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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-06-26 |
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102387
PMID:42229582
|
研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了小鼠胰岛在高血糖进展过程中的高分辨率转录组图谱,揭示了胰岛细胞的动态重塑机制 | 首次在单细胞分辨率下纵向解析了高脂饮食诱导胰岛素抵抗过程中小鼠胰岛内分泌和非内分泌细胞的全面转录组动态变化,发现了CCL27a趋化因子信号在β细胞与M1巨噬细胞相互作用中的新角色 | 未提及具体限制 | 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛的细胞重塑和转录组动态变化 | 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠胰岛细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 | 高脂饮食组和常规饮食对照组小鼠,每个时间点多个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 802 | 2026-06-26 |
scTACL: a multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag361
PMID:42242168
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研究论文 | 开发了一种名为scTACL的拓扑感知对比学习方法,用于单细胞转录组学分析,以提升数据填补、聚类、批次效应校正和细胞-细胞相互作用等任务的表现 | 首次将拓扑感知对比学习与ZINB分布结合,无需空间位置信息即可有效区分上皮和间充质区域,并通过细胞间通讯分析识别到关键信号通路 | NA | 开发新型计算方法以应对单细胞RNA测序数据中的噪声和缺失事件,提高下游分析准确性 | 单细胞RNA测序数据及空间转录组数据中的细胞群体 | 机器学习 | 肺癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 803 | 2026-06-26 |
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70973
PMID:42253032
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研究论文 | 该研究探索了MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活如何导致NMOSD疾病发作和利妥昔单抗难治性复发 | 首次揭示MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在利妥昔单抗难治性NMOSD中的作用机制,并发现单核细胞特异性MALAT1上调与血清BAFF升高相关 | 样本量较小,特别是单细胞RNA测序样本仅6例,且研究主要基于体外细胞实验,未在动物模型中验证 | 探索利妥昔单抗难治性NMOSD的免疫失调机制,特别是MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴的作用 | NMOSD患者(包括初发、利妥昔单抗缓解和利妥昔单抗难治性复发患者)的外周血单核细胞和血清,以及THP-1细胞 | 机器学习 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告基因检测, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | PBMCs初发10例,血清初发23例,利妥昔单抗治疗缓解26例,利妥昔单抗难治性复发13例,健康对照15例;单细胞RNA测序6例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 804 | 2026-06-26 |
scMagnifier: Resolving fine-grained cell subtypes via GRN-informed perturbations and consensus clustering
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014167
PMID:42313807
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研究论文 | 提出scMagnifier框架,通过基因调控网络引导的扰动与共识聚类,解析单细胞RNA测序数据中的精细细胞亚型 | 创新性地结合基因调控网络(GRN)引导的计算机扰动与共识聚类,通过扰动效应传播放大微弱转录差异,并引入扰动感知可视化(rpcUMAP)用于亚型分离与最优聚类数选择 | 文中未明确提及局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中精细细胞亚型的分辨率和准确性 | 卵巢癌细胞亚型及其空间组织结构 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 805 | 2026-06-26 |
Skin eQTL-Cerebrospinal Fluid Metabolites-Keloid Axis: An Integrative Multi-Omics Mediation Mendelian Randomization Study
2026-Jun, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70346
PMID:42338145
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研究论文 | 整合皮肤eQTL、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩GWAS数据,通过孟德尔随机化框架鉴定因果中介通路,并利用体外实验验证基因与代谢物的功能角色 | 首次通过多组学中介孟德尔随机化分析,将皮肤基因表达、脑脊液代谢物与瘢痕疙瘩风险联系起来,发现PARP14和ALDH2为上游调控基因,并揭示SOPC和鞘磷脂通过纤维细胞增殖促进疾病发展的新机制 | 未明确说明研究局限性 | 揭示遗传变异、分子表型与瘢痕疙瘩易感性之间的机制联系,鉴定因果中介通路 | 皮肤基因表达(GTEx v8)、338个脑脊液代谢物、两个欧洲人群瘢痕疙瘩GWAS数据集 | 机器学习 | 皮肤瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、GWAS统计摘要 | GTEx v8皮肤eQTL数据(样本量未明确)、两个独立欧洲瘢痕疙瘩GWAS数据集(样本量未明确) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 806 | 2026-06-26 |
Anti-PD-1 Nanobody-Armored MSLN CAR-T Therapy for Malignant Mesothelioma: Preclinical and Clinical Studies
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508754
PMID:41134065
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研究论文 | 开发了抗PD-1纳米抗体装甲的MSLN CAR-T细胞(NAC-T),并在恶性间皮瘤的临床前和临床研究中验证了其疗效 | 首次将抗PD-1纳米抗体与MSLN CAR-T细胞结合,并在人临床试验中验证安全性和有效性 | 样本量较小(11名患者),且未提供长期随访数据或随机对照比较 | 评估NAC-T细胞治疗恶性间皮瘤的安全性和抗肿瘤活性 | 恶性间皮瘤患者 | NA | 恶性间皮瘤 | CAR-T细胞技术,单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 11名恶性间皮瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 807 | 2026-06-26 |
Arginase-1 Expressing Macrophages Interact with Myofibroblasts to Regulate Insulin-Like Growth Factor-1-Dependent Tubule Repair
2026-Jun-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001150
PMID:41628890
|
研究论文 | 本文揭示了精氨酸酶-1表达巨噬细胞与肌成纤维细胞相互作用,通过调节胰岛素样生长因子-1依赖的肾小管修复机制 | 首次发现Arg1表达巨噬细胞通过诱导肌成纤维细胞和内皮细胞表达IGF1,而非自身产生,来促进肾小管上皮细胞增殖 | 未明确巨噬细胞与肌成纤维细胞间具体的信号分子机制 | 探究Arg1表达巨噬细胞促进肾小管修复的分子机制 | 小鼠缺血再灌注损伤模型中的肾脏细胞,包括巨噬细胞、肌成纤维细胞、内皮细胞和肾小管上皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,定量PCR | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏样本(野生型和Arg1mko小鼠)及人类肾脏活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 808 | 2026-06-26 |
1 Hz Low-Frequency Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation Ameliorates Epilepsy by Suppressing Interferon-γ Signaling-Dependent Microglial Synaptic Phagocytosis in Mice
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70979
PMID:42287127
|
研究论文 | 研究1 Hz低频重复经颅磁刺激通过抑制干扰素-γ信号依赖的小胶质细胞突触吞噬作用改善小鼠癫痫 | 首次揭示1 Hz LF-rTMS通过激活IFN-γ/STAT2信号通路并下调CADM1/2/3表达,抑制小胶质细胞突触吞噬,从而减轻癫痫发作和认知障碍的新机制 | 基于小鼠模型,临床相关性仅通过人脑组织snRNA-seq初步验证,缺少人体临床试验证据 | 探究低频重复经颅磁刺激对颞叶癫痫中活化小胶质细胞的影响及其分子机制和临床潜力 | 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠模型和人类海马硬化组织样本 | 机器学习 | 癫痫 | 单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 红藻氨酸诱导的颞叶癫痫小鼠及人类海马硬化组织样本 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | NA |
| 809 | 2026-06-26 |
Integrative Drug-Target Causal Analysis, Single-Cell Sequencing and In-Vivo Validation for Dissecting Molecular Mechanisms Underlying Focal Epilepsy
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70985
PMID:42295059
|
研究论文 | 结合单细胞测序与孟德尔随机化分析,鉴定局灶性癫痫的潜在药物靶点 | 首次整合单细胞表达数据、eQTL遗传数据和孟德尔随机化方法,系统解析局灶性癫痫的分子机制,并利用分子对接和动物模型进行验证 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制结果的普适性;未进行多组织或不同亚型的进一步分析 | 识别并验证局灶性癫痫的新药物靶点 | 局灶性癫痫患者及颞叶癫痫动物模型 | 自然语言处理 | 局灶性癫痫 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、共定位分析、分子对接 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | FinnGen和UK Biobank队列数据,包含局灶性癫痫病例和对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 来自GSE190452数据集的单细胞表达数据 |
| 810 | 2026-06-26 |
Inflammatory Neovascularization and Vascular Remodeling Associated With Carotid Plaque Destabilization
2026-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70992
PMID:42319127
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析颈动脉斑块不同区域中促进病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 | 首次系统分析颈动脉斑块动脉粥样硬化核心区和近端邻近区中血管新生和重塑的细胞异质性 | NA | 阐明颈动脉斑块不同区域中介导病理性新生血管和血管重塑的特定细胞亚群 | 颈动脉斑块的动脉粥样硬化核心区与近端邻近区 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 811 | 2026-06-26 |
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2026-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcag014
PMID:42344606
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研究论文 | 通过纵向研究揭示早期NDMA暴露通过持续干扰素信号和克隆扩增促进DNA甲基化损伤诱导的肝癌发生 | 首次在体内证明早期生命阶段的急性NDMA暴露可通过持续的DNA损伤信号、慢性干扰素激活和克隆扩增共同驱动MGMT依赖性肝癌发生,并定义了机制性生物标志物和潜在干预靶点 | 研究仅在小鼠模型中进行,人类外推到肝癌发生过程仍需验证;NDMA暴露剂量和时间窗口可能不完全模拟真实人类暴露场景 | 阐明早期环境诱变剂暴露如何促进潜伏性肝肿瘤发生的分子机制 | 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 | 机器学习 | 肝癌 | 转录组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织病理学 | NA | 转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据、组织病理图像 | 小鼠在出生后第8天和第15天腹腔注射NDMA,随访至暴露后10个月 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 812 | 2026-06-26 |
Incorporating WGCNA and Machine Learning to Identify ADAP2 as a Critical Efferocytosis-Related Gene in Sepsis
2026-Jun-01, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens15060596
PMID:42347208
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research paper | 整合WGCNA与机器学习方法识别ADAP2为脓毒症中关键胞葬作用相关基因 | 首次通过整合WGCNA与五种共识机器学习算法,从多维度转录组数据中筛选并验证ADAP2作为脓毒症核心胞葬相关基因,并揭示其在单核/巨噬细胞亚群中的动态表达模式 | 需要进行前瞻性验证和功能研究以确认临床价值 | 识别脓毒症中具有预后价值的胞葬作用相关生物标志物 | 脓毒症患者的全转录组数据和单细胞RNA-seq数据,以及脓毒症患者外周血单核细胞和盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症小鼠 | machine learning | sepsis | RNA-seq, qPCR, single-cell RNA-seq | WGCNA, consensus machine learning algorithms | 转录组数据(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) | 两个独立队列(GSE205672和GSE133822)及两个单细胞数据集(GSE167363和GSE175453) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2026-06-26 |
Genetically Informed Single-Cell Analysis Reveals PLXND1 as a Cell-Type-Specific Molecular Switch in MASLD
2026-May-30, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060378
PMID:42346358
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研究论文 | 整合遗传因果性与单细胞转录组学,揭示PLXND1在MASLD中作为细胞类型特异性分子开关 | 首次将孟德尔随机化与单细胞eQTL相结合,建立多组学因果框架,发现PLXND1在不同免疫细胞类型中具有相反的功能效应,并通过多维度验证其作为分子开关的作用 | 未明确说明研究的局限性 | 建立整合遗传因果性与细胞类型特异性组织功能紊乱的框架,揭示MASLD多组学因果架构 | MASLD患者的多组学数据、人类肝脏单细胞转录组数据、高脂饮食诱导的小鼠模型 | 机器学习和计算生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、代谢数据 | 大规模eQTL和pQTL数据集、14种免疫谱系的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 814 | 2026-06-26 |
A clinically relevant SLC2A1-associated malignant epithelial cell state predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-May-29, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01897-x
PMID:42209795
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研究论文 | 通过整合多组学分析,识别肺腺癌中与不良预后和免疫治疗反应相关的恶性上皮细胞状态,并构建风险评分模型 | 首次利用Scissor算法从单细胞转录组数据中鉴定与预后相关的恶性上皮细胞状态,并基于此建立风险评分模型SERS,关联免疫治疗反应 | 文中未明确提及研究限制 | 阐明肺腺癌中驱动不良预后和免疫治疗耐药的恶性上皮细胞状态,并提供生物标志物 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组分析、Scissor算法 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据 | 多个独立队列,包括免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 815 | 2026-06-26 |
Empowering fungal infection research with single-cell RNA sequencing
2026-May-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10304-x
PMID:42215623
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综述 | 综述了单细胞RNA测序技术在真菌感染研究中的应用,包括关键发现、宿主-真菌病原体相互作用机制、当前局限和未来方向 | 首次系统综述了单细胞RNA测序这一新兴技术在真菌感染领域的研究进展,强调了其在解析宿主-真菌相互作用动态变化中的潜力 | 单细胞RNA测序在真菌感染研究中仍存在技术挑战和应用差距,论文未提供具体解决方案 | 促进单细胞技术在真菌感染研究中的广泛应用 | 真菌病原体与宿主之间的相互作用 | 自然语言处理 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 816 | 2026-06-26 |
Highly Constrained Kinetic Models for Single-Cell Gene Expression Analysis
2026-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.727214
PMID:42244749
|
研究论文 | 该研究提出了一个高度约束的动力学模型,用于整合和分析单细胞基因表达数据,包括稳态和时间分辨数据 | 首次将单细胞RNA测序和高分辨率成像数据整合到统一动力学模型中,发现三态模型相较于传统双态模型的优势,并识别出广泛保守的无量纲量 | 未提及该方法在不同生物系统或更大规模数据集上的验证,以及模型参数估计的潜在不确定性 | 构建一个能够整合多种数据类型、模拟基因转录随机过程的动力学模型,以揭示基因表达动态和机制 | 单细胞基因表达动力学模型,适用于多种基因和转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单分子追踪 | 三态动力学模型 | 图像、时间序列数据 | 未明确提及样本数量,使用多个基因和数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 817 | 2026-06-26 |
Targeting Osteoporosis-Osteoarthritis Comorbidity: Multi-Omics Identification of SON and Exploration of Therapeutic Agents
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114905
PMID:42278435
|
研究论文 | 采用多组学方法识别骨质疏松症与骨关节炎共病的关键基因SON,并探索潜在治疗药物尼洛替尼 | 首次通过WGCNA、孟德尔随机化和单细胞测序多方法联合验证,确认SON蛋白是OP与OA共病的关键链接分子和潜在治疗靶点 | 需要进一步的功能研究证实SON的因果作用,且相关体外实验仍有待深入开展 | 探索骨质疏松症与骨关节炎共病的共享分子通路及潜在治疗靶点 | 骨质疏松症与骨关节炎共病患者 | 机器学习 | 骨质疏松症,骨关节炎 | NA | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 818 | 2026-06-26 |
CCR5 and CD74 are potential therapeutic targets for necroinflammation in preclinical cholesterol crystal embolism
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv8372
PMID:42202044
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胆固醇晶体栓塞模型中肾脏细胞变化,并发现CCR5和CD74作为坏死性炎症的潜在治疗靶点 | 首次构建胆固醇晶体栓塞肾脏的单细胞图谱,并鉴定CCR5和CD74信号通路在血管损伤和急性肾损伤中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,需要进一步在人类患者中验证靶点的有效性和安全性 | 探索胆固醇晶体栓塞导致急性肾损伤的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | C57BL/6J小鼠胆固醇晶体栓塞模型及人类肾活检样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型(C57BL/6J)及人类肾活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 819 | 2026-06-26 |
Genomic instability drives POSTN+ myofibroblasts via STING-WNT axis to promote immunosuppression and PARPi resistance in ovarian cancer
2026-May-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ady2719
PMID:42202048
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了基因组不稳定性通过STING-WNT轴驱动POSTN+肌成纤维细胞促进免疫抑制和PARP抑制剂耐药性的机制 | 首次阐明肿瘤内在基因组不稳定性通过STING-WNT信号轴指导基质重编程,将基因组不稳定性驱动的免疫激活转化为免疫抑制,并鉴定POSTN为基质特异性免疫检查点 | 研究主要基于临床样本和动物模型,POSTN阻断治疗的长期效果和临床转化潜力需进一步验证 | 探究肿瘤内在基因组不稳定性如何通过基质重编程促进免疫抑制和PARPi耐药 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本、卵巢癌和乳腺癌模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序及单细胞表观基因组测序 |
| 820 | 2026-06-26 |
Spatially-Resolved Multiomic Atlas of Leiomyosarcoma Identifies Two Clinically Relevant Epigenetically-Driven Cell States
2026-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726988
PMID:42244620
|
研究论文 | 通过对未经治疗的平滑肌肉瘤进行单细胞多组学测序,识别出两种表观遗传驱动的细胞状态及其临床意义 | 首次在单细胞水平上揭示平滑肌肉瘤中存在两种先前未知且表观遗传学不同的细胞状态,并发现NFI和AP-1转录因子在其中的调控作用,以及空间转录组学揭示的肿瘤免疫微环境差异 | 未提及研究的具体局限性 | 从转录组和表观基因组层面理解平滑肌肉瘤的细胞异质性和分子基础 | 未经治疗的原发性平滑肌肉瘤组织 | 数字病理学 | 平滑肌肉瘤 | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 128个平滑肌肉瘤样本的328个组织芯 | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium单细胞多组学、10x Visium空间转录组学 | 10x Chromium单细胞多组学测序、10x Visium空间转录组学分析 |