单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37744 篇文献，本页显示第 8141 - 8160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8141 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into SPP1+ TAM-mediated immune suppression and CD8+ T cell dysfunction in lung cancer
2025-Sep-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04180-3
PMID:41021043
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过A2AR信号通路介导CD8+ T细胞功能失调的免疫抑制机制 | 首次系统比较原发性和脑转移性肺癌中SPP1+ TAM与CD8+ T细胞的相互作用，并证实抗SPP1治疗可逆转T细胞耗竭 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺癌免疫抑制中的作用机制 | 肺癌原发灶和脑转移灶中的免疫细胞，特别是SPP1+ TAM和CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，qPCR，Western blot，共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，免疫荧光图像 | 肺癌原发和脑转移组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8142 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of ILF2 reveals its prognostic value and functional roles across pan-cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03609-6
PMID:41021104
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示ILF2在泛癌中的预后价值和功能作用 | 首次对ILF2进行系统性泛癌分析，涵盖表达模式、预后意义、遗传变异、免疫浸润和治疗反应等多个维度 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证功能机制 | 阐明ILF2在泛癌中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型和ILF2基因 | 生物信息学 | 泛癌分析（特别关注肝细胞癌） | 多组学分析，单细胞RNA测序 | 生物信息学分析模型 | 基因组数据，转录组数据，临床数据 | 多种癌症类型的多组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 8143 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals NFATc1-mediated regulatory mechanisms of vascular smooth muscle cell osteogenic transformation in the osteosarcoma microenvironment
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03606-9
PMID:41021149
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的NFATc1介导的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示NFATc1在骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化中的分布特征和共表达网络 | 需要功能扰动实验来建立因果关系 | 研究骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的调控机制 | 新鲜骨肉瘤组织中的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | k-近邻/Louvain聚类 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, NovaSeq 6000 | 10x Chromium Single Cell 3' v3试剂 |
| 8144 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell and bulk RNA sequencing data establishes a cuproptosis-related gene predictive signature in breast cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03525-9
PMID:41021161
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，建立了乳腺癌中铜死亡相关基因的预测特征 | 首次系统评估铜死亡相关基因在乳腺癌中的预后意义，并构建了基于四个关键基因的预后特征模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立乳腺癌铜死亡相关基因的预后预测模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 预后特征模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO队列的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 8145 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic biomarkers associated with T and melanoma cell subpopulations in melanoma through integrating machine learning and multiomics
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03701-x
PMID:41021162
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和多组学数据，识别了与黑色素瘤预后相关的T细胞和黑色素瘤细胞亚群，并构建了新型预后风险评分模型 | 首次鉴定出MITF+T细胞和M2细胞亚群与黑色素瘤预后的关联，并采用72种机器学习算法组合开发共识预后模型 | NA | 识别黑色素瘤预后相关的细胞亚群并构建预后预测模型 | 黑色素瘤患者和相关的细胞亚群 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | 预后风险评分模型, 机器学习算法组合 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集(GSE200218, GSE215121, GSE65904)和TCGA-SKCM数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达分析 | NA | NA |
| 8146 | 2025-10-05 |
Cell division cycle 25 C (CDC25C) mediates cell-cycle progression and immune evasion in glioma
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03596-8
PMID:41021167
|
研究论文 | 本研究探讨CDC25C在胶质瘤细胞周期进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次系统揭示CDC25C通过调控CDK1-Cyclin B1轴促进胶质瘤细胞增殖并与免疫抑制微环境形成关联 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 阐明CDC25C在胶质瘤进展和免疫逃逸中的分子机制 | 胶质瘤患者样本和U87MG胶质瘤细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA测序, siRNA干扰, EdU染色, 流式细胞术, Western blot | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 多个公共数据库(TCGA, CGGA, GEO)的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 8147 | 2025-10-05 |
Deciphering key chemotherapeutic drug targets within tyrosine metabolism for breast cancer and advancing a wide-ranging diagnostic strategy
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03577-x
PMID:41021173
|
研究论文 | 本研究通过整合分析乳腺癌转录组数据，探索酪氨酸代谢在乳腺癌中的作用及其与化疗反应的关系 | 开发了酪氨酸代谢共表达预后模型，其性能优于传统临床指标，并识别出MAOA和MAOB两个关键基因作为连接免疫治疗和化疗的重要潜在生物标志物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索酪氨酸代谢在乳腺癌早期诊断和治疗中的作用机制 | 乳腺癌患者转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 机器学习算法Extra Trees (BO) | 转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8148 | 2025-10-05 |
FGL1-mediated lymph node metastasis in stage T1 non-small cell lung cancer: therapeutic targeting
2025-Sep-29, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00709-5
PMID:41024301
|
研究论文 | 本研究揭示了FGL1在T1期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移中的关键作用机制 | 首次发现FGL1+细胞亚群介导T1期NSCLC的N2淋巴结转移，并验证了靶向FGL1的新型基因治疗方法 | 研究机制尚未完全阐明，临床转化需要进一步验证 | 探究T1期非小细胞肺癌纵隔淋巴结转移的分子机制并开发靶向治疗策略 | T1期非小细胞肺癌患者样本和细胞模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞测序,转录组测序,代谢组测序,质谱分析 | NA | 单细胞数据,转录组数据,代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8149 | 2025-10-05 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq identifies transcriptional and epigenetic blueprint guiding osteoclastogenic trajectory
2025-Sep-28, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf084
PMID:40577680
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析，揭示了指导破骨细胞生成轨迹的转录和表观遗传蓝图 | 首次在单细胞分辨率上整合多组学分析，发现IRF8作为破骨细胞生成的主要负调控因子 | 研究仅限于小鼠模型，人类样本验证尚需进行 | 阐明破骨细胞生成的转录和表观遗传调控机制 | 野生型和IRF8条件性敲除小鼠的破骨细胞及其前体细胞 | 单细胞多组学 | 骨溶解性疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 8150 | 2025-10-05 |
High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer
2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012613
PMID:40998518
|
研究论文 | 本研究通过分析三级淋巴结构在宫颈癌和头颈鳞癌中的密度、组成及预后影响，揭示其在HPV相关癌症中的免疫调节作用差异 | 首次发现宫颈癌中三级淋巴结构的高Treg和PMN-MDSC浸润与患者不良预后相关，不同于头颈鳞癌中三级淋巴结构密度与良好预后的正相关 | 样本来源限于HPV相关癌症，未涵盖其他癌症类型；空间转录组学分析范围有限 | 探究三级淋巴结构在HPV诱导的宫颈癌和头颈鳞癌中对抗肿瘤免疫的塑造作用及预后影响 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 多重免疫荧光、免疫组织化学、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 组织切片图像、空间转录组数据、流式细胞数据 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8151 | 2025-10-05 |
Myasthenia thymus reprograms class-switched B cells into BAFF-dependent survivors
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677075
PMID:41000735
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示重症肌无力胸腺中B细胞通过转向BAFF依赖的生存机制逃避正常免疫耐受检查点 | 首次发现重症肌无力胸腺中发生免疫耐受检查点转换，B细胞从T细胞依赖性激活转向BAFF驱动的生存机制 | 研究样本仅限于人类胸腺组织，未验证BAFF-BCMA轴在其他自身免疫疾病中的普适性 | 解析重症肌无力中自身反应性B细胞逃避免疫耐受的分子机制 | 人类胸腺组织中的B细胞和滤泡辅助T细胞 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,V(D)J repertoire分析,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 237,661个细胞，来自人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 8152 | 2025-10-05 |
Decoding the Tumor Microenvironment: Insights and New Targets from Single-Cell Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Sep-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090730
PMID:41020852
|
综述 | 本文探讨单细胞测序和空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的应用与进展 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术，在单细胞分辨率下揭示肿瘤微环境的异质性和空间动态 | NA | 探索肿瘤微环境的分子机制并发现新的治疗靶点 | 肿瘤微环境中的细胞组成和空间结构 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8153 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应，揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8154 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 8155 | 2025-10-05 |
TGF-β-Enriched Exosomes from Acute Myeloid Leukemia Activate Smad2/3-MMP2 and ERK1/2 Signaling to Promote Leukemic Cell Proliferation, Migration, and Immune Modulation
2025-Aug-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090690
PMID:41020812
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和外泌体转录组分析，揭示急性髓系白血病来源的TGF-β富集外泌体通过激活Smad2/3-MMP2和ERK1/2信号通路促进白血病进展 | 首次整合单细胞转录组与外泌体分析，发现AML外泌体通过TGF-β介导的信号通路同时增强白血病侵袭性和免疫微环境重塑的双重作用机制 | AML外泌体的精确功能特征仍未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究急性髓系白血病来源外泌体在肿瘤进展中的功能作用和分子机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓穿刺样本和外泌体 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 外泌体转录组数据 | AML患者和健康捐赠者的骨髓穿刺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8156 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息，无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 8157 | 2025-10-05 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotypes and phenotypes in chronic lymphocytic leukemia
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279049.124
PMID:39965935
|
研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 结合scBayes分析方法和MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高转录本覆盖度并扩展可检测的突变信息 | 研究样本量较小，仅包含6名患者 | 研究携带BTK C481S突变的癌症亚克隆，识别共存的CLL驱动突变，并分析突变亚克隆的转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者的癌细胞亚克隆 | 单细胞测序分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | scBayes | 单细胞RNA测序数据，DNA测序数据 | 6名慢性淋巴细胞白血病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 8158 | 2025-10-05 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
|
研究论文 | 本研究通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术，对小鼠视网膜进行了全面的转录组分析 | 首次系统比较单细胞长读长与传统短读长RNA测序技术，发现了44,325个转录本异构体，其中38%为先前未表征，17%在特定细胞亚类中特异性表达 | 研究仅限于小鼠视网膜组织，未验证其他组织或物种的适用性 | 建立有效的转录本异构体表征方法，研究选择性剪接在视网膜生物学中的作用 | 约30,000个小鼠视网膜细胞 | 单细胞测序 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约30,000个细胞 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台, Oxford Nanopore测序平台 | 短读长测序产生15.4亿条reads，长读长测序产生14.0亿条reads |
| 8159 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies molecular biomarkers predicting late progression to CDK4/6 inhibition in patients with HR+/HER2- metastatic breast cancer
2025-Feb-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02226-9
PMID:39955556
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂晚期进展的分子生物标志物 | 首次在单细胞水平分析CDK4/6抑制剂治疗前后肿瘤微环境变化，识别出预测晚期进展的分子特征和免疫细胞动态 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证生物标志物的临床适用性 | 开发预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂治疗反应的生物标志物 | HR+/HER2-转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝转移、胸腔积液、腹水和骨转移等多个转移部位的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8160 | 2025-10-05 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
|
研究论文 | 提出一种名为广义二元协方差分解的统计方法，用于从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 开发了能够将肿瘤转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关共享成分的新统计方法 | 方法在强肿瘤间异质性存在时的性能优势需进一步验证 | 解析肿瘤转录异质性并识别与癌症进展相关的共享表达模式 | 胰腺导管腺癌单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |