单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
801	2025-05-26	Single-cell RNA sequencing reveals adrb1 as a sympathetic nerve-regulated immune checkpoint driving T cell exhaustion and impacting immunotherapy in esophageal squamous cell carcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1520766 PMID:40406147	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示了ADRB1作为交感神经调节的免疫检查点，驱动T细胞耗竭并影响食管鳞状细胞癌的免疫治疗效果	首次发现ADRB1在食管鳞状细胞癌中作为免疫检查点的作用，并通过单细胞RNA测序和实验验证揭示了其在T细胞耗竭和免疫治疗中的作用	研究主要基于单细胞RNA测序和TCGA数据，需要进一步的体内实验验证ADRB1的调控机制和治疗潜力	探索ADRB1在食管鳞状细胞癌中的免疫调节作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	食管鳞状细胞癌（ESCC）患者样本中的T细胞和其他免疫细胞	数字病理学	食管鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、拷贝数变异（CNV）分析	NA	单细胞RNA测序数据、TCGA数据	未明确提及具体样本数量，但涉及ESCC患者的新辅助治疗前后样本
802	2025-05-26	Single-Cell RNA-Seq Recognized Key Genes for Metastasis and Macrophage Infiltration in Colorectal Cancer 2025, Human mutation IF:3.3Q2 DOI:10.1155/humu/9488531 PMID:40406545	研究论文	通过单细胞RNA测序技术识别结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因	首次利用单细胞RNA测序数据识别出ZFAND2A作为结直肠癌转移和巨噬细胞浸润的关键基因，并验证其在癌细胞活性和巨噬细胞极化中的功能	研究主要基于体外实验，尚未进行体内验证	探索结直肠癌转移和免疫细胞浸润的分子机制	结直肠癌组织和相关基因	数字病理学	结直肠癌	scRNA-seq, qRT-PCR, WB分析, CCK-8, transwell实验, ELISA, 流式细胞术	lasso回归	基因表达数据	GSE261012和GSE234804数据集中的样本
803	2025-05-26	CD9 expression rivals IDH mutation as a prognostic marker in glioma: a novel nomogram approach 2025, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2025.1507443 PMID:40406701	研究论文	本研究评估了四跨膜蛋白CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，以确立其临床相关性并确定治疗策略	CD9作为胶质瘤的预后生物标志物，其过表达与肿瘤发展的因果关系得到证实，并开发了基于CD9的列线图以提高预后精确度	研究样本主要来自TCGA和CGGA队列，可能无法完全代表所有胶质瘤患者群体	评估CD9在胶质瘤中的预后意义和功能机制，确立其临床相关性并确定治疗策略	胶质瘤患者样本	数字病理学	胶质瘤	多组学分析、单细胞RNA测序、Mendelian randomization (MR)、KEGG富集分析、PPI网络构建	Cox回归、CellChat、Monocle3	基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据	1,033个胶质瘤样本（来自TCGA和CGGA队列）和20个胶质母细胞瘤病例的单细胞RNA测序数据
804	2025-05-26	Fibroblast-specific TGF-β signaling mediates cardiac dysfunction, fibrosis, and hypertrophy in obese diabetic mice 2024-Dec-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae210 PMID:39373248	research paper	该研究探讨了成纤维细胞特异性TGF-β信号在2型糖尿病心肌病发病机制中的作用	揭示了成纤维细胞特异性TGF-β/Smad3信号通路在糖尿病心肌病中的关键作用，并发现TSP-4可能作为糖尿病诱导的纤维化介质	体外实验未显示TSP-4对心脏成纤维细胞有明显的激活作用	研究TGF-β诱导的成纤维细胞激活在糖尿病心肌病发病机制中的作用	肥胖糖尿病小鼠（db/db小鼠）的心脏成纤维细胞	心血管疾病研究	心血管疾病	转录组学研究、scRNA-seq、Ingenuity通路分析（IPA）	小鼠模型	基因表达数据、scRNA-seq数据	肥胖db/db小鼠和瘦型小鼠
805	2025-05-26	Olfr2-positive macrophages originate from monocytes proliferate in situ and present a pro-inflammatory foamy-like phenotype 2024-Nov-05, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae153 PMID:39229899	研究论文	本研究探讨了表达嗅觉受体2（Olfr2）的血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的功能表型和起源	首次揭示了Olfr2+巨噬细胞来源于单核细胞，并在疾病早期阶段积累，具有增殖和促炎潜能	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究Olfr2+血管巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用机制	Olfr2+巨噬细胞及其前体单核细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、RNA-seq、流式细胞术	Apoe-/-小鼠模型	基因表达数据、细胞表型数据	CD45.1Apoe-/-Olfr2+/+和CD45.2Apoe-/-Olfr2-/-小鼠
806	2025-05-26	Serine protease inhibitor, SerpinA3n, regulates cardiac remodelling after myocardial infarction 2024-Jul-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvae075 PMID:38666458	research paper	该研究探讨了丝氨酸蛋白酶抑制剂SerpinA3n在心肌梗死后心脏重塑中的调节作用	首次揭示了SerpinA3n通过调节基质功能和炎症反应影响心肌梗死后心脏重塑的因果作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	理解Serpins在心肌梗死后瘢痕形成中的调节作用	心肌梗死后的心脏重塑过程	心血管疾病研究	心血管疾病	单细胞转录组学、蛋白质组学分析	条件性基因敲除小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	SerpinA3n条件性敲除小鼠
807	2025-05-26	Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19 2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.) DOI:10.1097/FM9.0000000000000190 PMID:40406392	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了一名康复的COVID-19孕妇的外周血单个核细胞的免疫反应	首次在单细胞分辨率下描绘了COVID-19康复孕妇的PBMCs免疫基因表达图谱，并发现CD16阳性单核细胞和MAIT细胞在母体免疫反应中的关键作用	研究样本量较小（仅1名患者），且缺乏纵向数据跟踪	探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制	孕妇外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1名COVID-19康复孕妇的PBMCs样本，与公开数据集中的健康孕妇对照进行比较
808	2025-05-25	NR2F2 and its contribution to lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma 2025-Aug, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111814 PMID:40262715	研究论文	探讨NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的作用及其与肿瘤干细胞特性的关系	首次将NR2F2与口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移联系起来，并揭示其在肿瘤干细胞亚群中的关键作用	研究主要基于细胞和动物模型，临床样本验证仍需进一步扩大	研究NR2F2在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中的分子机制	口腔鳞状细胞癌患者样本、肿瘤细胞系和动物模型	肿瘤生物学	口腔鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、Western blot、功能实验、体内实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据	未明确说明患者样本数量，包含细胞系和动物模型
809	2025-05-25	Atlas of temporal molecular pathological alterations after traumatic brain injury based on RNA-Seq 2025-Aug, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115270 PMID:40268159	研究论文	该研究通过RNA测序技术，系统描绘了创伤性脑损伤（TBI）后不同时间点的分子病理变化图谱	首次利用RNA-seq和WGCNA方法，全面揭示了TBI进展过程中时间依赖性的分子病理变化，并重点分析了细胞焦亡在神经炎症过程中的关键作用	研究仅使用了C57/BL6小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	揭示创伤性脑损伤后时间依赖性的分子病理变化机制	C57/BL6小鼠脑组织	生物信息学	创伤性脑损伤	RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光	WGCNA, Mfuzz	RNA测序数据	C57/BL6小鼠在10个时间点（0h至7d）的脑组织样本
810	2025-05-25	Unraveling the immune activation mechanisms of DAMPs in coronary artery disease through transcriptomic and single-cell analyses 2025-Jul, Cytokine IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cyto.2025.156952 PMID:40306092	研究论文	本研究通过转录组学和单细胞分析探讨了损伤相关分子模式（DAMPs）在冠状动脉疾病（CAD）中触发免疫激活的机制	揭示了P2RY14和IFIH1基因在CAD中的显著表达差异及其在免疫反应和炎症过程中的潜在作用，以及单细胞分析中免疫细胞的独特聚类模式	NA	探究DAMPs在CAD中触发免疫激活的机制	冠状动脉疾病（CAD）患者	生物信息学	心血管疾病	RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	转录组数据, 单细胞数据	来自GSE202625、GSE242046和GSE159677数据集的RNA-seq和单细胞RNA-seq数据
811	2025-05-25	Unveiling the spatiotemporal strategies of plants in response to biotic and abiotic stresses:A comprehensive review 2025-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109967 PMID:40315636	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术在研究植物应对生物和非生物胁迫的细胞水平响应中的应用	首次全面探讨了scRNA-seq和ST技术在植物环境胁迫响应研究中的应用，填补了先前综述的空白	植物组织解离的挑战限制了单细胞技术在植物研究中的广泛应用	揭示植物在细胞水平上应对环境胁迫的时空策略	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据, 空间转录组数据	NA
812	2025-05-25	Apocrine Gland Damage and the Release of Specific Keratins in Early Stage Indicate the Crucial Involvement of Apocrine Glands in Hidradenitis Suppurativa 2025-Jun, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.09.021 PMID:39547394	research paper	本研究探讨了顶泌汗腺在化脓性汗腺炎（HS）发病机制中的潜在作用，通过免疫组织化学和单细胞测序技术分析了HS患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤	首次报道了顶泌汗腺在HS早期病变中的损伤及释放特定角蛋白的现象，揭示了顶泌汗腺在HS发病机制中的关键作用	样本量较小（HS患者n=12，健康对照n=8），且仅针对早期病变进行研究	探讨顶泌汗腺在化脓性汗腺炎发病机制中的作用	化脓性汗腺炎患者和健康对照组的非病变皮肤和早期病变皮肤	皮肤病学	化脓性汗腺炎	免疫组织化学，单细胞测序	NA	组织样本，血清样本	HS患者n=12（组织样本），n=20（血清样本）；健康对照n=8
813	2025-01-07	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions 2025-Jun, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013 PMID:39756533	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
814	2025-05-25	Transcriptional reprogramming triggered by neonatal UV radiation or Lkb1 loss prevents BRAFV600E-induced growth arrest in melanocytes 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03339-7 PMID:40057604	研究论文	该研究揭示了新生儿UV辐射或Lkb1缺失通过触发转录重编程阻止BRAFV600E诱导的生长停滞，从而促进黑色素瘤发展的机制	发现了独立于痣进展的BRAF突变黑色素瘤发展新机制，并识别出潜在治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究	阐明UVB引发的新生儿特异性黑色素瘤与BRAF相关的生长停滞机制	黑色素细胞和黑色素瘤	肿瘤生物学	黑色素瘤	单细胞转录组学、基因组分析	小鼠模型	基因组数据、转录组数据、临床数据	未明确说明具体样本数量（包含小鼠模型和人类临床数据）
815	2025-05-25	GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data 2025-Jun, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110283 PMID:40311462	研究论文	通过结合单细胞RNA测序数据和深度学习技术，识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点	开发了一个结合自编码器、分类器和判别器的深度学习框架，分析免疫细胞中的基因表达，包括传统方法常忽略的细微遗传变异	研究主要关注外周血单个核细胞，可能未涵盖所有相关细胞类型或组织	识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点	阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单个核细胞	数字病理学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	对抗自编码器(AAE)	基因表达数据	NA
816	2025-05-25	An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression 2025-May-23, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633 PMID:40408430	research paper	该研究通过工程化病毒蛋白激活STAT5，以增强T细胞功能并防止其耗竭	利用工程化的疱疹病毒蛋白TIP招募LCK激酶直接激活STAT蛋白，实现细胞因子非依赖的T细胞功能维持	研究主要针对STAT5激活，未全面评估其他STAT蛋白的影响	探索通过重编程信号通路增强T细胞在实体瘤中的持久性和功能	T细胞（特别是CD8+ T细胞）和STAT5信号通路	免疫治疗	肿瘤	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	未明确样本数量（体外和体内T细胞实验）
817	2025-05-25	M-band wavelet-based multi-view clustering of cells 2025-May-23, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1013060 PMID:40408513	研究论文	本文提出了一种基于M波段小波的单细胞RNA测序数据多视图聚类方法（WMC）	首次将M波段小波分析与UMAP结合应用于scRNA-seq数据，能够发现稀有细胞类型并进行缺失细胞类型的可视化	方法在scRNA-seq数据中的应用尚未广为人知，可能缺乏与其他方法的广泛比较	开发新的单细胞RNA测序数据分析方法以提高细胞类型鉴别的分辨率	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	scRNA-seq, M-band小波分析, UMAP	多视图聚类	基因表达数据	一组单细胞测序数据集（具体数量未提及）
818	2025-05-25	Association of DNA damage response signals and oxidative stress status with nivolumab efficacy in patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2025-May-23, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03032-2 PMID:40410274	research paper	研究DNA损伤反应信号和氧化应激状态与头颈鳞状细胞癌患者对nivolumab疗效的关联	首次在头颈鳞状细胞癌患者中，通过外周血单核细胞检测DNA损伤反应信号和氧化应激状态，探索其与免疫检查点抑制剂疗效的相关性	样本量较小（50例患者），需要进一步验证	探索DNA损伤反应信号和氧化应激状态作为预测头颈鳞状细胞癌患者对nivolumab疗效的生物标志物	头颈鳞状细胞癌患者	肿瘤免疫学	头颈鳞状细胞癌	空间转录组学	NA	RNA测序数据	26名健康对照和50名复发/转移性头颈鳞状细胞癌患者
819	2025-05-25	Angiopoietin-TIE2 feedforward circuit promotes PIK3CA-driven venous malformations 2025-May-23, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-025-00655-9 PMID:40410415	研究论文	本文揭示了静脉畸形（VMs）中PI3Kα-TIE2信号环路的作用机制及其作为治疗靶点的潜力	发现了PI3K-FOXO1-ANGPT-TIE2信号环路在PIK3CA相关静脉畸形中的核心驱动作用，并验证了TIE2作为治疗靶点的有效性	mTOR阻断对晚期静脉畸形的治疗效果有限	探究PIK3CA突变导致的静脉畸形的发病机制并寻找潜在治疗靶点	PIK3CA突变导致的静脉畸形	血管生物学	静脉畸形	单细胞转录组学、谱系追踪	小鼠模型	基因表达数据	小鼠和人类静脉畸形样本
820	2025-05-25	Confronting the challenge of cell segmentation in spatial transcriptomics 2025-May-23, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-025-02717-z PMID:40410420	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA