单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 8221 - 8240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8221 | 2025-05-15 |
Single-cell transcriptomic construction of fibroblast score for analysis of immune infiltration in primary and metastatic ovarian cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1549541
PMID:40357367
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据构建成纤维细胞评分，分析原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润 | 构建了一种新的成纤维细胞评分（Fib score），并发现TIMP3通过调控CXCL12/CXCR4信号轴影响卵巢癌的预后、免疫抑制和耐药性 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未进行实验验证 | 探索原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润及成纤维细胞差异标志物在卵巢癌免疫调节中的作用 | 原发性和转移性卵巢癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | COX单因素分析 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8222 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2024-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.601561
PMID:39005414
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术，识别出再生原基中的13个不同细胞群，并发现至少4种新的前体细胞群 | 研究局限于海参这一特定物种，分子机制仍需进一步验证 | 探究海参肠道再生过程中再生原基细胞的分子特征和分化潜能 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, HCR-FISH分析 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光原位杂交图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8223 | 2025-10-06 |
Cancer-specific innate and adaptive immune rewiring drives resistance to PD-1 blockade in classic Hodgkin lymphoma
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54512-7
PMID:39737927
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间分析揭示了经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制 | 首次发现循环和肿瘤浸润的IL1β单核细胞/巨噬细胞群在cHL患者中的特异性存在及其与PD-1阻断耐药性的关联 | 样本来源和数量未明确说明，需要进一步验证外周血检测的临床实用性 | 阐明经典霍奇金淋巴瘤对PD-1阻断治疗的免疫应答机制和耐药性原因 | 经典霍奇金淋巴瘤患者和健康供体的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，空间分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 8224 | 2025-10-06 |
Immune checkpoint inhibitor-induced severe epidermal necrolysis mediated by macrophage-derived CXCL10 and abated by TNF blockade
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54180-7
PMID:39737932
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点抑制剂诱导的严重表皮坏死松解症的发病机制 | 首次发现巨噬细胞来源的CXCL10在ICI-SJS/TEN发病机制中的关键作用，并证实TNF阻断可有效治疗该病症 | 样本量较小（仅25例患者），需要更大规模研究验证 | 探究免疫检查点抑制剂诱导严重皮肤不良反应的分子机制和治疗方法 | 免疫检查点抑制剂诱导的Stevens-Johnson综合征/中毒性表皮坏死松解症患者 | 单细胞测序分析 | 皮肤不良反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个队列共25例ICI诱导SJS/TEN患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8225 | 2025-10-06 |
Monocyte Invasion into the Retina Restricts the Regeneration of Neurons from Müller Glia
2024-Nov-13, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0938-24.2024
PMID:39353729
|
研究论文 | 本研究揭示外周免疫系统中的单核细胞通过浸润受损视网膜并分泌骨桥蛋白抑制Müller胶质细胞的神经再生能力 | 首次发现外周免疫系统（单核细胞）是中枢神经系统再生的屏障，并鉴定出骨桥蛋白是抑制神经再生的关键细胞因子 | 研究主要基于小鼠模型，在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探索限制哺乳动物视网膜神经元再生的机制 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞和浸润的单核细胞 | 神经再生 | 视网膜疾病 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | CCR2基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 不同性别的CCR2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8226 | 2025-10-06 |
Identification and Analysis of Biomarkers Associated with Lipophagy and Therapeutic Agents for COVID-19
2024-06-07, Viruses
DOI:10.3390/v16060923
PMID:38932215
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定与脂噬相关的COVID-19生物标志物和潜在治疗药物 | 首次系统研究脂噬相关基因在COVID-19中的作用，并发现7个脂噬相关基因作为生物标志物和药物靶点 | 基于生物信息学分析的预测结果需要实验验证 | 研究脂噬相关生物标志物和基于脂噬的COVID-19治疗药物 | COVID-19患者基因表达数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，机器学习 | 随机森林，支持向量机，广义线性模型，极限梯度提升 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集（GSE145926，GSE183533，GSE190496） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8227 | 2025-10-06 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-May-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化程序 | 发现了新生儿肺间充质细胞的新亚型，包括能够分化为成熟肺泡肌成纤维细胞的未成熟祖细胞 | NA | 研究新生儿肺发育过程中肺泡肌成纤维细胞的分化机制 | 新生小鼠肺组织中的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,细胞分选,原代细胞培养,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8228 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和蛋白质组学筛选胰腺癌表面受体靶点，开发靶向紧密连接蛋白claudin-4的分子成像诊疗剂 | 首次通过空间转录组学数据驱动筛选发现claudin-4作为胰腺癌诊疗靶点，开发了特异性肽类分子成像剂 | NA | 开发胰腺癌分子成像和诊疗新方法 | 胰腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 分子成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 8229 | 2025-10-06 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
|
研究论文 | 提出一种分析结核分枝杆菌感染小鼠肺部单细胞RNA测序数据的标准化流程 | 开发了专门针对肺部淋巴细胞群体的单细胞RNA测序数据分析流程，特别针对感染与健康状态的比较分析 | 未明确说明样本数量和技术重复情况，依赖已处理数据而非原始数据 | 建立标准化分析流程以解析肺部淋巴细胞在结核感染中的变化 | 健康与结核分枝杆菌感染小鼠的肺部淋巴细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8230 | 2025-10-06 |
Protocol for identifying immune checkpoint on circulating tumor cells of human pancreatic ductal adenocarcinoma by single-cell RNA sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102539
PMID:37659082
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过单细胞RNA测序识别胰腺导管腺癌循环肿瘤细胞上免疫检查点的实验方案 | 开发了从胰腺导管腺癌肝转移患者中分离循环肿瘤细胞并进行单细胞RNA测序以识别免疫检查点的标准化流程 | NA | 建立有效的免疫治疗方案以预防肿瘤转移 | 胰腺导管腺癌肝转移患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8231 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and analysis of rodent blood stage Plasmodium
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102491
PMID:37581982
|
研究论文 | 本文提供了一种利用单细胞RNA测序技术分析啮齿动物血液阶段疟原虫发育阶段特异性基因表达调控的方案 | 首次应用单细胞RNA测序技术于疟原虫血液阶段研究，克服了传统批量RNA测序无法区分发育阶段特异性基因调控的局限 | NA | 建立疟原虫血液阶段发育特异性基因表达分析的方法学 | 啮齿动物血液阶段的疟原虫(Plasmodium chabaudi chabaudi AS)感染的红色血细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，FACS分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8232 | 2025-10-06 |
Isolation of Thymus Stromal Cells from Human and Murine Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2679-5_13
PMID:36255703
|
研究方法论文 | 详细介绍从人类和小鼠组织中分离胸腺基质细胞的方法学 | 提供了针对胸腺基质细胞分离优化的组织解离方案 | NA | 开发胸腺基质细胞分离方法以支持下游分析 | 人类和小鼠的胸腺组织 | 单细胞分析 | 免疫系统疾病 | 组织解离、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8233 | 2025-10-06 |
Molecular mapping of interstitial lung disease reveals a phenotypically distinct senescent basal epithelial cell population
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.143626
PMID:33705361
|
研究论文 | 本研究通过分子图谱分析揭示了间质性肺病中表型独特的衰老基底上皮细胞群体 | 首次在ILD中识别出具有独特表型的衰老基底上皮细胞群体，并建立了肺上皮细胞特异性衰老转录特征 | 缺乏功能性研究验证，人类肺组织样本中环境特异性细胞衰老特征分析工具不足 | 阐明间质性肺病中衰老细胞的起源和特征 | 特发性肺纤维化(IPF)和系统性硬化相关间质性肺病(SSc-ILD)的肺组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,体外模型 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 对照、IPF和SSc-ILD肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8234 | 2025-10-06 |
Overcoming immunotherapy resistance in colorectal cancer through nano-selenium probiotic complexes and IL-32 modulation
2025-Sep, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型纳米硒益生菌复合物，通过调节IL-32增强CD8+ T细胞免疫应答，克服结直肠癌免疫治疗耐药性 | 首次将硒纳米颗粒负载的细胞外囊泡与工程化益生菌及IL-32结合，创建了新型纳米生物材料复合物 | 研究主要基于人源化异种移植小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发克服结直肠癌免疫治疗耐药性的新策略 | 结直肠癌患者样本和人源化小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，电子显微镜，动态光散射 | 人源化异种移植小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，图像数据 | 免疫治疗耐药结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8235 | 2025-10-06 |
Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer
2025-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24200
PMID:38476085
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞异质性，并鉴定分泌性白细胞蛋白酶抑制剂作为胰腺癌致癌基因 | 首次在胰腺癌中通过单细胞测序识别八个细胞亚群，发现SPPI和血管内皮生长因子相关通路在不同细胞中的激活，并鉴定SLPI作为新的治疗靶点 | 未提及样本量大小和研究队列特征，功能验证实验可能不够充分 | 探索胰腺癌肿瘤微环境的细胞异质性并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌肿瘤微环境中的各类细胞（上皮细胞、髓系细胞、癌症相关成纤维细胞等） | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8236 | 2025-10-06 |
RETRACTED: Exploring the tumor microenvironment: Chemokine-related genes and immunotherapy/chemotherapy response in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24190
PMID:38488671
|
研究论文 | 本研究通过构建趋化因子相关基因预后模型，探索了透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境对免疫治疗和化疗反应的影响 | 首次基于趋化因子相关基因构建ccRCC预后模型，并鉴定IGF2BP3作为舒尼替尼耐药的关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 识别趋化因子相关基因并构建透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和786-O、A498细胞系 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, CCK-8, Western blot, RT-qPCR | 预后风险模型 | 转录组数据, 单细胞数据 | 531例批量转录组数据, GSE159115单细胞数据集及其他验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8237 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of diquat-induced oxidative stress and its impact on organ-specific toxicity
2025-Jun-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118246
PMID:40327929
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示敌草快中毒诱导的氧化应激微环境在多器官损伤中的核心作用 | 首次构建敌草快中毒多器官单细胞图谱，揭示氧化应激微环境通过调控细胞死亡和代谢重编程加剧组织损伤的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，缺乏人类临床样本验证 | 探究敌草快中毒诱导多器官损伤的分子机制 | 敌草快中毒小鼠的肺、肝、肾器官细胞 | 单细胞组学 | 中毒性器官损伤 | 单细胞/单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过270,000个小鼠细胞，包含10小时、20小时、36小时三个时间点及对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8238 | 2025-10-06 |
Hypoxia-induced RHCG as a key regulator in psoriasis and its modulation by secukinumab
2025-Jun, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250742
PMID:40351602
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的RHCG在银屑病发病机制中的关键调控作用及其被苏金单抗调节的机制 | 首次发现RHCG在银屑病皮损中显著上调且受缺氧诱导，并阐明其通过调控角质形成细胞标志物和CXCL14分泌参与免疫细胞活化的新机制 | RHCG在银屑病中的具体信号通路机制尚未完全阐明 | 阐明RHCG在银屑病发病机制中的生物学功能及其治疗意义 | 银屑病患者皮肤标本、角质形成细胞、树突状细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 空间转录组学分析、单细胞转录组学分析、批量数据分析 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 临床银屑病皮肤标本 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 8239 | 2025-05-14 |
Multi-omics Analysis Reveals the Propagation Mechanism of Ferroptosis in Acute Kidney Injury
2025-May-13, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02311-7
PMID:40358793
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示了急性肾损伤中铁死亡的传播机制 | 首次揭示了GPX4、FTH1和FTL基因在急性肾损伤中铁死亡传播中的关键作用，并发现KLF6作为铁死亡相关基因的抑制因子 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本数据，需要在更大规模的人类研究中验证 | 探究急性肾损伤中铁死亡的传播机制 | 急性肾损伤患者的肾脏组织和双侧肾缺血再灌注损伤小鼠模型 | 生物医学 | 急性肾损伤 | snRNA-seq、空间转录组学、染色质可及性分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，包括AKI患者和健康人的肾脏组织以及小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 8240 | 2025-10-06 |
Inhibition of DOCK1 suppresses Notch signalling pathway and impairs leukaemogenesis
2025-May-12, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20140
PMID:40355246
|
研究论文 | 本研究揭示了DOCK1通过调控Notch信号通路促进急性髓系白血病发生发展的机制 | 首次系统阐明DOCK1在AML中的致病作用及其通过Notch信号通路调控白血病干细胞功能的机制 | 研究主要基于临床样本分析和动物模型，需要进一步验证在人类原代AML细胞中的适用性 | 探究DOCK1在急性髓系白血病中的病理作用及其分子机制 | 341名新发非M3型AML患者、白血病细胞系、异种移植模型和Dock1条件性基因敲除小鼠 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 341名AML患者、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |