单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8141 - 8160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8141 | 2025-10-06 |
Targeting p53 for immune modulation: Exploring its functions in tumor immunity and inflammation
2025-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217614
PMID:40054656
|
综述 | 本文综述了p53在肿瘤免疫和炎症中的双重调节功能及其治疗潜力 | 系统阐述p53在先天性与适应性免疫中的协调作用，揭示其通过免疫原性细胞死亡和NF-κB信号通路参与炎症调节的新机制 | 属于理论综述，缺乏原始实验数据验证具体机制 | 探索p53在免疫调节和肿瘤免疫治疗中的功能与临床应用 | p53蛋白的免疫调节功能及其与免疫细胞（巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞、T细胞、B细胞）的相互作用 | 分子免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8142 | 2025-10-06 |
Integration of bulk and single-cell RNA sequencing reveals dynamic changes in epidermal cells
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142601
PMID:40158578
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序技术，揭示了牦牛表皮细胞在毛囊周期中的动态变化和调控机制 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术系统研究牦牛毛囊周期中表皮细胞的时空动态变化和分化轨迹 | 研究仅针对牦牛模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究毛囊周期中表皮细胞群体的分子调控机制 | 牦牛表皮细胞 | 单细胞组学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 毛囊周期的生长期、退行期和休止期样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8143 | 2025-10-06 |
Roles of innate immune system and receptor Dectin-1 in synovium and cartilage homeostasis of osteoarthritis
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142669
PMID:40164261
|
研究论文 | 本研究探讨先天免疫系统及受体Dectin-1在骨关节炎滑膜和软骨稳态中的作用机制 | 首次构建骨关节炎诊断模型并发现HLA-DRA+细胞为关键细胞群，揭示Dectin-1通过Dectin-1/Syk/NF-κB通路调控巨噬细胞M1极化的新机制 | 先天免疫机制仍需进一步探索，实验验证部分仅聚焦Dectin-1功能 | 探究先天免疫在骨关节炎滑膜炎中的具体作用机制 | 骨关节炎患者的滑膜组织和细胞群 | 生物医学 | 骨关节炎 | RNA测序, 单细胞测序, 机器学习算法 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 8144 | 2025-10-06 |
Hepatic immune environment differences among common mouse strains in models of MASH and liver cancer
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101380
PMID:40342632
|
研究论文 | 比较常见小鼠品系在MASH和肝癌模型中的肝脏免疫环境差异 | 首次系统比较C57BL/6、BALB/c和FVB/N小鼠在健康、MASH和HCC状态下的肝脏免疫景观差异，并进行跨物种验证 | 样本量较小（每组n=4），仅使用公开scRNA-seq数据集进行验证 | 研究不同小鼠品系肝脏免疫环境的差异及其在人类疾病模型中的适用性 | C57BL/6、BALB/c和FVB/N小鼠品系 | 免疫学 | 肝癌 | 高维光谱流式细胞术，scRNA-seq | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | 每组4只小鼠，共多个实验条件 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8145 | 2025-10-06 |
A Germline Heterozygous Dominant Negative IKZF2 Variant Causing Syndromic Primary Immune Regulatory Disorder and ICHAD
2025-Apr-28, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01882-2
PMID:40295428
|
研究论文 | 本文详细描述了一例由IKZF2基因变异引起的ICHAD综合征患儿的免疫学表型分析 | 首次报道生殖系杂合显性负性HELIOS缺陷的免疫学表型，并在单细胞水平扩展了对自身免疫性溶血性贫血发病机制的理解 | 仅基于单个病例研究，样本量有限 | 研究由IKZF2基因变异导致的免疫失调机制 | 携带IKZF2 c.406+540_574+13477dup变异的儿科患者 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 多参数流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 1例儿科患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8146 | 2025-10-06 |
MultiOmics analysis of metabolic dysregulation and immune features in breast cancer
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114376
PMID:40054322
|
研究论文 | 通过多组学分析构建乳腺癌代谢风险模型，用于预测患者预后和免疫治疗反应 | 首次系统整合代谢通路和免疫特征构建乳腺癌预后预测模型，并利用单细胞测序验证特征基因表达模式 | 样本量相对有限（247例），缺乏外部验证队列 | 开发基于代谢特征的乳腺癌预后预测模型 | 乳腺癌患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | GSVA，单细胞测序，机器学习算法 | 代谢风险模型 | 基因表达数据，临床病理数据 | 247例乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8147 | 2025-10-06 |
How fish intestinal cells responded to dietary methylmercury exposure? A single-cell transcriptomic analysis
2025-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.125967
PMID:40043872
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示鱼类肠道细胞对膳食甲基汞暴露的异质性响应 | 首次在单细胞分辨率下系统解析鱼类肠道不同细胞群体对甲基汞的特异性响应机制 | 研究仅针对金头鲷单一物种，未验证其他鱼类或更广泛生物体系的普适性 | 探究膳食甲基汞暴露下鱼类肠道细胞的分子响应机制 | 金头鲷肠道细胞 | 单细胞转录组学 | 重金属毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8148 | 2025-10-06 |
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
2025-Apr-15, ArXiv
PMID:40321945
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架，用于提高空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 开发了自适应利用外部细胞标记信息的迁移学习框架，能够从低分辨率空间转录组数据中可靠提取生物信号 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组数据分析的准确性和可靠性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8149 | 2025-10-06 |
Paradoxical Effect of Myosteatosis on the Immune Checkpoint Inhibitor Response in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2025-Apr, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13758
PMID:40052383
|
研究论文 | 探讨肌脂肪变性对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的差异性影响 | 首次发现肌脂肪变性在不同免疫治疗方案（PD-1抑制剂+CTLA-4抑制剂 vs PD-1抑制剂+TKI）中对预后的相反效应 | 回顾性研究设计，样本量较小（90例患者），单中心数据 | 评估低骨骼肌质量和肌脂肪变性对mRCC患者一线免疫治疗预后的影响 | 转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 多变量生存分析模型 | 临床数据，单细胞RNA测序数据 | 90例mRCC患者（59例接受PD-1+CTLA-4抑制剂，31例接受PD-1+TKI治疗） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8150 | 2025-10-06 |
Single-Cell Proteomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2025-Apr, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.100949
PMID:40090465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞蛋白质组学技术深入表征了前列腺癌耐药细胞的蛋白质组特征及其与形态变化的关联 | 采用优化的高通量数据非依赖性采集方法实现单细胞水平蛋白质组分析，平均每个细胞鉴定超过1300种蛋白质，并发现与细胞大小变化相关的蛋白质亚群 | 研究主要聚焦于PC3细胞系，需要在更广泛的细胞模型和临床样本中验证发现 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组特征及其分子机制 | 前列腺癌耐药细胞和亲代PC3细胞 | 单细胞蛋白质组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | 高通量数据非依赖性采集方法，通量达每天60个样本 |
| 8151 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of pyroptosis-related genes and natural killer T cells in sepsis pathogenesis: a comprehensive bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2025-Apr, Journal of physiology and pharmacology : an official journal of the Polish Physiological Society
IF:2.0Q3
DOI:10.26402/jpp.2025.2.10
PMID:40350654
|
研究论文 | 通过生物信息学和孟德尔随机化分析揭示焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的作用 | 首次整合多组学数据和孟德尔随机化方法系统分析焦亡相关基因与NKT细胞在脓毒症中的因果关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 阐明焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的具体作用 | 脓毒症患者基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 机器学习 | 机器学习, ROC分析, 生存分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE57065、GSE95233、GSE65682、GSE167363） | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
| 8152 | 2025-10-06 |
iMetAct: An integrated systematic inference of metabolic activity for dissecting tumor metabolic preference and tumor-immune microenvironment
2025-Mar-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115375
PMID:40053454
|
研究论文 | 开发了一个整合代谢-转录网络和信息传播策略的框架iMetAct，用于从基因表达数据推断酶活性 | 通过整合代谢-转录网络并考虑翻译后修饰效应，能够更准确地预测代谢物转化率 | NA | 解析肿瘤代谢偏好和肿瘤免疫微环境 | 肝癌细胞代谢酶活性和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 信息传播网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8153 | 2025-10-06 |
Protocol for interpretable and context-specific single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103670
PMID:40042970
|
研究论文 | 提出一种从bulk RNA-seq数据中提取单细胞相关信息的可解释性协议 | 开发了基于单细胞特征的CLIER模型，可在特定单细胞生物学背景下生成可解释的潜变量 | NA | 从bulk RNA-seq数据中提取单细胞相关信息 | bulk RNA-seq数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 单细胞特征提取 | PLIER算法, CLIER模型 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞特征分析 | NA | NA |
| 8154 | 2025-10-06 |
A highland-adaptation variant near MCUR1 reduces its transcription and attenuates erythrogenesis in Tibetans
2025-Mar-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100782
PMID:40043709
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序发现MCUR1基因附近的高原适应变异会降低其转录水平并减弱藏人的红细胞生成 | 首次揭示MCUR1介导的线粒体钙稳态是红细胞生成的新调控机制，并发现rs61644582作为MCUR1的表达数量性状位点和功能变异 | NA | 探索高原适应的遗传机制，特别是与红细胞生成相关的基因 | 藏高原人群和汉族低地人群 | 基因组学 | 高原适应相关生理变化 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 藏高原人群和汉族低地人群样本 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8155 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory role of the stem cell circadian clock in muscle repair
2025-Mar-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq8538
PMID:40043110
|
研究论文 | 本研究揭示了肌肉干细胞生物钟通过调控免疫微环境在肌肉修复中的作用机制 | 首次发现肌肉干细胞生物钟通过NAD代谢调控中性粒细胞活性的时间依赖性免疫调节机制 | 研究主要关注中性粒细胞相互作用，其他免疫细胞类型的作用尚未完全阐明 | 探索生物钟调控肌肉干细胞免疫调节功能的分子机制 | 肌肉干细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 细胞生物学 | 肌肉损伤修复 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8156 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling reveals mechanism, therapeutic potential, and prognostic value of cancer stemness characteristic in nasopharyngeal carcinoma
2025-Mar-07, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01561-w
PMID:40053129
|
研究论文 | 通过生物信息学和机器学习技术研究鼻咽癌中癌症干性特征的机制、治疗潜力和预后价值 | 首次在鼻咽癌中鉴定出两种具有不同干性水平的癌细胞发育轨迹，并建立了基于干性特征的预后模型 | 直接证据仍然有限，需要更多实验验证 | 研究鼻咽癌中癌症干性特征的机制及其临床意义 | 鼻咽癌细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 机器学习 | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8157 | 2025-10-06 |
Engineered mesenchymal stromal cells with bispecific polyvalent peptides suppress excessive neutrophil infiltration and boost therapy
2025-Mar-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt7387
PMID:40053594
|
研究论文 | 本研究通过DNA自组装技术构建双特异性多价肽修饰的间充质基质细胞，有效抑制中性粒细胞过度浸润并增强治疗效果 | 首次利用DNA自组装技术构建靶向P-选择素和E-选择素的双特异性多价肽修饰MSCs，使其能够竞争性抑制中性粒细胞的内皮细胞结合位点 | 研究仅在小鼠急性肝衰竭模型中验证，尚未在其它疾病模型或临床环境中测试 | 开发增强间充质基质细胞靶向能力和治疗效果的工程化方法 | 工程化修饰的间充质基质细胞及其在急性肝损伤治疗中的作用 | 细胞治疗 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，DNA自组装技术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠急性肝衰竭模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8158 | 2025-10-06 |
Genetically encoded tension heterogeneity sculpts cardiac trabeculation
2025-Mar-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads2998
PMID:40053597
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌细胞命运决定中基因编码张力异质性如何调控心脏小梁形成 | 发现Notch信号通过调控PI3K活性和Arp2/3复合物招募，诱导肌动球蛋白网络极化积累驱动细胞分层的新机制 | NA | 探究心肌细胞命运决定机制和心肌模式形成 | 心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因编码生物传感器, 全胚胎活体成像 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8159 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing to predict prognosis and therapeutic response for colorectal cancer
2025-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91761-y
PMID:40055390
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建结直肠癌预后预测模型 | 结合单细胞和bulk RNA测序数据开发9基因预后模型，并建立临床适用的列线图 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 预测结直肠癌预后和治疗反应 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8160 | 2025-10-06 |
CTSO and HLA-DQA1 as biomarkers in sepsis-associated ARDS: insights from RNA sequencing and immune infiltration analysis
2025-Mar-07, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-025-10726-8
PMID:40055592
|
研究论文 | 通过RNA测序和免疫浸润分析探讨脓毒症相关ARDS中CTSO和HLA-DQA1作为生物标志物的作用 | 首次从生物信息学角度系统研究溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境中溶酶体变化的关联，并识别出CTSO和HLA-DQA1作为核心预测基因 | 脓毒症病因复杂，ARDS与脓毒症的区分仅基于感染部位差异，且许多ARDS病例病因复杂 | 探讨溶酶体相关基因与脓毒症免疫微环境变化的关联 | 脓毒症患者，特别是伴有急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的患者 | 生物信息学 | 脓毒症，急性呼吸窘迫综合征 | RNA测序，单细胞测序，基因集富集分析(GSEA)，加权基因共表达网络分析(WGCNA) | PPI网络，免疫浸润模型 | 基因表达数据，临床数据 | NA | BGI | RNA测序，单细胞测序 | NA | NA |