单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8181 - 8200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 8181 | 2025-10-06 |
Unveiling the key mechanisms of FOLR2+ macrophage-mediated antitumor immunity in breast cancer using integrated single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2025-Mar-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-01980-4
PMID:40045365
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序技术，揭示了FOLR2+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴激活CD8 T细胞在乳腺癌抗肿瘤免疫中的关键作用机制 | 首次系统阐明FOLR2+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴调控CD8 T细胞功能的抗肿瘤免疫机制 | NA | 深入研究FOLR2+巨噬细胞在乳腺癌中的免疫学功能和机制 | 乳腺癌患者肿瘤组织中的FOLR2+巨噬细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,体内实验,体外实验 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8182 | 2025-10-06 |
ENACT: End-to-End Analysis of Visium High Definition (HD) Data
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf094
PMID:40053700
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研究论文 | 开发了ENACT端到端分析流程，用于处理Visium高清晰度空间转录组数据 | 整合先进细胞分割技术与Visium HD转录组数据，提出新型bin-to-cell分配方法，提高单细胞转录本估计准确性 | 未在论文摘要中明确说明 | 解决空间转录组数据分析中转录本准确映射到细胞和细胞类型分配的挑战 | 组织切片中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 数十万个细胞的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium High Definition技术 |
| 8183 | 2025-10-06 |
STING Deficiency Promotes Th17-Like Tfh to Aggravate the Experimental Autoimmune Uveitis
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.8
PMID:40042874
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研究论文 | 本研究探讨STING信号通路通过调控Th17样T滤泡辅助细胞在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的致病机制 | 首次揭示STING缺陷通过促进Th17样Tfh细胞分化加重葡萄膜炎的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究STING信号在实验性自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 小鼠模型中的T滤泡辅助细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8184 | 2025-10-06 |
Single-Cell Multiomics Analysis of Early Wound Response Programs in the Mouse Corneal Epithelium
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.9
PMID:40042873
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了小鼠角膜上皮早期伤口反应的转录组和表观遗传变化 | 首次在单细胞水平同时分析角膜上皮伤口反应的转录组（RNA-seq）和染色质可及性（ATAC-seq）变化 | 仅关注早期伤口反应阶段，且仅在小鼠模型中进行研究 | 阐明角膜上皮早期伤口反应的基因调控程序 | 小鼠角膜上皮细胞 | 单细胞多组学 | 角膜伤口愈合 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色, 实时定量PCR | Seurat, ArchR, Monocle 2, CellChat, pySCENIC | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确样本数量，使用已发表数据集和新的伤口模型数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8185 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis to Reveal Heterogeneity of Tumor-Associated Neutrophils in Glioma
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70745
PMID:40052358
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研究论文 | 本研究通过整合分析揭示胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性，并开发预后模型 | 首次系统揭示胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性，构建基于7个基因的预后风险评分模型 | 研究基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性验证 | 研究胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其在预后评估中的作用 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | 风险评分模型, WGCNA, 共识聚类 | 基因表达数据, 临床数据, 实验数据 | 四个独立数据集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8186 | 2025-10-06 |
Prognostic and Therapeutic Significance of Cancer-Associated Fibroblasts Genes in Osteosarcoma Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70424
PMID:40045162
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研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据构建骨肉瘤中癌症相关成纤维细胞基因的风险特征模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据系统分析骨肉瘤中CAF相关基因，构建了11基因预后特征模型 | 样本量有限（仅6例单细胞数据），需要更大规模验证 | 开发更准确的骨肉瘤预后预测模型并指导治疗策略 | 骨肉瘤患者和肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | COX回归, Lasso回归 | 基因表达数据 | 6例OS患者的46,544个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8187 | 2025-10-06 |
[Efficacy and mechanism of Guizhi Tongluo Tablets in alleviating atherosclerosis by inhibiting CD72hi macrophages]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究探讨桂枝通络片通过抑制CD72hi巨噬细胞缓解动脉粥样硬化的疗效与机制 | 首次揭示桂枝通络片通过靶向CD72hi巨噬细胞缓解动脉粥样硬化的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类临床试验 | 探究桂枝通络片治疗动脉粥样硬化的效果及其作用机制 | ApoE敲除小鼠和C57BL/6J对照小鼠 | 病理机制研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附测定,实时荧光定量PCR,免疫荧光,TUNEL染色 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织染色图像,血清生化指标 | ApoE敲除小鼠分组：模型组、高/中/低剂量桂枝通络片组、阿托伐他汀组，及C57BL/6J对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8188 | 2025-10-06 |
Structure and Function Relationships of Mucociliary Clearance in Human and Rat Airways
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.572054
PMID:38187619
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研究论文 | 本研究通过比较人类和雌性大鼠气道结构与功能差异，揭示了人类气道黏液纤毛清除效率更高的机制 | 首次系统比较人类与雌性大鼠气道细胞分布和纤毛运动的物种特异性差异，建立了评估人类气道功能的通用基准 | 研究主要基于雌性大鼠与人类比较，缺乏其他动物模型的对照数据 | 探究气道结构对黏液纤毛清除功能的影响机制 | 人类和雌性大鼠的气道组织 | 呼吸系统研究 | 慢性阻塞性肺疾病, 哮喘 | 单细胞转录组学, 物理建模 | 物理模型 | 实验数据, 模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8189 | 2025-10-06 |
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和组成成分 | 通过单细胞测序技术揭示了肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式 | 传统抗纤维化治疗的局限性 | 探讨肝巨噬细胞在肝纤维化中的作用机制和治疗靶点 | 肝巨噬细胞 | 病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8190 | 2025-10-06 |
[Characterization of protective effects of Jianpi Tongluo Formula on cartilage in knee osteoarthritis from a single cell-spatial heterogeneity perspective]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和空间转录组学技术，系统表征健脾通络方对膝骨关节炎软骨的保护作用及分子机制 | 首次从单细胞-空间异质性角度揭示膝骨关节炎软骨组织的异质特征和动态变化，发现NCOA4和HMGB1在调节软骨细胞自噬和炎症反应中的关键作用 | 研究主要基于动物模型验证，临床转化仍需进一步验证 | 阐明健脾通络方对膝骨关节炎软骨保护作用的分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨组织和KOA大鼠模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 实时定量PCR, Western blot, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 使用公共数据集GSE254844和GSE255460，建立KOA大鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8191 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq data have prevalent blood contamination but can be rescued by Originator, a computational tool separating single-cell RNA-Seq by genetic and contextual information
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588144
PMID:38617220
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研究论文 | 开发了一种名为Originator的计算工具，用于识别和分离单细胞RNA测序数据中的血液污染细胞 | 提出首个结合遗传信息和背景信息来分离单细胞RNA测序数据中血液污染细胞的计算框架 | 未提及方法在特定组织类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中普遍存在的血液污染问题 | 人类复杂组织中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多种人工混合和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8192 | 2025-10-06 |
Polymorphisms in immunosuppression-related genes are associated with AML
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530510
PMID:39975548
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研究论文 | 本研究通过检测免疫抑制相关基因的多态性，分析其与急性髓系白血病易感性、治疗反应和预后的关联 | 首次系统研究五个免疫抑制相关基因(CIITA、CD200、CD163、MRC1和LILRB4)中九个SNP与AML的关联 | 样本量相对有限(307例患者和316例对照)，仅检测了特定基因的SNP | 探讨免疫抑制相关基因多态性在AML发病机制和治疗预后中的作用 | 307例AML患者和316例健康对照个体 | 生物医学研究 | 急性髓系白血病 | SNP基因分型、单细胞转录组学 | NA | DNA样本、基因分型数据 | 307例AML患者和316例健康对照 | Agena Bioscience | SNP基因分型 | MassARRAY | MassARRAY平台 |
| 8193 | 2025-10-06 |
Unveiling macrophage dynamics and efferocytosis-related targets in diabetic kidney disease: insights from single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521554
PMID:40046045
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研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示糖尿病肾病中巨噬细胞动态变化及胞葬作用相关靶点 | 首次系统阐明糖尿病肾病中巨噬细胞亚型动态转变过程，并识别出CD36、ITGAM和CX3CR1三个关键胞葬作用调控基因 | 研究主要基于早期糖尿病肾病样本，晚期疾病阶段的验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中巨噬细胞异质性、表型动态变化及胞葬作用关键靶点 | 糖尿病肾病患者的免疫细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 伪时间轨迹分析 | 差异表达基因分析 | RNA测序数据 | 早期人类糖尿病肾病测序数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | CD45富集的免疫细胞单细胞RNA测序，NephroseqV5平台临床数据分析 |
| 8194 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics in islet transplantation for diabetes treatment: advancing towards personalized therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1554876
PMID:40051625
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在胰岛移植治疗糖尿病中的应用及其推动个性化治疗的潜力 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面揭示胰岛移植中的细胞多样性、功能状态及组织微环境相互作用 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有研究综述，且未详细讨论技术实施中的具体操作挑战 | 探索先进组学技术如何提升胰岛移植疗效并推动糖尿病个性化治疗发展 | 胰岛移植过程中的细胞类型、基因表达特征及组织微环境 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8195 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for hepatocellular carcinoma based on microvascular invasion characteristic genes by spatial transcriptomics sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529569
PMID:40051627
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研究论文 | 本研究通过空间转录组测序开发了基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次利用空间转录组测序技术筛选MVI区域特异性基因，构建了7基因预后模型并在多个外部验证队列中证实其优越性 | 仅使用4个不同分级的MVI样本进行空间转录组测序，样本量有限 | 开发基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 肝细胞癌患者和微血管入侵样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机生存森林 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 图像数据 | 4个不同分级的MVI样本用于空间转录组测序，三个外部验证队列 | NA | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 8196 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment-driven resistance to immunotherapy in non-small cell lung cancer: strategies for Cold-to-Hot tumor transformation
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2025.14
PMID:40342732
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌肿瘤微环境驱动的免疫治疗耐药机制及冷肿瘤向热肿瘤转化的策略 | 提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的多维框架，整合了新兴机制如中性粒细胞胞外诱捕网、三级淋巴结构和外泌体信号网络 | NA | 克服非小细胞肺癌免疫治疗耐药性，实现冷肿瘤向热肿瘤的转化 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、纳米医学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 8197 | 2025-10-06 |
The Low Tumorigenic Risk and Subtypes of Cardiomyocytes Derived from Human-induced Pluripotent Stem Cells
2025, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
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研究论文 | 本研究评估了人诱导多能干细胞来源心肌细胞的肿瘤形成风险和亚型组成 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子组测序系统评估hiPSC-CMs的肿瘤风险并解析其细胞亚型组成 | 研究仅在NOD-SCID小鼠模型中进行了3个月的肿瘤形成观察，缺乏更长期的随访数据 | 评估hiPSC-CMs的肿瘤形成风险并鉴定其细胞亚型组成 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,全外显子组测序,流式细胞术,电生理学 | NA | 基因表达数据,基因组数据,细胞表型数据 | 分化第25天的hiPSC-CMs | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 8198 | 2025-10-06 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-12, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
|
研究论文 | 通过生物信息学分析揭示干燥综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次发现干燥综合征与复发性流产共享KCNN3枢纽基因及相关生物学通路 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索干燥综合征与复发性流产之间的基因相关性 | 干燥综合征和复发性流产的基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病与生殖疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), limma分析, 单细胞RNA测序 | ceRNA网络 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的干燥综合征和复发性流产样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8199 | 2025-10-06 |
Understanding the development of enzalutamide resistance based on a functional single-cell approach
2024-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.20.619319
PMID:39484437
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的机制 | 首次在单细胞水平揭示AR低表达细胞亚群是恩杂鲁胺耐药的前体细胞 | 研究基于LNCaP细胞系，需要在更多模型和临床样本中验证 | 探索前列腺癌恩杂鲁胺耐药机制并寻找潜在治疗策略 | LNCaP前列腺癌细胞系 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LNCaP细胞系单细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8200 | 2025-10-06 |
SUV39H1 Preserves Cancer Stem Cell Chromatin State and Properties in Glioblastoma
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.607856
PMID:39229036
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持和肿瘤进展中的关键作用 | 首次证明SUV39H1通过调控染色质可及性和干细胞特性在胶质母细胞瘤干细胞维持中发挥关键作用 | 研究主要基于患者来源的肿瘤干细胞和异种移植模型，临床转化仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤干细胞维持的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤样本和正常脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |