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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8181 | 2025-10-06 | A single-cell and spatially resolved atlas of human osteosarcomas 
          2024-08-20, Journal of hematology & oncology
          
          IF:29.5Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13045-024-01598-7
          PMID:39164791
         | 研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析构建人类骨肉瘤的细胞图谱 | 首次提供人类骨肉瘤的单细胞和空间分辨率转录组图谱,揭示化疗耐药相关空间生态位 | 未明确说明样本规模和临床随访数据 | 解析骨肉瘤的细胞组成和组织结构 | 人类骨肉瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | 细胞元图谱构建 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8182 | 2025-10-06 | Type I interferons induce an epigenetically distinct memory B cell subset in chronic viral infection 
          2024-05-14, Immunity
          
          IF:25.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.immuni.2024.03.016
          PMID:38593796
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了慢性病毒感染中I型干扰素诱导形成表观遗传特征独特的记忆B细胞亚群 | 首次发现慢性病毒感染中存在富含干扰素刺激基因的独特记忆B细胞亚群,并证明早期干扰素受体阻断可改变其表观遗传特征 | 感染4周后记忆B细胞对干预措施产生抵抗,限制了治疗时间窗口 | 探究慢性病毒感染中记忆B细胞发育异常的机制及可逆性 | 急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型中的记忆B细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8183 | 2025-10-06 | Protocol to analyze immune cells in the tumor microenvironment by transcriptome using machine learning 
          2024-03-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102684
          PMID:38219153
         | 研究论文 | 提出一种基于机器学习的肿瘤微环境免疫细胞转录组分析方案 | 整合单细胞RNA测序与机器学习方法,系统分析肿瘤微环境中免疫细胞的表型变化、分化轨迹和浸润过程 | NA | 开发肿瘤微环境免疫细胞分析流程,识别潜在药物靶点 | 肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是单核吞噬细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 批量RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA | 
| 8184 | 2025-10-06 | Transcription factor NFYa controls cardiomyocyte metabolism and proliferation during mouse fetal heart development 
          2023-12-18, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.012
          PMID:37972593
         | 研究论文 | 本研究揭示了转录因子NFYa在小鼠胎儿心脏发育过程中协调心肌细胞代谢与增殖的关键作用 | 首次发现NFYa通过与辅助因子SP2相互作用,在转录水平激活连接代谢与增殖的基因,揭示了一种先前未被认识的心脏代谢转录调控机制 | 研究仅限于小鼠胎儿心脏发育阶段,未涉及成年期心脏再生过程 | 探究转录因子NFYa在协调心肌细胞代谢与增殖过程中的分子机制 | 小鼠胎儿心脏发育过程中的心肌细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 空间转录组分析,单细胞转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠胎儿心脏组织 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8185 | 2025-10-06 | Protocol for isolation of signet ring cells from human gastric mucosa 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102695
          PMID:37925632
         | 研究论文 | 本文介绍了一种从人胃黏膜中分离印戒细胞的高活性悬浮方案 | 开发了专门针对胃黏膜印戒细胞的高活性分离方案,并支持多种下游应用 | NA | 建立标准化的印戒细胞分离技术流程 | 人胃黏膜组织中的印戒细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 组织解离、免疫组织化学染色、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 8186 | 2025-10-06 | Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
          PMID:37742175
         | 研究论文 | 提出一种将多只小鼠脑组织切片整合到单个空间转录组学载玻片上的实验方案 | 开发了将不同小鼠海马体冷冻切片合并成单个冷冻块的方法,可在单个捕获区域分析多个样本 | NA | 提高空间转录组学分析的样本通量和成本效益 | 小鼠海马体脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多只小鼠脑组织切片 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8187 | 2025-10-06 | Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
          PMID:37925636
         | 研究论文 | 本文提出了一种从全层人肠道组织切除样本中分离单细胞的实验方案 | 开发了针对全层肠道组织的单细胞分离标准化流程,包括固有层和肌层的分离处理 | NA | 建立肠道组织单细胞分离的实验方法 | 人全层肠道组织切除样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium平台 | 
| 8188 | 2025-10-06 | Protocol for multispectral imaging on cryosections to map myeloid cell heterogeneity in its spatial context 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102601
          PMID:37742177
         | 研究论文 | 本文提出了一种用于在组织冰冻切片上进行多光谱成像以绘制髓系细胞异质性的实验方案 | 开发了在原位通过多光谱成像技术保留细胞空间背景来研究髓系细胞异质性的方法 | NA | 建立一种能够在空间背景下分析髓系细胞异质性的成像方案 | 组织冰冻切片中的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像 | NA | 图像 | NA | NA | 多光谱成像 | NA | NA | 
| 8189 | 2025-10-06 | Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
          PMID:37756156
         | 研究论文 | 本文介绍了一种建立PPP1R15A抑制小鼠模型并利用单细胞技术分析B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫反应的实验方案 | 开发了结合PPP1R15A抑制剂Sephin1处理与单细胞转录组和TCR测序的整合分析流程 | NA | 探索PPP1R15A抑制剂对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 小鼠B16F1皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8190 | 2025-10-06 | Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
          PMID:37910511
         | 研究论文 | 介绍从人类胰腺癌组织中分离单细胞并通过流式细胞术分析主要免疫细胞群的实验方案 | 提供标准化的胰腺癌组织免疫细胞分离和分析流程 | NA | 建立胰腺癌组织免疫细胞分离和分析的实验方案 | 人类胰腺癌组织中的免疫细胞 | NA | 胰腺癌 | 流式细胞术 | NA | 细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8191 | 2025-10-06 | TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
          PMID:38019649
         | 研究论文 | 介绍TimiGP R软件包,用于从批量转录组数据推断肿瘤微环境中免疫细胞间的相互作用及其与患者预后的关联 | 开发基于基因对的肿瘤免疫微环境分析方法,能够从批量基因表达数据推断细胞间相互作用 | NA | 开发分析肿瘤微环境中免疫细胞相互作用及其临床意义的计算工具 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,批量转录组测序 | NA | 基因表达数据,生存数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 8192 | 2025-10-06 | Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses 
          2023-12-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
          PMID:38043054
         | 研究论文 | 本文介绍了一种适用于成年秀丽隐杆线虫的单核RNA测序实验方案 | 开发了针对成年秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方案,克服了单细胞RNA测序在该模型生物中遇到的困难 | NA | 建立适用于秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方法,用于研究环境刺激响应 | 成年秀丽隐杆线虫 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA | 
| 8193 | 2025-10-06 | Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal 
          2023-12-04, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.004
          PMID:37909044
         | 研究论文 | 本研究揭示了小鼠肝外胆管中异质性胆管周围腺体通过分区化机制协调上皮更新的细胞层次结构 | 首次通过无标记和靶向克隆命运图谱证明肝外胆管存在分区化更新机制,不同位置的胆管细胞承担不同的更新功能 | 研究仅限于小鼠模型,人类胆管系统可能存在差异 | 探索肝外胆管上皮稳态更新的细胞身份和多重性机制 | 小鼠肝外胆管及其周围腺体 | 单细胞生物学 | 胆道疾病 | 单细胞测序, 克隆命运图谱, 轨迹分析 | NA | 单细胞基因表达数据, 命运图谱数据 | 小鼠胆管组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8194 | 2025-10-06 | Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages 
          2023-11-20, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011
          PMID:37875117
         | 研究论文 | 本研究揭示了α-1肾上腺素能信号通过调控巨噬细胞表型分化激活细胞外基质重塑转录程序,从而驱动斑马鱼心脏再生的机制 | 首次发现α-1肾上腺素能受体通过调控巨噬细胞表型分化激活细胞外基质重塑程序,并阐明其通过midkine介导的旁分泌信号激活胶原-12表达成纤维细胞的分子机制 | 研究仅限于斑马鱼模型,尚未在哺乳动物系统中验证 | 探究肾上腺素能信号在心脏修复过程中调控免疫反应和再生能力的分子机制 | 斑马鱼心脏再生模型中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,药理学干预,遗传操作 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8195 | 2025-10-06 | The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on Clinical Manifestation, Immune Response, and Viral Dynamics in SARS-CoV-2 Coinfection 
          2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2023.11.15.567132
          PMID:38014096
         | 研究论文 | 本研究探讨SIV诱导的免疫缺陷对SARS-CoV-2共感染的临床表现、免疫反应和病毒动态的影响 | 首次在受控环境中直接研究慢性SIV感染导致的免疫缺陷对COVID-19疾病和病毒持续性的影响 | 样本量较小(仅2只猪尾猕猴),属于初步研究 | 评估免疫缺陷状态下SARS-CoV-2共感染的临床和病毒学特征 | 慢性感染SIVmac239的猪尾猕猴 | 传染病学 | HIV/AIDS, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 2只SIV感染的猪尾猕猴,与先前发表的SIV未感染队列比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8196 | 2025-10-06 | Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9 
          2025-May-05, Chinese medical journal
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
          PMID:38945689
         | 研究论文 | 本研究揭示了迷走神经通过调控巨噬细胞产生CXCL9参与慢加急性肝衰竭发展的神经免疫通讯机制 | 首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯在ACLF发展中的关键作用 | 动物模型与人类疾病存在差异,临床转化需要进一步验证 | 探索ACLF发病机制中的关键分子及迷走神经与免疫紊乱的神经免疫通讯 | ACLF模型小鼠和ACLF患者 | 免疫学 | 肝病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光,CRISPR/Cas9技术 | 动物模型 | 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据,病理图像 | ACLF模型小鼠和ACLF患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | NA | 
| 8197 | 2025-05-15 | MS4A7 based metabolic gene signature as a prognostic predictor in lung adenocarcinoma 
          2025, Frontiers in molecular biosciences
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.3389/fmolb.2025.1591446
          PMID:40356720
         | 研究论文 | 本研究探讨了MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境动态中的作用,并开发了一个基于代谢基因的预后预测模型 | 首次将MS4A7基因与肺腺癌的预后和免疫微环境动态联系起来,并开发了一个高预测准确性的预后模型 | 研究依赖于TCGA数据库的RNA-seq数据,可能无法完全代表所有肺腺癌患者的异质性 | 探索MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 肺腺癌患者和MS4A7基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA-seq数据 | 500名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA | 
| 8198 | 2025-05-15 | Single-cell transcriptomics and functional validation revealed PLEKHA5-L as a promoter of growth and migration in brain metastatic melanoma cells 
          2025, Frontiers in oncology
          
          IF:3.5Q2
          
         
          DOI:10.3389/fonc.2025.1560954
          PMID:40356756
         | 研究论文 | 通过单细胞转录组学和功能验证揭示了PLEKHA5-L作为促进脑转移黑色素瘤细胞生长和迁移的分子 | 首次在单细胞水平上发现PLEKHA5在脑转移黑色素瘤中的表达增加,并验证了PLEKHA5-L通过上调HRAS、AKT3等癌基因促进黑色素瘤的迁移和增殖 | 样本量较小(7个黑色素瘤样本),且仅在动物模型中验证了PLEKHA5的表达 | 研究促进黑色素瘤脑转移的分子机制,寻找潜在的治疗靶点 | 黑色素瘤细胞,特别是脑转移的黑色素瘤细胞 | 癌症研究 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,RNA干扰,慢病毒载体过表达,CCK8测试,集落形成测试,transwell小室实验,RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 7个黑色素瘤样本(4个原发,3个脑转移) | NA | NA | NA | NA | 
| 8199 | 2025-05-15 | An immune cell activation signature reflected hepatocellular carcinoma heterogeneity and predicted clinical outcomes 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1534611
          PMID:40356904
         | 研究论文 | 本研究开发了一个六基因特征,用于预测肝细胞癌(HCC)患者的预后,并探讨了候选基因RORC在HCC进展中的作用 | 开发了一个新的六基因特征,能够有效预测HCC患者的预后,并揭示了候选基因RORC在HCC进展中的调控机制及其与多药耐药性的关联 | 研究依赖于公共数据集进行验证,可能受到数据质量和样本量的限制 | 识别可靠的免疫激活相关预后标志物,以预测HCC患者的临床结果 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 基因表达分析、单细胞测序、免疫组化(IHC) | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组化数据 | 三个独立的GEO数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA | 
| 8200 | 2025-05-15 | Identification of B cell antigens in solid cancer: initial insights and functional implications 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1571570
          PMID:40356924
         | review | 本文综述了B细胞在实体癌中的抗原识别及其功能意义 | 强调了B细胞抗原在癌症免疫反应中的重要性,并利用单细胞测序技术进行抗原特异性研究 | NA | 探索B细胞在癌症中的抗原识别及其功能 | B细胞抗原 | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序、重组单克隆抗体生产、癌症结合筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |