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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8241 - 8260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8241 | 2025-10-06 |
Elevated levels of IRF1 and CASP1 as pyroptosis-related biomarkers for intestinal epithelial cells in Crohn's disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1551547
PMID:40018047
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别出IRF1和CASP1作为克罗恩病肠道上皮细胞焦亡相关的关键生物标志物 | 首次系统识别并验证IRF1和CASP1在克罗恩病肠道上皮细胞焦亡中的关键作用，并证明其在不同CD亚型中的诊断价值 | 研究主要聚焦于IRF1和CASP1，其他焦亡相关基因的作用仍需进一步探索 | 探索焦亡在克罗恩病肠道上皮细胞中的作用机制并识别关键生物标志物 | 克罗恩病患者肠道上皮细胞、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 差异表达分析、机器学习算法、单细胞测序分析、RT-PCR、蛋白质印迹 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8242 | 2025-05-12 |
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals transcriptomic signatures associated with deep vein thrombosis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1551879
PMID:40342960
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示了与深静脉血栓形成(DVT)相关的转录组特征，并识别了潜在的遗传标记 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，识别了DVT相关的8个高度特征性基因，并验证了CXCR4作为潜在遗传标记的作用 | 样本量相对较小(内部测试集11例患者+6例对照，外部测试集12例患者+6例对照)，需要更大规模研究验证 | 识别和验证与深静脉血栓形成(DVT)相关的最具特征性的基因 | DVT患者和对照组的全血样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 机器学习算法, 免疫荧光 | WGCNA, 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 内部测试集17例(11患者+6对照)，外部测试集18例(12患者+6对照)，scRNA-seq 6例(3患者+3对照) | NA | NA | NA | NA |
| 8243 | 2025-05-12 |
Decoding immune cell interactions during cardiac allograft vasculopathy: insights derived from bioinformatic strategies
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1568528
PMID:40342971
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review | 本文综述了单细胞和多组学方法在心脏同种异体移植血管病变（CAV）研究中的应用，总结了最新发现并讨论了其对理解CAV发病机制的意义 | 总结了单细胞RNA测序等先进技术在揭示CAV中免疫-内皮-基质相互作用方面的突破性发现 | 目前将这些技术应用于CAV的研究仍然较少，限制了这些发现向临床实践的转化 | 理解心脏移植后慢性同种异体移植血管病变（CAV）的发病机制 | 心脏移植受者的血管病变 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8244 | 2025-05-12 |
PDGF-BB overexpressing dental pulp stem cells improve angiogenesis in dental pulp regeneration
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1578410
PMID:40343206
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research paper | 研究通过scRNA-seq发现PDGF(+)间充质亚群具有增强的血管生成特征，并通过过表达PDGF-BB的DPSCs改善牙髓再生中的血管生成 | 通过scRNA-seq识别PDGF(+)亚群并验证其与血管的关联，以及通过基因工程增强DPSCs的血管生成能力 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验 | 改善牙髓再生中的血管生成问题 | 牙髓干细胞（DPSCs）和PDGF(+)间充质亚群 | digital pathology | dental disease | scRNA-seq, 多重免疫组化, 慢病毒载体转染 | NA | RNA-seq数据, 免疫组化图像 | 人类牙髓样本和大鼠肾囊移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 8245 | 2025-05-12 |
Leveraging transcriptome-wide association studies identifies the relationship between upper respiratory flora and cell type-specific gene expression in severe respiratory disease
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322864
PMID:40343915
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研究论文 | 本研究利用转录组范围关联研究（TWAS）探讨了上呼吸道菌群与严重流感样疾病（ILI）中免疫细胞特异性基因表达的关系 | 首次结合GWAS数据和scRNA-seq数据，通过TWAS方法揭示了上呼吸道菌群与免疫细胞基因表达的关联，并识别了影响ILI进展的关键免疫细胞类型和通路 | 研究样本量相对有限（1195例GWAS数据），且仅关注了严重ILI患者 | 探究上呼吸道菌群如何通过调节免疫细胞功能影响ILI的疾病进展 | 上呼吸道菌群和免疫细胞（如CD4+T效应记忆细胞、cDCs、NK细胞等） | 基因组学与免疫学 | 呼吸道疾病 | GWAS、scRNA-seq、LDSC、MAGMA、scDRS、FUSION | TWAS | 基因组数据和单细胞转录组数据 | 1195例严重ILI相关的GWAS数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8246 | 2025-05-12 |
scRNA-seq and scATAC-seq analyses highlight the role of TNF signaling pathway in chronic obstructive pulmonary disease model mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322538
PMID:40343927
|
研究论文 | 通过scRNA-seq和scATAC-seq分析，研究TNF信号通路在慢性阻塞性肺疾病模型小鼠中的作用 | 结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，揭示了TNF信号通路在COPD模型小鼠中的重要作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究TNF信号通路在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用 | C57BL/6小鼠的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | COPD小鼠模型 | 单细胞测序数据 | 未明确说明数量的小鼠肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8247 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein E is a novel marker for chondrocytes in the growth plate resting zone
2024-Aug-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4656728/v1
PMID:39149484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现载脂蛋白E是生长板静息区软骨细胞的新型标志物 | 首次发现载脂蛋白E可作为小鼠和人类生长板静息区软骨细胞的全面标志物 | 研究未详细探讨载脂蛋白E在静息区软骨细胞中的具体功能机制 | 寻找生长板静息区软骨细胞的可靠分子标志物 | 小鼠和人类生长板静息区软骨细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼发育疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 基因敲入技术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8248 | 2025-05-11 |
Identification of novel biomarkers and drug targets for frailty-related skeletal muscle aging: a multi-omics study
2025-May-09, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcaf108
PMID:40343466
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研究论文 | 通过多组学研究识别与衰弱相关骨骼肌衰老的新型生物标志物和药物靶点 | 首次发现24个生物标志物基因，并构建了基于转录组特征的预测模型，揭示了内皮细胞在肌肉退化中的关键作用 | 研究结果需要在更大样本中进行验证，且药物靶点的临床转化效果尚不明确 | 识别早期检测和治疗干预衰弱相关骨骼肌衰老的生物标志物和药物靶点 | 人类骨骼肌衰老过程 | 生物信息学 | 老年疾病 | 转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、贝叶斯共定位分析 | 机器学习预测模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 8249 | 2025-05-11 |
Mature tertiary lymphoid structures evoke intra-tumoral T and B cell responses via progenitor exhausted CD4+ T cells in head and neck cancer
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59341-w
PMID:40335494
|
research paper | 研究头颈癌中成熟三级淋巴结构（mTLS）通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞促进肿瘤内T和B细胞反应的机制 | 揭示了mTLS通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞激活B细胞和DC-LAMP树突状细胞，从而支持CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究仅针对头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者，未涉及其他癌症类型 | 探究mTLS在肿瘤免疫中的作用机制及其对免疫检查点阻断（ICB）治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序、抗原受体测序和空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者肿瘤组织样本（具体数量未提及） | NA | NA | NA | NA |
| 8250 | 2025-05-11 |
Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in EBV positive diffuse large B cell lymphoma
2025-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00410-x
PMID:40335578
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，研究EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境异质性及其与预后的关系 | 首次整合10X Visium空间转录组学和scRNA-seq技术，揭示EBV+DLBCL中PD-1/PD-L1信号通路的免疫抑制特性，并验证PD-1/PD-L1抑制剂BMS202的治疗潜力 | 研究样本量未明确说明，且功能验证仅限于EBV+Farage细胞系 | 探究EBV+DLBCL肿瘤微环境异质性及其对患者生存的影响 | EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤（EBV+DLBCL） | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 10X Visium空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8251 | 2025-05-11 |
Immunodynamic axis of fibroblast-driven neutrophil infiltration in acute pancreatitis: NF-κB-HIF-1α-CXCL1
2025-May-07, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00734-6
PMID:40335899
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞通过NF-κB-HIF-1α-CXCL1信号轴驱动中性粒细胞浸润在急性胰腺炎中的免疫动力学机制 | 首次证明成纤维细胞激活是中性粒细胞浸润的免疫驱动因素之一，并阐明NF-κB-HIF-1α通路驱动的糖酵解是成纤维细胞分泌CXCL1趋化中性粒细胞的内在分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证不足 | 阐明急性胰腺炎中成纤维细胞驱动中性粒细胞过度浸润的分子机制 | C57BL/6J小鼠模型和人类胰腺星状细胞 | 免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞迁移实验、细胞转染、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、共免疫沉淀(co-IP) | 小鼠急性胰腺炎模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用C57BL/6J小鼠和人类胰腺星状细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 8252 | 2025-05-11 |
Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development
2025-May-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01213-6
PMID:40335909
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术探讨了手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响 | 首次在围手术期使用单细胞测序技术深入分析手术/麻醉对免疫细胞的影响，特别是发现单核细胞可能促进肿瘤发展 | 样本量较小（仅4名患者），观察时间较短（仅48小时） | 研究手术/麻醉对围手术期患者免疫系统的影响 | 接受大手术患者的围手术期外周血单个核细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序, RT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名手术患者 | NA | NA | NA | NA |
| 8253 | 2025-05-11 |
PAQR5 drives the malignant progression and shapes the immunosuppressive microenvironment of hepatocellular carcinoma by activating the NF-κB signaling
2025-May-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00785-z
PMID:40336138
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研究论文 | 本研究揭示了PAQR5通过激活NF-κB信号通路促进肝细胞癌（HCC）恶性进展和免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次系统阐明了PAQR5在HCC中的致癌作用机制，并通过多组学分析和实验验证揭示了其通过ERK/NF-κB信号轴驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化应用仍需进一步验证 | 阐明PAQR5在肝细胞癌进展中的作用机制及其对肿瘤免疫微环境的调控 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析（包括bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组）、体外实验和体内实验 | NA | 转录组数据、实验数据 | 未明确说明具体样本量，但涉及多个转录组队列和实验模型 | NA | NA | NA | NA |
| 8254 | 2025-05-11 |
Positive Prognostic Overall Survival Impacts of Methylated TGFB2 and MGMT in Adult Glioblastoma Patients
2025-Mar-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17071122
PMID:40338274
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research paper | 探讨了TGFB2和MGMT基因甲基化对成人胶质母细胞瘤患者总体生存期的积极影响 | 首次发现TGFB2和MGMT基因甲基化水平升高可预测胶质母细胞瘤患者总体生存期改善，尤其在年轻成年男性患者中效果显著 | 研究基于TCGA数据集，可能需要更多独立数据集验证 | 评估TGFB2和MGMT基因甲基化对胶质母细胞瘤患者预后的影响 | 成人胶质母细胞瘤患者 | digital pathology | glioblastoma | 甲基化分析，单细胞RNA-seq | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8255 | 2025-05-11 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
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review | 本文讨论了消除HIV持久性储存库的挑战，以及基于生物标志物表达的策略 | 探讨了识别定义所有HIV储存库细胞亚群的最小细胞表面蛋白集的需求，并提出了未来研究方向 | 目前缺乏定义HIV潜伏感染细胞的特定分子标志物或生物标志物，且生物标志物存在异质性 | 研究如何通过生物标志物表达来消除HIV持久性储存库，实现HIV治愈 | HIV持久性储存库及其生物标志物 | 传染病学 | HIV/AIDS | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8256 | 2025-10-06 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.19.563173
PMID:37905060
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研究论文 | 开发了用于跨物种单细胞转录组数据插补和比较的神经网络框架Icebear | 首次实现了跨物种单细胞基因表达谱的准确预测，并揭示了哺乳动物X染色体上调的进化适应性 | 未明确说明样本规模和具体数据集限制 | 开发跨物种单细胞转录组比较和预测方法 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8257 | 2025-10-06 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (Class, Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2024-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.29.596006
PMID:38854132
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组测序技术，通过265个蛋白质编码基因进行系统基因组分析，揭示了该属中至少存在9个隐存种 | 样本仅来自韩国和美国地区，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫的25个物种群体（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 多物种溯祖模型 | 转录组数据 | 25个物种群体，37个种群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8258 | 2025-10-06 |
Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma
2024-May-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.03.029
PMID:38653236
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学、空间蛋白质组学和计算方法，揭示胶质母细胞瘤的多层次组织结构 | 首次结合多种空间组学技术系统揭示胶质瘤细胞状态的三类组织模式，发现缺氧作为长程组织者的新功能 | 未明确说明样本规模和技术平台的详细参数 | 解析胶质瘤细胞状态的组织结构和空间分布规律 | 胶质瘤组织样本，包括高级别和低级别IDH突变胶质瘤 | 空间生物学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 计算分析 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 8259 | 2025-10-06 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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综述 | 探讨细胞类型进化研究的新机遇与方法学挑战 | 强调结合基因编辑工具和单细胞基因组学技术研究细胞类型进化，提出通过发育本体论准确识别同源细胞的新视角 | 未涉及具体实验验证，主要提出理论框架和研究方向 | 解析细胞类型进化机制及其在动物演化中的作用 | 多种研究生物体的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学，基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8260 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌肿瘤内异质性并建立预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌肿瘤内异质性，发现B细胞显著招募现象，建立跨队列验证的预后模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索肺腺癌肿瘤内异质性及其临床意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD(n=503), GSE68465(n=442), GSE72094(n=398), GSE26939(n=115) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |