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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8261 | 2025-10-06 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (Class, Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.29.596006
PMID:38854132
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组测序技术,通过265个蛋白质编码基因进行系统基因组分析,揭示了该属中至少存在9个隐存种 | 样本仅来自韩国和美国地区,可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫的25个物种群体(代表6个形态种) | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 多物种溯祖模型 | 转录组数据 | 25个物种群体,37个种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8262 | 2025-10-06 |
Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
2024-May-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.029
PMID:38653236
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研究论文 | 通过整合空间转录组学、空间蛋白质组学和计算方法,揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构 | 首次结合多种空间组学技术系统揭示胶质瘤细胞状态的三类组织模式,发现缺氧作为长程组织者的新功能 | 未明确说明样本规模和技术平台的详细参数 | 解析胶质瘤细胞状态的组织结构和空间分布规律 | 胶质瘤组织样本,包括高级别和低级别IDH突变胶质瘤 | 空间生物学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 计算分析 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
8263 | 2025-10-06 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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综述 | 探讨细胞类型进化研究的新机遇与方法学挑战 | 强调结合基因编辑工具和单细胞基因组学技术研究细胞类型进化,提出通过发育本体论准确识别同源细胞的新视角 | 未涉及具体实验验证,主要提出理论框架和研究方向 | 解析细胞类型进化机制及其在动物演化中的作用 | 多种研究生物体的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学,基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8264 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌肿瘤内异质性并建立预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌肿瘤内异质性,发现B细胞显著招募现象,建立跨队列验证的预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤内异质性及其临床意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD(n=503), GSE68465(n=442), GSE72094(n=398), GSE26939(n=115) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8265 | 2025-10-06 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
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研究论文 | 本研究揭示了Tex10通过精细调控Wnt信号通路在原始生殖细胞特化和精子发生中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Wnt负调控基因来精细调控Wnt信号通路,影响PGC特化和精子发生 | NA | 探究Tex10在原始生殖细胞特化和精子发生中的发育功能 | 原始生殖细胞样细胞、条件性基因敲除小鼠模型 | 发育生物学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8266 | 2025-05-10 |
Loss of ADAP1/CentA1 Protects Against Autoimmune Demyelination
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403078R
PMID:40326762
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研究论文 | 本文研究了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的作用,发现其缺失可以部分抵抗实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的发展 | 揭示了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的新功能,特别是在调节Tregs、单核细胞和NK细胞功能方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性的验证尚不充分 | 探究ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫疾病中的机制作用 | ADAP1/CentA1缺陷小鼠和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型 | 神经免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | EAE小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8267 | 2025-05-10 |
Allometry of cell types in planarians by single-cell transcriptomics
2025-May-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7042
PMID:40333969
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序技术探索了涡虫中细胞类型的异速生长关系 | 首次利用scRNA-seq技术研究涡虫细胞类型的异速生长,揭示了不同大小涡虫中细胞类型比例的变化及其与能量储存的关系 | 研究仅针对无性繁殖的涡虫,结果可能不适用于其他生物 | 探索细胞类型异速生长的分子和细胞机制 | 无性繁殖的涡虫 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 不同大小的涡虫样本 | NA | NA | NA | NA |
8268 | 2025-05-10 |
Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59591-8
PMID:40328805
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研究论文 | 该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制 | 首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降,并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类睾丸衰老的类似机制仍需验证 | 探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 年轻与老年小鼠的Leydig细胞 | 生殖生物学 | 睾丸功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠衰老模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞 | NA | NA | NA | NA |
8269 | 2025-05-10 |
Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma
2025-May-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99017-5
PMID:40328901
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research paper | 该研究通过整合生物信息学和机器学习技术,识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用 | 首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用,并利用机器学习算法筛选关键生物标志物 | 研究依赖于公开数据集,未进行实验验证 | 阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制,识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL) | 生物信息学 | 头颈癌, 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8270 | 2025-05-10 |
Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling
2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02220-0
PMID:40329299
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研究论文 | 研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型,揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用 | 首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发,并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 探索哮喘复发的细胞和分子机制,寻找预防哮喘恶化的新治疗策略 | 急性过敏性哮喘小鼠模型 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8271 | 2025-05-10 |
Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer
2025-May-06, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01882-4
PMID:40329330
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研究论文 | 研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制 | 揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用,并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,临床前和临床验证仍需进一步研究 | 评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用,寻找克服这一临床挑战的新策略 | 结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116,以及肿瘤组织和邻近正常组织 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、代谢组学、下一代测序(NGS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Cellchat检测、Western blot | NA | 基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据 | 结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
8272 | 2025-05-10 |
Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy
2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028
PMID:39521279
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研究论文 | 本研究通过流行病学和免疫转录组学方法,探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)发生或进展的风险及潜在机制 | 首次结合FDA不良事件报告系统(FAERS)和大规模RNA测序数据,揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险 | 研究基于FAERS数据库的回顾性分析,存在报告偏倚,且缺乏实验验证 | 评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制 | 使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例 | 免疫学与肿瘤学 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | RNA测序(包括bulk和单细胞RNA测序) | NA | 药物不良事件报告数据、转录组数据 | FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告(其中606例为肿瘤报告) | NA | NA | NA | NA |
8273 | 2025-05-08 |
Abnormal lineage differentiation of peri-implantation aneuploid embryos revealed by single-cell RNA sequencing
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70326
PMID:40329849
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8274 | 2025-05-10 |
Targeting VSIG4+ tissue-resident macrophages enhances T cell cytotoxicity and immunotherapy efficacy in cancer
2025-Apr-29, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.011
PMID:40339578
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研究论文 | 本研究探讨了VSIG4+组织驻留巨噬细胞在癌症中的作用及其对T细胞细胞毒性和免疫治疗效果的增强作用 | 发现VSIG4过表达的TRM衍生TAM亚群在多种癌症中存在,并揭示了VSIG4通过直接或间接方式促进免疫抑制效应的机制,同时鉴定出MEF2C作为维持VSIG4表达的关键转录因子 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索TRM衍生的TAM亚群在癌症中的作用及其对免疫治疗的影响 | VSIG4+组织驻留巨噬细胞及其衍生的TAM亚群 | 肿瘤免疫学 | 睾丸癌、肝细胞癌、肺癌、胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8275 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Outperforms Single-Nucleus RNA Sequencing in Analyzing Pancreatic Cell Diversity and Gene Expression in Goats
2025-Apr-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083916
PMID:40332786
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研究论文 | 本研究比较了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)在分析山羊胰腺细胞多样性和基因表达方面的效果 | 首次在山羊胰腺研究中比较了scRNA-seq和snRNA-seq的效果,发现scRNA-seq在检测细胞类型多样性和关键基因表达谱方面更优 | 研究仅使用了3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织,样本量较小 | 比较scRNA-seq和snRNA-seq在山羊胰腺研究中的效果 | 山羊胰腺组织 | 基因组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织 | NA | NA | NA | NA |
8276 | 2025-05-10 |
Personalized Stem Cell-Based Regeneration in Spinal Cord Injury Care
2025-Apr-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083874
PMID:40332538
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综述 | 本文探讨了干细胞工程和再生医学在脊髓损伤治疗中的新进展,特别是通过神经干细胞/祖细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞的移植 | 结合患者特异性变异、生物工程创新和转录组学引导的精准医学,定义了脊髓损伤治疗的新前沿 | 患者特异性因素如细胞衰老、遗传和表观遗传变异、损伤微环境和合并症影响干细胞疗法的疗效 | 探索干细胞疗法在脊髓损伤治疗中的临床应用 | 脊髓损伤患者 | 再生医学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学、CRISPR介导的低免疫原性工程、生物材料递送平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8277 | 2025-05-10 |
Identifying Aberrant 1CM-Related Pathways by Multi-Omics Analysis and Validating Tumor Inhibitory Effect of One-Carbon Donor Betaine in Gastric Cancer
2025-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083841
PMID:40332533
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃癌中异常的1CM相关通路,并验证一碳供体甜菜碱对胃癌的抑制作用 | 首次通过多组学联合分析揭示胃癌中1CM相关通路的异常激活,并发现甜菜碱作为一碳供体对胃癌细胞的抑制作用 | 样本量有限,特别是转录组测序仅使用了6对组织样本,需要更大规模的验证 | 阐明胃癌中代谢重编程的分子机制,特别是1CM相关通路的作用 | 胃癌患者和健康个体的血浆样本、胃癌组织 | 代谢组学 | 胃癌 | 代谢组学分析、转录组测序、单细胞测序、Random Forest分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞数据 | 334例血浆样本(胃癌患者和健康个体)、6对组织样本 | NA | NA | NA | NA |
8278 | 2025-05-10 |
The Complementary Role of Morphology in Understanding Microglial Functional Heterogeneity
2025-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083811
PMID:40332469
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综述 | 本文探讨了小胶质细胞在稳态、发育阶段和疾病状态下的异质性,重点整合了转录组数据和形态学分析 | 通过整合转录组数据和形态学分析,深入理解小胶质细胞的异质性及其在不同条件下的功能 | 未提及具体实验样本量或数据来源的详细描述 | 揭示小胶质细胞的异质性及其在发育和疾病中的功能 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8279 | 2025-05-10 |
IRF5 Mediates Artery Inflammation in Salt-Sensitive Hypertension by Regulating STAT1 and STAT2 Phosphorylation to Increase ESM1 Transcription: Insights from Bioinformatics and Mechanistic Analysis
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083722
PMID:40332339
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研究论文 | 本研究揭示了IRF5通过调节STAT1和STAT2的磷酸化促进ESM1转录,从而在盐敏感性高血压中调节动脉炎症的分子机制 | 首次发现IRF5通过调控STAT1和STAT2磷酸化促进ESM1转录的机制,并验证了其在盐敏感性高血压中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证较少 | 探究盐敏感性高血压中动脉炎症的分子机制 | 盐敏感性高血压小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | 生物信息学与分子机制研究 | 心血管疾病 | scRNA-seq, RNA测序, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测 | DOCA-盐诱导高血压小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量,包括小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
8280 | 2025-05-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Potential Mechanisms of Follicular Development in Stra8-Deficient Mice
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083734
PMID:40332359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探讨Stra8缺陷小鼠卵泡发育的潜在机制 | 使用单细胞RNA测序技术构建了野生型和Stra8缺陷小鼠卵巢细胞的全面转录图谱,揭示了Stra8在生殖细胞分化和卵泡形成中的复杂作用 | 研究仅限于胚胎期E14.5和E16.5阶段的小鼠卵巢细胞,未涉及其他发育阶段或其他物种 | 探讨Stra8缺陷对小鼠卵泡发育的影响及其分子机制 | 野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 14,755个单细胞,来自野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢 | NA | NA | NA | NA |