单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 8221 - 8240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8221 | 2024-10-05 |
Novel FABP4+C1q+ macrophages enhance antitumor immunity and associated with response to neoadjuvant pembrolizumab and chemotherapy in NSCLC via AMPK/JAK/STAT axis
2024-Oct-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-07074-x
PMID:39353883
|
研究论文 | 研究了新型FABP4+C1q+巨噬细胞在非小细胞肺癌（NSCLC）患者中增强抗肿瘤免疫的作用及其与新辅助派姆单抗和化疗（NAPC）疗效的关系 | 发现了与新辅助化疗免疫疗法疗效相关的新型FABP4C1q巨噬细胞亚型，并揭示了其通过AMPK/JAK/STAT轴增强抗炎和吞噬能力的机制 | NA | 探讨新辅助派姆单抗和化疗在非小细胞肺癌中的疗效机制及预测标志物 | 非小细胞肺癌患者及其肿瘤组织和淋巴结中的巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 8222 | 2024-10-05 |
SAE-Impute: imputation for single-cell data via subspace regression and auto-encoders
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05944-x
PMID:39354334
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAE-Impute的新计算方法，通过结合子空间回归和自动编码器来提高单细胞数据插补的准确性和可靠性 | SAE-Impute通过子空间回归评估样本相关性，并在自动编码器框架内利用这些预测进行插值，从而解决了现有方法忽略样本间相关性的问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题，提高数据分析的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 8223 | 2024-10-05 |
ScRNAbox: empowering single-cell RNA sequencing on high performance computing systems
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05935-y
PMID:39354372
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研究论文 | 介绍了一种名为scRNAbox的创新性单细胞RNA测序分析管道，专为高性能计算系统设计 | scRNAbox是一个端到端的解决方案，通过SLURM工作负载管理器高效处理标准和Hashtag样本的原始数据，并集成了质量控制过滤、样本整合、聚类、聚类注释工具以及细胞类型特异性差异基因表达分析 | NA | 开发一个用户友好且适用于高性能计算系统的单细胞RNA测序数据处理和分析管道 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开数据集 |
| 8224 | 2024-10-05 |
Comprehensive analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics revealed IER3 for predicting malignant progression and immunotherapy efficacy in glioma
2024-Oct-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03511-1
PMID:39354533
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了IER3在预测胶质瘤恶性进展和免疫治疗效果中的作用 | 首次全面分析了IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | NA | 探讨IER3在胶质瘤病理中的作用及其作为生物标志物的潜力 | IER3在胶质瘤中的表达及其与预后、免疫治疗效果的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 免疫组化、免疫荧光、Cox回归分析、Kaplan-Meier曲线 | NA | RNA测序数据 | 公开的胶质瘤数据集 |
| 8225 | 2024-10-05 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-Sep-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
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研究论文 | 研究探讨了缺氧诱导的ROS抗性记忆在再氧合过程中的作用及其通过MUC1-C促进转移的机制 | 首次揭示了缺氧后细胞在再氧合过程中保留缺氧诱导基因表达的现象，并证明了MUC1-C在其中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探讨缺氧如何通过MUC1-C促进肿瘤转移 | 乳腺癌细胞及其在缺氧和再氧合条件下的基因表达和转移能力 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及动物模型和患者来源的异种移植模型 |
| 8226 | 2024-10-05 |
Glioblastoma induces the recruitment and differentiation of dendritic-like "hybrid" neutrophils from skull bone marrow
2024-Sep-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.008
PMID:39255776
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研究论文 | 研究揭示了胶质母细胞瘤如何诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞招募和分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并探讨了这些细胞在肿瘤微环境中的作用 | 首次发现胶质母细胞瘤诱导颅骨骨髓中的中性粒细胞分化为具有树突状特征的“混合”中性粒细胞，并揭示了这些细胞在抑制肿瘤生长中的作用 | NA | 探讨肿瘤相关中性粒细胞在胶质母细胞瘤生物学中的作用 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关中性粒细胞、颅骨骨髓 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和鼠类胶质母细胞瘤样本 |
| 8227 | 2024-10-05 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2024-Sep-02, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
|
综述 | 本文综述了原发性硬化性胆管炎（PSC）的免疫生物学最新进展 | 重点介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在PSC研究中的应用 | NA | 全面概述PSC的免疫生物学机制 | PSC相关的免疫细胞类型及其在疾病中的作用 | NA | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 8228 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of MYH11+ tumour-associated fibroblasts between left-sided and right-sided colorectal cancer
2024-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70102
PMID:39294858
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序揭示了左半结肠癌和右半结肠癌中MYH11+肿瘤相关成纤维细胞的异质性 | 首次全面注释了左半结肠癌和右半结肠癌的特征和差异，并发现了一种新的MYH11+癌症相关成纤维细胞亚群 | 样本量较小，仅包括12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 | 探讨左半结肠癌和右半结肠癌的异质性及其潜在机制 | 左半结肠癌和右半结肠癌患者的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例左半结肠癌和10例右半结肠癌患者 |
| 8229 | 2024-10-05 |
Identification of functional heterogeneity of immune cells and tubular-immune cellular interplay action in diabetic kidney disease
2024-Sep, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2023-0130
PMID:39360161
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研究论文 | 研究探讨了糖尿病肾病中免疫细胞的功能异质性和肾小管-免疫细胞相互作用 | 首次揭示了dapagliflozin治疗对M2巨噬细胞抗炎功能的代谢转变，并识别了新的分子特征和信号通路 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化验证，缺乏体内实验验证 | 探讨糖尿病肾病中免疫细胞的异质性和治疗机制 | 糖尿病肾病中的免疫细胞和肾小管细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 58760个细胞 |
| 8230 | 2024-10-05 |
Spatial Transcriptomics Analysis: Maternal Obesity Impairs Myogenic Cell Migration and Differentiation during Embryonic Limb Development
2024-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179488
PMID:39273445
|
研究论文 | 研究母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响 | 首次探讨了母体肥胖对肌细胞迁移相关生物过程的抑制作用 | 仅使用了C57BL/6小鼠模型，样本量较小 | 探讨母体肥胖对胚胎肢体发育过程中肌细胞迁移和分化的影响 | C57BL/6小鼠胚胎的肌细胞迁移和分化 | 数字病理学 | 肥胖症 | GeoMx DSP平台 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6小鼠胚胎，E13.5期，样本量未明确提及 |
| 8231 | 2024-10-05 |
Role of Neutrophils in the Development of Steatotic Liver Disease
2024-Aug, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0044-1789207
PMID:39117322
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综述 | 本文综述了中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的生物学作用及其作为治疗靶点的潜力 | 本文介绍了中性粒细胞在无菌性炎症中的作用，这是脂肪肝疾病发病机制的关键组成部分 | 尽管技术进步如单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞亚群的存在，但这些不同亚群如何不同地参与脂肪肝疾病的发展仍不清楚 | 探讨中性粒细胞在脂肪肝疾病发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 中性粒细胞及其在脂肪肝疾病中的作用 | NA | 脂肪肝疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 8232 | 2024-10-05 |
The dynamic behavior of chromatophores marks the transition from bands to spots in leopard geckos
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2400486121
PMID:38976731
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研究论文 | 研究豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变过程 | 首次揭示了豹纹守宫皮肤颜色从带状到斑点的转变机制，并通过遗传分析和单细胞转录组学分析确定了关键基因的作用 | 研究主要集中在豹纹守宫的特定基因型，可能不适用于其他物种或基因型 | 探讨爬行动物皮肤颜色形成的发育过程和分子信号通路 | 豹纹守宫的带状和斑点皮肤模式 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 基因序列 | 豹纹守宫的胚胎皮肤样本 |
| 8233 | 2024-10-05 |
Single-cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00194-24
PMID:38567950
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人类树突状细胞对寨卡病毒感染的抗病毒反应 | 首次在单细胞水平上揭示了寨卡病毒感染时抗病毒网络的组成和功能 | 研究仅限于人类树突状细胞，未涉及其他细胞类型 | 深入理解宿主对寨卡病毒感染的反应机制 | 人类树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一批人类单核细胞衍生的树突状细胞 |
| 8234 | 2024-10-05 |
Stimulation of fracture mineralization by salt-inducible kinase inhibitors
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1450611
PMID:39359266
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研究论文 | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折矿化的刺激作用 | 首次测试了盐诱导激酶抑制剂YKL-05-099对骨折愈合的加速作用，并开发了基于水凝胶的siRNA递送系统 | NA | 研究盐诱导激酶抑制剂对骨折愈合的影响 | 骨折愈合过程中的矿化和组织结构 | NA | NA | RT-qPCR, 单细胞RNA测序, μCT成像 | NA | RNA, 图像 | 126只雌性小鼠 |
| 8235 | 2024-10-05 |
Recent progress and applications of single-cell sequencing technology in breast cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1417415
PMID:39359479
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在乳腺癌研究中的最新进展和应用 | 单细胞RNA测序和单细胞DNA测序技术结合多组学技术，显著增强了我们对肿瘤微环境中细胞多样性的理解 | NA | 探讨单细胞测序技术在乳腺癌研究中的潜力，特别是其在解码驱动疾病进展、治疗抵抗和转移的复杂基因组景观中的作用 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞DNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 8236 | 2024-10-05 |
Food antigens suppress small intestinal tumorigenesis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1373766
PMID:39359724
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研究论文 | 研究食物抗原在小肠肿瘤发生中的抑制作用 | 首次报道食物抗原通过Peyer's patches（PPs）在小肠肿瘤发生中起到抑制作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨食物抗原在小肠肿瘤发生中的作用 | 小肠肿瘤、Peyer's patches（PPs）、食物抗原 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型中的免疫细胞 |
| 8237 | 2024-10-05 |
Single-cell RNA sequencing data locate ALDH1A2-mediated retinoic acid synthetic pathway to glomerular parietal epithelial cells
2024, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2024.10167
PMID:39360029
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review | 本文通过挖掘单细胞和单核RNA测序数据库，发现肾小球壁上皮细胞中存在完整的视黄酸合成途径 | 首次在肾小球壁上皮细胞中发现ALDH1A2介导的视黄酸合成途径，并探讨了其在肾脏生理和病理中的潜在作用 | 需要进一步的实验验证和临床研究来证实ALDH1A2在肾脏中的具体作用 | 探讨ALDH1A2在肾脏生理和病理中的作用 | 肾小球壁上皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠和人类肾脏的单细胞和单核RNA测序数据 |
| 8238 | 2024-10-05 |
Discovery of GJC1 as a prognostic biomarker in glioma cells: insights into its cell-cycle relationship and differential expression in non-neuronal cells
2024, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2024.1440409
PMID:39360264
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研究论文 | 本研究探讨了GJC1作为胶质瘤细胞中的预后生物标志物的潜力及其与细胞周期的关系 | 发现GJC1在胶质瘤中具有独立的预后价值，并揭示了其在非神经细胞中的差异表达 | 研究主要基于回顾性分析，未来需要进一步的实验验证 | 研究GJC1在胶质瘤中的预后价值及其与细胞周期的关系 | 胶质瘤细胞及其与GJC1表达的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的数据 |
| 8239 | 2024-10-05 |
Cellular Heterogeneity of Activated Primary Human Macrophages and Associated Drug-Gene Networks: From Biology to Precision Therapeutics
2023-11-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究了干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞的细胞异质性及其相关的药物-基因网络，旨在从生物学到精准治疗 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，鉴定了两种主要的巨噬细胞亚群，并结合细胞签名药物库识别了一种新型化合物，该化合物能够靶向治疗动脉粥样硬化 | NA | 探索巨噬细胞亚群在动脉粥样硬化中的作用，并开发新的免疫治疗方法 | 干扰素-γ激活的人类原代巨噬细胞及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢物消耗分析、免疫测定、功能测试 | NA | RNA序列数据 | 人类原代巨噬细胞、人类颈动脉粥样硬化斑块、小鼠动脉粥样硬化模型 |
| 8240 | 2024-10-05 |
Adrenomedullin has a pivotal role in trophoblast differentiation: A promising nanotechnology-based therapeutic target for early-onset preeclampsia
2023-11-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi4777
PMID:37922358
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研究论文 | 研究探讨了肾上腺髓质素（ADM）在滋养层细胞分化中的关键作用，并提出了一种基于纳米技术的早期子痫前期的潜在治疗靶点 | 首次揭示了ADM在滋养层细胞分化中的重要作用，并提出了一种基于纳米技术的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨ADM在早期子痫前期中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 滋养层细胞、早期子痫前期患者、妊娠小鼠 | 生物医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类绒毛膜滋养层细胞、滋养层干细胞、滋养层类器官、妊娠小鼠 |