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当前共找到 40217 篇文献，本页显示第 8121 - 8140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8121 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8122 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 8123 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
DOI:10.52202/079017-1129
PMID:41551654
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度 | 数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度 | 旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究 | 空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8124 | 2026-01-28 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-11-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白，抑制I型干扰素信号通路，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）持续感染和HBV诱导的肝细胞癌（HCC）发生的新机制 | 首次发现UBR7在非组蛋白（Sp110）泛素化中的新功能，并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索 | 探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制 | 乙型肝炎病毒（HBV）、肝细胞癌（HCC）细胞、HCC患者样本 | 分子生物学与肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | HCC患者样本（具体数量未明确说明） | NA | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 8125 | 2026-01-28 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集，构建了一个元图谱，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因，并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识 | 首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集，生成共识元图谱，以改善罕见神经元类别的分辨率，并连接转录组谱与历史分类系统 | 数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法，可能导致细胞类型检测差异；未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接 | 通过整合scRNA-seq数据集，达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识，并提高罕见神经元类别的检测能力 | 小鼠肠道神经系统中的神经元 | 单细胞转录组学 | 肠道动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集，涉及数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8126 | 2026-01-28 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响，覆盖多个平台和超过50个真实数据集 | 未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制，可能受数据集异质性限制 | 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8127 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8128 | 2026-01-27 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术鉴定了人脱落乳牙干细胞的功能亚群，并揭示了其血管生成和软骨生成能力 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定了SHEDs中的BAMBI⁺功能亚群，并证实其具有更强的增殖、软骨生成和血管生成能力 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源有限，可能影响结果的普适性 | 鉴定人脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标记，为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人脱落乳牙干细胞（SHEDs） | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、Western blot、组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8129 | 2026-01-27 |
Temporal single-cell landscape suggests infection-induced IgM plasma cells as a correlate of durable influenza immunity
2026-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2025.108227
PMID:41242688
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和BCR数据分析，比较了自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，揭示了感染诱导的IgM⁺浆细胞群在持久免疫中的潜在作用 | 首次在单细胞水平上全面比较了流感自然感染与疫苗接种后的B细胞反应，识别出感染特有的、具有持续HLA-II表达的IgM⁺浆细胞群，并揭示了感染与疫苗接种在干扰素刺激基因表达、克隆多样性及时间动态上的关键差异 | 样本量较小（仅7名个体），且仅针对H3N2流感病毒，可能限制了结果的普遍适用性 | 比较流感自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，以探索持久免疫的相关因素 | 人类B细胞 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组测序，BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，BCR序列数据 | 7名个体（3名自然H3N2感染者，4名四价疫苗接种者），共150,131个B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8130 | 2026-01-27 |
FAST: Scalable Factor Analysis for Spatial Dimension Reduction of Multi-section Spatial Transcriptomics
2026-Jan-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag006
PMID:41581212
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研究论文 | 本文开发了一种名为FAST的可扩展因子分析模型，用于多切片空间转录组数据的空间降维处理 | FAST模型能同时处理多切片计数数据，并利用局部空间依赖性进行可扩展计算，是唯一能在2小时内分析超过230万个空间位置数据的方法 | 论文未明确说明模型在处理极高维度或噪声数据时的具体限制 | 开发高效可扩展的空间降维方法以处理大规模多切片空间转录组数据 | 空间转录组数据，包括模拟数据集、真实数据集（小鼠胚胎Stereo-seq数据和乳腺癌Xenium数据） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学技术 | 概率因子分析模型 | 空间转录组计数数据 | 超过230万个空间位置（来自小鼠胚胎Stereo-seq数据集） | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq, Xenium | 小鼠胚胎Stereo-seq数据集和乳腺癌Xenium数据集 |
| 8131 | 2026-01-27 |
Endothelial stem cells of the retinal vasculature reside in the optic nerve
2026-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68201-6
PMID:41577708
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、集落形成实验和谱系追踪分析，揭示了视网膜血管内皮细胞由视神经中的干细胞/祖细胞库供应的新调控系统 | 首次发现视神经中存在视网膜血管内皮细胞的干细胞/祖细胞库，为视网膜血管供应提供了新的调控机制 | NA | 研究视网膜血管内皮细胞的维持和修复机制 | 视网膜血管内皮细胞和视神经中的干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 集落形成实验, 谱系追踪分析 | NA | RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8132 | 2026-01-27 |
Discovery of Anoikis-correlated Biomarkers for Ovarian Cancer Through Integrated Transcriptome and Single-cell RNA Sequencing Analyses
2026-Jan-15, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，发现了与卵巢癌免疫浸润和药物敏感性相关的两个失巢凋亡相关生物标志物STAT3和BCL2L1 | 整合了批量转录组学和单细胞RNA测序数据，识别出与失巢凋亡相关的生物标志物，并关联了免疫浸润和药物敏感性 | 需要通过功能和临床实验进一步验证STAT3/BCL-xL轴靶向和联合免疫治疗的策略 | 识别卵巢癌的精确可靠预后生物标志物 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | LASSO回归，支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8133 | 2026-01-27 |
GLP-1 Targeting Agents Impair Chemoimmunotherapy Effectiveness in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8380296/v1
PMID:41542041
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研究论文 | 本研究评估了GLP-1R在多种人类肿瘤中的表达，并发现GLP-1靶向药物会通过作用于肿瘤细胞和免疫细胞，损害三阴性乳腺癌化疗免疫疗法的疗效 | 首次全面评估了GLP-1R在人类肿瘤中的表达和活性，并揭示了GLP-1暴露会重塑肿瘤微环境、促进恶性细胞间质转化并破坏巨噬细胞炎症，从而损害化疗免疫疗法效果 | NA | 研究GLP-1R靶向药物对三阴性乳腺癌化疗免疫疗法疗效的影响 | 多种人类肿瘤类型，重点关注三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、临床病理数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8134 | 2026-01-27 |
Imputation integrates single-cell and spatial gene expression data to resolve transcriptional networks in barley shoot meristem development
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02176-6
PMID:41501532
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研究论文 | 本文通过整合深度单细胞RNA测序和空间基因表达数据，研究了大麦发育过程中的转录变化，从分生组织和器官创始细胞的指定到不同花器官的起始 | 采用一种整合单细胞RNA测序与空间基因表达数据的插补方法，实现了在细胞分辨率下分析超过40,000个基因的表达谱，并通过BARVISTA网络图形界面进行虚拟微解剖 | 当前技术无法完全实现基因表达谱的精确时空信息，可能影响对局部微环境的理解 | 解析大麦分生组织发育中的转录网络，以理解复杂发育过程的遗传基础 | 大麦分生组织和器官创始细胞，包括花器官的起始和发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 多个大麦组织中的超过40,000个基因 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 8135 | 2026-01-27 |
Cross-organ single-cell integration identifies liver-specific fibroblast programs and HGF-MET/AGT-AGTR1B axes that link fibrosis to hepatocarcinogenesis
2025-Dec-29, Neuro endocrinology letters
PMID:41565578
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研究论文 | 本研究通过跨器官单细胞整合分析，识别了肝脏特异性成纤维细胞程序及HGF-MET/AGT-AGTR1B轴，揭示了肝纤维化与肝细胞癌发生之间的潜在联系 | 采用跨器官单细胞RNA-seq数据整合方法，通过减去共享的全纤维化特征来提名肝脏特异性成纤维细胞基因和通路，并识别了肝脏选择性基质环路及肝细胞-成纤维细胞轴 | 研究依赖于公共数据集，可能存在批次效应或数据异质性；结论为假设性，需进一步实验验证 | 探究肝脏选择性基质机制，以及肝纤维化如何连接到肝细胞癌的发生 | 纤维化心脏、肾脏、肝脏和肺脏的单细胞RNA-seq数据，以及肝细胞癌数据集 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq | Seurat整合工作流、Slingshot伪时间分析、CellChat配体-受体推断 | 单细胞RNA-seq数据 | 多个公共数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8136 | 2026-01-27 |
Intraperitoneal programming of tailored CAR macrophages via mRNA lipid nanoparticle to boost cancer immunotherapy
2025-Dec-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67674-9
PMID:41444487
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向巨噬细胞的mRNA脂质纳米颗粒系统，用于原位编程CAR-M，以增强对实体瘤腹膜转移的免疫治疗效果 | 通过mRNA-LNP系统评估了36种CAR格式，并发现CD3ζ TLR4 ICDs的CAR-M能有效激活适应性免疫，与PD-1/L1疗法协同作用，重塑肿瘤微环境 | CAR设计中潜在细胞内域及其抗肿瘤机制仍需系统探索，研究可能未全面评估所有CAR格式的长期效果或副作用 | 开发针对实体瘤腹膜转移的免疫治疗策略，通过编程CAR-M来增强抗肿瘤免疫反应 | 巨噬细胞、CAR-M、肿瘤微环境、CD8 T细胞 | 免疫治疗 | 实体瘤 | mRNA脂质纳米颗粒系统、单细胞RNA测序 | CAR-M模型 | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8137 | 2026-01-27 |
Comprehensive analysis of malignant subtypes of lung adenocarcinoma based on multi-omics landscape and functional validation of prognostic biomarker BAIAP2L2
2025-Dec-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33171-8
PMID:41436784
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研究论文 | 本研究基于多组学数据，对肺腺癌恶性亚型进行了综合分析，并通过功能实验验证了预后生物标志物BAIAP2L2的作用 | 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据，结合CNV评估、细胞轨迹分析、恶性细胞识别和细胞通讯分析等多种方法，深入解析肺腺癌上皮细胞的异质性，并首次通过CoxBoost模型挖掘并实验验证了BAIAP2L2作为肺腺癌预后风险基因的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于体外细胞实验，缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 | 深入探究肺腺癌的恶性亚型特征，并寻找有效的预后生物标志物 | 肺腺癌上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | CoxBoost模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8138 | 2026-01-27 |
PLAUR, C3, and EMP3 coordinate tumor progression and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04292-3
PMID:41417143
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了PLAUR、C3和EMP3三个基因在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤进展和免疫逃逸中的协同作用，并指出PLAUR是主要驱动因子 | 首次系统性地将PLAUR、C3和EMP3三个基因联系起来，阐明它们在ccRCC肿瘤微环境和免疫逃逸中的协同作用机制，并通过单细胞RNA-seq数据明确了这些基因在不同细胞类型中的表达模式 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 | 识别驱动透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进展和免疫逃逸的关键分子，为ccRCC的诊断和治疗提供新靶点 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验, ELISA | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 基于GSE6344和GSE781数据集，以及正常肾细胞和ccRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8139 | 2026-01-27 |
Identification of NK cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic signature in breast cancer
2025-Dec-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03647-0
PMID:41417435
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序数据识别NK细胞标志基因，构建了一个用于乳腺癌预后预测的模型 | 首次结合单细胞测序数据识别NK细胞标志基因，并利用机器学习构建乳腺癌预后模型，揭示了NK细胞在乳腺癌免疫浸润中的关键作用 | 研究依赖于公共数据库（TCGA和GEO）的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证 | 阐明NK细胞在乳腺癌预后和免疫浸润中的作用，并构建预测模型 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8140 | 2026-01-27 |
Celastrol suppresses bone destruction in rheumatoid arthritis by inhibiting ALOX5 expression in macrophages via the NF-κB pathway
2025-Dec-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33001-x
PMID:41408107
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了中药活性成分雷公藤红素通过抑制巨噬细胞中ALOX5基因表达，进而抑制NF-κB通路活化，从而减轻类风湿关节炎骨破坏的分子机制 | 首次系统性地结合多组学数据（GEO数据库、单细胞RNA测序）和分子对接技术，鉴定出雷公藤红素在RA中的13个潜在靶点，并明确了ALOX5在巨噬细胞中的关键作用及其通过TNF-NFκB通路调控MMP3的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证；单细胞分析的数据来源和样本量未具体说明 | 阐明雷公藤红素（Celastrol）在类风湿关节炎（RA）中抑制骨破坏的具体分子机制 | 类风湿关节炎（RA）相关的基因表达数据、雷公藤红素的分子靶点、巨噬细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 基因集变异分析（GSVA）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（微阵列/RNA-seq）、单细胞转录组数据 | 基于三个GEO数据集（GSE55235, GSE93777, GSE200815），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |