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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8241 | 2025-10-06 | High-resolution spatial transcriptomics and cell lineage analysis reveal spatiotemporal cell fate determination during craniofacial development 
          2025-May-12, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-025-59206-2
          PMID:40355462
         | 研究论文 | 通过高分辨率空间转录组学和细胞谱系分析揭示颅面发育过程中细胞命运决定的时空动态 | 首次构建了小鼠腭发育过程中颅神经嵴细胞来源间充质谱系分化的高分辨率时空转录组图谱,并发现Sox9+异质性间充质祖细胞群在腭发育起始前就已激活早期谱系特异性标记 | 研究局限于小鼠模型,需要进一步验证在人类发育中的适用性 | 解析颅面发育过程中细胞命运决定的分子机制 | 小鼠颅神经嵴细胞来源的间充质细胞 | 空间转录组学 | 发育生物学 | 空间转录组学,细胞谱系追踪 | NA | 空间转录组数据 | E12.5至E15.5胚胎期小鼠组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8242 | 2025-05-14 | Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq 
          2025-May-12, Nature reviews. Genetics
          
         
          DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
          PMID:40355601
         | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 8243 | 2025-10-06 | IL-11/IL-11R signal inhibition by 9MW3811 remodels immune tumor microenvironment and enhances anti-tumor efficacy of PD-1 blockade 
          2025-May-12, NPJ precision oncology
          
          IF:6.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41698-025-00913-w
          PMID:40355638
         | 研究论文 | 介绍一种靶向IL-11信号通路的单克隆抗体9MW3811,通过重塑肿瘤免疫微环境增强PD-1阻断疗法的抗肿瘤效果 | 首次证明9MW3811可通过调节XCL1和CCL7逆转T细胞耗竭,并与抗PD-1疗法产生协同作用,即使在PD-1无应答模型中仍有效 | 目前研究仅限于小鼠模型,临床疗效尚待验证 | 开发靶向IL-11信号通路的抗肿瘤治疗策略 | IL-11/IL-11R信号通路和肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8244 | 2025-10-06 | INHBA+ macrophages and Pro-inflammatory CAFs are associated with distinctive immunosuppressive tumor microenvironment in submucous Fibrosis-Derived oral squamous cell carcinoma 
          2025-May-12, BMC cancer
          
          IF:3.4Q2
          
         
          DOI:10.1186/s12885-025-14261-2
          PMID:40355814
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌具有独特的免疫抑制肿瘤微环境 | 首次发现INHBA+巨噬细胞和促炎性癌症相关成纤维细胞在ODSCC中的特异性富集及其通过INHBA-ACVR信号通路调节Treg细胞的机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证INHBA信号通路的具体作用机制 | 阐明口腔黏膜下纤维化衍生的口腔鳞状细胞癌中肿瘤免疫抑制微环境的细胞组成和调控网络 | 口腔鳞状细胞癌组织样本,包括OSF衍生的ODSCC和非OSF衍生的NODSCC | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 来自GEO数据库的scRNA-seq和ST数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8245 | 2025-10-06 | Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma 
          2025-May-11, Hereditas
          
          IF:2.1Q3
          
         
          DOI:10.1186/s41065-025-00437-0
          PMID:40350499
         | 研究论文 | 通过整合多组学数据分析发现GADD45B是皮肤黑色素瘤中与免疫相关的预后生物标志物 | 首次系统揭示GADD45B在皮肤黑色素瘤中的免疫调节功能及其作为新型免疫检查点的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,临床验证仍需进一步开展 | 探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的生物学功能和临床意义 | 皮肤黑色素瘤患者数据、细胞系和小鼠模型 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞分析、功能富集分析、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞数据 | 26个SKCM相关数据集、30个人类SKCM细胞系、29个SKCM细胞系表型特征 | NA | 转录组测序,单细胞分析 | NA | NA | 
| 8246 | 2025-10-06 | Anti-Müllerian hormone signalling sustains circadian homeostasis in zebrafish 
          2025-May-10, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-025-59528-1
          PMID:40348785
         | 研究论文 | 本研究揭示了抗缪勒氏管激素(Amh)信号通路在维持斑马鱼昼夜节律稳态中的关键作用 | 首次发现Amh-Bmpr2a/Bmpr1bb-Smad1/5/9信号轴通过调控垂体细胞群时钟基因表达来维持昼夜节律稳态 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的保守性尚未验证 | 探索维持昼夜节律稳态的关键信号通路 | 斑马鱼及其垂体细胞群 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析,基因敲除 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8247 | 2025-10-06 | Air pollutants and lung regeneration: impact on the fate of lung stem cells 
          2025-May-09, Environment international
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.envint.2025.109525
          PMID:40354720
         | 综述 | 本文综述了空气污染物对肺干细胞命运的影响及其在肺再生中的作用机制 | 从组织再生视角探讨吸入污染物与肺干细胞的相互作用,并引入类器官和单细胞测序技术的新研究方法 | NA | 阐明空气污染物如何影响肺干细胞的再生能力,为预防和控制相关肺疾病提供策略 | 肺上皮-黏膜屏障中的区域特异性干细胞(气道和肺泡关键干细胞) | 毒理学与再生医学 | 肺疾病 | 单细胞测序、类器官培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8248 | 2025-10-06 | scMINER: a mutual information-based framework for clustering and hidden driver inference from single-cell transcriptomics data 
          2025-May-08, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-025-59620-6
          PMID:40341143
         | 研究论文 | 介绍了一个基于互信息的单细胞转录组数据分析框架scMINER,用于细胞聚类和隐藏驱动因子推断 | 开发了首个基于互信息的集成框架,在细胞聚类和网络推断方面优于现有方法,特别擅长区分密切相关的细胞群体和揭示T细胞耗竭等关键转录因子驱动因子 | NA | 解决单细胞转录组数据的随机性和稀疏性带来的分析挑战 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,CROP-seq | 互信息框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA | 
| 8249 | 2025-10-06 | Patient-derived models of UBA5-associated encephalopathy identify defects in neurodevelopment and highlight potential therapeutic avenues 
          2025-May-07, Science translational medicine
          
          IF:15.8Q1
          
         
          DOI:10.1126/scitranslmed.adn8417
          PMID:40333994
         | 研究论文 | 本研究建立了UBA5相关脑病患者来源的皮质类器官模型,揭示了神经发育缺陷并探索了潜在治疗方法 | 首次开发了UBA5相关脑病的人类神经元模型,通过单细胞RNA测序发现GABA能中间神经元发育缺陷,并评估了两种增强UBA5蛋白表达的潜在治疗策略 | 研究仅基于两名患者的样本,样本量较小 | 研究UBA5基因变异导致的脑病发病机制并探索潜在治疗方法 | UBA5相关脑病患者来源的皮质类器官和工程化U87-MG细胞 | 神经科学 | 脑病 | 单细胞RNA测序,CRISPRa,SINEUP技术 | 类器官模型 | RNA测序数据,电生理数据 | 两名UBA5相关脑病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8250 | 2025-10-06 | Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models 
          2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2024-010820
          PMID:40341024
         | 研究论文 | 本研究评估了在小鼠胰腺癌模型中联合阻断LIF和PD-L1对立体定向放射治疗抗肿瘤疗效的增强作用 | 首次证明LIF和PD-L1双重阻断可显著增强SBRT的抗肿瘤疗效,并诱导长期系统性抗肿瘤免疫记忆 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探索LIF阻断联合PD-L1抑制和放射治疗在胰腺癌治疗中的协同效应 | 小鼠原位胰腺肿瘤模型和肿瘤浸润免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,Luminex检测,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,细胞因子数据 | 多个小鼠原位胰腺肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 8251 | 2025-10-06 | Induced B cell receptor diversity predicts PD-1 blockade immunotherapy response 
          2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
          DOI:10.1073/pnas.2501269122
          PMID:40314973
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析,发现PD-1抑制剂治疗诱导的B细胞受体多样性可预测免疫治疗疗效 | 首次揭示PD-1阻断治疗诱导的BCR克隆多样性是免疫治疗响应的关键预测因子,并开发了基于基线肿瘤RNA测序的机器学习预测模型 | 研究队列规模有限,需要在更多癌种和更大样本中进一步验证 | 探索PD-1免疫检查点抑制剂治疗响应机制及预测生物标志物 | 局部晚期或转移性基底细胞癌患者,以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理 | 基底细胞癌,胶质母细胞瘤,黑色素瘤,头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间免疫受体分析 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床随访数据 | 多个癌症队列患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 8252 | 2025-10-06 | Proximal Tubule Cells Contribute to the Thin Descending Limb of the Loop of Henle during Mouse Kidney Development 
          2025-May-06, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1681/ASN.0000000721
          PMID:40327839
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示了小鼠肾脏发育过程中近端小管细胞对髓袢降支细段形成的贡献 | 首次发现近端小管细胞能够分化为髓袢降支细段细胞,并证实转录因子Hnf4a在此过程中调控Aqp1基因表达的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类肾脏发育过程可能存在差异 | 探究髓袢降支细段在肾脏发育过程中的细胞起源 | 发育中小鼠肾脏细胞 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 多个非突变发育小鼠肾脏数据集整合 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8253 | 2025-10-06 | Huoxue Tongluo tablet enhances atherosclerosis efferocytosis by promoting the differentiation of Trem2+ macrophages via PPARγ signaling pathway 
          2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
          
          IF:6.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.phymed.2025.156579
          PMID:40068297
         | 研究论文 | 本研究揭示活血通络片通过激活PPARγ信号通路上调Trem2⁺巨噬细胞分化,从而增强动脉粥样硬化斑块内胞葬作用 | 首次在单细胞层面证实活血通络片通过PPARγ信号通路调控Trem2⁺巨噬细胞亚群分化并促进胞葬作用 | 研究主要基于ApoE⁻/⁻小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究活血通络片治疗动脉粥样硬化的疗效机制 | ApoE⁻/⁻小鼠模型和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,UPLC-MS/MS,流式细胞术,免疫荧光,Western blotting,qPCR | NA | 单细胞转录组数据,质谱数据,图像数据 | ApoE⁻/⁻小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8254 | 2025-10-06 | Irreversible electroporation combined with PD-L1/IL-6 dual blockade promotes anti-tumor immunity via cDC2/CD4+T cell axis in MHC-I deficient pancreatic cancer 
          2025-May-01, Cancer letters
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.canlet.2025.217620
          PMID:40068706
         | 研究论文 | 本研究阐明了不可逆电穿孔联合PD-L1/IL-6双阻断通过cDC2/CD4+T细胞轴在MHC-I缺陷型胰腺癌中促进抗肿瘤免疫的机制 | 首次揭示IRE消融疗法通过激活cDC2-CD4+T细胞轴在MHC-I低表达胰腺癌中的补偿性抗肿瘤作用,并提出PD-L1/IL-6双阻断联合消融的新治疗策略 | 研究主要基于临床样本和小鼠模型,尚未进行大规模临床试验验证 | 探究MHC-I缺陷型胰腺癌中CD4+T细胞的补偿性免疫应答机制及联合治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 临床患者样本和实验小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8255 | 2025-10-06 | UBE2C mediates follicular thyroid carcinoma invasion and metastasis via K29-Specific vimentin ubiquitination 
          2025-May-01, Cancer letters
          
          IF:9.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.canlet.2025.217624
          PMID:40074069
         | 研究论文 | 本研究揭示UBE2C通过K29特异性波形蛋白泛素化调控滤泡性甲状腺癌的侵袭和转移 | 首次发现UBE2C在FTC中具有促进增殖但抑制迁移侵袭的双重功能,并阐明其通过K29连接泛素化降解波形蛋白的分子机制 | 动物模型中UBE2C敲低出现原发肿瘤减小但转移增加的表型,其具体机制需要进一步研究 | 探究UBE2C在滤泡性甲状腺癌进展中的具体作用和分子机制 | 滤泡性甲状腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,功能实验,动物模型 | 动物模型 | 基因表达数据,蛋白质数据 | FTC标本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8256 | 2025-10-06 | Pitaya stem polysaccharide promotes wound healing by modulating macrophage polarization via single-cell RNA sequencing evidence 
          2025-May, International journal of biological macromolecules
          
          IF:7.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142653
          PMID:40158567
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序证据揭示火龙果茎多糖通过调节巨噬细胞极化促进伤口愈合的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示火龙果茎多糖诱导巨噬细胞M2极化的独特转录特征及其通过PI3K/Akt信号通路促进伤口愈合的新机制 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细信息,缺乏对多糖具体分子结构的深入分析 | 研究火龙果茎多糖通过影响巨噬细胞M2/M1极化促进伤口愈合的作用机制 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 皮肤创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8257 | 2025-10-06 | Inborn errors of immunity underlie clonal T cell expansions in large granular lymphocyte leukemia 
          2025-May-01, The Journal of clinical investigation
          
          IF:13.3Q1
          
         
          DOI:10.1172/JCI184431
          PMID:40309770
         | 研究论文 | 本研究通过免疫基因组学分析揭示T细胞大颗粒淋巴细胞白血病中克隆性T细胞扩增与先天性免疫缺陷的关联 | 首次发现T-LGLL中先天性免疫缺陷基因变异的高频率存在,揭示了免疫缺陷特征与克隆性T细胞扩增之间的因果关系 | 样本量相对有限(92例全外显子测序),需要更大规模研究验证 | 探究T细胞大颗粒淋巴细胞白血病的发病机制,特别是免疫缺陷在疾病发生中的作用 | 92例T-LGLL患者队列(总队列271例)及其临床实验室特征 | 基因组学 | 白血病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, TCR测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 92例患者进行全外显子测序,271例患者进行临床实验室特征分析 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, TCR测序, RNA测序 | NA | NA | 
| 8258 | 2025-10-06 | Integration of Single-Cell RNA Sequencing Data and Bulk Sequencing Data to Characterise the CD8+ T-Cell Exhaustion Mediated Immune Microenvironment in CRC 
          2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
          
          IF:4.3Q2
          
         
          DOI:10.1111/jcmm.70556
          PMID:40356050
         | 研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量测序数据,研究结直肠癌中CD8+ T细胞耗竭介导的免疫微环境特征 | 首次整合单细胞和批量测序数据系统分析CRC中CD8+ T细胞耗竭机制,发现MIF和CD99是关键调控因子,并构建了基于XGBoost的预后预测模型 | 未明确说明样本规模和验证队列的详细信息 | 阐明结直肠癌中CD8+ T细胞耗竭的分子机制及其对免疫治疗的影响 | 结直肠癌肿瘤组织中的T细胞亚型和免疫微环境 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量测序, 功能验证实验 | XGBoost | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 8259 | 2025-10-06 | Comprehensive pan-cancer single-cell analysis reveals glycolysis-related signatures as predictive biomarkers for immunotherapy response and their role in bladder cancer 
          2025-Apr-16, International immunopharmacology
          
          IF:4.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.intimp.2025.114381
          PMID:40058104
         | 研究论文 | 通过全面的泛癌单细胞分析揭示了糖酵解相关特征作为免疫治疗反应的预测生物标志物及其在膀胱癌中的作用 | 首次在泛癌水平系统研究糖酵解特征与免疫治疗反应的关系,并发现COPB2作为新的治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索糖酵解在泛癌特别是膀胱癌中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 34个单细胞RNA测序队列、8个ICI治疗的bulk RNA测序队列和TCGA泛癌RNA测序队列 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 34个scRNA-seq队列、8个ICI治疗队列和TCGA泛癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 8260 | 2025-10-06 | Multi-transcriptomics reveals niche-specific expression programs and endothelial cells in glioblastoma 
          2025-Apr-15, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12967-025-06185-z
          PMID:40234880
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了胶质母细胞瘤中坏死周围假栅栏区和微血管增殖区的空间特异性表达程序及内皮细胞特征 | 首次系统阐明胶质母细胞瘤特定组织病理学特征的空间分子和细胞组成,发现NDRG1和EPAS1在PAN和MVP区域的特异性表达,以及内皮细胞在肿瘤微环境中的分化轨迹 | 样本数量有限,需要更大规模验证;空间分辨率可能不足以捕捉所有细胞亚群 | 解析胶质母细胞瘤特定组织病理区域的空间分子表达和细胞组成特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 单细胞轨迹分析 | RNA测序数据 | 胶质母细胞瘤患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |