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当前共找到 34772 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-12-22 |
Heimdall: A Modular Framework for Tokenization in Single-Cell Foundation Models
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.09.687403
PMID:41292913
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研究论文 | 本文介绍了Heimdall，一个用于系统评估单细胞基础模型中标记化策略的模块化框架和开源工具包 | 提出首个全面框架，将单细胞基础模型分解为模块化组件，实现标记化策略的细粒度控制和归因，并系统评估其在跨分布转移场景下的影响 | 未明确说明样本量或具体数据集细节，可能限制了结果的普适性验证 | 系统评估单细胞基础模型中标记化策略对模型性能的影响，特别是在分布转移场景下 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 802 | 2025-12-22 |
KLF7 as a biomarker for the pre-metastatic state promotes colorectal cancer liver metastasis via TGFβ autocrine signaling
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218123
PMID:41213461
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，定义了结直肠癌肝转移前的“前转移状态”细胞亚群及其亚型，并鉴定出KLF7作为关键生物标志物，通过TGFβ自分泌信号通路促进转移 | 首次系统定义了结直肠癌肝转移的“前转移状态”细胞亚群及其两个亚型，并揭示了KLF7通过TGFβ自分泌信号驱动转移的新机制 | 未明确说明样本的具体数量及来源细节，机制研究的体内外模型细节未充分描述 | 识别和表征能够成功从原发肿瘤播散并定植转移部位的转移起始细胞亚群，以预防转移 | 结直肠癌细胞、转移起始细胞亚群（前转移状态细胞） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 机器学习、生物信息学分析、双荧光素酶报告基因实验、体外和体内实验 | NA | RNA测序数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 803 | 2025-12-22 |
D-dimer drives immune dysregulation in COVID-19 via chemokine modulation and inflammatory signaling
2025-Nov, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2025.199641
PMID:41083108
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研究论文 | 本研究探讨了D-二聚体在COVID-19中通过调节趋化因子和炎症信号通路驱动免疫失调的作用 | 揭示了D-二聚体作为血栓炎症反应的潜在驱动因子，不仅作为临床生物标志物，还通过上调趋化因子（如CXCL5、CXCL6）和富集IL-17、PI3K-Akt等炎症通路来调节免疫微环境 | 体外实验使用THP-1细胞系，可能无法完全模拟体内复杂免疫环境；样本来自上海地区，可能存在地域局限性 | 探究D-二聚体在COVID-19免疫调节中的作用机制 | COVID-19患者（轻症和重症）及SARS-CoV-2阴性对照参与者 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、体外细胞刺激实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 356名参与者（包括轻症和重症COVID-19患者及阴性对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 804 | 2025-12-22 |
Age-Related Changes in Myeloid Cells and Their Impact on Subcutaneous Melanoma Growth in Mice
2025-Nov, Aging and cancer
DOI:10.1002/aac2.70006
PMID:41409350
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研究论文 | 本研究探讨了衰老如何通过改变Gr-1+髓系细胞的功能来影响小鼠皮下黑色素瘤的生长及免疫治疗反应 | 揭示了衰老背景下Gr-1+髓系细胞功能增强（如CD8+ T细胞抑制、活性氧产生和胞外陷阱形成）与黑色素瘤生长加速及免疫治疗反应差异之间的关联，并首次证明髓过氧化物酶（MPO）在此过程中的关键驱动作用 | 研究主要在YUMM1.7黑色素瘤细胞系和小鼠模型中进行，结论可能不适用于所有黑色素瘤亚型或人类情况；研究聚焦于Gr-1+髓系细胞，其他免疫细胞类型的影响未全面探讨 | 表征衰老如何改变Gr-1+髓系细胞功能及其对黑色素瘤生长和免疫治疗反应的影响 | 2月、6月和12月龄的野生型小鼠及同基因型髓过氧化物酶缺陷小鼠，以及多种YUMM黑色素瘤细胞系（特别是YUMM1.7） | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞功能分析（CD8+ T细胞抑制、活性氧检测、胞外陷阱形成评估） | 小鼠皮下黑色素瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、肿瘤生长测量数据 | 多个年龄组（2、6、12月龄）的野生型和MPO缺陷型小鼠，使用多种YUMM黑色素瘤细胞系进行肿瘤生长评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 805 | 2025-12-22 |
LEGEND: Identifying Co-expressed Genes in Multimodal Transcriptomic Sequencing Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf056
PMID:40591483
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LEGEND的计算方法，用于整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，以识别细胞类型和组织域水平的共表达基因群 | LEGEND通过创新的层次聚类算法整合scRNA-seq和SRT数据，最大化簇内冗余和簇间互补性，从而更精细地捕捉基因共表达和空间一致性模式 | NA | 识别跨组织域和细胞类型的共表达基因，以揭示生物或病理过程中的共功能基因 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 层次聚类算法 | 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 806 | 2025-12-22 |
Integrative exome sequencing and machine learning identify MICB and interferon pathway genes as contributors to SSc risk
2025-Aug, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.009
PMID:40514331
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研究论文 | 本研究通过整合外显子组测序、机器学习、单细胞RNA测序和表达数量性状位点分析，识别了系统性硬化症的新风险基因位点和致病通路 | 采用进化作用-机器学习框架整合多组学数据，首次发现MICB和干扰素通路基因在系统性硬化症风险中的关键作用 | 研究主要基于高加索和欧洲血统人群，结果可能不适用于其他种族群体 | 识别系统性硬化症的蛋白质编码变异和致病通路 | 系统性硬化症患者和对照组的遗传与表达数据 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 外显子组测序, 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析 | 机器学习 | 遗传数据, 表达数据 | 初始GWAS包括2,559例病例和893例对照，复制阶段包括9,846例病例和18,333例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 807 | 2025-12-22 |
Single-cell and spatial transcriptomics of stricturing Crohn's disease highlights a fibrosis-associated network
2025-Jul, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02225-y
PMID:40562913
|
研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术，分析了克罗恩病（CD）狭窄病变中的纤维化相关网络 | 首次在CD狭窄病变中配对应用单细胞和空间转录组学，揭示了免疫细胞、炎症成纤维细胞等关键亚群的空间共定位，并将基因表达与肠道生物地理学及遗传风险位点关联 | 样本量相对有限（61个样本来自31名患者），且未涉及长期随访或治疗干预效果评估 | 探究克罗恩病狭窄病变的纤维化机制和细胞网络 | 克罗恩病患者和非炎症性肠病患者的肠道组织样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 61个样本来自21名CD患者和10名非IBD患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 808 | 2025-12-22 |
Single-cell RNA-seq data normalization: A benchmarking study
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335102
PMID:41411311
|
研究论文 | 本研究对六种广泛使用的单细胞RNA测序数据标准化方法进行了全面的基准测试分析 | 从细胞聚类、差异表达分析和计算资源需求三个角度，结合七个真实数据集和四个模拟数据集，系统评估了不同标准化方法的性能 | NA | 评估单细胞RNA测序数据标准化方法的性能，为学者选择合适的工具提供参考 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个真实数据集和四个模拟数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 809 | 2025-12-22 |
MEGF8-driven metabolic reprogramming and immune evasion define a high-risk subtype of endometriosis-associated ovarian cancer
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/AOPY5249
PMID:41415082
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和临床数据，识别了与子宫内膜异位症相关的卵巢癌预后生物标志物，并构建了一个8基因预后模型 | 首次通过共识聚类识别了卵巢癌的三种分子亚型，并发现亚型A具有'双重恶性表型'，同时构建了包含MEGF8的8基因预后模型，揭示了MEGF8通过代谢重编程和免疫逃逸促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床研究验证，且体外实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 识别子宫内膜异位症相关卵巢癌的预后生物标志物并探索其分子机制 | 卵巢癌患者（来自TCGA-OC和GSE53963数据库）及卵巢癌细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 卵巢癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LASSO回归、Cox回归、体外功能验证 | 预后模型（基于LASSO和Cox回归）、共识聚类 | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-OC和GSE53963数据库的卵巢癌患者样本，以及GSE184880单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 810 | 2025-12-22 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity among AT2 epithelial cells in the lung adenocarcinoma microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1735459
PMID:41415280
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺腺癌微环境中AT2上皮细胞的异质性及其在肿瘤发生中的作用 | 首次在早期肺腺癌患者中通过单细胞RNA测序全面描绘AT2细胞的转录组景观，并识别出与预后相关的关键基因和调控网络 | 样本量较小（仅3名患者），且仅针对早期肺腺癌，可能无法代表所有疾病阶段 | 阐明肺腺癌微环境中细胞类型特异性转录组景观及肿瘤微环境对疾病的影响 | 肺腺癌组织及匹配的邻近正常组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名早期肺腺癌患者的肿瘤和正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 811 | 2025-12-22 |
Complementary strategies in pancreatic cancer precision medicine: therapeutic prediction and immune modulation
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1718911
PMID:41415544
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌精准医学的最新进展，包括类器官药物筛选平台、mRNA免疫疗法和整合诊断技术 | 整合了患者来源类器官的药物敏感性预测、个性化mRNA新抗原疫苗以及空间转录组学和液体活检的实时分子监测，代表了互补的精准医学策略 | 各方法已展示独立临床价值，但它们的整合仍是未来重要方向，目前尚未形成全面框架 | 探讨胰腺导管腺癌精准医学中的治疗预测和免疫调节策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，液体活检，药物敏感性测试 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 812 | 2025-12-22 |
Investigation for atherosclerotic plaque rupture with thrombosis in mice based on single-cell sequencing and bioinformatics analysis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1658170
PMID:41415585
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学分析，探索了小鼠动脉粥样硬化斑块破裂伴血栓形成的关键基因和调控通路 | 首次结合单细胞RNA测序和生物信息学分析，识别了动脉粥样硬化斑块破裂伴血栓形成中的关键基因和细胞亚群，并提出了新的生物标志物 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明，可能影响统计效力 | 探索动脉粥样硬化斑块破裂伴血栓形成过程中的关键基因，为临床治疗提供新研究方向 | 小鼠动脉粥样硬化斑块破裂伴血栓形成模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2025-12-22 |
Multi-omics analysis unveils the role of lipid metabolism-derived acylation modifications in POAG and its potential implications
2025 Jan-Dec, Therapeutic advances in ophthalmology
IF:2.3Q2
DOI:10.1177/25158414251405373
PMID:41416255
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了脂质代谢衍生的酰化修饰在原发性开角型青光眼中的作用及其潜在机制 | 首次整合孟德尔随机化、转录组学、机器学习与单细胞测序，系统揭示了脂质代谢衍生的酰化修饰（如棕榈酰化、肉豆蔻酰化）通过ALAS2和PLCE1基因驱动POAG发病的新机制 | 研究主要基于公共数据库（GEO、GWAS）和体外样本，缺乏大规模临床队列验证，且机制细节需进一步实验证实 | 探索脂质代谢衍生的酰化修饰在原发性开角型青光眼发病中的作用及分子机制 | 原发性开角型青光眼相关的脂质代谢特征、酰化修饰基因及人小梁网样本 | 多组学分析 | 青光眼 | 多组学整合分析（孟德尔随机化、转录组学、单细胞测序）、机器学习 | 机器学习特征选择模型 | 基因组、转录组、单细胞测序数据 | 基于公共数据库（GEO、GWAS、PubChem）及人小梁网单细胞测序样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 814 | 2025-12-22 |
Reprogramming of cells during embryonic transfating: overcoming a reprogramming block
2024-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.203152
PMID:39628450
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海胆胚胎中细胞在缺失微球细胞后的重编程过程，并发现信号时序对色素细胞恢复的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术实时追踪胚胎细胞在转命运过程中的基因调控状态转变，并揭示Delta信号在Nodal信号之前表达可克服重编程障碍 | 研究仅针对海胆胚胎模型，未验证其他动物胚胎中的普适性 | 探究胚胎调节性发育中细胞替代能力的分子机制 | 海胆胚胎细胞（特别是微球细胞缺失后的早期内胚层细胞） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及多个时间点的海胆胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 815 | 2025-12-21 |
Spatial evidence for carcinoma in situ (CIS) as an entity in human papillomavirus (HPV)-associated tonsillar squamous cell carcinoma (TSCC)
2026-Feb-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70207
PMID:41129372
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研究论文 | 本研究通过系统综述、荟萃分析和空间转录组学技术，探讨了人乳头瘤病毒相关扁桃体鳞状细胞癌的起源和进展模式 | 首次使用空间转录组学技术比较扁桃体原位癌与宫颈高级别上皮内病变，揭示了它们在基因表达上的高度相关性，并识别出与组织学相关的上皮细胞簇 | 样本量相对较小，且研究基于假设性存在纯扁桃体发育不良病变，需要进一步验证 | 研究人乳头瘤病毒相关扁桃体鳞状细胞癌的肿瘤起源和进展机制 | 人乳头瘤病毒相关扁桃体鳞状细胞癌、宫颈癌和人乳头瘤病毒无关口腔癌病例 | 数字病理学 | 扁桃体鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括系统综述中的多项研究和空间转录组学分析的具体病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 816 | 2025-12-21 |
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2026-Feb, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156429
PMID:41205649
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞中Slc2a5介导的果糖代谢途径在急性缺血性脑卒中（AIS）早期进展中的关键作用及其神经保护机制 | 首次发现小胶质细胞Slc2a5（果糖转运蛋白）通过调控果糖代谢加剧AIS脑损伤，并阐明其通过PKM2介导小胶质细胞向神经保护亚群分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需验证；机制研究集中在PKM2通路，可能存在其他调控途径 | 探究小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中病理机制中的作用，寻找潜在治疗靶点 | 小胶质细胞、小鼠AIS模型 | 神经科学 | 急性缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除、体外实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、病理表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 817 | 2025-12-21 |
SAMD4A inhibits abdominal aortic aneurysm development and VSMC phenotypic transformation through targeting KDM2B
2026-Jan, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.018
PMID:40081568
|
研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白SAMD4A通过靶向KDM2B抑制腹主动脉瘤（AAA）发展和血管平滑肌细胞（VSMC）表型转化的机制 | 首次发现SAMD4A在AAA形成过程中调控VSMC表型转化的作用，并阐明其通过结合KDM2B抑制VSMC收缩标志物转录的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性仍需进一步验证 | 探究SAMD4A是否抑制VSMC表型转化并阻止AAA形成 | 腹主动脉瘤（AAA）和血管平滑肌细胞（VSMC） | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq），RNA免疫沉淀测序（RIP-seq），染色质免疫沉淀定量PCR（ChIP-qPCR） | NA | 单细胞转录组数据，RNA测序数据，染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 818 | 2025-12-21 |
Development of a fully human glioblastoma-in-brain-spheroid model for accelerated translational research
2026-Jan, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.055
PMID:40188875
|
研究论文 | 本文开发了一种名为hGliCS的完全人类胶质母细胞瘤-脑球体模型，用于加速转化研究 | 结合患者来源的胶质母细胞瘤细胞与诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元，克服了现有模型的关键限制 | NA | 研究胶质母细胞瘤与脑微环境（特别是神经元）的相互作用，以加速转化研究和药物筛选 | 患者来源的胶质母细胞瘤细胞和诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 819 | 2025-12-21 |
A cell-type-specific regulon controlling monoterpene indole alkaloid biosynthesis with feedback and feedforward activation loops
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70712
PMID:41208325
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探究了两种植物中单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其调控网络 | 首次在两种远缘植物物种中，通过单细胞RNA-seq数据揭示了MYB和bHLH转录因子在细胞类型特异性MIA生物合成中的共同调控机制，并构建了包含反馈和前馈激活环路的基因调控网络 | 研究主要基于单细胞RNA-seq数据，可能未完全覆盖所有调控因子或细胞类型，且实验验证主要依赖于过表达分析 | 探究单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其转录调控机制 | 两种植物物种：Catharanthus roseus和Camptotheca acuminata | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 来自C. acuminata茎部的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 820 | 2025-12-21 |
Bulk Transcriptome and Single-Cell Sequencing Datasets Reveal Key Programmed Cell Death Patterns in Radiation-Induced Lung Injury: Crosstalk Between NETosis and Macrophages' Responses
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503208R
PMID:41405834
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研究论文 | 本研究整合了批量转录组和单细胞RNA测序数据集，揭示了辐射诱导肺损伤中NETosis与巨噬细胞反应之间的关键程序性细胞死亡模式 | 首次通过整合批量转录组和单细胞测序数据，识别出NETosis是辐射诱导肺损伤中最显著的程序性细胞死亡亚型，并揭示了中性粒细胞与巨噬细胞之间的交互作用及转录因子调控网络 | 研究依赖于公共数据集，可能受限于样本来源和实验条件的异质性，且未进行体内或体外实验验证 | 探究辐射诱导肺损伤中程序性细胞死亡的特定亚型及其细胞类型特异性模式 | 肺组织样本，包括辐射处理和对照 | 数字病理学 | 肺损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自三个公共数据集（GSE25295, GSE41789, GSE211713）的样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |