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当前共找到 37744 篇文献，本页显示第 8221 - 8240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8221 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8222 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 8223 | 2025-10-05 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-Nov, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件的广泛失调，并利用CRISPR干扰实验验证了特定转座元件对炎症基因的调控作用 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统鉴定转座元件表达数量性状位点(teQTL)，并通过CRISPRi实验验证了神经元特异性转座元件调控机制 | 研究主要基于三个脑组织生物样本库，样本来源和数量可能存在限制 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件失调的遗传调控机制 | 人类阿尔茨海默病患者的脑组织样本和iPSC来源的神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序,全基因组测序,CRISPR干扰,xQTL分析 | 数量性状位点分析,共定位分析 | 基因组数据,转录组数据 | 三个大型人类AD脑组织生物样本库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 8224 | 2025-10-05 |
Mouse blood cells types and aging prediction using penalized Latent Dirichlet Allocation
2024-Sep-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10763-8
PMID:39294566
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研究论文 | 本研究开发了一种基于惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)的统计方法，用于分析小鼠血液单细胞RNA测序数据以预测细胞类型和衰老状态 | 提出了惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)这一新型统计方法，用于单细胞RNA测序数据的降维表示学习 | 仅使用小鼠血液数据进行验证，未在其他组织或物种中进行测试 | 开发计算方法来分析单细胞RNA测序数据，以理解衰老过程中的转录组变化 | 小鼠血液细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA) | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8225 | 2025-10-05 |
scRNA-seq identifies unique macrophage population in murine model of ozone induced asthma exacerbation
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604740
PMID:39211080
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧诱导哮喘加重模型中鉴定出独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群，并揭示了其特异性基因表达通路 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 探究臭氧暴露导致哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 尘螨、豚草和臭氧暴露的小鼠肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 暴露于DRA、臭氧或DRA+臭氧的小鼠肺部免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8226 | 2025-10-05 |
Reusability report: Leveraging supervised learning to uncover phenotype-relevant biology from single-cell RNA sequencing data
2024-Mar, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-024-00804-y
PMID:41020135
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研究论文 | 评估PENCIL监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的可重复性和可转移性 | 通过基因集变异分析增强PENCIL的细胞亚群识别能力，创建了预测皮肤癌免疫检查点阻断反应的细胞毒性T细胞免疫治疗反应特征 | 对输入扰动敏感，原始版本存在可重复性问题 | 评估和改进监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的性能 | 12个单细胞RNA测序数据集，代表四种不同表型 | 机器学习 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序，监督学习，基因集变异分析 | PENCIL框架 | 单细胞RNA测序数据 | 12个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8227 | 2025-10-05 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
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研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 | 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 | 在其他人体器官（肾、肺、肝、肌肉）中未观察到相同的周细胞染色模式，组织特异性较强 | 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 | 人和小鼠不同脑区的周细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个人和小鼠脑区样本，以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | EasySci | 高通量低成本单细胞转录组测序方法 |
| 8228 | 2025-10-05 |
A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01243-4
PMID:36543915
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞技术和空间转录组学构建了人类肺部空间分辨图谱，揭示了气管粘膜下腺中的免疫细胞生存微环境 | 发现了气管粘膜下腺中IgA浆细胞的生存微环境，并证明腺上皮细胞通过表达CCL28、APRIL和IL-6招募B细胞和IgA浆细胞，促进其局部存活和抗体分泌 | NA | 重新定义肺和气管的组织结构，解析人类肺部的空间组织结构 | 健康人类肺部的五个近端到远端位置 | 空间转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 人类肺部五个解剖位置的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 8229 | 2025-10-06 |
Decoding chicken growth regulation through multi-omics insights and emerging genetic tools for growth optimization
2025-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105542
PMID:40652768
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综述 | 本文综述了鸡生长性状的遗传调控机制，整合多组学方法和新兴基因工具以优化生长性能 | 强调单细胞RNA测序在解析生长相关组织细胞异质性中的应用，结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术开辟精准育种新途径 | 现有遗传变异发现对可持续高效家禽生产的应用仍有限制 | 阐明鸡生长性状的遗传调控网络，推动精准育种策略开发 | 鸡的生长性状（体重和生长）及其遗传调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因组编辑, 多组学分析（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 基因组测序 | NA | NA |
| 8230 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Sep-29, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011875
PMID:41021609
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体基因表达模式 | 首次在三刺棘鱼中发现缺乏减数分裂性染色体失活现象，挑战了该过程在硬骨鱼类中的保守性假设 | 研究仅针对单一物种，需要更多硬骨鱼类研究验证结论的普适性 | 探究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体失活现象的存在与否 | 三刺棘鱼(Gasterosteus aculeatus)的性染色体(X和Y染色体) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8231 | 2025-10-06 |
Scproca: A Cross-Attention-Enhanced Deep Generative Model for Single-Cell Transcriptomics and Proteomics Integration and Imputation
2025-Sep-29, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3615771
PMID:41021958
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研究论文 | 提出一种用于单细胞转录组学和蛋白质组学数据整合与插补的深度生成模型 | 通过交叉注意力机制整合细胞间关系，处理异质性输入数据，在高蛋白质稀疏性下保持鲁棒性 | NA | 开发能够整合单细胞转录组学和蛋白质组学数据的深度学习方法 | 单细胞RNA测序数据和蛋白质组学共分析数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学共分析 | 深度生成模型, 交叉注意力机制 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学共分析 | NA | NA |
| 8232 | 2025-10-06 |
Hypothesis-generating evaluation of multi-armoured oncolytic HSV-1 (VG161) in intrahepatic cholangiocarcinoma: pooled insights from multicentre studies
2025-Sep-29, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335904
PMID:41022576
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研究论文 | 评估多效溶瘤病毒VG161在肝内胆管癌中的安全性和疗效，并探索其免疫机制 | 首次报道表达IL-12、IL-15和PD-L1拮抗剂的多效溶瘤HSV-1病毒VG161在ICC中的临床数据，通过多组学分析揭示免疫微环境重塑机制 | 样本量较小（24例患者），需要更大规模试验验证结果 | 探索VG161溶瘤病毒在晚期肝内胆管癌患者中的安全性、疗效和免疫机制 | 晚期肝内胆管癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 | NA | 临床数据、肿瘤活检样本、转录组数据 | 24例晚期ICC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8233 | 2025-10-06 |
Interpretable Multi-task Analysis of Single-Cell RNA-seq Data Through Topological Structure Preservation and Data Denoising
2025-Sep-29, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00765-9
PMID:41023370
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA-seq数据多任务分析的可解释框架scIMTA，解决拓扑结构保持和dropout事件处理问题 | 实现稀疏高噪声基因表达数据的协作多任务分析，通过生物学基础增强可解释性，在保持数据完整性的同时稳健处理dropout事件 | NA | 开发单细胞转录组数据的多任务分析方法，解决数据稀疏性和噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多任务分析框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8234 | 2025-10-06 |
Distinct cell state ecosystems for nodular lymphocyte-predominant Hodgkin lymphoma
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63339-9
PMID:41006203
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研究论文 | 本研究开发了NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型，识别出34种不同细胞状态并建立临床相关生物学分类 | 首次建立NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型，识别出3种不同的免疫微环境生态型及其临床预后意义 | NLPHL为罕见癌症，样本量相对有限（总171例） | 深入研究结节性淋巴细胞为主型霍奇金淋巴瘤的免疫微环境和罕见淋巴细胞优势细胞 | 171例NLPHL患者样本中的淋巴细胞优势细胞和免疫微环境细胞 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 空间转录组学 | LPE生态型模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 训练队列109例（65% LPE1/2），验证队列62例（61% LPE1/2），总计171例NLPHL样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8235 | 2025-10-06 |
Spatially-restricted inflammation-induced senescent-like glia in multiple sclerosis and patient-derived organoids
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63371-9
PMID:41006208
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研究论文 | 本研究探讨多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关系，发现病变区域存在衰老样胶质细胞积累 | 首次通过单细胞转录组和空间转录组技术揭示MS病变中衰老样胶质细胞的空间分布特征，并利用患者来源的类器官模型验证小胶质细胞对炎症诱导衰老的特殊敏感性 | 样本数量有限，类器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关联及其对疾病进展的影响 | 多发性硬化症患者脑组织样本和hiPSC来源的神经类器官 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析、空间转录组学、hiPSC衍生神经类器官、3T MRI | NA | 转录组数据、影像数据 | 466名患者脑组织样本及hiPSC衍生神经类器官 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 8236 | 2025-10-06 |
Comparison of imaging based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63414-1
PMID:41006245
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研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本比较三种成像空间转录组学平台的性能 | 首次系统评估商业空间转录组学平台在肿瘤样本中的表现，并揭示探针设计等参数对数据质量的重要性 | 研究仅使用肺癌和胸膜间皮瘤样本，样本类型相对有限 | 评估不同空间转录组学平台在肿瘤生物学研究中的性能差异 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤的福尔马林固定石蜡包埋手术切除样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学（CosMx、MERFISH、Xenium）、批量RNA测序、多重免疫荧光、GeoMx、HE染色 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 使用组织微阵列中的肺腺癌和胸膜间皮瘤样本 | CosMx, MERFISH, Xenium | 空间转录组学，单细胞分辨率成像 | CosMx, MERFISH, Xenium | 单模态和多模态Xenium平台 |
| 8237 | 2025-10-06 |
Aging in mice alters regionally enriched striatal astrocytes
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63429-8
PMID:41006292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠纹状体中星形胶质细胞随年龄增长的分子变化和区域异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别了纹状体中分子特征不同的星形胶质细胞亚型，并发现背侧纹状体星形胶质细胞表现出更大的年龄相关分子变化 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；样本数量未明确说明 | 探究衰老对纹状体星形胶质细胞分子特征和区域分布的影响 | 年轻和老年小鼠的纹状体星形胶质细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8238 | 2025-10-06 |
Intramuscular enteric glia persist in Hirschsprung disease and undergo neurogenesis in response to GDNF-NCAM1 signaling
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17734-3
PMID:41006492
|
研究论文 | 本研究探讨了先天性巨结肠症中肠胶质细胞的分子特征、起源及神经生成潜力 | 发现先天性巨结肠症病变区域存在CAMK2b+肠外神经胶质细胞，并揭示GDNF通过非经典NCAM1依赖通路促进神经生成 | 研究主要基于Ednrb基因敲除小鼠模型和人类组织样本，样本量有限 | 探究先天性巨结肠症中肠胶质细胞的分子特性和神经生成能力 | Ednrb-null小鼠和人类先天性巨结肠症组织的肠胶质细胞 | 分子生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外细胞培养 | NA | 基因表达数据、图像数据 | Ednrb-null小鼠模型和人类先天性巨结肠症组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8239 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing of BCG naïve and recurrent non-muscle invasive bladder cancer reveals a CD6/ALCAM-mediated immune-suppressive pathway
2025-Sep-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01093-3
PMID:41006678
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示CD6/ALCAM信号通路在BCG治疗后复发的非肌层浸润性膀胱癌中的免疫抑制作用 | 首次发现CD6/ALCAM介导的T细胞与尿路上皮细胞相互作用在BCG耐药中的关键作用 | 样本量有限，需要在更大队列中验证 | 探索BCG治疗耐药的非肌层浸润性膀胱癌的免疫机制 | 非肌层浸润性膀胱癌患者 | 单细胞测序分析 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 两个独立的BCG治疗NMIBC队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8240 | 2025-10-06 |
Mechanism of sepsis regulation by ELANE via macrophage polarization
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18848-4
PMID:41006720
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了ELANE基因通过促进巨噬细胞M1极化加剧脓毒症的机制 | 首次系统性地将ELANE鉴定为脓毒症核心免疫调控基因，并通过单细胞测序和体外实验证实其在巨噬细胞极化中的关键作用 | 样本量较小（20例患者），且主要基于体外实验，需要更大规模的临床验证 | 鉴定脓毒症核心免疫调控基因ELANE并探索其通过巨噬细胞极化调控脓毒症的机制 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本，以及LPS刺激的巨噬细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | RNA测序、生物信息学分析、单细胞测序、流式细胞术、ELISA | NA | RNA测序数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据 | 20例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |