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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8101 | 2025-10-06 |
Recombinant interleukin-7 treatment of refractory Mycobacterium avium complex lung disease (IMPULSE-7): a pilot phase II, single-center, randomized, clinical trial
2025 Jan-Dec, Therapeutic advances in infectious disease
IF:3.8Q2
DOI:10.1177/20499361251339300
PMID:40351870
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研究论文 | 评估重组白细胞介素-7治疗难治性鸟分枝杆菌复合体肺病效果的II期临床试验 | 首次在难治性MAC-LD患者中评估IL-7的免疫治疗潜力,并采用单细胞RNA测序探索免疫抑制机制 | 样本量小(仅8名参与者),研究结果可能受限于患者数量不足 | 评估IL-7治疗难治性鸟分枝杆菌复合体肺病的疗效和安全性 | 难治性鸟分枝杆菌复合体肺病患者 | 临床医学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 8名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8102 | 2025-10-06 |
Single-cell combined transcriptome probes prognostic mechanisms of sialylation-related genes in cervical cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1534247
PMID:40352586
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研究论文 | 基于唾液酸化相关基因构建宫颈癌预后模型并探索其机制 | 首次结合转录组和单细胞RNA测序数据系统研究唾液酸化相关基因在宫颈癌中的预后价值 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 开发宫颈癌预后模型并探索唾液酸化相关基因的作用机制 | 宫颈癌患者 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR | LASSO Cox回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8103 | 2025-10-06 |
Overexpression of MMP14 is associated with poor prognosis and immune cell infiltration in colon cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564375
PMID:40352589
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研究论文 | 本研究探讨MMP14在结肠癌中的过表达与预后不良及免疫细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞转录组分析揭示MMP14在肝转移组成纤维细胞中高表达,并构建基于MMP14共表达基因的三基因风险预测模型 | 需要更多体外和体内实验验证研究结果,样本量有限 | 研究MMP14在免疫功能中的调控作用及其对结直肠癌预后的影响 | 结直肠癌组织和细胞系COLO205 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序,单细胞转录组分析,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光,HE染色 | 机器学习,Cox回归分析 | 基因表达数据,临床数据,单细胞数据 | 4对结直肠癌患者肿瘤与癌旁组织,公共数据库(TCGA和GEO)数据 | NA | 转录组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
8104 | 2025-10-06 |
RGS14 binds to GNAI3 and regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells by affecting PLPP2 expression and MAPK signaling
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1593595
PMID:40352663
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研究论文 | 本研究揭示了RGS14通过结合GNAI3调控PLPP2表达和MAPK信号通路,影响人类精原干细胞增殖与凋亡的分子机制 | 首次发现RGS14-GNAI3-PLPP2调控轴在精原干细胞稳态维持中的关键作用,并阐明其在非梗阻性无精子症发病机制中的功能 | 研究主要基于细胞系实验,需要进一步在动物模型中验证该调控通路的生理功能 | 探究非梗阻性无精子症患者精原干细胞功能障碍的调控网络机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫荧光,蛋白质相互作用分析,免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据,RNA测序数据,蛋白质相互作用数据 | 非梗阻性无精子症患者与正常睾丸组织的精原干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
8105 | 2025-10-06 |
The miR-941/FOXN4/TGF-β feedback loop induces N2 polarization of neutrophils and enhances tumor progression of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561081
PMID:40352924
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研究论文 | 本研究揭示了miR-941/FOXN4/TGF-β反馈环路通过诱导中性粒细胞N2极化促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现miR-941通过靶向FOXN4调控TGF-β信号通路,形成反馈环路驱动肿瘤相关中性粒细胞的N2极化 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探讨miR-941在肺腺癌肿瘤相关中性粒细胞中的作用机制 | 肺腺癌患者肿瘤相关中性粒细胞、A549和H1299细胞系、小鼠移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 荧光素酶报告实验, Western blot, ELISA | miReact算法, 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 肺腺癌患者样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8106 | 2025-10-06 |
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55164-3
PMID:39738047
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雄性小鼠衰老过程中肺免疫微环境重塑促进黑色素瘤转移的机制 | 首次发现衰老通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移的免疫机制,并证明senolytic药物procyanidin C1可逆转此过程 | 研究仅限于雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本 | 探究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移的分子机制 | 雄性小鼠的肺免疫微环境和黑色素瘤转移模型 | 单细胞测序分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤转移模型 | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老雄性小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8107 | 2025-10-06 |
Early transcriptional similarities between two distinct neural lineages during ascidian embryogenesis
2024-10, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.06.005
PMID:38878991
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海鞘胚胎中两种不同神经谱系在发育早期的转录组动态 | 首次以高时间分辨率比较两种不同发育起源神经前体细胞的转录组特征,发现神经板阶段存在早期转录相似性 | 转录因子结合位点富集分析显示两种神经谱系间共享转录调控的证据有限 | 探究不同神经谱系在谱系限制过程中的转录状态相似性程度 | 海鞘胚胎中两种不同发育起源的神经前体细胞及其姐妹细胞谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | PCA分析, 层次聚类 | 单细胞转录组数据 | 从16细胞期到神经板阶段连续五个细胞周期的手工分离神经前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8108 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the gene expression profile and cellular communication in human fetal heart development
2024-10, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.06.004
PMID:38876166
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胎儿心脏发育过程中的基因表达谱和细胞通讯 | 首次在人类胎儿心脏发育的四个时间点(GW8、GW10、GW11、GW17)系统描绘单细胞基因表达图谱,并发现关键信号通路随发育时间的动态变化 | 仅分析了四个发育时间点,样本时间跨度有限;未验证功能机制 | 解析人类胎儿心脏发育过程中的细胞分化和细胞通讯机制 | 人类胎儿心脏组织 | 单细胞组学 | 心脏发育 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4个时间点(GW8、GW10、GW11、GW17)的胎儿心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8109 | 2025-10-06 |
Characterizing Spatially Continuous Variations in Tissue Microenvironment through Niche Trajectory Analysis
2024-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.23.590827
PMID:38712255
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研究论文 | 提出一种基于图神经网络的空间微环境连续变化分析方法ONTraC | 首次开发基于图神经网络的生态位轨迹构建方法,能够系统表征组织微环境的空间连续变化 | NA | 分析组织微环境的空间连续变化特征 | 组织微环境、胚胎发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8110 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析2型糖尿病患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在单细胞水平揭示2型糖尿病患者PBMCs的转录组图谱,发现T细胞和单核细胞中的差异表达基因及关键信号通路 | 样本量较小(仅3名健康参与者和3名T2DM患者),需要更大规模研究验证 | 探索2型糖尿病患者外周血免疫细胞的功能特征和分子机制 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,Ficoll密度梯度离心 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名参与者(3名健康对照,3名T2DM患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8111 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的免疫细胞基因表达特征 | 首次在单细胞水平比较有无皮肤银屑病的银屑病关节炎患者的免疫反应差异 | 未发现PsA-only和PsA/PsC患者间的差异表达基因,样本量相对有限 | 探索银屑病关节炎临床表型与免疫发病机制之间的关联 | 70名银屑病关节炎患者和10名健康对照的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析,基因集富集分析 | 单细胞转录组数据 | 80个样本(70名患者+10名健康对照) | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody Single-Cell Analysis System |
8112 | 2025-10-06 |
Protocol for profiling in vitro intratumor heterogeneity using spatially annotated single-cell sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102447
PMID:37453069
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研究论文 | 介绍一种利用空间注释单细胞测序分析体外肿瘤异质性的实验方案 | 结合活细胞成像和光图案化照明技术,实现特定区域细胞的空间标记和单细胞RNA测序 | 目前主要应用于体外肿瘤模型,尚未在组织切片中广泛应用 | 开发空间解析的肿瘤异质性分析技术 | 体外培养的肿瘤细胞系 | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 活细胞成像, 光激活标记 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据 | 多种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8113 | 2025-10-06 |
Computational workflow for investigating highly variable genes in single-cell RNA-seq across multiple time points and cell types
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102387
PMID:37379219
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研究论文 | 提出一种用于分析单细胞RNA测序数据中跨多个时间点和细胞类型的高变基因的计算工作流程 | 开发了能够同时分析多个时间点和细胞类型中高变基因的计算框架,重点关注与生物学通路相关的基因动态表达 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中高变基因在多个时间点和细胞类型中的表达特征 | 登革热病毒和COVID-19数据集中的免疫细胞类型 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8114 | 2025-10-06 |
Isolation and profiling of viable tumor cells from human ex vivo glioblastoma cultures through single-cell transcriptomics
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102383
PMID:37393609
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研究论文 | 本文提出了一种从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞并进行单细胞转录组分析的实验方案 | 开发了从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞进行单细胞转录组分析的完整实验流程 | NA | 建立胶质母细胞瘤单细胞水平的研究方法 | 人源体外胶质母细胞瘤培养物中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8115 | 2025-10-06 |
Optimized single-cell RNA sequencing protocol to study early genome activation in mammalian preimplantation development
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102357
PMID:37314922
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研究论文 | 本文提出了一种优化的单细胞RNA测序方案,用于研究哺乳动物着床前发育过程中的早期基因组激活 | 改进了单细胞标记逆转录协议,优化了逆转录酶、cDNA扩增酶、裂解缓冲液和纯化步骤,适用于手工挑选的单细胞或数十至数百个细胞 | NA | 开发优化的单细胞RNA测序方案以研究基因表达 | 哺乳动物着床前发育阶段的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单个细胞至数百个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞标记逆转录协议的改进方法 |
8116 | 2025-10-06 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
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研究论文 | 本文提出了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离方案,用于单细胞RNA测序和流式细胞术分析 | 开发了专门针对小鼠足垫组织的免疫细胞分离方案,能够在保持高细胞活力的前提下获得可靠的单细胞悬液 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离和制备方法 | 小鼠足垫组织中的白细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,酶组织消化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8117 | 2025-10-06 |
Protocol to dissociate and isolate wide-diversity single cells by density gradient centrifugation from human hepatoblastoma tissue
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102449
PMID:37459235
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研究论文 | 介绍从人类肝母细胞瘤组织中分离高活性肝细胞和免疫细胞的实验方案 | 开发了基于Percoll密度梯度离心的单细胞分离方案,适用于人类肝母细胞瘤组织 | 方案主要针对肝母细胞瘤组织,对其他组织类型的适用性需要进一步验证 | 建立从人类肝母细胞瘤组织中分离高质量单细胞的标准化流程 | 人类肝母细胞瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8118 | 2025-10-06 |
Protocol to isolate human normal and neoplastic pancreatic cells for single-cell omic analyses
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102464
PMID:37480562
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研究论文 | 本文介绍了一种从正常和肿瘤人类胰腺组织中分离单细胞的实验方案 | 提供了专门针对人类胰腺组织(包括正常和肿瘤样本)的单细胞分离标准化流程 | NA | 建立高质量的人类胰腺单细胞分离方法,用于后续单细胞组学分析 | 人类正常和肿瘤胰腺组织 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | 10x Genomics platform | NA |
8119 | 2025-10-06 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.533888
PMID:37034624
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研究论文 | 开发了一种名为exFINDER的计算方法,用于从单细胞转录组数据中识别细胞接收的外部通讯信号 | 首次提出能够识别单细胞转录组数据中细胞接收的外部信号的方法,而现有方法仅能推断数据中已测量细胞发送的信号 | NA | 开发计算工具以识别细胞接收的外部通讯信号 | 单细胞转录组测序数据中的细胞通讯信号 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | exFINDER算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8120 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.523391
PMID:36747870
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研究论文 | 开发了一个基于互信息的计算框架scMINER,用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性细胞-细胞和基因-基因关系,能够识别传统表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 仅基于scRNA-seq数据,未整合多组学数据验证 | 从单细胞组学数据中识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |