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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8121 | 2025-10-06 | Uncovering Hippo pathway-related biomarkers in acute myocardial infarction via scRNA-seq binding transcriptomics 
          2025-Mar-26, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-025-94820-6
          PMID:40133574
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别急性心肌梗死中Hippo信号通路相关生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法鉴定出五个AMI特异性生物标志物,并预测了179种潜在治疗药物 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证生物标志物的临床价值 | 探索急性心肌梗死的发病机制并寻找诊断生物标志物 | 急性心肌梗死患者和对照人群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8122 | 2025-10-06 | Clonal expansion dictates the efficacy of mitochondrial lineage tracing in single cells 
          2025-Mar-26, Genome biology
          
          IF:10.1Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13059-025-03540-7
          PMID:40134031
         | 研究论文 | 本研究通过计算建模和单细胞基因组学探讨了mtDNA变异作为细胞谱系追踪标记的有效性 | 揭示了克隆扩增程度决定线粒体谱系追踪效果的关键机制,并开发了谱系信息评分系统 | 研究主要基于计算模拟和特定生物场景,需要在更多实验条件下验证 | 评估mtDNA变异作为内源性条形码在单细胞水平追踪人类细胞谱系的有效性 | 线粒体DNA变异在不同生物环境中的克隆动态 | 计算生物学 | NA | 单细胞基因组学, 计算建模 | 计算模型 | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学 | NA | NA | 
| 8123 | 2025-10-06 | Single-cell RNA sequencing reveals potential therapeutic targets in the tumor microenvironment of lung squamous cell carcinoma 
          2025-Mar-26, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-025-93916-3
          PMID:40140461
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺鳞癌肿瘤微环境,识别恶性细胞表型及其临床意义 | 应用非负矩阵分解识别独特的恶性细胞表型(元程序),揭示其与预后的临床相关性 | 基于公共数据集分析,样本来源有限 | 探索肺鳞癌肿瘤微环境组成并识别潜在治疗靶点 | 肺鳞癌肿瘤微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 两个队列的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8124 | 2025-10-06 | Combined targeting of glioblastoma stem cells of different cellular states disrupts malignant progression 
          2025-Mar-26, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-025-58366-5
          PMID:40140646
         | 研究论文 | 本研究通过靶向胶质母细胞瘤干细胞的不同细胞状态,揭示了MEOX2和SRGN在恶性进展中的关键作用 | 首次发现MEOX2-NOTCH和SRGN-NFκB轴分别调控经典型和间充质型胶质母细胞瘤干细胞的增殖与干性维持,并鉴定出FDA批准的靶向药物 | 未明确MEOX2和SRGN在其他类型肿瘤干细胞中的普适性,且临床前模型需进一步验证 | 开发针对胶质母细胞瘤干细胞异质性的联合靶向治疗策略 | 胶质母细胞瘤干细胞(GSCs),特别是经典型(CL)和间充质型(MES)亚群 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8125 | 2025-10-06 | Ectopic expression of Slc1a2 in the prefrontal cortex of sleep-deprived male mice counteracts the glutamate/GABA-glutamine dysfunction 
          2025-Mar-26, BMC biology
          
          IF:4.4Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12915-025-02161-7
          PMID:40140835
         | 研究论文 | 本研究探讨了前额叶皮层中Slc1a2异位表达对睡眠剥夺诱导的谷氨酸/GABA-谷氨酰胺功能紊乱的调节作用 | 首次揭示Slc1a2异位表达可通过星形胶质细胞-神经元通讯逆转睡眠剥夺引起的GABA功能障碍 | 研究仅使用雄性小鼠,未探讨性别差异;机制研究仍需进一步深入 | 阐明Slc1a2在前额叶皮层的异位表达对睡眠剥夺引起的神经代谢紊乱的调节机制 | 雄性小鼠的前额叶皮层、脑干、皮层和下丘脑区域 | 神经科学 | 睡眠障碍 | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 免疫荧光染色, 核磁共振波谱, 行为学测试 | 小鼠睡眠剥夺模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 代谢数据, 行为数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8126 | 2025-10-06 | Combined analysis of single-cell and bulk transcriptome sequencing data identifies critical glycolysis genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension 
          2025-Mar-26, Journal of translational medicine
          
          IF:6.1Q1
          
         
          DOI:10.1186/s12967-025-06373-x
          PMID:40140873
         | 研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组测序数据,识别特发性肺动脉高压中糖酵解关键基因 | 首次结合单细胞和批量转录组数据系统分析IPAH糖酵解机制,发现成纤维细胞是主要调控细胞类型 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于大鼠模型 | 探究特发性肺动脉高压中糖酵解的关键调控机制 | 特发性肺动脉高压患者组织样本和大鼠肺动脉高压模型 | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, scMetabolism, AUCcell, ssGSEA, WGCNA, PPI网络分析 | NA | 转录组测序数据 | 来自GEO数据库的IPAH患者样本和大鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 8127 | 2025-10-06 | Spatiotemporal profiling of adhesion G protein-coupled receptors in developing mouse and human pancreas reveals a role for GPR56 in islet development 
          2025-Mar-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
          
          IF:6.2Q1
          
         
          DOI:10.1007/s00018-025-05659-z
          PMID:40137991
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学系统分析了黏附GPCRs在发育中小鼠和人类胰腺的表达模式,并揭示了GPR56在胰岛发育中的关键作用 | 首次系统描绘了黏附GPCRs在胰腺发育过程中的时空表达图谱,并发现GPR56是胰腺内分泌祖细胞中最丰富的黏附GPCR,通过基因敲除实验证实其调控胰岛细胞比例和β细胞增殖 | 研究主要基于动物模型和转录组数据,需要进一步验证在人类中的功能机制 | 探究黏附GPCRs在胰腺内分泌谱系决定和胰岛发育中的作用 | 发育中的小鼠和人类胰腺组织 | 发育生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qPCR, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠和人类胰腺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8128 | 2025-10-06 | Identification and characterization of human retinal stem cells capable of retinal regeneration 
          2025-Mar-26, Science translational medicine
          
          IF:15.8Q1
          
         
          DOI:10.1126/scitranslmed.adp6864
          PMID:40138453
         | 研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学技术鉴定并表征了人类视网膜中具有再生潜能的神经视网膜干细胞样细胞 | 首次发现并表征了人类胎儿视网膜中不同于传统视网膜祖细胞的新型神经视网膜干细胞样细胞,并证明其在视网膜退行性疾病中的治疗潜力 | 研究主要基于胎儿视网膜和视网膜类器官,在成年人类视网膜中的存在和功能需要进一步验证 | 鉴定和表征人类视网膜干细胞及其在视网膜再生医学中的应用潜力 | 人类胎儿视网膜、视网膜类器官和rd10视网膜色素变性小鼠模型 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞多组学,空间转录组学,细胞移植 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本和视网膜类器官 | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA | 
| 8129 | 2025-10-06 | Single-cell RNA sequencing reveals an IL1R2+Treg subset driving immunosuppressive microenvironment in HNSCC 
          2025-Mar-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
          
         
          DOI:10.1007/s00262-025-04015-1
          PMID:40131478
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现头颈鳞状细胞癌中IL1R2+Treg亚群驱动免疫抑制微环境 | 首次鉴定出IL1R2+Treg亚群在HNSCC中的促癌作用,并揭示联合靶向IL1R2和CTLA4的治疗潜力 | NA | 探究头颈鳞状细胞癌中Treg亚群对肿瘤微环境的影响及治疗策略 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和荷瘤小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,组织微阵列,酶联免疫吸附测定 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片,血清蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8130 | 2025-10-06 | DNA methylation-regulated HLA-C expression modulates immune responses and metabolic alterations to influence prognosis in mesothelioma 
          2025-Mar-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
          
         
          DOI:10.1007/s00262-025-04012-4
          PMID:40131544
         | 研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了DNA甲基化调控的HLA-C表达通过影响免疫反应和代谢过程来调节恶性间皮瘤预后的分子机制 | 首次系统阐明DNA甲基化调控HLA-C在恶性间皮瘤肿瘤微环境中的表达模式及其通过免疫细胞、炎症因子和代谢物影响预后的机制 | 研究主要基于TCGA队列数据,需要进一步实验验证和独立队列验证 | 探究HLA-C在恶性间皮瘤进展中的作用机制及其临床意义 | 恶性间皮瘤患者肿瘤微环境中的免疫细胞(巨噬细胞、T细胞、NK细胞) | 生物信息学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析, 基因集富集分析 | 孟德尔随机化模型, 中介分析模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 临床数据 | TCGA间皮瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA | 
| 8131 | 2025-10-06 | Single-cell sequencing combined with urinary multi-omics analysis reveals that the non-invasive biomarker PRDX5 regulates bladder cancer progression through ferroptosis signaling 
          2025-Mar-24, BMC cancer
          
          IF:3.4Q2
          
         
          DOI:10.1186/s12885-025-13881-y
          PMID:40122834
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序和尿液多组学分析揭示了PRDX5作为膀胱癌非侵入性生物标志物通过调控铁死亡信号通路促进肿瘤进展的机制 | 首次结合单细胞测序和尿液多组学分析发现PRDX5在膀胱癌中的表达特征及其通过调控ROS水平和铁死亡通路促进肿瘤进展的新机制 | NA | 阐明过氧化物酶5(PRDX5)在膀胱癌中的表达谱和生物学意义,研究其通过调控活性氧水平和激活铁死亡通路对膀胱癌进展的影响 | 膀胱癌组织、膀胱癌细胞系、肿瘤微环境中的各种细胞类型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,尿液蛋白质组学,转录组分析 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,转录组学 | NA | NA | 
| 8132 | 2025-10-06 | Intranasal prime-boost RNA vaccination elicits potent T cell response for lung cancer therapy 
          2025-Mar-24, Signal transduction and targeted therapy
          
          IF:40.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41392-025-02191-1
          PMID:40122855
         | 研究论文 | 开发了一种基于环状RNA的鼻内RNA疫苗,通过诱导局部黏膜免疫反应治疗肺癌 | 首次将鼻内给药方式应用于RNA癌症疫苗,利用环状RNA在脂质纳米颗粒中的封装技术诱导局部黏膜免疫反应 | 目前仅在临床前肺癌模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发针对黏膜恶性肿瘤的RNA疫苗新策略 | 肺癌临床前模型 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8133 | 2025-10-06 | Unveiling the role of PPIF and macrophage subtypes in LSCC progression via single-cell and exosome RNA sequencing 
          2025-Mar-24, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-025-93584-3
          PMID:40128571
         | 研究论文 | 通过单细胞和外泌体RNA测序揭示PPIF和巨噬细胞亚型在喉鳞状细胞癌进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示LSCC中巨噬细胞-C1-C1QC亚群通过上调PPIF表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究样本量有限,需要进一步验证PPIF在巨噬细胞亚型中的具体功能机制 | 探究喉鳞状细胞癌肿瘤微环境中细胞异质性及其在癌症进展中的作用 | 喉鳞状细胞癌组织和肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 外泌体RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 外泌体RNA测序 | NA | NA | 
| 8134 | 2025-10-06 | Prognostic and immunological implications of protein kinases in gastric cancer: a focus on hub gene ABL2 and its impact on the polarization of M2 macrophages 
          2025-Mar-24, Biology direct
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13062-025-00636-9
          PMID:40128818
         | 研究论文 | 本研究通过分析胃癌中蛋白激酶的表达特征,构建预后模型并揭示核心基因ABL2通过调控M2巨噬细胞极化促进胃癌进展的机制 | 首次基于蛋白激酶基因构建胃癌分子分型和预后模型,发现ABL2作为核心基因调控M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索蛋白激酶在胃癌中的预后价值和免疫调控机制 | 胃癌患者和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 体外实验 | 机器学习模型 | 转录组数据, 多组学数据, 单细胞测序数据 | GEO和TCGA数据库中的胃癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 8135 | 2025-10-06 | Dietary emulsifier carboxymethylcellulose-induced gut dysbiosis and SCFA reduction aggravate acute pancreatitis through classical monocyte activation 
          2025-Mar-24, Microbiome
          
          IF:13.8Q1
          
         
          DOI:10.1186/s40168-025-02074-1
          PMID:40128912
         | 研究论文 | 本研究揭示食品乳化剂羧甲基纤维素通过诱导肠道菌群失调和短链脂肪酸减少,经经典单核细胞激活加重急性胰腺炎 | 首次阐明羧甲基纤维素通过肠道菌群-单核细胞轴加重急性胰腺炎的机制,并发现阿克曼氏菌和丁酸盐的干预潜力 | 动物模型研究,人类临床相关性需进一步验证 | 探究羧甲基纤维素对急性胰腺炎的影响及其机制 | C57BL/6小鼠和急性胰腺炎患者 | 免疫学 | 急性胰腺炎 | 16S rRNA基因扩增子测序, 单细胞RNA测序, 粪便微生物移植, 短链脂肪酸定量 | 小鼠急性胰腺炎模型 | 基因测序数据, 免疫参数, 分子参数 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA | 
| 8136 | 2025-10-06 | NCKAP1 Inhibits the Progression of Renal Carcinoma via Modulating Immune Responses and the PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway 
          2025-Mar-20, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms26062813
          PMID:40141455
         | 研究论文 | 本研究探讨NCKAP1在肾癌免疫调节和肿瘤进展中的具体作用 | 首次揭示NCKAP1通过调节免疫反应和PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制肾癌进展的机制 | NCKAP1在肾癌中的具体功能此前未知,研究结果需要进一步实验验证 | 研究NCKAP1在肾癌免疫调节和肿瘤进展中的功能 | 肾癌患者样本和769P肾癌细胞系 | 癌症生物学 | 肾癌 | RNA测序, ssGSEA, 单细胞RNA测序, CIBERSORT分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 多种癌症类型的患者样本和769P细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 8137 | 2025-10-06 | Pulmonary Myeloid Cells in Mild Cases of COVID-19 Upregulate the Intracellular Fc Receptor TRIM21 and Transcribe Proteasome-Associated Molecules 
          2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms26062769
          PMID:40141410
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析轻症COVID-19患者肺髓样细胞中TRIM21及其下游信号通路的转录特征 | 首次发现轻症COVID-19患者肺髓样细胞中胞内Fc受体TRIM21转录上调并表达蛋白酶体相关分子,而炎症分支通路被沉默 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平和功能验证 | 探究COVID-19不同严重程度患者肺免疫细胞中Fc受体及其下游信号通路的转录特征 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和轻症、重症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8138 | 2025-10-06 | Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveal a Novel Prognostic Signature of Combining Cuproptosis- and Ferroptosis-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma 
          2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms26062779
          PMID:40141422
         | 研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个结合铜死亡和铁死亡相关基因的肝细胞癌预后特征模型 | 首次将铜死亡和铁死亡相关基因结合构建预后特征模型,并通过单细胞测序数据验证其与肿瘤微环境的关联 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌的预后预测模型和治疗策略 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 共识聚类分析, 主成分分析, 多变量COX回归分析, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 8139 | 2025-10-06 | Diverse Subsets of γδT Cells and Their Specific Functions Across Liver Diseases 
          2025-Mar-19, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms26062778
          PMID:40141420
         | 综述 | 本文系统阐述了γδT细胞在不同肝脏疾病中的功能多样性及其治疗潜力 | 整合单细胞测序和空间转录组学最新发现,揭示γδT细胞亚群(Vδ1/Vδ2/γδT17)在肝脏疾病中的特异性功能 | γδT细胞的功能多样性和调控机制尚未完全阐明 | 探讨γδT细胞在肝脏疾病发病机制中的作用及免疫治疗应用前景 | γδT细胞及其亚群(Vδ1、Vδ2、γδT17等) | 免疫学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 8140 | 2025-10-06 | Inflammatory Transformation of Skin Basal Cells as a Key Driver of Cutaneous Aging 
          2025-Mar-14, International journal of molecular sciences
          
          IF:4.9Q2
          
         
          DOI:10.3390/ijms26062617
          PMID:40141258
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞测序和GWAS数据揭示了皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和炎症转化机制 | 首次发现基底细胞在衰老过程中可向棘状分化或炎症状态两个不同路径分化,并识别出IFI27角质形成细胞亚群在衰老过程中的关键作用 | 研究主要基于测序数据分析,需要进一步的实验验证 | 探究皮肤衰老过程中角质形成细胞的异质性和发育轨迹 | 皮肤角质形成细胞亚群 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞测序, 转录组学, 全基因组关联研究(GWAS) | 单细胞伪时间分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |