找克服这一临床挑战的新策略 | 结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116，以及肿瘤组织和邻近正常组织 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、代谢组学、下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、Cellchat检测、Western blot | NA | 基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据 | 结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8279 | 2025-05-10 |
Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy
2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028
PMID:39521279
|
研究论文 | 本研究通过流行病学和免疫转录组学方法，探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）发生或进展的风险及潜在机制 | 首次结合FDA不良事件报告系统（FAERS）和大规模RNA测序数据，揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险 | 研究基于FAERS数据库的回顾性分析，存在报告偏倚，且缺乏实验验证 | 评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制 | 使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例 | 免疫学与肿瘤学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL） | RNA测序（包括bulk和单细胞RNA测序） | NA | 药物不良事件报告数据、转录组数据 | FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告（其中606例为肿瘤报告） | NA | NA | NA | NA |
| 8280 | 2025-05-08 |
Abnormal lineage differentiation of peri-implantation aneuploid embryos revealed by single-cell RNA sequencing
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70326
PMID:40329849
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |