单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Aug-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦中受赤霉病真菌操纵的特定细胞类型及其导致易感性的机制 | 首次在小麦中应用单细胞RNA测序技术解析不同细胞类型对适应性和非适应性真菌侵染的特异性响应 | 研究仅关注了接种后1-3天的早期响应，未涵盖整个病害发展过程 | 探究小麦胚芽鞘细胞类型特异性响应在真菌侵染过程中的作用机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 802 | 2025-10-05 |
Evolutionary trends in the emergence of skeletal cell types
2025-Aug, Evolution letters
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/evlett/qraf012
PMID:40980705
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研究论文 | 本研究通过整合基因组系统发育地层学和单细胞转录组学，探索骨骼细胞类型特异性基因表达程序的进化趋势 | 挑战了关于脊椎动物骨骼结构进化的长期观点，提出软骨内骨化和软骨细胞肥大可能在颌口类最后共同祖先中已经进化 | NA | 探索骨骼细胞类型特异性基因表达程序的进化趋势 | 成骨细胞、肥厚软骨细胞和未成熟软骨细胞 | 进化生物学 | NA | 基因组系统发育地层学，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 803 | 2025-10-05 |
TREM2-Mediated Myeloid Cells Protect Against Pathological Choroidal Neovascularization
2025-Jul-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501793R
PMID:40716081
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研究论文 | 本研究揭示了TREM2通过调节髓系细胞功能在病理性脉络膜新生血管形成中的保护作用 | 首次系统阐明TREM2在脉络膜新生血管中的保护机制，发现其与SOCS3通过独立但重叠的抗血管生成程序发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究TREM2在脉络膜新生血管形成中的分子机制和功能作用 | 激光诱导的脉络膜新生血管小鼠模型 | 眼科疾病研究 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序，免疫染色，转录组分析，基因功能研究 | 基因缺陷小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，病理图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 804 | 2025-10-05 |
Single Cell Profiling in the Sox10Dom Hirschsprung Mouse Implicates Hox Genes in Enteric Neuron Trajectory Allocation
2025-Jul-21, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101590
PMID:40701368
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10Dom突变对肠道神经系统发育的影响，揭示了Hox基因在肠神经元轨迹分配中的作用 | 首次将Hox基因表达变化（特别是Hoxa6）与肠神经元轨迹改变相关联 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元比例及其在早期ENS发育中的作用机制 | Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的ENS祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 杂交链式反应 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的ENS细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 805 | 2025-10-05 |
SMURF Reconstructs Single-Cells from Visium HD Data to Reveal Zonation of Transcriptional Programs in the Intestine
2025-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656357
PMID:40502153
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研究论文 | 开发了一种名为SMURF的新型软分割算法，用于从Visium HD数据重建单细胞并揭示肠道中转录程序的分区 | 提出了一种新的软分割算法SMURF，能够将捕获点的mRNA映射到邻近细胞核，并在复杂组织结构中将细胞展开到标准笛卡尔坐标系中 | NA | 开发计算工具以准确地将转录本分配给单个细胞，并研究组织中细胞组织的空间分布 | 肠道组织中的细胞及其转录程序 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 软分割算法 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | NA |
| 806 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5通过调控内皮细胞糖酵解和动脉编程参与肺动脉高压的发病机制 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压患者样本、PH大鼠模型、基因敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序, 蛋白质组分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类PAH患者样本、PH大鼠模型、Egln1Tie2Cre和Egln1Tie2Cre/Fabp4/5-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 807 | 2025-10-05 |
The glycolytic reaction PGAM restrains Th17 pathogenicity and Th17-dependent autoimmunity
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115799
PMID:40482033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现糖酵解反应PGAM抑制Th17细胞的致病性及其依赖性自身免疫 | 首次揭示PGAM酶作为糖酵解通路中的负向调节因子抑制Th17细胞致病性分化，与传统认知中糖酵解促进效应细胞功能相反 | 研究主要基于计算预测和体外实验验证，在人体中的生理相关性需进一步确认 | 探究糖酵解反应如何调控Th17细胞的致病性分化 | T辅助17细胞(Th17细胞) | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | Compass算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 808 | 2025-10-05 |
WFDC3 identified as a prognostic and immune biomarker in pancreatic cancer
2025-May-08, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12444
PMID:40350979
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，发现WFDC3在胰腺癌中高表达并促进肿瘤转移和免疫逃逸 | 首次系统揭示WFDC3在胰腺癌中的促癌功能及其通过诱导上皮间质转化和抑制T细胞毒性介导免疫逃逸的机制 | WFDCs在肿瘤进展中的具体作用机制仍需进一步深入研究 | 探究WFDC家族成员在胰腺癌发生发展中的作用及其临床意义 | 胰腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 功能富集分析, CCK-8增殖实验, EdU检测, transwell实验, 免疫荧光染色, 流式细胞术, LDH释放实验, Western blotting, qRT-PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 809 | 2025-10-05 |
distQTL: Distribution Quantitative Trait Loci Identification by Population-Scale Single-Cell Data
2025-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647121
PMID:40291679
|
研究论文 | 提出了一种基于群体规模单细胞数据的分布数量性状位点识别方法distQTL | 利用Fréchet回归将完整经验分布作为响应对象，而非简单的汇总统计量，能够更全面地识别基因表达分布的数量性状位点 | NA | 研究遗传变异如何影响基因表达分布 | 982名供体的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞基因表达数据 | 982名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 810 | 2025-10-05 |
Single-cell-guided identification of logic-gated antigen combinations for designing effective and safe CAR therapy
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644074
PMID:40568068
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞转录组数据的计算方法，用于识别逻辑门控抗原组合以设计更安全有效的CAR疗法 | 首次利用单细胞转录组数据系统性地识别具有逻辑门控（AND、OR、NOT）的癌症特异性抗原回路，可扩展至五基因组合 | 即使优化的共享回路对某些患者仍然不足，需要个性化设计 | 克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性，提高靶向效果和安全性 | 乳腺癌患者肿瘤细胞和正常细胞 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | 计算方法 | 单细胞转录组数据 | 342例临床患者样本，约200万个细胞（包含>62万个肿瘤细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 811 | 2025-10-05 |
Cellular heterogeneity in metabolism and associated microbiome of a non-model phytoflagellate
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf046
PMID:40057978
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学分析非模式微真核生物Ochromonas triangulata的代谢异质性和相关微生物组 | 首次在无参考基因组的非模式微真核生物中应用单细胞转录组学，发现了与不同生长阶段相关的第三种转录状态 | 研究对象为实验室培养的单一物种，可能无法完全反映自然环境中的复杂性 | 探索微真核生物的代谢异质性和与细菌群落的相互作用 | 非模式微真核生物Ochromonas triangulata及其共培养的细菌群落 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单个微真核生物细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞全长转录组测序协议 |
| 812 | 2025-10-05 |
Artemisinin derivatives modulate KEAP1-NRF2-xCT pathway to alleviate Sjögren's disease: insights from scRNA-seq and systems biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626230
PMID:40934008
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和系统生物学方法，探讨青蒿素衍生物通过调节KEAP1-NRF2-xCT通路缓解干燥综合征的作用机制 | 首次揭示青蒿素通过抑制KEAP1介导的NRF2泛素化/降解，上调xCT和GPX4表达，从而保护唾液腺上皮细胞免于铁死亡的新机制 | 研究仅使用NOD/Ltj小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究青蒿素衍生物通过调节铁死亡通路治疗干燥综合征的分子机制 | 干燥综合征患者样本和NOD/Ltj小鼠模型 | 系统生物学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 分子对接, 透射电子显微镜, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 组织学图像 | NOD/Ltj小鼠模型和干燥综合征患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 813 | 2025-10-05 |
FLT3L combined with GM-CSF induced dendritic cells drive broad tumor-specific CD8+ T cell responses and remodel the tumor microenvironment to enhance anti-tumor efficacy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649891
PMID:40977690
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研究论文 | 本研究比较了FLT3L联合GM-CSF诱导的树突状细胞与传统GM/IL4-DCs在抗肿瘤免疫中的功能差异 | 首次系统比较FL/GM-DCs与常规GM/IL4-DCs的功能差异，发现FL/GM-DCs具有独特的亚群分布和更强的交叉抗原呈递能力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索新型树突状细胞诱导方法在癌症免疫治疗中的应用潜力 | 小鼠骨髓细胞、树突状细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | 单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 814 | 2025-10-05 |
The interplay between mesenchymal stem cells and the immune microenvironment in rotator cuff tendon-to-bone healing: current progress and future directions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661340
PMID:40977708
|
综述 | 本文综述了间充质干细胞与免疫微环境在肩袖肌腱-骨愈合中的相互作用机制及治疗前景 | 聚焦MSC与免疫细胞的双向通讯机制，提出整合单细胞转录组和AI预测的个体化治疗新策略 | 存在MSC异质性、患者免疫反应差异及临床转化障碍等挑战 | 探索MSC通过免疫调节促进肩袖肌腱-骨愈合的机制与治疗策略 | 间充质干细胞与免疫微环境（巨噬细胞、T细胞、NK细胞） | 组织工程与再生医学 | 肩袖损伤 | 单细胞转录组测序, 细胞因子特征分析 | AI算法 | 转录组数据, 细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 815 | 2025-10-05 |
Opportunities, challenges, and future perspectives of oncolytic virus therapy for malignant melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653683
PMID:40977706
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综述 | 本文综述溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的机遇、挑战和未来前景 | 系统阐述溶瘤病毒通过诱导免疫原性细胞死亡和激活cGAS-STING通路将'冷'肿瘤转化为'热'肿瘤的创新机制，并展望单细胞RNA测序和CRISPR/Cas系统等前沿技术在个性化溶瘤病毒设计中的应用 | 面临肿瘤异质性、核心机制局限、病毒脱落风险和监管障碍等挑战 | 探讨溶瘤病毒疗法在恶性黑色素瘤治疗中的发展现状和未来方向 | 恶性黑色素瘤 | 肿瘤免疫治疗 | 恶性黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas系统, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 816 | 2025-10-05 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal PANoptosis-associated immune dysregulation of fibroblasts in periodontitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671919
PMID:40977731
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示牙周炎中成纤维细胞的PANoptosis相关免疫失调 | 首次在牙周炎中系统研究PANoptosis的作用机制，并整合多种机器学习模型筛选关键基因 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证 | 探究PANoptosis在牙周炎发病机制中的作用 | 人牙龈组织和牙龈成纤维细胞，牙周炎模型小鼠 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫荧光染色，qPCR，免疫组化 | 113种机器学习模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，空间转录组数据 | 牙周炎患者和健康个体的牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 817 | 2025-10-05 |
Myeloid-specific S100A8/A9 deficiency attenuates atrial fibrillation through prevention of TLR4/NF-kB-mediated immune cell recruitment and inflammation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623486
PMID:40977740
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，揭示了髓系细胞来源的S100A8/A9通过TLR4/NF-κB轴促进心房颤动发生发展的分子机制 | 首次阐明髓系细胞特异性S100A8/A9在心房颤动中的致病作用及其通过TLR4/NF-κB信号通路调控免疫细胞募集和炎症反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需要进一步验证；NF-κB激活剂HY-18739的药理作用机制需更深入研究 | 探究髓系细胞来源的S100A8/A9在心房颤动发病机制中的作用及其治疗潜力 | 心房颤动患者样本和单核细胞/巨噬细胞特异性S100A9条件性基因敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因敲除, 电生理检测 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 组织病理数据 | 未明确具体样本数量，包括AF患者样本和基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 818 | 2025-10-05 |
ANXA1 and ARG2 drive T cell proliferation in ischemia-reperfusion injury: integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1673163
PMID:40977888
|
研究论文 | 通过整合性转录组分析揭示ANXA1和ARG2在缺血再灌注损伤中驱动T细胞增殖的分子机制 | 首次通过整合性转录组分析识别ANXA1和ARG2作为缺血再灌注损伤中T细胞增殖的关键调控因子 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证这些基因的功能机制 | 探究缺血再灌注损伤中T细胞增殖的分子机制 | 缺血再灌注损伤模型中的T细胞 | 生物信息学 | 缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫浸润分析, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 多个器官模型的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 819 | 2025-10-05 |
Multi-transcriptomics analysis of ferroptosis related genes reveals CAFs exosomal COX4I2 as a novel therapeutic target in osteosarcoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620648
PMID:40977891
|
研究论文 | 通过多转录组学分析发现CAFs外泌体COX4I2是骨肉瘤铁死亡治疗的新靶点 | 首次发现CAFs通过外泌体传递COX4I2蛋白抑制骨肉瘤细胞铁死亡的新机制 | 铁死亡在骨肉瘤中的预后意义和调控机制仍需进一步探索 | 探究铁死亡相关基因在骨肉瘤中的预后价值和调控机制 | 骨肉瘤细胞系143B、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、裸鼠 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, Western blot, 共聚焦显微镜, 透射电子显微镜 | LASSO回归, SVM, RF, XGBoost, BORUTA | RNA测序数据, 蛋白质数据, 细胞成像数据 | 两个独立GEO队列(GSE21257和GSE39055), 体外细胞实验, 裸鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体分析 | NA | NA |
| 820 | 2025-10-05 |
scAGG: Sample-level embedding and classification of Alzheimer's disease from single-nucleus data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.009
PMID:40977903
|
研究论文 | 提出scAGG模型，利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类 | 开发了样本级池化机制来聚合单细胞嵌入，能够从单细胞数据中学习疾病严重程度的细胞排序 | 注意力模型的解释性有限 | 利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类和疾病机制研究 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 样本级池化模型,注意力模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |