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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8121 | 2025-10-06 |
Understanding Enzalutamide-Resistance Based on a Functional Single-Cell Approach
2025-Jun, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24895
PMID:40211483
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能验证研究前列腺癌细胞对恩杂鲁胺耐药的机制 | 首次在治疗前前列腺癌细胞中发现并分离出AR低表达亚群,并证实其在恩杂鲁胺治疗中被选择性扩增导致耐药 | 研究主要基于细胞系模型,临床样本验证有限 | 阐明前列腺癌对恩杂鲁胺耐药的分子机制 | 前列腺癌细胞系LNCaP及其亚群 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,单细胞克隆,异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据 | LNCaP细胞系及其亚群 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
8122 | 2025-10-06 |
High-resolution transcriptome analysis on a mouse model of neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy using single-nucleus RNA-seq
2025-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102026
PMID:40342532
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研究论文 | 本研究使用单核RNA测序技术分析新生小鼠缺氧缺血性脑病模型的转录组变化 | 首次在HIE模型中应用单核RNA测序技术研究海马体特异性神经元损伤 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类样本 | 深入理解新生儿缺氧缺血性脑病的发病机制 | 新生小鼠HIE模型的海马体组织 | 转录组学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单核RNA测序,免疫染色 | NA | RNA测序数据,图像数据 | 小鼠HIE模型 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
8123 | 2025-10-06 |
The human endometrium: atlases, models, and prospects
2025-Jun, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2025.102341
PMID:40154154
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综述 | 概述人类子宫内膜单细胞转录组图谱和体外模型的研究进展及其在子宫内膜生物学研究中的应用前景 | 整合单细胞分析揭示WNT、NOTCH和TGFβ信号通路的调控作用,并利用先进体外模型捕捉子宫内膜细胞异质性和结构 | 子宫内膜病因学研究不足,现有模型仍存在局限性 | 研究子宫内膜生物学及其功能障碍的机制 | 人类子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8124 | 2025-10-06 |
Cyclopamine Attenuates Pulmonary Arterial Hypertension Development: Implications of Hedgehog Signaling Involvement for the Pathophysiology
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403350R
PMID:40353829
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研究论文 | 本研究探讨环巴明通过抑制Hedgehog信号通路改善肺动脉高压的作用机制 | 首次揭示环巴明通过抑制Hedgehog信号通路改善肺动脉高压的血管重构机制 | 研究主要基于动物模型,人体临床应用效果需进一步验证 | 探索Hedgehog信号通路抑制剂环巴明对肺动脉高压的治疗潜力 | C57BL/6J雄性小鼠和人肺动脉平滑肌细胞 | 病理生理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人肺动脉平滑肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
8125 | 2025-10-06 |
Multifaceted profiling of virus-specific CD8 T cells reveals distinct immune signatures against cytomegalovirus infection states during pregnancy
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112416
PMID:40343282
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了孕妇体内巨细胞病毒特异性CD8 T细胞的免疫特征 | 首次揭示了不同巨细胞病毒感染状态下病毒特异性CD8 T细胞的表型和抗原识别特征差异 | 样本数量有限,需要更大规模研究验证 | 研究孕妇体内抗巨细胞病毒细胞免疫特征及其与血清学诊断的关系 | 具有不同抗巨细胞病毒血清学模式的孕妇 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | MHC-葡聚糖体单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 具有不同血清学模式的孕妇样本(IgGIgM/AI-low、IgGIgM/AI-high和IgGIgM) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | MHC-葡聚糖体单细胞RNA测序 |
8126 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights a significant retinal Müller glial population in dry age-related macular degeneration
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112464
PMID:40343286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干性年龄相关性黄斑变性中一个重要的视网膜Müller胶质细胞亚群 | 首次在AMD小鼠模型和患者中鉴定出表达高水平Sox2的Müller细胞亚群,并发现铁死亡和凋亡是导致这些细胞损伤的关键机制 | NA | 描述干性年龄相关性黄斑变性的全面细胞图谱并识别关键致病细胞群 | 小鼠AMD模型和干性AMD患者 | 单细胞组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8127 | 2025-10-06 |
Schwann cells secrete IGFBP5 to facilitate the growth of keloids
2025-May-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123534
PMID:40049369
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现雪旺细胞通过分泌IGFBP5蛋白促进瘢痕疙瘩生长 | 首次揭示雪旺细胞在瘢痕疙瘩中的浸润现象及其通过分泌IGFBP5促进病变生长的分子机制 | 研究样本量有限,分子机制仍需进一步验证 | 探究瘢痕疙瘩的分子病理机制及潜在治疗靶点 | 瘢痕疙瘩组织、正常瘢痕组织、瘢痕疙瘩成纤维细胞、兔耳瘢痕模型 | 单细胞生物学 | 皮肤纤维增生性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8128 | 2025-10-06 |
Construction of a novel CD8T cell-related index for predicting clinical outcomes and immune landscape in ovarian cancer by combined single-cell and RNA-sequencing analysis
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02582-4
PMID:40354001
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研究论文 | 通过结合单细胞和RNA测序分析构建CD8T细胞相关指数,用于预测卵巢癌临床结局和免疫景观 | 开发了基于机器学习的新型CD8T细胞相关指数(CCAI),首次整合多个CD8T细胞相关分子作为卵巢癌预后生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索CD8T细胞相关生物标志物在预测卵巢癌预后和免疫治疗疗效中的潜在作用 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序,RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞数据 | 多个卵巢癌队列(EMTAB8107, TCGA-OV, GSE26712, GSE26193) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8129 | 2025-10-06 |
Multi-omics identify ribosome related causal genes methylation, splicing, and expression in prostate cancer
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02584-2
PMID:40354008
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研究论文 | 通过多组学方法识别核糖体相关基因NSUN4和MPHOSPH6在甲基化、剪接和表达水平上与前列腺癌风险的因果关系 | 首次整合mQTL、sQTL和eQTL多组学数据,结合孟德尔随机化和共定位分析,系统揭示核糖体基因在前列腺癌中的因果作用机制 | 研究基于汇总数据,缺乏个体层面验证;样本来源有限(仅使用公共数据库数据) | 探究核糖体相关基因在前列腺癌发生发展中的分子机制 | 前列腺癌患者基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学整合分析,单细胞测序,SMR分析,共定位分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,表观遗传数据 | 来自前列腺癌协会基因组研究(PRACTICAL)和FinnGen研究的汇总数据 | NA | 单细胞测序,多组学分析 | NA | NA |
8130 | 2025-10-06 |
CIEC: Cross-tissue Immune Cell Type Enrichment and Expression Map Visualization for Cancer
2025-May-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae067
PMID:39363510
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研究论文 | 开发了一个基于网络的跨组织免疫细胞类型富集分析工具CIEC,用于癌症研究 | 首个整合数据库和富集分析的网络应用程序,用于评估跨组织免疫细胞类型或状态 | NA | 探索癌症患者免疫细胞的内在特征,指导新型癌症免疫生物标志物开发和免疫治疗策略 | 323名癌症患者的480个样本,包括原发肿瘤、癌旁正常组织、淋巴结、转移组织和外周血 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | KOBAS算法 | 基因表达数据 | 480个样本来自323名癌症患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8131 | 2025-10-06 |
Mapping the molecular signature of ABA-regulated gene expression in germinating barley embryos
2025-May-10, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-06654-z
PMID:40348990
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学、代谢组学和空间转录组学技术,揭示了ABA在发芽大麦胚中调控植物激素互作、能量代谢和组织特异性基因活性的分子特征 | 首次在植物组织中成功应用Visium空间转录组学技术,实现了对六个胚区基因表达的精确定位,提供了传统RNA-seq无法解析的组织特异性表达模式 | 空间转录组学技术在植物组织中的应用仍存在技术挑战 | 解析ABA调控大麦种子萌发的分子机制 | 大麦(Hordeum vulgare)胚 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium Spatial Transcriptomics |
8132 | 2025-10-06 |
Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC
2025-May-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03259-w
PMID:40349025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现硫氧还蛋白(TXN)在非小细胞肺癌免疫治疗耐药患者中高表达,并验证其通过促进肿瘤增殖迁移和抑制免疫杀伤导致免疫逃逸 | 首次在单细胞水平揭示TXN表达与NSCLC免疫治疗耐药和冷肿瘤形成的关联,并发现TXN通过调控CD40介导免疫逃逸的新机制 | 研究样本量有限,机制研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究TXN在非小细胞肺癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 非小细胞肺癌患者组织样本和A549、SK-MES-1细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 接受ICB治疗的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8133 | 2025-10-06 |
Diversity and functional specialization of oyster immune cells uncovered by integrative single-cell level investigations
2025-May-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102622
PMID:40343849
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研究论文 | 通过整合单细胞水平研究揭示牡蛎免疫细胞的多样性和功能特化 | 首次在无脊椎动物中通过整合单细胞RNA测序、定量细胞学、细胞分选和功能分析等方法,系统鉴定出至少七种功能不同的血细胞类型和三种造血谱系 | 研究主要聚焦于太平洋牡蛎,结果向其他软体动物和无脊椎动物的普适性需要进一步验证 | 深入表征双壳类软体动物血细胞的多样性和免疫功能 | 太平洋牡蛎的血细胞(血淋巴细胞) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 定量细胞学, 细胞分选, 功能分析, 伪时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 细胞图像数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8134 | 2025-10-06 |
Microvascular immunity is organ-specific and remodeled after kidney injury in mice
2025-May-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59609-1
PMID:40346040
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示小鼠急性肾损伤后肾脏、肝脏和肺部微血管中免疫细胞的动态变化 | 首次发现微血管作为免疫细胞活动的独特场所,并揭示急性肾损伤后肾脏微血管界面的持续重塑过程 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证 | 探究微血管在器官特异性免疫反应中的作用及其在肾脏损伤后的重塑机制 | 小鼠肾脏、肝脏和肺部的微血管免疫细胞 | 免疫学 | 急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8135 | 2025-10-06 |
Identification of programmed cell death-related genes and construction of a prognostic model in oral squamous cell carcinoma using single-cell and transcriptome analysis
2025-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02520-4
PMID:40346375
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研究论文 | 通过单细胞和转录组分析识别口腔鳞状细胞癌中程序性细胞死亡相关基因并构建预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析口腔鳞状细胞癌的程序性细胞死亡相关基因,并建立五基因预后特征模型 | 研究样本量有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建口腔鳞状细胞癌的预后预测模型 | 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织和健康组织样本 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Cox回归模型,LASSO回归 | 基因表达数据 | 341个肿瘤组织,31个健康样本,6个单细胞样本,76个验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
8136 | 2025-10-06 |
Multi-omics integration reveals Vha68-3 as a testicular aging-specific factor that coordinates spermatid elongation through mitochondrial metabolic homeostasis
2025-May-09, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00737-3
PMID:40346547
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析发现Vha68-3作为睾丸衰老特异性因子,通过调控线粒体代谢稳态协调精子细胞伸长过程 | 首次鉴定Vha68-3作为睾丸特异性V型ATP合酶亚基在睾丸衰老中的关键作用,揭示了其通过调控丙酮酸代谢通路影响精子细胞伸长的分子机制 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体在睾丸衰老过程中影响精子发生的分子机制 | 果蝇睾丸组织及精子细胞 | 多组学整合分析 | 男性生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑,免疫荧光染色,透射电子显微镜,单细胞RNA测序,转录组-代谢组关联分析,液相色谱-串联质谱 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,代谢组数据,蛋白质互作数据,显微图像数据 | 果蝇睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学,蛋白质组学 | NA | NA |
8137 | 2025-10-06 |
S100A9 as a potential novel target for experimental autoimmune cystitis and interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2025-May-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00763-5
PMID:40346703
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子生物学实验发现S100A9是间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的关键促炎分子,并通过TLR4信号通路加剧膀胱组织损伤 | 首次揭示S100A9在IC/BPS发病机制中的核心作用,并证明靶向S100A9可显著减轻病理过程 | 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明IC/BPS的关键靶点和潜在机制,寻找有效治疗靶点 | 实验性自身免疫性膀胱炎小鼠模型、基因敲除小鼠和IC/BPS患者 | 单细胞生物学 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组测序, 分子生物学实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8138 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis Reveals Genes Causal Relation with Ovarian Cancer and aging
2025-May-09, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、GWAS和eQTL数据,识别并验证了与卵巢癌和衰老相关的单核细胞亚型关键基因及其因果关系 | 首次整合单细胞RNA测序、GWAS和eQTL数据,采用SMR和HEIDI方法系统识别卵巢癌与衰老相关的因果基因 | 研究基于欧洲人群数据,样本代表性有限;部分基因表达模式存在矛盾 | 识别和验证与卵巢癌和衰老相关的单核细胞亚型关键基因及其潜在因果关系 | 单核细胞亚型(经典单核细胞、中间单核细胞、髓样树突状细胞) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, eQTL, SMR分析, HEIDI检验 | 孟德尔随机化 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 123,280个细胞,GWAS包含14,049个样本和40,941个对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
8139 | 2025-10-06 |
scMUSCL: multi-source transfer learning for clustering scRNA-seq data
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf137
PMID:40152244
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研究论文 | 提出一种名为scMUSCL的新型迁移学习方法,通过利用多个注释参考数据集的知识来改善单细胞RNA测序数据的聚类效果 | 开发了首个多源迁移学习框架用于单细胞聚类,无需预先知道目标数据集的聚类数量,且无需进行批次校正 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 20个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8140 | 2025-10-06 |
Mechanistic insights into EIF6 as a target of Apigenin in alleviating chondrocyte senescence
2025-May, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2025.112725
PMID:40049422
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研究论文 | 本研究揭示芹菜素通过上调EIF6表达缓解软骨细胞衰老的机制 | 首次发现EIF6是芹菜素在膝骨关节炎中的关键靶点,并验证其通过上调EIF6表达抑制软骨细胞衰老 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内实验验证 | 探究芹菜素在膝骨关节炎治疗中的作用靶点和机制 | 人类软骨组织和SW1353软骨肉瘤细胞系 | 生物医学 | 膝骨关节炎 | 网络药理学, 孟德尔随机化分析, 分子对接, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 分子对接数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |