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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8181 | 2025-10-06 |
The Low Tumorigenic Risk and Subtypes of Cardiomyocytes Derived from Human-induced Pluripotent Stem Cells
2025, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究评估了人诱导多能干细胞来源心肌细胞的肿瘤形成风险和亚型组成 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子组测序系统评估hiPSC-CMs的肿瘤风险并解析其细胞亚型组成 | 研究仅在NOD-SCID小鼠模型中进行了3个月的肿瘤形成观察,缺乏更长期的随访数据 | 评估hiPSC-CMs的肿瘤形成风险并鉴定其细胞亚型组成 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,全外显子组测序,流式细胞术,电生理学 | NA | 基因表达数据,基因组数据,细胞表型数据 | 分化第25天的hiPSC-CMs | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
8182 | 2025-10-06 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-12, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示干燥综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次发现干燥综合征与复发性流产共享KCNN3枢纽基因及相关生物学通路 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索干燥综合征与复发性流产之间的基因相关性 | 干燥综合征和复发性流产的基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病与生殖疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), limma分析, 单细胞RNA测序 | ceRNA网络 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的干燥综合征和复发性流产样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
8183 | 2025-10-06 |
Understanding the development of enzalutamide resistance based on a functional single-cell approach
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619319
PMID:39484437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的机制 | 首次在单细胞水平揭示AR低表达细胞亚群是恩杂鲁胺耐药的前体细胞 | 研究基于LNCaP细胞系,需要在更多模型和临床样本中验证 | 探索前列腺癌恩杂鲁胺耐药机制并寻找潜在治疗策略 | LNCaP前列腺癌细胞系 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LNCaP细胞系单细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8184 | 2025-10-06 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次证明SUV39H1通过调控染色质可及性和干细胞特性在胶质母细胞瘤干细胞维持中发挥关键作用 | 研究主要基于患者来源的肿瘤干细胞和异种移植模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤干细胞维持的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本和正常脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8185 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
DOI:10.1186/s13014-024-02472-z
PMID:38926892
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了辐射后皮肤中成纤维细胞亚群的变化和小窝蛋白表达变异 | 首次在辐射诱导纤维化中识别出成纤维细胞亚群的转录特征差异,并发现Cav1和Cav2的拮抗表达模式 | 样本量较小(仅6例患者),且仅针对女性乳腺癌患者 | 探索辐射诱导皮肤纤维化的细胞机制 | 接受放射治疗的乳腺癌患者的配对辐照和非辐照皮肤样本 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,生物力学测试 | Seurat聚类分析,SingleR分类器 | 单细胞转录组数据,组织学图像,生物力学数据 | 6例女性患者的配对皮肤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞平台 |
8186 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory Role of the Stem Cell Circadian Clock in Muscle Repair
2024-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.24.595728
PMID:38854114
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研究论文 | 本研究揭示了肌肉干细胞生物钟通过调控NAD+代谢节律影响免疫微环境的时间依赖性机制 | 首次发现肌肉干细胞生物钟通过NAD+代谢节律调控中性粒细胞活化的时间依赖性免疫反应 | 未明确说明样本规模和实验模型的具体细节 | 探究生物钟调控肌肉干细胞与免疫微环境互作的分子机制 | 肌肉干细胞和再生肌肉微环境中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肌肉再生障碍 | 单核单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8187 | 2025-10-06 |
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.003
PMID:38224933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析文昌鱼脊索细胞的组成和功能特性 | 首次在单细胞水平揭示文昌鱼脊索细胞的基因表达特征,发现脊索特异性肌原纤维基因和不同类型Müller细胞的功能分化 | 未涉及其他脊索动物物种的比较分析,样本来源相对单一 | 解析脊索细胞的组成特性和功能分化 | 文昌鱼脊索细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Iso-seq分析, 原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8188 | 2025-10-06 |
Neutrophils facilitate the epicardial regenerative response after zebrafish heart injury
2024-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.01.011
PMID:38286185
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在斑马鱼心脏损伤后通过激活FGF和MAPK/ERK信号通路促进心外膜再生反应的新机制 | 首次发现中性粒细胞作为早期响应细胞通过分泌hbegfa配体协同FGF和MAPK/ERK信号通路激活心外膜细胞增殖和扩张 | 研究仅限于斑马鱼模型,未在哺乳动物系统中验证 | 探究中性粒细胞在斑马鱼心脏再生早期事件中的功能和作用机制 | 斑马鱼心脏损伤模型中的中性粒细胞和心外膜细胞 | 发育生物学 | 心脏损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1天心脏损伤后的中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8189 | 2025-10-06 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-Dec, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
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研究论文 | 本研究通过整合肿瘤全基因组测序和微环境单细胞RNA测序,揭示了基因组特征和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗临床结局的预测价值 | 首次系统揭示了APOBEC突变活性、IKZF3和RPL5缺失等基因组驱动因素与免疫微环境特征在预测多发性骨髓瘤免疫治疗反应中的复杂相互作用 | 样本来源于单中心二期临床试验,需要更大规模的多中心研究验证 | 探索影响新诊断多发性骨髓瘤患者接受含达雷妥尤单抗免疫治疗方案临床结局的预测因素 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 基因组学与免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 二期临床试验患者队列 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8190 | 2025-10-06 |
Epigenomic landscape exhibits interferon signaling suppression in the patient of myocarditis after BNT162b2 vaccination
2023-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36070-y
PMID:37264110
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研究论文 | 通过表观基因组分析揭示BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者外周血单核细胞中干扰素信号通路抑制现象 | 首次追踪BNT162b2疫苗接种后心肌炎患者外周血单核细胞的染色质动态变化 | 研究样本量有限,仅为单例患者分析 | 探究BNT162b2疫苗接种后心肌炎副作用的免疫学机制 | BNT162b2疫苗接种后发生心肌炎患者的外周血单核细胞 | 表观基因组学 | 心肌炎 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | 纵向研究 | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 1例心肌炎患者 | 10x Genomics | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞染色质可及性测序与单细胞RNA测序并行分析 |
8191 | 2025-10-06 |
Comprehensive profiling of cell type-specific expression and distribution of complement genes in mouse and human kidneys: insights into normal physiology and response to kidney transplantations
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2471568
PMID:40015727
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面分析了小鼠和人类肾脏中补体基因的细胞类型特异性表达模式 | 首次在肾脏细胞景观演变背景下系统分析补体基因表达,比较了正常与移植排斥肾脏的差异 | 研究主要基于现有数据库的二次分析,缺乏实验验证 | 探究肾脏中补体基因的表达分布及其在肾脏移植排斥反应中的变化 | 健康人类受试者、C57BL/6小鼠和肾脏移植排斥小鼠 | 单细胞转录组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 基因表达数据 | 来自NCBI GEO数据库的健康人类、正常小鼠和移植排斥小鼠肾脏单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8192 | 2025-10-06 |
Immunogenic cuproptosis in cancer immunotherapy via an in situ cuproptosis-inducing system
2025-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究通过构建铜死亡诱导系统,探索铜死亡在结直肠癌免疫治疗中的免疫原性作用机制 | 首次系统评估12种细胞死亡模式的免疫原性,发现铜死亡与免疫原性细胞死亡和免疫应答的强相关性,并开发了原位铜死亡诱导系统 | 研究主要聚焦于结直肠癌,在其他癌种中的适用性需要进一步验证 | 探索铜死亡在癌症免疫治疗中的作用机制并开发新型治疗策略 | 结直肠癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 癌症免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,体外和体内实验 | NA | 基因表达数据,实验数据 | 内部队列和独立队列的多组样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
8193 | 2025-05-12 |
The MYC/TXNIP axis mediates NCL-Suppressed CD8+T cell immune response in lung adenocarcinoma
2025-May-09, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01224-3
PMID:40346484
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研究论文 | 本研究探讨了核仁蛋白NCL通过MYC/TXNIP轴调节CD8+T细胞的葡萄糖代谢和免疫功能,从而影响肺腺癌的免疫逃逸 | 揭示了NCL通过MYC/TXNIP轴调控CD8+T细胞葡萄糖代谢的新机制 | 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究NCL在T细胞葡萄糖代谢和肺腺癌免疫逃逸中的作用 | CD8+T细胞和肺腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、原位移植小鼠模型 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 来自GEO和TCGA的数据库数据,以及体外和小鼠实验样本 | NA | NA | NA | NA |
8194 | 2025-05-12 |
Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies circadian rhythm disruption and cluster-specific clinical insights in colorectal tumorigenesis
2025-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02521-3
PMID:40338428
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research paper | 该研究通过单细胞和批量转录组测序,探讨了结直肠癌(CRC)中昼夜节律(CR)的失调,并构建了CR亚型分类器,分析了不同CR簇的预后意义、肿瘤微环境状态及对免疫检查点阻断(ICB)治疗的反应 | 首次在CRC中构建了CR亚型分类器和CR评分系统(CRS),揭示了CR基因与CRC预后之间的潜在联系,并识别了影响CRC预后的潜在靶基因 | 研究样本量有限,且未进行实验验证CR基因与CRC预后的直接因果关系 | 探讨昼夜节律失调在结直肠癌发生发展中的作用,并开发基于CR相关基因的预后模型 | 结直肠癌患者及其肿瘤组织 | digital pathology | colorectal cancer | bulk and single-cell RNA sequencing | machine learning | RNA-seq data | 未明确提及具体样本数量,但涉及CRC患者和正常组织的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
8195 | 2025-05-12 |
Isoform-resolution single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional panorama of adult Baoshan pig testis cells
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11636-4
PMID:40340725
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研究论文 | 本研究通过整合长读长(Nanopore)和短读长(Illumina)单细胞RNA测序技术,对保山猪睾丸细胞进行了转录组分析,揭示了睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 首次在保山猪睾丸中应用长读长和短读长单细胞RNA测序技术,全面解析了睾丸细胞的转录组特征和精子发生的动态过程 | 研究仅针对保山猪睾丸细胞,结果可能不适用于其他物种或猪的其他品种 | 解析猪睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 保山猪睾丸细胞 | 生殖生物学 | NA | Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 11,520个单细胞和23,402个基因 | NA | NA | NA | NA |
8196 | 2025-05-12 |
Single-cell multi-omics delineates the dynamics of distinct epigenetic codes coordinating mouse gastrulation
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11619-5
PMID:40340740
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术描绘了小鼠原肠胚形成过程中不同表观遗传代码的动态变化 | 整合scRNA-seq和单细胞ChIP-seq分析揭示了增强子激活与基因表达之间的'时间滞后'过渡模式,并构建了以关键转录因子为中心的基因调控网络 | 研究仅关注H3K27ac和H3K4me1两种组蛋白修饰,可能忽略了其他重要的表观遗传调控机制 | 阐明表观遗传重编程在小鼠原肠胚形成过程中的分子协调机制 | 小鼠胚胎 | 表观遗传学 | 先天性疾病 | 单细胞ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 表观遗传组数据, 转录组数据 | 六个连续时间点收集的小鼠胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
8197 | 2025-05-12 |
Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer
2025-May-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01237-y
PMID:40340806
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研究论文 | 通过转录组和基因组数据分析乳腺癌中细胞外基质(ECM)的组成模式及其生物学功能,并探索其对免疫治疗的影响 | 首次识别了乳腺癌中三种不同的ECM簇,并发现ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞通过不同信号通路调控B细胞谱系,为免疫治疗提供了新的生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中ECM的组成模式及其在肿瘤微环境中的作用,以及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、机器学习 | 非负矩阵分解(NMF)、加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 转录组数据、基因组数据 | TCGA数据库中的乳腺癌患者数据,以及10个独立公共队列(共6,736例样本) | NA | NA | NA | NA |
8198 | 2025-05-12 |
Identification of the "Collagen-Macrophage" sub-category of patients with colorectal cancer as an extension of the CMS4 subtype with THBS2 as a therapeutic target
2025-May-08, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03918-8
PMID:40340827
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research paper | 该研究通过整合结肠癌转录组和单细胞转录组数据集,识别出一类富含'胶原蛋白-TAMs'的结直肠癌患者亚群,称为CM类,并发现CAF衍生的THBS2可作为潜在生物标志物 | 提出了一种新的结直肠癌患者分类系统CM类,作为传统CMS分类系统的扩展,并发现THBS2作为新的潜在免疫治疗联合靶点 | 未提及研究样本的具体数量或研究人群的详细信息 | 提高结直肠癌的分类准确性和治疗效果 | 结直肠癌患者及其肿瘤微环境 | digital pathology | colorectal cancer | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
8199 | 2025-05-12 |
High-throughput strategies for monoclonal antibody screening: advances and challenges
2025-May-08, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00513-z
PMID:40340930
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综述 | 本文综述了高通量单克隆抗体筛选策略的最新进展与挑战 | 介绍了抗体库展示、单B细胞抗体技术和单细胞测序等新技术,显著降低了成本并提高了抗体开发效率 | 未具体讨论这些新技术在实际应用中可能遇到的具体技术障碍或限制条件 | 探讨高通量抗体开发的最新进展及其相对于传统方法的潜在优势 | 单克隆抗体的高通量筛选技术 | 生物医学工程 | NA | 抗体库展示、单B细胞抗体技术、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
8200 | 2025-05-12 |
The cancer stem cells characteristics analysis of LGR5 + cells that influence lung cancer risk by using single cell RNA-seq analysis
2025-May-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00585-3
PMID:40341189
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析LGR5+细胞的癌症干细胞特性,研究其对肺癌风险的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别LGR5+干细胞在肺腺癌进展中的关键作用,并发现其hub基因如HLA-DPB1、CD74、CTSH和HLA-DRB5介导独特的转录状态 | 研究仅基于公开数据库GSE149655的数据,实验验证部分仅使用了BEAS-2B和A549细胞系,可能无法完全代表临床样本的复杂性 | 探索肺腺癌中癌症干细胞的特性及其在癌症进展中的作用 | 肺腺癌(LUAD)中的LGR5+干细胞 | digital pathology | lung cancer | single cell RNA-seq, qRT-PCR, western blotting, wound healing, trans-well assays, EdU tests, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE149655数据集中的单细胞RNA-seq数据,以及BEAS-2B和A549细胞系 | NA | NA | NA | NA |