单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 34043 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2025-12-05
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型,揭示了ALS中炎症反应的改变机制 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响,并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 研究主要基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境;样本类型和数量有限 探究肌萎缩侧索硬化症(ALS)中,C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元和小胶质细胞,包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增(HRE)的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除(KO)iPSC系 神经科学 肌萎缩侧索硬化症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞共培养,炎症因子表达与分泌分析 iPSC来源的细胞共培养模型 单细胞转录组数据,细胞表型数据 多个iPSC细胞系(包括C9ORF72 HRE和KO系),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
802 2025-12-05
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
研究论文 本研究通过血浆蛋白质组学分析,结合前瞻性队列和遗传数据,识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点,特别是TNFRSF14,并探讨其临床和细胞机制 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据,系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析,因果推断需进一步实验验证;单细胞测序数据可能样本有限,需扩大验证 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点,以提升治疗效果 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 蛋白质组学 糖尿病多发性神经病 血浆蛋白质组学、单细胞测序 NA 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 大规模临床和遗传数据集(具体样本数未在摘要中说明) NA 单细胞测序 NA NA
803 2025-12-05
Dissolvable microneedles loaded with denosumab alleviate knee osteoarthritis in rodent and canine models by inhibiting macrophage senescence
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究开发了一种负载地诺单抗的可溶性微针阵列,用于局部递送药物以治疗骨关节炎,并在啮齿类和犬类模型中验证了其疗效 首次将可溶性微针平台用于地诺单抗的经皮关节内递送,以靶向衰老巨噬细胞,提供了一种微创、局部治疗骨关节炎的新策略,避免了关节内注射的侵入性和全身给药的不良反应 研究主要在啮齿类和犬类动物模型中进行,其疗效和安全性仍需在人体临床试验中进一步验证 开发一种微创的微针给药平台,用于局部递送地诺单抗以治疗骨关节炎,并评估其疗效和机制 骨关节炎(OA) 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光,组织学评估,行为学评估,衰老巨噬细胞-软骨细胞共培养 NA 基因表达数据,图像数据,行为数据 啮齿类动物(具体物种和数量未明确说明)和比格犬 NA 单细胞RNA测序 NA NA
804 2025-12-05
Enhancer-mediated NR2F2 recruitment activates BGN to promote tumor growth and shape tumor microenvironment in papillary thyroid cancer
2026, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究揭示了NR2F2-BGN轴在调控甲状腺乳头状癌(PTC)肿瘤生长和肿瘤微环境(特别是巨噬细胞极化)中的关键作用,并评估了靶向该轴的潜在治疗策略 首次系统阐明了BGN在PTC中通过内分泌和旁分泌方式促进肿瘤进展的双重作用机制,并发现了NR2F2作为BGN转录的关键上游调控因子,同时验证了NR2F2特异性抑制剂CIA1的治疗潜力 研究主要基于细胞系和小鼠模型,其临床转化效果和长期安全性仍需在更多临床样本和试验中验证 探究细胞外基质成分BGN在甲状腺乳头状癌(PTC)发生发展中的内分泌与旁分泌作用及其分子机制 甲状腺乳头状癌(PTC)细胞、小鼠模型、肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是巨噬细胞) 肿瘤生物学 甲状腺癌 多组学整合分析、RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、CRISPR干扰、荧光素酶报告基因检测 NA 基因表达数据、单细胞测序数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
805 2025-12-05
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析,比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中,结合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 样本量相对较小(空间转录组学分析仅8例,免疫组化分析35例),且未包括其他卒中病因亚型 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 42例急性缺血性卒中患者(其中8例LAA,27例CE),空间转录组学分析8例(4例LAA,4例CE),免疫组化分析35例(8例LAA,27例CE) NA 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
806 2025-12-05
Comparing great apes reveals human-specific ZEB2 roles in neural development
2025-Dec-04, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1
研究论文 本研究通过比较人类、黑猩猩和猩猩的ZEB2转录因子调控差异,揭示了人类特异性神经发育调控网络 首次在可控细胞系统中检测到跨物种ZEB2调控差异,并发现人类ZEB2调控更多神经发育相关基因,特别是非编码基因的富集 研究主要使用B淋巴细胞样细胞系作为模型,虽验证于脑类器官,但仍需更多直接神经组织验证 探究人类与其他灵长类在转录调控层面的进化差异 人类、黑猩猩、猩猩的B淋巴细胞样细胞及脑类器官数据 基因组学与进化生物学 NA 转录组测序、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、单细胞转录组数据 三种大猿物种的B淋巴细胞样细胞系(含生物学重复) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
807 2025-12-05
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2025-Dec-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
综述 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的角色及潜在治疗靶点 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
808 2025-12-05
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达,激活肺内皮细胞干扰素信号通路,导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达,并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 研究主要基于体外细胞和动物模型,人类样本验证相对有限,且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 分子生物学 肺动脉高压 RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 NA RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
809 2025-12-05
Identification of CD7 as a novel biomarker of embryonal hepatoblastoma
2025-Dec-04, Pediatric surgery international IF:1.5Q3
研究论文 本研究通过多种生物信息学分析和免疫组化染色,探讨了CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为新型生物标志物的潜力 首次将CD7鉴定为胚胎型肝母细胞瘤的新型生物标志物,并揭示其与肿瘤进展和不良临床结局的关联 研究主要基于回顾性分析,需要进一步的前瞻性验证和功能实验来确认CD7的生物学作用 研究CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为生物标志物的潜力 人类肝母细胞瘤样本 数字病理学 肝母细胞瘤 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析, 免疫组化染色 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
810 2025-12-05
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Dec-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了ScisTree2,一种基于无限位点模型、用于大规模细胞谱系树推断和基因型调用的快速准确方法 ScisTree2是首个能够处理数万或更多细胞数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法,并采用高效局部搜索优化树结构 NA 开发一种能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树并进行基因型调用的计算方法 单细胞测序数据中的细胞谱系树和基因型 生物信息学 NA 单细胞测序 无限位点模型 单细胞测序数据 数万或更多细胞的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
811 2025-12-05
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Dec-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了一种名为geneCover的无标签组合方法,用于在单细胞RNA测序和空间转录组学数据中选择最优的标记基因面板 提出了一种基于基因-基因相关性的无标签组合方法,能有效识别稀有细胞类型或微妙空间模式的标记基因,并具有出色的可扩展性 未在摘要中明确提及具体局限性 开发一种无标签的标记基因选择方法,以捕获单细胞和空间转录组学数据中的细胞和空间异质性 单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的标记基因面板 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 组合方法 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
812 2025-12-05
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Dec-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架,用于整合不同平台的空间转录组学数据,无需共享基因面板 LLOKI通过最优传输引导的特征传播和基于图的插补技术,解决了跨平台ST数据整合中基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性的挑战,并利用scGPT等单细胞基础模型生成统一特征 未在摘要中明确说明 开发一个能够整合不同平台空间转录组学数据的统一框架,以促进对组织结构和细胞相互作用的深入理解 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 scGPT(单细胞基础模型),基于图的插补模型 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 来自五种不同技术的小鼠脑样本,以及五个卵巢癌数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
813 2025-12-05
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Dec-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为SIID的算法,用于整合不同空间转录组学平台的数据,以进行基因表达的插补和解卷积 SIID算法通过联合非负因子分解模型,结合空间对齐,能够同时处理基因表达缺失和细胞类型特异性表达推断,在模拟和真实数据中均表现出优于现有工具的性能 NA 整合不同空间转录组学技术的数据,以克服单个技术的局限性,实现基因表达的准确插补和解卷积 空间转录组学数据,特别是来自10x Genomics Visium和Xenium平台的人类乳腺癌和结肠癌组织切片 空间转录组学 乳腺癌,结肠癌 空间转录组学 联合非负因子分解模型 基因表达数据 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium平台测量多细胞大小点的全转录组,10x Xenium平台在亚细胞分辨率下测量数百个基因
814 2025-12-05
Optimal marker genes for c-separated cell types with SepSolve
2025-Dec-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为SepSolve的新方法,用于在单细胞RNA-seq研究中识别细胞类型,通过优化选择标记基因以实现细胞类型的c-分离 引入c-分离概念,并设计线性规划模型,在考虑细胞类型内表达变异的同时避免处理所有细胞对,从而高效计算最优标记基因集 未在摘要中明确提及具体局限性 开发一种高效且稳定的标记基因选择方法,以准确区分单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型及其标记基因 单细胞分析 NA 单细胞RNA-seq 线性规划 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
815 2025-12-05
Genome and Single-Cell Transcriptome Reveal the Evolution of Holoparasitic Plants: A Case Study of Cistanche deserticola
2025-Dec-03, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究构建了肉苁蓉首个染色体级别基因组图谱,并结合单细胞转录组揭示了全寄生植物在基因组和细胞层面的进化机制 首次构建肉苁蓉染色体级别基因组图谱,通过单细胞转录组技术鉴定出寄生过程相关的细胞类型及其阶段特异性分化 研究主要聚焦于单一物种肉苁蓉,其进化机制在其他全寄生植物中的普适性有待进一步验证 探究全寄生植物在分子和细胞水平的进化机制 肉苁蓉(Cistanche deserticola),一种典型的濒危全寄生植物 植物基因组学与单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序,基因组测序 NA 基因组序列数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及肉苁蓉的基因组和单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
816 2025-12-05
IL-8-Induced Tumor Self-Rampart Spatially Confines Oncolytic Virotherapy in Glioblastoma
2025-Dec-03, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了胶质母细胞瘤通过IL-8诱导的肿瘤自我壁垒(TSR)来空间限制溶瘤病毒疗法的机制,并提出了克服该耐药性的策略 首次发现并命名了肿瘤自我壁垒(TSR)这一空间防御结构,揭示了IL-8驱动的旁分泌信号在限制溶瘤病毒传播中的关键作用,并提出了IL-8作为药效学生物标志物和治疗靶点的双重功能 研究主要基于PDX模型和有限的患者样本,临床转化效果需进一步大规模试验验证 探究胶质母细胞瘤中限制溶瘤病毒持续复制和传播的分子与空间机制,并开发改善疗效的组合策略 胶质母细胞瘤、溶瘤腺病毒YSCH-01、患者来源异种移植(PDX)模型、肿瘤细胞 空间转录组学 胶质母细胞瘤 空间转录组学、全基因组CRISPR激活筛选、组织学分析 NA 空间转录组数据、组织图像数据 PDX模型和患者肿瘤样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
817 2025-12-05
Single-cell multi-omic landscape reveals anatomical-specific immune features in adult and pediatric sepsis
2025-Dec-03, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析,揭示了成人和儿童脓毒症中解剖部位特异性和年龄特异性的免疫特征 首次整合单细胞转录组、T/B细胞受体测序、CITE-seq、bulk RNA测序和血浆蛋白质组学,系统描绘了不同感染部位(腹部、肺部、皮肤)和年龄(成人、儿童)脓毒症的免疫图谱,并鉴定出NR4A2中央记忆CD4 T细胞等关键细胞亚群及其功能 研究主要基于外周血样本,未直接分析感染局部组织;样本量虽较大但可能仍不足以覆盖所有脓毒症亚型;部分机制验证依赖于动物模型或体外实验 阐明不同解剖部位感染如何塑造脓毒症的免疫反应特征,并探索年龄相关的免疫差异 成人和儿童脓毒症患者及对照个体的外周血单个核细胞和血浆 单细胞多组学 脓毒症 单细胞转录组测序, 单细胞T/B细胞受体测序, CITE-seq, bulk RNA测序, 血浆蛋白质组学 NA 单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 281名成人和儿童个体(脓毒症患者及对照),并在164名独立个体中验证 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
818 2025-12-05
Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets
2025-Dec-03, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过生成Spatial Touchstone数据集,评估了Xenium和CosMx平台在成像空间转录组学中的性能,并提出了标准化操作流程和开源软件SpatialQM,以促进数据评估和可重复性 首次为成像空间转录组学技术建立了标准化评估指标和操作流程,并开发了开源软件SpatialQM,支持跨平台数据比较和细胞注释插补 研究仅基于Xenium和CosMx两个平台,可能未涵盖所有成像空间转录组学技术;样本类型和数量有限,可能影响通用性 评估成像空间转录组学技术的可重复性和性能,并建立标准化指标以促进数据整合和分析 六种组织类型的空间转录组学数据,包括公共和新生成的Spatial Touchstone数据集 空间转录组学 NA 成像空间转录组学,原位杂交技术 NA 空间转录组学数据,图像数据 254个空间剖面,涵盖六种组织类型 10x Genomics, NanoString 成像空间转录组学 Xenium, CosMx Xenium和CosMx平台,用于成像空间转录组学分析
819 2025-12-05
Multi-omics highlights the impacts of cryptorchidism history on immune microenvironment variation in TGCT
2025-Dec-03, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学分析探讨了隐睾病史对睾丸生殖细胞肿瘤免疫微环境的影响 首次结合转录组、DNA甲基化和单细胞RNA测序技术,系统揭示了隐睾病史如何重塑TGCT的免疫微环境,并识别了关键的hub基因 研究样本可能有限,且未详细探讨成人隐睾样本中DNA甲基化变化较少的具体机制 探究隐睾病史对睾丸生殖细胞肿瘤生物学过程和免疫微环境的影响 正常睾丸组织、隐睾组织和睾丸生殖细胞肿瘤样本 数字病理学 睾丸生殖细胞肿瘤 转录组测序、DNA甲基化分析、单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析、伪时间轨迹分析 转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据 包括正常、隐睾和TGCT样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
820 2025-12-05
Single-cell sequencing in bladder cancer: new insights from tumor cell diversity to individualized treatment strategies
2025-Dec-03, Cancer cell international IF:5.3Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用进展,及其在评估肿瘤异质性、肿瘤微环境、转移和治疗耐药性方面带来的新见解 强调了单细胞测序技术相较于传统高通量测序在解析膀胱癌细胞异质性方面的显著优势,为未来研究提供了新的视角 NA 探讨单细胞测序技术如何为膀胱癌的个体化治疗策略提供新的见解 膀胱癌 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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