单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
801	2025-05-04	Syringin inhibits the crosstalk between macrophages and fibroblast-like synoviocytes to treat rheumatoid arthritis via PDE4 2025-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156401 PMID:39842374	研究论文	研究探讨了丁香苷（SRG）通过抑制巨噬细胞和成纤维样滑膜细胞（FLS）之间的相互作用，以及调节PDE4来治疗类风湿性关节炎（RA）的机制	首次整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析和体内外验证，揭示了SRG通过阻断巨噬细胞与RA-FLS的相互作用发挥抗RA作用，并确定了PDE4在其中的核心作用	SRG在体外对RA-FLS无直接影响，其作用依赖于巨噬细胞的调节	探究SRG抗RA的药理机制	胶原诱导性关节炎（CIA）大鼠模型、THP-1细胞、RA-FLS	药理学	类风湿性关节炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	CIA大鼠模型	基因表达数据、细胞培养数据	NA
802	2025-05-04	Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted 2025-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-08466-x PMID:39843748	研究论文	本研究探讨了小肠组织中组织驻留记忆CD8 T细胞的多样性及其空间和时间印记	利用空间转录组学和小鼠模型揭示了小肠不同组织微环境如何驱动T细胞表型异质性	研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能不完全反映人类T细胞多样性的全部情况	揭示组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和调控机制	小肠组织中的组织驻留记忆CD8 T细胞	免疫学	NA	空间转录组学、单转录本分辨率分析、光学编码基因扰动策略	NA	转录组数据、空间定位数据	人类样本和小鼠模型
803	2025-05-04	Monocyte-Derived cxcl12 Guides a Directional Migration of Blood Vessels in Zebrafish 2025-Mar, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321588 PMID:39846165	研究论文	本研究揭示了斑马鱼胸鳍血管定向迁移的分子机制，发现单核细胞来源的Cxcl12a引导血管定向生长	首次发现gata1阳性单核细胞表达Cxcl12a，并证实其引导斑马鱼胸鳍血管与节间血管的长距离迁移和吻合	研究仅针对斑马鱼模型，尚未在高等脊椎动物中验证	探索血管定向生长的分子调控机制	斑马鱼胸鳍血管系统	发育生物学	NA	活体成像分析、全标本原位杂交、荧光原位杂交、单细胞测序	NA	影像数据、基因表达数据、单细胞测序数据	斑马鱼胚胎模型
804	2025-05-04	Assessing spatial sequencing and imaging approaches to capture the molecular and pathological heterogeneity of archived cancer tissues 2025-Mar, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6383 PMID:39846232	研究论文	评估空间转录组学和成像方法在捕捉存档癌症组织分子和病理异质性方面的应用	优化了两种基于测序的空间转录组学协议，使其适用于具有挑战性的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织，并评估了多种成像方法在量化肿瘤异质性方面的表现	研究的组织样本存储时间跨度较大（4至14年），RNA质量不一，可能影响结果的稳定性	探索空间转录组学在解密存档癌症组织异质性中的应用	存档的皮肤福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织	数字病理学	癌症	空间转录组学（ST）、RNAScope单分子成像、CODEX多重蛋白成像	NA	RNA表达谱、蛋白质成像数据	覆盖存储时间4至14年的FFPE组织样本，RNA质量不一
805	2025-05-04	Key glycometabolism during oocyte maturation and early embryonic development 2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England) DOI:10.1530/REP-24-0275 PMID:39846956	综述	该综述探讨了葡萄糖代谢在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的关键作用及其对辅助生殖技术的潜在影响	揭示了葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和核苷酸之间复杂的相互作用及其在早期胚胎发育中的关键作用，提出了非侵入性代谢监测在胚胎选择和个性化辅助生殖技术中的革命性应用	NA	探讨代谢过程在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的作用，以推动生殖医学和胚胎学的发展	哺乳动物配子和早期胚胎	生殖医学	NA	单细胞测序、代谢组学、生物信息学	NA	代谢数据	NA
806	2025-05-04	Tiaogeng decoction improves mild cognitive impairment in menopausal APP/PS1 mice through the ERs/NF-κ b/AQP1 signaling pathway 2025-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156391 PMID:39848022	研究论文	探讨调羹汤通过ERs/NF-κb/AQP1信号通路改善更年期APP/PS1小鼠轻度认知障碍的潜在药理机制	首次揭示调羹汤可能通过调节ERs/NF-κb/AQP1信号通路预防和改善更年期轻度认知障碍	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究调羹汤在预防更年期轻度认知障碍中的药理机制	更年期APP/PS1小鼠	神经科学	轻度认知障碍	RNA-seq, 单细胞测序, Western blotting, RT-qPCR, 透射电子显微镜	APP/PS1小鼠模型	基因表达数据, 蛋白质数据	不同组别的小鼠海马组织
807	2025-05-04	Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine 2025-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024 PMID:39853303	研究论文	通过单细胞转录组学预测缺血损伤肠道中急性上皮修复的新潜在调节因子	利用单细胞转录组学技术识别了与年龄相关的肠道修复反应中的新上游调节因子CSF-1	研究结果基于猪模型，尚未在人类中进行验证	探索缺血损伤肠道中上皮修复的年龄依赖性机制，并寻找潜在的治疗靶点	幼年和新生猪的缺血损伤肠道上皮细胞	单细胞转录组学	肠道缺血损伤	单细胞转录组学	猪模型	基因表达数据	幼年和新生猪的缺血损伤肠道组织样本
808	2025-05-04	CD271high cancer stem cells regulate macrophage polarization in head and neck squamous cell carcinoma 2025-Mar, Oral oncology IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.oraloncology.2025.107181 PMID:39854870	research paper	该研究探讨了CD271高表达的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）干细胞如何调节肿瘤免疫微环境中的巨噬细胞极化	首次揭示了CD271作为HNSCC干细胞标志物的作用及其对巨噬细胞极化的调控机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本量有限	阐明CD271高表达HNSCC细胞的干细胞特性及其与肿瘤免疫微环境的相互作用	头颈鳞状细胞癌（HNSCC）组织和细胞	肿瘤免疫学	头颈鳞状细胞癌	scRNA-seq, 流式细胞术, qPCR	小鼠模型	基因表达数据, 流式细胞数据	未明确说明临床样本数量，使用C57BL/6小鼠模型
809	2025-05-04	Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells 2025-Mar, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103490 PMID:39854938	研究论文	本研究探讨了地氟烷通过调节ITGB1/CD9信号通路和减轻氧化损伤在肾缺血再灌注损伤中的保护作用	首次揭示了地氟烷通过调控ITGB1/CD9轴减轻肾缺血再灌注损伤的分子机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索地氟烷对肾缺血再灌注损伤的保护作用及其机制	肾小管上皮细胞和小鼠模型	肾脏病学	肾脏疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、Western blot、TUNEL检测	小鼠肾缺血再灌注模型	基因表达数据、蛋白质表达数据、生化指标数据	未明确说明具体样本量，但包含体外细胞实验和体内小鼠模型
810	2025-05-04	Single-cell transcriptome reveals three types of adipocytes associated with intramuscular fat content in pigs 2025-Mar, Genomics IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.ygeno.2025.110998 PMID:39855485	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示了与猪肌肉内脂肪含量相关的三种脂肪细胞类型	首次鉴定出三种未表征的脂肪细胞类型（Adipocyte 1、Adipocyte 2和Aregs），并揭示了它们的基因表达特征和转录因子调控机制	研究仅针对成年猪的肌肉组织，未涉及其他发育阶段或物种	探究肌肉内脂肪的细胞类型组成及其基因调控机制	猪肌肉组织中的脂肪细胞	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组分析、ATAC-seq、RNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据、ATAC-seq数据	成年猪肌肉组织样本
811	2025-05-04	Automated Laser-Assisted Single-Cell Sorting for Cell Functional and RNA Sequencing 2025-Feb-28, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.4c02417 PMID:39843241	研究论文	本文介绍了一种自动化、高效的激光辅助单细胞分选技术，用于细胞功能和RNA测序	结合激光诱导正向转移（LIFT）和高通量皮升微孔阵列，实现了高效（>80%）和精确（约100%）的单细胞分选，同时保持高细胞活力（约80%）	未提及大规模临床应用验证	开发一种高效、精确的单细胞分选技术，以支持下游单细胞分析	单细胞，特别是稀有转染的PC-9细胞	单细胞分析	NA	激光诱导正向转移（LIFT），单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量，但展示了稀有转染PC-9细胞的分选
812	2025-05-04	NFE2-driven neutrophil polarization promotes pancreatic cancer liver metastasis progression 2025-02-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115226 PMID:39827463	研究论文	该研究揭示了NFE2驱动的中性粒细胞极化在胰腺癌肝转移进展中的关键作用	首次发现NFE2是调节中性粒细胞表型极化的关键转录因子，并阐明了其在转移性肿瘤微环境中的作用机制	研究主要基于单细胞测序和空间转录组学结果，需要进一步的体内外实验验证	探究胰腺癌肝转移过程中适应性免疫重塑的机制，特别是中性粒细胞的作用	胰腺癌肝转移患者样本中的中性粒细胞	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	未明确说明样本数量
813	2025-05-04	Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice 2025-02-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225 PMID:39827461	research paper	研究间歇性禁食对不同年龄小鼠β细胞功能和系统代谢的影响	揭示了慢性间歇性禁食对年轻小鼠β细胞成熟和功能的负面影响，并通过scRNA-seq技术进行了验证	研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自T1D和T2D患者胰岛	探讨间歇性禁食对β细胞功能的影响及其年龄依赖性	老年、中年和年轻小鼠以及人类胰岛	代谢研究	糖尿病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	不同年龄组的小鼠和人类胰岛样本
814	2025-05-04	Early precursor-derived pituitary gland tissue-resident macrophages play a pivotal role in modulating hormonal balance 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115227 PMID:39841599	research paper	本研究通过单细胞转录组学、命运图谱和成像技术，揭示了垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，并探讨了它们在调节垂体激素平衡中的作用	首次描述了垂体驻留巨噬细胞的异质性、空间分布及其对激素平衡的调节机制，特别是通过细胞外ATP介导的细胞间信号传导	研究未涉及垂体驻留巨噬细胞与其他免疫细胞的相互作用，以及这些巨噬细胞在疾病状态下的变化	探索垂体驻留巨噬细胞的特性及其在调节内分泌系统中的作用	垂体驻留巨噬细胞（pitMØs）及其与激素分泌细胞的相互作用	免疫学	NA	单细胞转录组学、命运图谱、成像技术	NA	单细胞RNA测序数据、成像数据	NA
815	2025-05-04	Single-cell analysis of neoplastic plasma cells identifies myeloma pathobiology mediators and potential targets 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101925 PMID:39855192	研究论文	通过单细胞RNA测序和B细胞受体测序技术，研究多发性骨髓瘤的病理生物学介质和潜在治疗靶点	首次结合scRNA-seq和scBCR-seq技术区分单克隆/肿瘤性浆细胞与多克隆/正常浆细胞，并发现更多失调基因，特别是在前体患者中	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	探索多发性骨髓瘤的病理生物学机制并识别潜在治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的浆细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	scRNA-seq, scBCR-seq	NA	单细胞RNA测序数据	未明确说明样本数量
816	2025-05-04	Engineered Extracellular Vesicles Modified by Angiopep-2 Peptide Promote Targeted Repair of Spinal Cord Injury and Brain Inflammation 2025-Feb-04, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c14675 PMID:39853366	research paper	研究通过生物修饰M2小胶质细胞，制备Ang2-EVs和M-Ang2-EVs，以促进脊髓损伤和脑炎症的靶向修复	应用Angiopep-2肽增强脊髓损伤细胞的靶向性，成功构建能靶向脊髓损伤部位和大脑的工程化细胞外囊泡	NA	开发更有效的工程化细胞外囊泡以治疗脊髓损伤和脑炎症	脊髓损伤和脑炎症	生物医学工程	脊髓损伤	单细胞测序、免疫荧光实验、单核测序	NA	测序数据、免疫荧光图像	小鼠脊髓
817	2025-05-04	Single-cell and Spatial Transcriptomics Illuminate Bat Immunity and Barrier Tissue Evolution 2025-Feb-03, Molecular biology and evolution IF:11.0Q1 DOI:10.1093/molbev/msaf017 PMID:39836373	研究论文	通过单细胞和空间转录组学技术，研究埃及果蝠的免疫系统及屏障组织进化，揭示其补体系统基因的独特表达模式	首次在埃及果蝠中通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了补体系统基因在肺和肠道上皮关键区域的高表达及其与抗病性的潜在关联	研究仅聚焦于埃及果蝠，未涵盖其他蝙蝠物种，且机制性实验验证不足	探究埃及果蝠免疫系统的转录特征及其与抗病性的关系	埃及果蝠的肠道、肺和血细胞，并与小鼠和人类进行比较	比较免疫学	NA	单细胞转录组学、空间转录组学	NA	转录组数据	埃及果蝠、小鼠和人类的组织样本（具体数量未明确说明）
818	2025-05-04	Cotton2035: From genomics research to optimized breeding 2025-Feb-03, Molecular plant IF:17.1Q1 DOI:10.1016/j.molp.2025.01.010 PMID:39844464	research paper	本文探讨了棉花基因组学研究及其在优化育种中的应用	提出了棉花ENCODE项目，以系统解码棉花基因组中的功能元件和调控网络，并强调了单细胞测序和高分辨率时空组学技术的重要性	未提及具体的技术实施细节或实验验证结果	实现从棉花基因组学到育种（G2B）的目标，推动棉花育种策略的发展	棉花（Gossypium）的野生和栽培品种	植物基因组学	NA	单细胞测序、高分辨率时空组学、基因组编辑、人工智能	NA	基因组数据、多组学数据	多种野生和栽培棉花种群的重测序数据
819	2025-05-04	Development of BACE2-IN-1/tranylcypromine-based compounds to induce steroidogenesis-dependent neuroprotection 2025-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.117851 PMID:39837213	研究论文	开发基于BACE2-IN-1/tranylcypromine的化合物以诱导类固醇生成依赖性神经保护	通过将tranylcypromine（LSD1抑制剂）插入BACE2抑制模板（BACE2-IN-1）并进行结构修饰，开发出新型神经保护剂，有效缓解氧化应激后的线粒体损伤并恢复胆固醇生物合成途径	研究主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验	开发新型神经保护剂以治疗创伤性脑损伤（TBI）	创伤性脑损伤（TBI）患者及小鼠模型	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Neuro-2a细胞和小鼠模型	基因表达数据和行为学数据	未明确提及具体样本数量
820	2025-05-04	Attractor Landscape Analysis Reveals a Reversion Switch in the Transition of Colorectal Tumorigenesis 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202412503 PMID:39840939	研究论文	本文介绍了一个名为REVERT的系统框架，用于重建核心分子调控网络模型，并基于单细胞转录组数据在肿瘤发生过程中识别逆转开关	提出了REVERT系统框架，能够重建核心分子调控网络模型并识别肿瘤发生过程中的逆转开关	未明确提及具体局限性	研究肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制，并寻找逆转这种转变的分子开关	结肠癌患者来源的匹配类器官和正常结肠的单细胞转录组数据	系统生物学	结肠癌	单细胞转录组测序	核心分子调控网络模型	单细胞转录组数据	未明确提及具体样本数量