单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-03-28 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-07, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子HMBOX1通过促进HACE1介导的ATG5泛素化降解来逆转自噬介导的结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药性的分子机制 | 首次发现HMBOX1-HACE1-ATG5轴在调控结直肠癌自噬和化疗耐药中的关键作用，并阐明其通过促进ATG5的K63-泛素化降解抑制自噬的分子机制 | 研究主要在细胞和动物模型中进行，临床验证样本量有限，需要更大规模的临床队列研究进一步验证 | 探究结直肠癌中5-氟尿嘧啶耐药性的分子机制，并寻找逆转耐药的治疗靶点 | 结直肠癌细胞系、患者组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、免疫组化、染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、组织图像数据 | 患者结直肠癌组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 802 | 2026-03-28 |
Targeting the Epigenetic Regulator CBX5 Promotes Fibroblast Metabolic Reprogramming and Inhibits Lung Fibrosis
2025-Jun, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0255OC
PMID:39642371
|
研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子CBX5在肺纤维化过程中通过调控成纤维细胞代谢重编程促进其持续活化的关键作用 | 首次发现CBX5作为连接表观遗传改变与成纤维细胞代谢异常的关键分子，并证明靶向CBX5可协同增强二甲双胍的抗纤维化效果 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，在人体内的直接治疗效应仍需进一步验证 | 探究表观遗传调控如何影响成纤维细胞代谢重编程从而促进肺纤维化进展 | 特发性肺纤维化（IPF）患者的成纤维细胞、博来霉素诱导的肺损伤模型、IPF肺组织外植体 | 表观遗传学与代谢研究 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、bulk RNA测序、代谢评估 | NA | 基因表达数据、代谢数据、组织图像 | 未明确具体样本数量，涉及IPF患者成纤维细胞、动物模型及肺组织外植体 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 803 | 2026-03-28 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
|
研究论文 | 本文通过纵向单细胞RNA测序研究慢性髓系白血病的进展，揭示了微观和宏观转录状态的演变 | 利用状态转移理论，揭示了细胞类型特异性贡献如何调控稳健的疾病表型状态转移，建立了从单细胞尺度到宏观状态水平的理论框架 | NA | 探索单细胞与批量转录组学中癌症特异性信息内容，解析离散疾病定义状态如何从噪声单细胞数据中涌现 | 慢性髓系白血病 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 804 | 2026-03-28 |
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02981-y
PMID:40128286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光分析，揭示了CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗驱动下肿瘤微环境的特异性免疫抑制变化 | 首次在单细胞水平上揭示了CLDN18.2阳性胃癌化疗后独特的免疫抑制微环境变化，包括NK细胞ADCC相关基因下调、Tregs和TAMs中TGFB1表达上调，以及特定的细胞间相互作用信号通路 | 样本量较小（37例GC样本，其中仅11例CLDN18.2阳性），且为观察性研究，需要更大样本和功能验证实验 | 探究CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗作用下肿瘤微环境的特异性变化，以解释化疗联合抗CLDN18.2抗体疗效有限的原因 | 胃癌组织样本，特别是CLDN18.2阳性和阴性的胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 37例胃癌样本（包括11例CLDN18.2阳性和26例CLDN18.2阴性样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 805 | 2026-03-28 |
Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies
2025-Mar-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763
PMID:39836414
|
研究论文 | 本研究识别了一种与波形蛋白IgG自身抗体相关的新型脑膜脑脊髓炎综合征 | 首次发现并描述了针对星形胶质细胞中间丝蛋白波形蛋白的自身抗体与一种独特的脑膜脑脊髓炎综合征的关联 | 研究为回顾性病例系列，样本量较小（14例患者），且随访时间有限（中位23个月） | 表征一种与未知星形胶质细胞自身抗体相关的脑膜脑脊髓炎综合征 | 患有未明确中枢神经系统自身免疫性疾病且具有相似临床和影像学特征的患者 | 数字病理学 | 神经系统自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基于细胞的测定、基于组织的测定 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据、影像学数据 | 14例患者（10例女性，中位年龄33岁），其中2例索引患者的脑脊液细胞进行了scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 806 | 2026-03-28 |
Decreased miR-486-5p is involved in lipopolysaccharide-induced HTR-8/SVneo cell dysfunction by promoting SMAD2 expression
2025-01-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-23-0502
PMID:39475824
|
研究论文 | 本研究探讨了miR-486-5p/Smad2通路在脂多糖诱导的绒毛外滋养细胞功能障碍及早期妊娠丢失发病机制中的作用 | 揭示了miR-486-5p通过靶向SMAD2调控绒毛外滋养细胞侵袭和TNFα产生的新机制，并利用单细胞RNA测序数据验证了SMAD2在复发性流产患者中的表达变化 | 研究主要基于细胞系HTR-8/SVneo和动物模型，人类样本验证有限，且未深入探讨其他潜在靶点或通路 | 阐明miR-486-5p在早期妊娠丢失发病机制中的具体作用及其分子通路 | 绒毛外滋养细胞（EVT）系HTR-8/SVneo、LPS诱导的早期妊娠丢失模型、人类蜕膜单细胞RNA测序数据 | 生殖医学 | 早期妊娠丢失 | 单细胞RNA测序、转录组分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 细胞系实验及公共数据库（GEO）中的人类样本数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 807 | 2026-03-28 |
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1568389
PMID:40236940
|
综述 | 本文综述了使用器官芯片平台建模生殖和妊娠相关组织的挑战、局限性以及高通量数据前沿 | 探讨了器官芯片技术在生殖和妊娠领域应用的创新点，包括克服现有平台限制的新方法，如空间转录组学和成像流式细胞术 | 描述了器官芯片平台的局限性，如细胞数量少、上清液体积低、制造材料限制以及分子和生化检测的不足 | 旨在评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关生理病理建模及药物评估中的应用潜力和挑战 | 生殖和妊娠相关的器官芯片平台 | 生物医学工程 | NA | 空间转录组学、成像流式细胞术、外泌体分析 | NA | 图像、分子数据 | NA | NA | 器官芯片、微生理系统 | NA | NA |
| 808 | 2026-03-28 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111394
PMID:39595571
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-Seq分析，将DNMT3B和PFKFB4的转录谱与肝母细胞瘤的转移特性联系起来 | 利用弹性网络机器学习方法识别了DNMT3B和PFKFB4作为肝母细胞瘤转移的关键预测因子，并构建了一个基于这两个酶表达的代谢评分，该评分在预测转移方面比现有分类器更敏感 | 研究基于GSE131329转录组数据集，样本来源可能有限，且未涉及实验验证或机制探讨 | 探究肝母细胞瘤中代谢酶的过表达与转移风险之间的关联，并开发预测转移的临床-生物学模型 | 肝母细胞瘤肿瘤组织与非癌性肝组织，重点关注代谢酶的表达差异 | 单细胞组学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA-Seq，转录组分析 | ElasticNet机器学习，逻辑回归模型 | 转录组数据 | 基于GSE131329转录组数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 809 | 2024-08-07 |
A New Immunological Index for the Elderly: High Proportion of Multiple TCR T Cells Based on scRNA-Seq
2024-05-07, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0509-1
PMID:38722790
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 810 | 2026-03-28 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf9941
PMID:37824646
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和多重空间转录组学技术，揭示了人类丘脑发育过程中的分子动态和细胞命运轨迹 | 首次在人类丘脑发育中应用单细胞和空间转录组学，明确了丘脑神经元在妊娠中期的分化及其分子和空间核团组织 | 研究主要聚焦于妊娠中期，未涵盖丘脑发育的完整时间范围，且样本数量有限 | 阐明人类丘脑发育过程中的分子轨迹和细胞命运特化机制 | 人类丘脑发育过程中的神经元细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 811 | 2026-03-28 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
|
研究论文 | 本文介绍了一种从神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤中获取单细胞悬液，并在10x平台上进行转录组分析的实验方案 | 提出了一种针对临床神经鞘肿瘤样本的单细胞测序实验方案，并整合了生物信息学工具进行发育轨迹构建和比较分析 | 该方案主要针对神经纤维瘤病1型相关肿瘤，可能不适用于其他类型肿瘤，且依赖于10x平台技术 | 研究神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤的异质性 | 神经纤维瘤病1型相关的神经鞘肿瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x平台单细胞转录组分析 |
| 812 | 2026-03-28 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
|
研究论文 | 本文介绍了一种将人类多能干细胞分化为肾脏类器官的协议，包括维护、分化、单细胞RNA-seq分析和验证步骤 | 提供了一种快速、可重复的人类肾脏发育和疾病建模模型，并详细描述了使用CRISPR-Cas9同源定向修复进行基因组工程以生成肾脏疾病模型 | NA | 开发人类肾脏发育和疾病建模的协议 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，CRISPR-Cas9 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2026-03-28 |
Protocol to assess fatal embolism risks from human stem cells
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102268
PMID:37133989
|
研究论文 | 本文提出了一种协议，用于识别人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs）中促栓塞亚群并预测ADSC输注的致命栓塞风险 | 开发了一种结合单细胞RNA-seq数据分析和数学建模的协议，以预测干细胞治疗中的栓塞风险 | 协议细节依赖于先前研究（Yan et al., 2022），可能需进一步验证 | 评估干细胞治疗中的栓塞风险，以提升细胞质量和临床应用安全性 | 人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 814 | 2026-03-28 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法，适用于单细胞RNA测序 | 协议依赖于酶解和流式细胞术，可能对细胞活性有特定要求，且未详细讨论所有潜在技术挑战 | 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法，以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 | 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 815 | 2026-03-28 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
|
研究论文 | 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 | 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案，结合单细胞RNA测序和流式细胞术，以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 | NA | 研究肥胖如何影响生殖器疱疹（由HSV-2引起）的易感性，并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 | 数字病理学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 816 | 2026-03-28 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
|
protocol | 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 | 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程，支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 | NA | 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 | 人类头颈部肿瘤组织 | digital pathology | head and neck cancer | fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 817 | 2026-03-28 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
|
研究论文 | 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 | 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台，对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析，并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 | 未提及样本量大小或具体患者特征，可能限制结果的普适性 | 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 | HIV感染患者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 | 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 818 | 2026-03-27 |
Retinoic acid regulates fetoplacental vascularization via notch signaling and a SEMA3E/F-PLEXIND1 axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115205
PMID:41884003
|
研究论文 | 本研究探讨了视黄酸通过Notch信号和SEMA3E/F-PLEXIND1轴调控胎盘血管化的机制 | 首次揭示了视黄酸缺乏通过影响Notch信号和PLEXIND1-SEMA3E/F轴导致胎盘内皮细胞过度增殖和动静脉重塑障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类胎盘中的机制仍需进一步验证 | 研究视黄酸在胎盘血管化中的作用机制 | Raldh2缺陷胚胎的胎盘细胞 | 发育生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | E9.5胚胎的胎盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 819 | 2026-03-27 |
Small and Large Extracellular Vesicles in Circulation of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Patients Originate From Different Cell Types of the Tumor Microenvironment
2026-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70259
PMID:41885389
|
研究论文 | 本研究探讨了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者循环中小型与大型细胞外囊泡的来源及其在肿瘤微环境中的细胞特异性分泌差异 | 首次通过单细胞测序数据反卷积分析揭示循环中小型与大型细胞外囊泡分别源自肿瘤微环境中的恶性细胞与非恶性免疫细胞 | 研究样本量有限，且主要基于体外细胞培养和血浆分析，未直接验证体内分泌动态 | 解析弥漫性大B细胞淋巴瘤患者循环细胞外囊泡的细胞来源及其作为液体活检标志物的潜力 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的血浆样本及体外培养的DLBCL细胞 | 肿瘤生物学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 密度梯度分离、可调电阻脉冲传感分析、小RNA测序、信使RNA测序、单细胞测序 | Statescope算法 | 测序数据、传感数据 | 17例DLBCL肿瘤组织的单细胞测序数据及患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 820 | 2026-03-27 |
LLOT: application of Laplacian Linear Optimal Transport in spatial transcriptome reconstruction
2026-Jan-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag046
PMID:41885893
|
研究论文 | 本文提出了一种名为LLOT的可解释方法，用于整合单细胞和空间转录组学数据，以在全基因组和单细胞分辨率下重建缺失的空间信息 | LLOT通过迭代校正平台效应并利用拉普拉斯最优传输，将空间转录组学数据中的每个点分解为空间平滑的单细胞概率混合，提供了一种可解释且通用的框架 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，以重建组织中的空间基因表达和推断细胞位置 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据（如原位杂交、Slide-seq、10x Visium和Visium HD） | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学技术（如原位杂交、Slide-seq、10x Visium、Visium HD） | 拉普拉斯线性最优传输（LLOT） | 基因表达数据（包括单细胞和空间数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Visium HD | 10x Visium和Visium HD用于空间转录组学测量 |