单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 8181 - 8200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8181 | 2024-09-27 |
Mechanism of multifunctional adaptor protein SHARPIN regulating myocardial fibrosis and how SNP mutation affect the prognosis of myocardial infarction
2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167467
PMID:39159699
|
研究论文 | 研究SHARPIN蛋白在心肌纤维化中的作用及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 首次揭示了SHARPIN在心肌纤维化中的分子机制，并探讨了其SNP突变对心肌梗死患者心血管事件的影响 | 研究主要基于小鼠模型和人类心肌组织，需要进一步在临床试验中验证 | 阐明SHARPIN在心肌纤维化中的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | SHARPIN蛋白、心肌纤维化、心肌梗死患者 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA干扰、转录组分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | SHARPIN+/-, 野生型小鼠, 人类心肌组织 |
| 8182 | 2024-09-27 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
|
研究论文 | 研究了PFKFB3表达的β细胞在糖尿病中的功能障碍及其与能量保存和正向上位性的关系 | 揭示了PFKFB3通过与抗凋亡基因的相互作用，促进糖尿病中功能障碍β细胞的长期存活，并提出了通过抑制PFKFB3来清除这些细胞以恢复葡萄糖耐量的方法 | NA | 探讨PFKFB3在糖尿病中如何掩盖功能障碍β细胞的竞争特性 | PFKFB3表达的β细胞及其在糖尿病中的功能障碍 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自nPOD T2D胰腺的PFKFB3阳性β细胞 |
| 8183 | 2024-09-27 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-Nov, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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综述 | 本文综述了通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的研究进展 | 利用空间转录组技术，本文揭示了卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境组成的详细信息 | NA | 探讨空间转录组技术在揭示卵巢癌肿瘤内异质性和治疗反应预测中的应用 | 卵巢癌的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8184 | 2024-09-27 |
Practical Compass of Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Oct, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00840-4
PMID:38019344
|
综述 | 本文提供了从处理fastq数据集到绘制图表和绘制轨迹的基本过程的逐步指导 | 本文介绍了用户友好的scRNA-seq包，用于配体-受体相互作用和轨迹分析 | 更新最新信息对许多研究人员来说很困难 | 提供单细胞RNA-seq数据分析的实用指南 | 单细胞RNA-seq数据分析的基本过程和工具 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA |
| 8185 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid: Insights into pathogenesis and therapy on bullous formation
2024-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19924
PMID:38433529
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8186 | 2024-09-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals surface markers of primordial germ cells in chicken and zebra finch
2024-Sep-26, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-024-02186-7
PMID:39325237
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的表面标记物 | 发现了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物NEGR1、SLC34A2和ESYT3，这些标记物在后期发育阶段和生殖组织中持续表达 | 现有的分离方法在效率和适用性方面存在局限，特别是SSEA-1的特异性在后期发育阶段下降 | 揭示鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物，以解决现有分离方法的局限性 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 |
| 8187 | 2024-09-27 |
VisualZoneR: A computational protocol to identify compartmental zones from single-cell spatial transcriptomics using R
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103196
PMID:39067026
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研究论文 | 本文介绍了一种基于R语言的技术VisualZoneR，用于从单细胞空间转录组数据中识别分隔区 | 提出了VisualZoneR技术，用于分析Visium或Visium HD技术生成的空间转录组数据，并识别分隔区 | NA | 开发一种计算协议，用于从单细胞空间转录组数据中识别分隔区 | 健康肝脏组织到内部转移区域的区分区，以及转录组变化 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8188 | 2024-09-27 |
Protocol for analysis of single-cell sequencing data by Seqtometry
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103209
PMID:39096493
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Seqtometry平台的单细胞测序数据分析协议 | Seqtometry平台通过先进的基因签名评分直接分析基因表达和可及性，为单细胞分析提供了一个新的分析平台 | NA | 提供一种用于单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序分析的协议 | 单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | NA |
| 8189 | 2024-09-27 |
Protocol to achieve high-resolution single-cell transcriptomics of cardiomyocytes in multiple species
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103194
PMID:39096494
|
研究论文 | 本文提供了一种生成多种物种心肌细胞高分辨率单细胞转录组测序的协议 | 本文提供了一种新的协议，用于生成高分辨率单细胞转录组测序数据，特别是针对稀有的心肌细胞群体 | NA | 开发一种高分辨率单细胞转录组测序协议，以详细了解心肌细胞的转录组信息 | 小鼠、斑马鱼心脏以及诱导多能干细胞中的心肌细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多种物种的心肌细胞 |
| 8190 | 2024-09-27 |
Protocol for preparing mammalian skin samples encompassing hair follicles for spatial transcriptomics
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103254
PMID:39146191
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于空间转录组学的哺乳动物皮肤样本（包括毛囊）制备方案 | 提供了一种适用于皮肤样本的空间转录组学制备方法 | 未提及 | 开发适用于皮肤样本的空间转录组学制备方案 | 哺乳动物皮肤样本，包括毛囊 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA | 未提及 |
| 8191 | 2024-09-27 |
Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103298
PMID:39244757
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的人类鼻黏膜样本处理协议，以获得高质量的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | 提出了同时获取鼻黏膜组织单细胞转录组学和表观基因组学高质量数据的处理协议 | 未提及 | 优化鼻黏膜样本处理，以支持鼻腔疾病研究和诊断 | 人类鼻黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞RNA和染色质可及性数据 | 未提及具体样本数量 |
| 8192 | 2024-09-27 |
Imputing abundance of over 2,500 surface proteins from single-cell transcriptomes with context-agnostic zero-shot deep ensembles
2024-Sep-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.08.006
PMID:39243755
|
研究论文 | 提出了一种名为SPIDER的上下文无关零样本深度集成模型，用于从单细胞转录组中预测超过2500种表面蛋白的丰度 | SPIDER模型能够在大规模蛋白质丰度预测中表现出色，并且在不同上下文中具有更好的泛化能力 | NA | 开发一种能够从单细胞转录组数据中预测表面蛋白丰度的新方法 | 单细胞转录组数据中的表面蛋白丰度 | 机器学习 | NA | CITE-seq | 深度集成模型 | 转录组数据 | 超过2500种表面蛋白 |
| 8193 | 2024-09-27 |
High infiltration of immune cells with lower immune activity mediated the heterogeneity of gastric adenocarcinoma and promoted metastasis
2024-Sep-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e37092
PMID:39319155
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析胃腺癌的转移特征 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了低免疫活性的免疫细胞高浸润与胃腺癌异质性和转移的关系 | 研究仅限于体外实验验证，缺乏体内实验数据 | 探索胃腺癌的转移特征 | 胃腺癌的免疫细胞和基因表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7697个细胞样本 |
| 8194 | 2024-09-27 |
A Quantitative Computational Framework for Allopolyploid Single-Cell Data Integration and Core Gene Ranking in Development
2024-Sep-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msae178
PMID:39213378
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研究论文 | 开发了一种名为“伪基因组分化量化”（pgDQ）的定量计算框架，用于量化和追踪异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 提出了pgDQ方法，能够直接在细胞水平上量化和追踪亚基因组分化，并能与单细胞RNA测序数据得出的细胞分化轨迹进行比较 | 未提及 | 探讨异源多倍体发育过程中不同基因组融合对发育的影响 | 异源多倍体单细胞数据中的亚基因组分化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 |
| 8195 | 2024-09-27 |
Scywalker: scalable end-to-end data analysis workflow for long-read single-cell transcriptome sequencing
2024-Sep-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae549
PMID:39254601
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研究论文 | 介绍了一种名为Scywalker的可扩展端到端数据分析工作流程，用于长读长单细胞转录组测序 | 开发了新的可扩展方法用于细胞条形码解复用和单细胞异构体调用与定量，并将其整合到一个易于部署的软件包中 | NA | 解决现有纳米孔单细胞数据分析工具在处理当前数据规模上的严重局限性 | 长读长单细胞或单核cDNA的转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类大脑、拟南芥叶片和混合细胞系的数据集 |
| 8196 | 2024-09-26 |
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor
2024-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02479-8
PMID:38528071
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研究论文 | 研究探讨了Kmt2c基因半合子缺失小鼠的转录组失调和自闭症样行为，并发现LSD1抑制剂可以改善这些行为 | 首次揭示了Kmt2c基因半合子缺失导致的神经发育缺陷的分子机制，并证明了LSD1抑制剂在治疗这些缺陷中的有效性 | 研究主要集中在成年小鼠，未探讨LSD1抑制剂对幼年小鼠的影响 | 探讨Kmt2c基因半合子缺失如何导致神经发育缺陷及其治疗方法 | Kmt2c基因半合子缺失小鼠及其行为和转录组变化 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年和新生小鼠脑组织样本 |
| 8197 | 2024-09-27 |
Irradiated tumor cell-released microparticles enhance the therapeutic efficacy of PD-1 inhibitors by promoting M1-TAMs polarization in NSCLC brain metastases
2024-Aug-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217133
PMID:39079563
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研究论文 | 研究探讨了放射治疗后肿瘤细胞释放的微粒子（RT-MPs）如何通过促进M1型肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的分化，增强PD-1抑制剂在非小细胞肺癌脑转移中的治疗效果 | 首次研究了RT-MPs在跨越血脑屏障后，通过改变TAMs的微环境，从M2型转变为M1型，从而增强免疫治疗效果 | 研究基于动物模型，尚未在临床试验中验证 | 探索提高非小细胞肺癌脑转移患者对免疫治疗反应的新方法 | 放射治疗后肿瘤细胞释放的微粒子（RT-MPs）和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞数据 | 动物模型 |
| 8198 | 2024-09-27 |
The Impact of Low Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569988
PMID:38106143
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对胎儿肾脏分子和细胞发育的影响 | 首次全面分析了低蛋白饮食对肾脏发育的影响，特别是对分支形态发生和肾元形成过程中细胞和分子变化的影响 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨低蛋白饮食对胎儿肾脏发育的影响及其分子和细胞机制 | 胎儿肾脏的发育过程，特别是肾元的形成 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，光学投影断层扫描，共聚焦显微镜 | NA | 图像，基因表达数据 | 小鼠模型中的多个发育阶段样本 |
| 8199 | 2024-09-27 |
CellCover Captures Neural Stem Cell Progression in Mammalian Neocortical Development
2024-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.06.535943
PMID:37383947
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法CellCover，用于在哺乳动物新皮质发育过程中捕捉神经干细胞的进展 | CellCover方法通过将基因面板选择视为组合优化中的“最小集合覆盖问题”，克服了单细胞RNA测序数据中的零膨胀问题，并能够同时分析多个基因，捕捉到细胞类别的特异性信号 | NA | 旨在识别能够区分细胞类别的基因面板 | 神经干细胞在哺乳动物新皮质发育中的进展 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 组合优化 | 基因表达数据 | 涉及小鼠、灵长类和人类的数据集 |
| 8200 | 2024-09-27 |
Dermal fibroblasts retain site-specific transcriptomic identity in keloids
2024-Aug-17, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2024.08.002
PMID:39322512
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研究论文 | 研究探讨了瘢痕疙瘩中成纤维细胞是否保留了部位特异性的转录组身份 | 首次揭示了瘢痕疙瘩中不同部位的成纤维细胞保留了独特的解剖学相关的基因表达谱 | 研究仅限于瘢痕疙瘩中的成纤维细胞，未涉及其他皮肤细胞类型 | 评估不同解剖部位的瘢痕疙瘩中是否存在空间异质性和部位特异性 | 瘢痕疙瘩中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 139个瘢痕疙瘩皮肤组织和19个瘢痕疙瘩成纤维细胞样本 |