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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8201 | 2025-05-12 |
Integrated analysis of MIOX gene in prognosis of clear-cell renal cell carcinoma
2025-May-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07698-7
PMID:40341358
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研究论文 | 本研究通过整合分析MIOX基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)预后中的作用,揭示了其作为独立预后标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组分析确定了MIOX在ccRCC中的特异性,并验证了其作为独立预后标志物的价值 | 研究主要基于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 探索铁死亡相关基因对ccRCC患者预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | 癌症基因组学 | 肾癌 | scRNA-seq, 空间转录组分析, Lasso回归分析, Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本与正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
8202 | 2025-10-06 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-May, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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研究论文 | 本研究揭示了血管紧张素转换酶依赖的肾内血管紧张素II通过下调PCYT2导致线粒体膜破坏和活性氧过度生成,在糖尿病肾小管病变中发挥关键作用 | 首次发现ACE依赖的肾内AngII通过下调PCYT2破坏肾小管线粒体膜稳态并导致ROS过度生成的机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;ACE抑制剂仅部分改善肾小管损伤 | 探讨ACE依赖的肾内AngII在糖尿病肾小管病变中的作用机制 | 糖尿病小鼠模型和肾小管细胞 | 肾脏病学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,肾动脉注射,生化检测 | NA | 基因表达数据,生化指标数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8203 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Aggressive Basal-Like Tumor Cell Subpopulation Associated With Poor Prognosis in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16915
PMID:39993788
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现与肝内胆管癌不良预后相关的侵袭性基底样肿瘤细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出具有基底上皮特征的侵袭性肿瘤细胞亚群,并揭示其通过HGF-MET轴与炎症性癌相关成纤维细胞的相互作用机制 | 样本量相对有限(23例患者),需要更大规模研究验证发现 | 解析肝内胆管癌的肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学染色, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, bulk RNA-seq数据, 图像数据 | 26个肿瘤样本(来自23例患者)+ 6个肿瘤切片(来自6例患者)+ 两个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
8204 | 2025-10-06 |
Centromere protein U mediates the ubiquitination and degradation of RPS3 to facilitate temozolomide resistance in glioblastoma
2025-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101214
PMID:40023134
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研究论文 | 本研究揭示了着丝粒蛋白U通过介导RPS3的泛素化降解促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的新机制 | 首次发现CENPU通过TRIM5α介导RPS3在K214位点的多聚泛素化降解,激活ERK1/2通路并上调RAD51表达,从而增强DNA损伤修复能力 | NA | 阐明胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制并探索增强其敏感性的方法 | 胶质母细胞瘤类器官、胶质瘤小鼠模型、胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序、免疫组织化学、免疫荧光、慢病毒转导、免疫共沉淀、质谱分析、碱性彗星实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、组织病理学图像 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8205 | 2025-10-06 |
Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy
2025-May, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418
PMID:40023886
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研究论文 | 本研究探讨硫化氢通过调节自噬改善CUMS诱导小鼠抑郁样行为的机制 | 首次揭示硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬,改善突触可塑性损伤,发挥抗抑郁作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究硫化氢通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调节自噬和突触可塑性的抗抑郁机制 | 慢性不可预见温和应激(CUMS)诱导的抑郁模型小鼠 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 蛋白质印迹 | 动物行为学模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 行为学数据 | CUMS诱导的抑郁模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8206 | 2025-05-12 |
Characterising Shared and Specific Cell-Cell Communication in Cardiomyopathy Subtypes From Single-Cell Transcriptomics Data
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70554
PMID:40344498
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性特征 | 揭示了心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性通路,为靶向治疗提供了新见解 | 研究仅基于转录组数据,未考虑蛋白质水平和功能验证 | 解析心肌病亚型中细胞间通讯的分子机制 | 心律失常性心肌病(ACM)、扩张型心肌病(DCM)、肥厚型心肌病(HCM)和缺血性心肌病(ICM)患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自ACM、DCM、HCM、ICM患者和健康供体的心室区域样本 | NA | NA | NA | NA |
8207 | 2025-10-06 |
Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9
2025-Apr, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446
PMID:40022823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统分析了绵羊感染绵羊肺炎支原体后肺组织的免疫反应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析绵羊肺炎支原体感染后肺组织11种细胞类型的转录组变化,并发现S100A9通过激活ERK信号通路和活性氧爆发促进中性粒细胞清除病原体的新机制 | 研究仅关注28天感染期,未探讨更长期感染效应;体外实验验证需进一步体内实验证实 | 阐明绵羊肺炎支原体感染对宿主肺部免疫系统的损伤机制 | 感染绵羊肺炎支原体的绵羊肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染28天的绵羊肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8208 | 2025-10-06 |
Temporal dynamics of immune cell transcriptomics in brain metastasis progression influenced by gut microbiome dysbiosis
2025-Mar-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115356
PMID:40023843
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研究论文 | 本研究探讨肠道微生物群失调如何通过改变免疫细胞转录组动态影响脑转移进展 | 首次揭示肠道微生物群通过调节单核细胞炎症反应时机和小胶质细胞激活特征来影响脑转移免疫动态 | 研究基于抗生素诱导的肠道菌群失调模型,可能无法完全模拟自然发生的微生物群变化 | 阐明肠道微生物群在脑转移进展过程中对免疫反应动态的调控作用 | 脑转移小鼠模型中的免疫细胞(单核细胞、T细胞、小胶质细胞) | 单细胞转录组学 | 脑转移癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 抗生素处理组和对照组的脑转移小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8209 | 2025-10-06 |
Integrated computational analysis identifies therapeutic targets with dual action in cancer cells and T cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.007
PMID:40023158
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研究论文 | 开发了一种计算靶点发现平台ICRAFT,用于识别同时抑制肿瘤进展和增强抗肿瘤免疫的双重作用靶点 | 整合免疫相关CRISPR筛选数据集、单细胞RNA测序数据和临床试验数据,实现系统水平的治疗靶点发现 | NA | 发现具有双重作用的治疗靶点,既能增强癌细胞对免疫攻击的敏感性,又能促进T细胞活化 | 癌细胞和T细胞 | 计算生物学 | 癌症 | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序, RNA测序 | 计算平台 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8210 | 2025-10-06 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 本研究揭示了脾脏TNF-α信号通路在巨细胞病毒感染期间促进NK细胞从先天免疫向适应性免疫转变的机制 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过经典和非经典NF-κB通路分别调控NK细胞的先天效应功能和适应性分化 | 研究主要聚焦于脾脏环境,其他组织中的类似机制尚未明确 | 探究病毒感染期间NK细胞在不同组织中的活化机制及其向适应性免疫的转变过程 | 自然杀伤细胞在巨细胞病毒感染过程中的动态变化 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8211 | 2025-10-06 |
[Comprehensive analysis of the structural phenotypes and functional characteristics of B cells in oral lichen planus and oral lichenoid lesions through single-cell and spatial transcriptomics]
2025-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学综合分析口腔扁平苔藓和口腔苔藓样病变中B细胞的结构表型和功能特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统揭示OLP/OLL中B细胞表型异质性及其在三级淋巴结构形成中的空间分布特征 | 样本量较小(6例患者+3例对照),B细胞参与的具体功能机制仍需进一步研究 | 揭示B细胞在口腔扁平苔藓及相关苔藓样病变中的免疫调控机制 | 口腔扁平苔藓患者、口腔苔藓样病变患者和健康对照的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | 口腔黏膜疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 无监督聚类, 细胞类型反卷积算法 | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | 2例糜烂型OLP、3例非糜烂型OLP、1例健康对照(单细胞数据);3例OLP/OLL患者、3例健康对照(空间转录组数据) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Visium HD空间转录组技术 |
8212 | 2025-10-06 |
Apolipoprotein E is a marker of all chondrocytes in the growth plate resting zone
2025-Mar-03, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00407-2
PMID:40025030
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现载脂蛋白E是生长板静息区所有软骨细胞的标志物 | 首次发现载脂蛋白E可作为小鼠和人类生长板静息区软骨细胞的全面标志物 | NA | 寻找生长板静息区软骨细胞的全面标志物 | 小鼠和人类生长板软骨细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼发育 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8213 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomic profiling reveals a STING-mediated Type II Interferon signature in SOD1-mutant amyotrophic lateral sclerosis models
2025-Mar-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07790-w
PMID:40025162
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研究论文 | 本研究通过整合转录组分析揭示了SOD1突变型肌萎缩侧索硬化模型中STING介导的II型干扰素特征 | 首次在ALS模型和患者中发现保守的干扰素刺激基因特征,并确定血管内皮细胞是ISGs主要来源,揭示STING-TBK1轴在II型ISGs诱导中的关键作用 | 研究主要基于动物模型和有限的人类样本,需要更大规模的人类队列验证 | 探究SOD1突变型ALS中干扰素信号通路的分子机制 | SOD1突变小鼠模型、人类诱导多能干细胞、ALS患者死后脊髓组织 | 转录组学 | 肌萎缩侧索硬化 | 整合转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型、hiPSCs和人类脊髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8214 | 2025-10-06 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文全面概述了血液系统恶性肿瘤中生物标志物的最新进展及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 整合了从传统形态学标记到先进分子技术(如单细胞RNA测序)的新型免疫血液学生物标志物 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤生物标志物的全面概述及其未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤的生物标志物 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 聚合酶链反应(PCR), 二代测序(NGS), 质谱分析, 单细胞RNA测序 | NA | 分子谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8215 | 2025-10-06 |
Data-Driven Molecular Typing: A New Frontier in Esophageal Cancer Management
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70730
PMID:40018789
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综述 | 本文系统回顾了基于大数据的食管鳞癌分子分型研究现状 | 整合多组学数据识别食管鳞癌的独特分子亚型,为精准治疗提供新方向 | NA | 探讨分子分型在食管鳞癌管理中的应用价值 | 食管鳞状细胞癌(ESCC) | 生物信息学 | 食管癌 | 多组学整合分析,单细胞测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8216 | 2025-10-06 |
The role and mechanism of JAK2 inhibitor in endothelial mesenchymal transition in systemic sclerosis
2025-Mar, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.02.001
PMID:40023747
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研究论文 | 本研究探讨JAK2抑制剂在系统性硬化症内皮间质转化中的作用及分子机制 | 首次揭示JAK2抑制剂通过调控PI3K/Akt/mTOR信号通路抑制系统性硬化症中的内皮间质转化 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行临床试验验证 | 研究JAK2抑制剂对系统性硬化症皮肤内皮间质转化的影响及其分子机制 | C57BL/6小鼠模型和人脐静脉内皮细胞 | 分子生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫荧光,定量RT-PCR,蛋白质印迹 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 野生型雌性C57BL/6小鼠和培养的人脐静脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
8217 | 2025-10-06 |
Glomerular CD68+ macrophages infiltration at initial biopsy predicts response to standard immunosuppression in proliferative lupus nephritis: CD68+ Mø predicts LN treatment response
2025-Mar, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103392
PMID:40024206
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研究论文 | 本研究探讨肾小球CD68+巨噬细胞浸润对增殖性狼疮性肾炎标准免疫抑制治疗反应的预测价值 | 首次发现肾小球CD68+巨噬细胞浸润强度可预测狼疮性肾炎治疗反应,并开发了结合临床参数和浸润评分的智能预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证模型的普适性 | 建立预测增殖性狼疮性肾炎对标准免疫抑制治疗反应的生物标志物和预测模型 | 247例新诊断的增殖性狼疮性肾炎患者 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序,免疫组化分析,机器学习算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据,图像数据,临床数据 | 247例患者(2个独立队列),其中10例接受重复肾活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8218 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the immune microenvironment in bronchoalveolar lavage fluid of checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2025-Mar-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03983-8
PMID:40024929
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析检查点抑制剂相关肺炎患者支气管肺泡灌洗液的免疫微环境 | 首次在严重CIP患者中发现并定义了异常基底样细胞群,揭示了其通过SOX9上调及CXCL3/5-CXCR2通路招募中性粒细胞的机制 | 样本量较小(11例患者),需要更大规模研究验证发现 | 阐明不同严重程度检查点抑制剂相关肺炎的免疫微环境特征和发病机制 | 检查点抑制剂相关肺炎患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞生物学 | 检查点抑制剂相关肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者,共121,409个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8219 | 2025-10-06 |
Chenodeoxycholic acid modulates cholestatic niche through FXR/Myc/P-selectin axis in liver endothelial cells
2025-Mar-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57351-2
PMID:40025016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现肝内皮细胞在胆汁淤积中通过FXR/Myc/P-选择素轴驱动中性粒细胞浸润和肝损伤 | 首次揭示鹅去氧胆酸通过FXR/Myc/P-选择素轴调控肝内皮细胞在胆汁淤积中的作用机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究肝内皮细胞在胆汁淤积性肝病中的作用机制 | 小鼠模型和胆汁淤积患者肝样本 | 单细胞生物学 | 胆汁淤积性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种肝损伤小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8220 | 2025-10-06 |
Unraveling the role of neuregulin-mediated astrocytes-OPCs axis in the pathogenesis of age-related macular degeneration and Parkinson's disease
2025-Mar-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92103-8
PMID:40025106
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和计算分析,探索了年龄相关性黄斑变性和帕金森病的共同分子机制 | 揭示了神经调节蛋白介导的星形胶质细胞-少突胶质前体细胞信号轴在两种疾病发病机制中的作用 | 研究主要基于计算预测和相关性分析,需要进一步实验验证 | 探索年龄相关性黄斑变性和帕金森病的共同分子和病理机制 | 干性年龄相关性黄斑变性视网膜和帕金森病脑组织 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性,帕金森病 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,基因集富集分析,细胞间通讯分析 | WGCNA,GSEA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |