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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-05-09 |
LILRB2+ monocytes reshape the immune activation landscape in immunotherapy with non-small cell lung cancer: Evidence from real-world cohorts and single-cell analyses
2026-Apr-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152331
PMID:42069195
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研究论文 | 本研究利用真实世界队列和单细胞分析,揭示LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中重塑免疫激活景观的作用 | 首次在单细胞水平解析LILRB2+单核细胞亚群对PD-1/PD-L1免疫治疗的影响,并建立LILRB2/S100A8单核细胞比值作为新的疗效预测指标 | 未充分探索LILRB2+单核细胞与其他免疫细胞的相互作用机制,且样本量有限,需进一步验证 | 探究LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中的作用及其预测价值 | 非小细胞肺癌患者的转录组数据和临床数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自OAK、POPLAR和ORIENT-11临床试验的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 802 | 2026-05-09 |
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Apr-29, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112560
PMID:42066829
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研究论文 | 本研究阐明了LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能及分子机制,并评估了其在多种人类癌症中的临床相关性 | 首次揭示LC3B通过Sp1-Cyclin D1/p27轴调控膀胱癌细胞增殖的非经典自噬功能,并进行了泛癌临床关联分析 | 未明确LC3B脂化独立功能的详细机制,且未涉及LC3B在免疫微环境中的作用 | 阐明LC3B在膀胱癌中的表达、功能及分子机制,并评估其泛癌临床意义 | 膀胱癌患者样本及T24T、J82膀胱癌细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除、细胞周期分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 膀胱癌上皮细胞及T24T、J82细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 803 | 2026-05-09 |
Aqueous extract of Solanum nigrum L. restrains colorectal cancer progression by blocking cancer-associated fibroblast-induced STAT3-Annexin A2 signaling
2026-Apr-28, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158257
PMID:42097000
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研究论文 | 该研究通过多组学分析发现龙葵水提物通过阻断癌相关成纤维细胞诱导的STAT3-Annexin A2信号通路抑制结直肠癌进展 | 首次揭示龙葵水提物通过直接结合STAT3调控ANXA2转录、破坏ANXA2-Cortactin复合物形成及抑制细胞骨架重塑的完整抗转移分子机制,并整合单细胞转录组与蛋白质组学数据识别药物靶点 | 研究中未提及龙葵水提物中除茄碱和边茄碱外其他活性成分的潜在贡献,且STAT3直接结合实验基于体外条件,体内药效学验证尚需更多临床前数据支撑 | 系统鉴定龙葵水提物的生物活性成分,阐明其在结直肠癌模型中的抗转移分子机制 | 结直肠癌细胞及皮下异种移植瘤、APCMin/+小鼠、实验性转移模型小鼠 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、TMT蛋白质组学、药物-靶标相互作用分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 人类结直肠癌单细胞RNA测序数据(具体样本量未说明)、多种小鼠模型(皮下移植瘤、APCMin/+、转移模型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类结直肠癌单细胞转录组分析 |
| 804 | 2026-05-09 |
Exogenous pyruvate restores mitochondrial bioenergetics by synergizing with the AMPK-mTOR-SIRT3 pathway to alleviate sepsis-associated acute kidney injury
2026-Apr-22, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112089
PMID:42031090
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研究论文 | 本研究揭示外源性丙酮酸乙酯通过AMPK-mTOR-SIRT3信号通路协同恢复线粒体生物能量学,从而减轻脓毒症相关急性肾损伤 | 首次阐明外源性代谢底物丙酮酸乙酯与AMPK激活剂协同作用,通过AMPK-mTOR-SIRT3通路恢复线粒体功能,为脓毒症相关急性肾损伤的代谢靶向治疗提供新机制 | 实验仅基于小鼠模型和细胞系,缺乏临床验证;SIRT3下游机制有待进一步探索 | 研究外源性丙酮酸乙酯通过调节线粒体生物能量学减轻脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | 盲肠结扎穿刺诱导的SA-AKI小鼠模型和LPS刺激的HK-2细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和HK-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 805 | 2026-05-09 |
A high-resolution spatial map of cilia-associated proteins in the human fallopian tube
2026-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71692-6
PMID:42010243
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研究论文 | 利用整合转录组学和蛋白质组学方法,在人输卵管中创建了纤毛相关蛋白的高分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下整合转录组学和蛋白质组学,绘制输卵管中纤毛相关蛋白的空间分布图,并验证了11个此前仅在转录水平研究的蛋白质 | 仅对一名输卵管积水患者进行了分析,样本量有限,且未提供其他疾病或正常组织的充分比较 | 揭示输卵管中纤毛相关蛋白的分子景观,以帮助理解不孕症和纤毛特异性相关疾病的通路 | 人输卵管及其他具有运动纤毛的组织 | 数字病理学 | 不孕症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱分析 | NA | 文本数据(转录组和蛋白质组数据) | 1名输卵管积水患者及其他健康样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 806 | 2026-05-09 |
SpaTRACE: Spatiotemporal recurrent auto-encoder for reconstructing signaling and regulatory networks from spatiotemporal transcriptomics data
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689569
PMID:42039614
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研究论文 | 提出SpaTRACE框架,从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络 | 利用时空递归自编码器同时重建转录因子-靶基因调控网络、配体-受体-靶基因信号通路及配体-受体结合关系,无需预定义配体-受体数据库 | 依赖伪时间轨迹采样,可能无法完全捕捉真实时间动态;模型复杂度高,需要较大数据集进行训练 | 从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络,捕捉发育和再生过程中的动态调控机制 | 小鼠中脑发育和蝾螈脑再生过程中的空间转录组数据 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 自编码器, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 807 | 2026-05-09 |
A Mouthful of Genomic Data: Single-Cell Insights into Salivary Gland Biology and Disease
2026-Apr-18, Biology
DOI:10.3390/biology15080641
PMID:42041920
|
综述 | 综述单细胞RNA测序在唾液腺生物学与疾病研究中的应用,总结主要发现、局限性及方法学考虑 | 系统整合了唾液腺scRNA-seq研究的最新进展,聚焦于细胞类型发现、分子机制及数据质量问题 | 数据处理不一致和实验方法报告不完整影响可重复性,限制高质量数据集的识别 | 总结scRNA-seq在唾液腺研究中的发现,指导未来研究 | 唾液腺(大唾液腺和小唾液腺) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 808 | 2026-05-09 |
Histotripsy-Initiated Immune Response Synergizes with Chemotherapy in a Neuroblastoma Murine Model
2026-Apr-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081249
PMID:42073574
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研究论文 | 本研究探讨了组织切除术在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导的免疫反应如何与化疗协同作用 | 首次展示了无创聚焦超声组织切除术通过机械性气泡云作用诱导系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效 | 未提供具体局限性信息 | 验证组织切除术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧胁部接种Neuro-2a细胞建立神经母细胞瘤模型 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 组织切除术,单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只小鼠双侧肿瘤(单侧治疗),每组5-7天后评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置信息 |
| 809 | 2026-05-09 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
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研究论文 | 对12种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试,提供实践指南 | 首次对12种CNV推断方法进行大规模系统基准测试,覆盖超过10万个细胞,建立了基于恶性细胞分类准确性、CNV推断准确性、可扩展性和鲁棒性的综合评估框架,并提供标准化CNV档案公共资源库 | 基准测试主要依赖现有数据集和合成数据,可能未完全涵盖所有实际应用场景;部分方法的性能高度依赖于原始测序数据可用性和等位基因推断质量 | 系统评估单细胞RNA测序数据的拷贝数变异推断方法,为研究人员提供实践决策指南 | 12种CNV推断方法(包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、等位基因数据 | 28个真实数据集(超过10万个细胞)及多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 810 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
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研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡,从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用,并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析,人类样本验证有限,且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 811 | 2026-05-09 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术,探讨了代谢手术(袖状胃切除术)如何通过抑制mTORC1/JAK/STAT信号通路减轻肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 首次利用单细胞RNA测序结合循环蛋白质组学揭示代谢手术对青少年肥胖相关肾病的分子机制,特别是mTORC1/JAK/STAT信号通路的抑制作用 | 研究样本量较小(仅5例患者进行配对活检),且缺乏长期随访数据以验证肾损伤缓解的持久性 | 探索垂直袖状胃切除术对肥胖青少年2型糖尿病患者肾脏结构和分子变化的影响及其潜在机制 | 5名患有2型糖尿病和肥胖的青少年(IMPROVE-T2D队列),以及64名接受代谢手术的肥胖青少年(Teen-LABS队列) | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 循环蛋白质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 临床代谢参数 | 5例配对肾活检样本(术前和术后12个月),64例独立队列的蛋白质组学样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 812 | 2026-05-09 |
Semi-parametric empirical bayes method for multiplet detection in snATAC-seq with probabilistic multi-omic integration
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013653
PMID:42054434
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研究论文 | 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA,用于snATAC-seq数据中的多细胞检测,并支持多模态证据整合 | 无需合成双细胞,直接从染色质可及性信号建模单细胞背景,实现假发现率控制;并扩展至多模态数据整合 | 标题与摘要未提及具体限制 | 开发高效的snATAC-seq多细胞检测方法 | snATAC-seq数据中的多细胞(双细胞) | 机器学习 | NA | snATAC-seq | 半参数经验贝叶斯模型 | 序列数据 | 多个多模态数据集与模拟数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 813 | 2026-05-09 |
Spatial multi-omics identifies a NOTCH3-mediated capillary-mCAF crosstalk driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70117
PMID:42099451
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研究论文 | 通过空间多组学数据分析,发现NOTCH3介导的毛细血管-mCAF相互作用导致肝细胞癌免疫排斥 | 首次利用空间多组学结合泛癌单细胞测序数据,揭示NOTCH3信号通路在肝细胞癌中通过毛细血管与基质产生型癌相关成纤维细胞(mCAF)的相互作用,驱动免疫排斥微环境形成 | NA | 阐明肝细胞癌中纤维化介导的免疫排斥机制,探索NOTCH信号通路在癌相关成纤维细胞极化中的作用 | 肝细胞癌组织样本及小鼠模型 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 814 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and phenotypic transitions of smooth muscle cells in aortic dissection
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70124
PMID:42099453
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 815 | 2026-05-09 |
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04836-1
PMID:41904745
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研究论文 | 通过整合转录组分析,发现IGSF9驱动恶性转化并可预测早期肺腺癌 | 首次发现IGSF9作为早期肺腺癌的诊断生物标志物,并揭示其在恶性转化中的多重作用,包括免疫逃逸、肿瘤细胞迁移和侵袭以及干细胞样AT2亚群向恶性状态的转化 | 未明确阐述研究样本数量、平台具体配置等细节,可能需要在更大规模队列中验证 | 阐明早期肺腺癌的分子机制并识别有效的诊断生物标志物 | 早期肺腺癌患者样本及肿瘤微环境中的肺泡细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肺腺癌 | scRNA-seq,机器学习 | 随机森林和LASSO | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 816 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 817 | 2026-05-09 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
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研究论文 | 通过多组学数据分析和验证结直肠癌肝转移中的肥大细胞及其富集基因的作用 | 首次结合批量测序和单细胞RNA测序数据,系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化,并构建基于三个富集基因(APOC1、SPP1、CLU)的预测模型 | 未明确提及样本来源或外部验证的局限性,可能缺少对不同亚型肥大细胞的深入功能验证 | 确定肥大细胞及富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌、肝转移 | 批量测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | 预测模型(基于基因表达) | 基因表达数据、组织样本图像 | 四个批量测序数据集共223个样本,一个单细胞RNA测序数据集,以及临床样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 818 | 2026-05-09 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
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研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析480个淋巴母细胞系,发现1200个性别偏向表达基因及其与疾病关联的转录调控机制 | 首次大规模系统揭示性别偏向表达的转录调控机制,发现4个X染色体剂量调控的转录因子(FOSL1、ZNF730、ZFX、ZNF726)贡献了79%的性别偏向表达,并鉴定了2390个性别偏向eQTL及其在多种疾病中的富集 | 独立数据集的验证结果较为有限,且主要基于淋巴母细胞系数据,组织特异性验证仅部分覆盖 | 探究人类性别差异表达的转录调控机制及其与疾病遗传变异的关联 | 480个人类淋巴母细胞系(LCLs)以及来自GTEx项目的多种组织样本 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq | 线性模型 | 转录组 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 819 | 2026-03-23 |
crocketa: an automated Snakemake framework for integrated single-cell transcriptome and immune-repertoire analysis
2026-Mar-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12767-y
PMID:41864892
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 820 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70047-5
PMID:41844605
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研究论文 | 利用空间转录组技术构建日本脑炎发病机制的综合时空图谱 | 首次同时原位捕获宿主和病毒转录组,构建日本脑炎发病的综合时空图谱,并揭示Ly6c2单核细胞和Ackr1内皮细胞在病毒传播和神经炎症中的关键作用 | 仅在小鼠模型中验证,需要进一步在人类样本中验证;未详细讨论其他细胞类型和信号的潜在贡献 | 研究日本脑炎病毒(JEV)感染引起的神经病理过程中的细胞互作机制 | 日本脑炎病毒感染的小鼠大脑 | 数字病理学 | 日本脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 雌性BALB/c小鼠,具体样本数量未提及 | 华大基因 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |