单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8161 - 8180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8161 | 2025-10-06 |
Engineered mesenchymal stromal cells with bispecific polyvalent peptides suppress excessive neutrophil infiltration and boost therapy
2025-Mar-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7387
PMID:40053594
|
研究论文 | 本研究通过DNA自组装技术构建双特异性多价肽修饰的间充质基质细胞，有效抑制中性粒细胞过度浸润并增强治疗效果 | 首次利用DNA自组装技术构建靶向P-选择素和E-选择素的双特异性多价肽修饰MSCs，使其能够竞争性抑制中性粒细胞的内皮细胞结合位点 | 研究仅在小鼠急性肝衰竭模型中验证，尚未在其它疾病模型或临床环境中测试 | 开发增强间充质基质细胞靶向能力和治疗效果的工程化方法 | 工程化修饰的间充质基质细胞及其在急性肝损伤治疗中的作用 | 细胞治疗 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，DNA自组装技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠急性肝衰竭模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8162 | 2025-10-06 |
Genetically encoded tension heterogeneity sculpts cardiac trabeculation
2025-Mar-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads2998
PMID:40053597
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌细胞命运决定中基因编码张力异质性如何调控心脏小梁形成 | 发现Notch信号通过调控PI3K活性和Arp2/3复合物招募，诱导肌动球蛋白网络极化积累驱动细胞分层的新机制 | NA | 探究心肌细胞命运决定机制和心肌模式形成 | 心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因编码生物传感器, 全胚胎活体成像 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8163 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing to predict prognosis and therapeutic response for colorectal cancer
2025-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91761-y
PMID:40055390
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建结直肠癌预后预测模型 | 结合单细胞和bulk RNA测序数据开发9基因预后模型，并建立临床适用的列线图 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 预测结直肠癌预后和治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8164 | 2025-10-06 |
CTSO and HLA-DQA1 as biomarkers in sepsis-associated ARDS: insights from RNA sequencing and immune infiltration analysis
2025-Mar-07, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-025-10726-8
PMID:40055592
|
研究论文 | 通过RNA测序和免疫浸润分析探讨脓毒症相关ARDS中CTSO和HLA-DQA1作为生物标志物的作用 | 首次从生物信息学角度系统研究溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境中溶酶体变化的关联，并识别出CTSO和HLA-DQA1作为核心预测基因 | 脓毒症病因复杂，ARDS与脓毒症的区分仅基于感染部位差异，且许多ARDS病例病因复杂 | 探讨溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境变化的关联 | 脓毒症患者，特别是伴有急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的患者 | 生物信息学 | 脓毒症，急性呼吸窘迫综合征 | RNA测序，单细胞测序，基因集富集分析(GSEA)，加权基因共表达网络分析(WGCNA) | PPI网络，免疫浸润模型 | 基因表达数据，临床数据 | NA | BGI | RNA测序，单细胞测序 | NA | NA |
| 8165 | 2025-10-06 |
Exploring the active ingredients and potential mechanisms of Pingchan granules in Parkinson's disease treatment through network pharmacology and transcriptomics
2025-Mar-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91344-x
PMID:40050654
|
研究论文 | 通过网络药理学和转录组学探索平颤颗粒治疗帕金森病的活性成分及潜在机制 | 首次整合网络药理学、转录组学、孟德尔随机化和分子对接技术系统揭示平颤颗粒治疗帕金森病的多靶点作用机制，并鉴定出关键活性成分蝙蝠葛碱 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内实验验证 | 探索平颤颗粒治疗帕金森病的活性成分和作用机制 | 帕金森病患者黑质转录组数据和平颤颗粒的活性成分 | 生物信息学 | 帕金森病 | 网络药理学,转录组学,孟德尔随机化,分子对接,单细胞测序 | 随机森林,蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据,分子结构数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 8166 | 2025-10-06 |
Unveiling ac4C modification pattern: a prospective target for improving the response to immunotherapeutic strategies in melanoma
2025-Mar-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06297-6
PMID:40050821
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组学数据，识别与黑色素瘤进展相关的ac4C修饰基因，并开发了一个能预测免疫治疗反应的基因特征 | 首次系统揭示ac4C mRNA修饰模式在黑色素瘤中的作用，开发了优于120个已有特征的acRGS特征，并验证了关键基因MYO10的功能 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要更多临床样本进一步验证 | 探究ac4C mRNA修饰模式对黑色素瘤临床结局的影响，开发预测免疫治疗反应的生物标志物 | 黑色素瘤患者和黑色素瘤细胞 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序，转录组学，机器学习 | 10种机器学习算法的101种组合 | 单细胞测序数据，转录组数据 | 四个外部数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8167 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling reveal CTHRC1+ fibroblasts promote EMT through WNT5A signaling in colorectal cancer
2025-Mar-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06236-5
PMID:40050872
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示CTHRC1+成纤维细胞通过WNT5A信号促进结直肠癌上皮间质转化 | 首次发现CTHRC1+ CAFs作为WNT5A主要来源，通过上调MSLN表达促进EMT和肿瘤细胞侵袭性的空间共定位机制 | CAFs的显著异质性与肿瘤细胞的复杂相互作用仍存在研究挑战 | 探索癌症相关成纤维细胞在结直肠癌进展和转移中的作用机制 | 结直肠癌组织中的细胞亚型，特别是CTHRC1+ CAFs和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | CellChat，NicheNet | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8168 | 2025-10-06 |
Discovering root causal genes with high-throughput perturbations
2025-Mar-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100949
PMID:40042510
|
研究论文 | 本文提出了一种利用高通量扰动技术发现根本因果基因的新方法 | 首次提出利用Perturb-seq技术学习基因间因果顺序，并将其转移到bulk RNA-seq数据中识别患者特异性根本因果基因 | RNA-seq数据存在测量误差、高维度和非线性等挑战，可能影响根本因果效应的准确估计 | 识别导致疾病症状的根本因果基因，为疾病早期治疗提供靶点 | 基因表达水平和患者症状 | 生物信息学 | 黄斑变性和多发性硬化症 | RNA-seq, Perturb-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8169 | 2025-10-06 |
MCT4: a key player influencing gastric cancer metastasis and participating in the regulation of the metastatic immune microenvironment
2025-Mar-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06279-8
PMID:40045374
|
研究论文 | 本研究探讨MCT4在胃癌转移及转移免疫微环境调控中的关键作用 | 首次通过单细胞测序结合多组学分析揭示MCT4在胃癌转移免疫微环境中的调控机制 | NA | 阐明MCT4在胃癌发生发展和转移过程中的作用机制 | 胃癌细胞系、胃癌肝转移模型、皮下肿瘤模型、临床胃癌患者组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序,转录组测序,免疫组织化学,多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 临床胃癌患者肿瘤及正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 8170 | 2025-10-06 |
Progressive T cell exhaustion and predominance of aging tissue associated macrophages with advancing disease stage in penile squamous cell carcinoma
2025-Mar-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89760-0
PMID:40044748
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析阴茎鳞状细胞癌肿瘤免疫微环境在不同疾病阶段和HPV感染状态下的变化 | 首次在阴茎鳞状细胞癌中系统描述疾病进展过程中T细胞耗竭和衰老组织相关巨噬细胞主导的免疫表型转变 | 样本量较小（10个样本），需要更大规模研究验证发现 | 评估阴茎鳞状细胞癌从局部到晚期疾病的肿瘤免疫微环境变化，识别晚期疾病的免疫逃逸机制 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本（包括原发灶、淋巴结和远处转移灶） | 单细胞基因组学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个阴茎鳞状细胞癌组织样本（包含4对匹配的原发灶和淋巴结样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8171 | 2025-10-06 |
New mouse models for exploring renal tumor extension into the inferior vena cava
2025-Mar-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07757-x
PMID:40044768
|
研究论文 | 本研究开发了两种新型小鼠模型用于研究肾肿瘤向下腔静脉延伸的机制 | 首次建立了模拟人类肾肿瘤下腔静脉癌栓的小鼠模型，包括免疫健全和免疫缺陷两种类型 | 模型与人类疾病仍存在差异，免疫缺陷模型中淋巴细胞数量较少 | 探索肾肿瘤下腔静脉癌栓的发病机制并开发治疗靶点 | BALB/c和BALB/c-nu/nu小鼠，使用小鼠Renca细胞系和人类肿瘤细胞系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序，免疫组织化学，多重免疫组织化学 | 动物模型 | 基因表达数据，图像数据 | 两种小鼠品系的动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8172 | 2025-10-06 |
A comprehensive analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq unveils B cell immune suppression in the AAV-loaded brain
2025-Mar-05, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09609-6
PMID:40044925
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和RNA测序综合分析，揭示AAV载体在大脑中引发B细胞免疫抑制的机制 | 首次发现XBP1蛋白通过MDK-NCL配体-受体对介导大脑中B细胞免疫抑制，并采用孟德尔随机化分析验证 | 研究仅初步探索了AAV诱导的免疫抑制机制，需要进一步验证调控因子和通路 | 研究AAV载体在大脑中引发的免疫反应机制，特别是免疫抑制现象 | AAV载体处理的大脑组织及相关的免疫细胞 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8173 | 2025-10-06 |
Bystander neuronal progenitors in forebrain organoids promote protective antiviral responses
2025-Mar-05, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03381-y
PMID:40045355
|
研究论文 | 本研究通过前脑类器官模型揭示了旁观者神经祖细胞通过I型干扰素信号介导保护性抗病毒反应的机制 | 发现三维前脑类器官中旁观者神经祖细胞通过I型干扰素信号传导发挥保护性抗病毒作用，这一现象在二维培养体系中未观察到 | 研究主要基于类器官模型，与真实脑组织的生理环境存在差异 | 探究神经元间通讯在介导内在神经元免疫和限制病毒感染中的作用 | 前脑类器官中的神经元和神经祖细胞 | 神经科学 | 病毒性脑炎 | 空间转录组学 | 前脑类器官模型 | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8174 | 2025-10-06 |
Unveiling the key mechanisms of FOLR2+ macrophage-mediated antitumor immunity in breast cancer using integrated single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2025-Mar-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-01980-4
PMID:40045365
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序技术，揭示了FOLR2+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴激活CD8 T细胞在乳腺癌抗肿瘤免疫中的关键作用机制 | 首次系统阐明FOLR2+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴调控CD8 T细胞功能的抗肿瘤免疫机制 | NA | 深入研究FOLR2+巨噬细胞在乳腺癌中的免疫学功能和机制 | 乳腺癌患者肿瘤组织中的FOLR2+巨噬细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,体内实验,体外实验 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8175 | 2025-10-06 |
ENACT: End-to-End Analysis of Visium High Definition (HD) Data
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf094
PMID:40053700
|
研究论文 | 开发了ENACT端到端分析流程，用于处理Visium高清晰度空间转录组数据 | 整合先进细胞分割技术与Visium HD转录组数据，提出新型bin-to-cell分配方法，提高单细胞转录本估计准确性 | 未在论文摘要中明确说明 | 解决空间转录组数据分析中转录本准确映射到细胞和细胞类型分配的挑战 | 组织切片中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 数十万个细胞的样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium High Definition技术 |
| 8176 | 2025-10-06 |
STING Deficiency Promotes Th17-Like Tfh to Aggravate the Experimental Autoimmune Uveitis
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.8
PMID:40042874
|
研究论文 | 本研究探讨STING信号通路通过调控Th17样T滤泡辅助细胞在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的致病机制 | 首次揭示STING缺陷通过促进Th17样Tfh细胞分化加重葡萄膜炎的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究STING信号在实验性自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的作用 | 小鼠模型中的T滤泡辅助细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8177 | 2025-10-06 |
Single-Cell Multiomics Analysis of Early Wound Response Programs in the Mouse Corneal Epithelium
2025-Mar-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.3.9
PMID:40042873
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了小鼠角膜上皮早期伤口反应的转录组和表观遗传变化 | 首次在单细胞水平同时分析角膜上皮伤口反应的转录组（RNA-seq）和染色质可及性（ATAC-seq）变化 | 仅关注早期伤口反应阶段，且仅在小鼠模型中进行研究 | 阐明角膜上皮早期伤口反应的基因调控程序 | 小鼠角膜上皮细胞 | 单细胞多组学 | 角膜伤口愈合 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光染色, 实时定量PCR | Seurat, ArchR, Monocle 2, CellChat, pySCENIC | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确样本数量，使用已发表数据集和新的伤口模型数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8178 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis to Reveal Heterogeneity of Tumor-Associated Neutrophils in Glioma
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70745
PMID:40052358
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性，并开发预后模型 | 首次系统揭示胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性，构建基于7个基因的预后风险评分模型 | 研究基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性验证 | 研究胶质瘤中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其在预后评估中的作用 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | 风险评分模型, WGCNA, 共识聚类 | 基因表达数据, 临床数据, 实验数据 | 四个独立数据集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8179 | 2025-10-06 |
Prognostic and Therapeutic Significance of Cancer-Associated Fibroblasts Genes in Osteosarcoma Based on Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70424
PMID:40045162
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据构建骨肉瘤中癌症相关成纤维细胞基因的风险特征模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据系统分析骨肉瘤中CAF相关基因，构建了11基因预后特征模型 | 样本量有限（仅6例单细胞数据），需要更大规模验证 | 开发更准确的骨肉瘤预后预测模型并指导治疗策略 | 骨肉瘤患者和肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列 | COX回归, Lasso回归 | 基因表达数据 | 6例OS患者的46,544个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8180 | 2025-10-06 |
[Efficacy and mechanism of Guizhi Tongluo Tablets in alleviating atherosclerosis by inhibiting CD72hi macrophages]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究探讨桂枝通络片通过抑制CD72hi巨噬细胞缓解动脉粥样硬化的疗效与机制 | 首次揭示桂枝通络片通过靶向CD72hi巨噬细胞缓解动脉粥样硬化的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类临床试验 | 探究桂枝通络片治疗动脉粥样硬化的效果及其作用机制 | ApoE敲除小鼠和C57BL/6J对照小鼠 | 病理机制研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附测定,实时荧光定量PCR,免疫荧光,TUNEL染色 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织染色图像,血清生化指标 | ApoE敲除小鼠分组：模型组、高/中/低剂量桂枝通络片组、阿托伐他汀组，及C57BL/6J对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |