单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8101 - 8120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8101 | 2025-10-06 |
Protocol for profiling in vitro intratumor heterogeneity using spatially annotated single-cell sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102447
PMID:37453069
|
研究论文 | 介绍一种利用空间注释单细胞测序分析体外肿瘤异质性的实验方案 | 结合活细胞成像和光图案化照明技术，实现特定区域细胞的空间标记和单细胞RNA测序 | 目前主要应用于体外肿瘤模型，尚未在组织切片中广泛应用 | 开发空间解析的肿瘤异质性分析技术 | 体外培养的肿瘤细胞系 | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 活细胞成像, 光激活标记 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据 | 多种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8102 | 2025-10-06 |
Computational workflow for investigating highly variable genes in single-cell RNA-seq across multiple time points and cell types
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102387
PMID:37379219
|
研究论文 | 提出一种用于分析单细胞RNA测序数据中跨多个时间点和细胞类型的高变基因的计算工作流程 | 开发了能够同时分析多个时间点和细胞类型中高变基因的计算框架，重点关注与生物学通路相关的基因动态表达 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中高变基因在多个时间点和细胞类型中的表达特征 | 登革热病毒和COVID-19数据集中的免疫细胞类型 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8103 | 2025-10-06 |
Isolation and profiling of viable tumor cells from human ex vivo glioblastoma cultures through single-cell transcriptomics
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102383
PMID:37393609
|
研究论文 | 本文提出了一种从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞并进行单细胞转录组分析的实验方案 | 开发了从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞进行单细胞转录组分析的完整实验流程 | NA | 建立胶质母细胞瘤单细胞水平的研究方法 | 人源体外胶质母细胞瘤培养物中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8104 | 2025-10-06 |
Optimized single-cell RNA sequencing protocol to study early genome activation in mammalian preimplantation development
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102357
PMID:37314922
|
研究论文 | 本文提出了一种优化的单细胞RNA测序方案，用于研究哺乳动物着床前发育过程中的早期基因组激活 | 改进了单细胞标记逆转录协议，优化了逆转录酶、cDNA扩增酶、裂解缓冲液和纯化步骤，适用于手工挑选的单细胞或数十至数百个细胞 | NA | 开发优化的单细胞RNA测序方案以研究基因表达 | 哺乳动物着床前发育阶段的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单个细胞至数百个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞标记逆转录协议的改进方法 |
| 8105 | 2025-10-06 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
|
研究论文 | 本文提出了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离方案，用于单细胞RNA测序和流式细胞术分析 | 开发了专门针对小鼠足垫组织的免疫细胞分离方案，能够在保持高细胞活力的前提下获得可靠的单细胞悬液 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离和制备方法 | 小鼠足垫组织中的白细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，酶组织消化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8106 | 2025-10-06 |
Protocol to dissociate and isolate wide-diversity single cells by density gradient centrifugation from human hepatoblastoma tissue
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102449
PMID:37459235
|
研究论文 | 介绍从人类肝母细胞瘤组织中分离高活性肝细胞和免疫细胞的实验方案 | 开发了基于Percoll密度梯度离心的单细胞分离方案，适用于人类肝母细胞瘤组织 | 方案主要针对肝母细胞瘤组织，对其他组织类型的适用性需要进一步验证 | 建立从人类肝母细胞瘤组织中分离高质量单细胞的标准化流程 | 人类肝母细胞瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8107 | 2025-10-06 |
Protocol to isolate human normal and neoplastic pancreatic cells for single-cell omic analyses
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102464
PMID:37480562
|
研究论文 | 本文介绍了一种从正常和肿瘤人类胰腺组织中分离单细胞的实验方案 | 提供了专门针对人类胰腺组织（包括正常和肿瘤样本）的单细胞分离标准化流程 | NA | 建立高质量的人类胰腺单细胞分离方法，用于后续单细胞组学分析 | 人类正常和肿瘤胰腺组织 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | 10x Genomics platform | NA |
| 8108 | 2025-10-06 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.533888
PMID:37034624
|
研究论文 | 开发了一种名为exFINDER的计算方法，用于从单细胞转录组数据中识别细胞接收的外部通讯信号 | 首次提出能够识别单细胞转录组数据中细胞接收的外部信号的方法，而现有方法仅能推断数据中已测量细胞发送的信号 | NA | 开发计算工具以识别细胞接收的外部通讯信号 | 单细胞转录组测序数据中的细胞通讯信号 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | exFINDER算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8109 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.523391
PMID:36747870
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研究论文 | 开发了一个基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别传统表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合多组学数据验证 | 从单细胞组学数据中识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8110 | 2025-10-06 |
scMINER: a mutual information-based framework for identifying hidden drivers from single-cell omics data
2023-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2476875/v1
PMID:36747874
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研究论文 | 开发了一种基于互信息的计算框架scMINER，用于从单细胞RNA-seq数据中识别隐藏的转录和信号驱动因子 | 利用互信息捕获非线性的细胞-细胞和基因-基因关系，能够识别常规表达分析难以检测的隐藏驱动因子 | 未在摘要中明确说明具体限制 | 解决单细胞组学数据稀疏性问题，识别调控细胞状态的隐藏转录和信号驱动因子 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 互信息框架 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8111 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals correct developmental dynamics and high-quality midbrain cell types by improved hESC differentiation
2023-01-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.10.016
PMID:36400027
|
研究论文 | 本研究通过改进人类胚胎干细胞分化方案，获得高质量中脑细胞类型并揭示其发育动态 | 发现层粘连蛋白-511、双重WNT激活联合GSK3β抑制和FGF8b能改善中脑模式化，并首次通过单细胞转录组分析显示与内源性人类腹侧中脑相似的发育动态 | 未提及具体样本数量限制，研究主要聚焦于体外分化系统 | 优化人类胚胎干细胞向中脑多巴胺能神经元的分化方案并验证细胞类型质量 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 单细胞生物学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8112 | 2025-10-06 |
Cell type-specific changes identified by single-cell transcriptomics in Alzheimer's disease
2022-11-30, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01136-5
PMID:36447241
|
综述 | 整合阿尔茨海默病单细胞转录组学研究的主要发现，并探讨空间组学和多模态研究的新进展 | 首次系统整合多篇单细胞研究，揭示特定细胞类型在阿尔茨海默病中的变化，并展望空间组学技术前景 | 基于已有研究数据的二次分析，未包含原始实验数据 | 系统梳理阿尔茨海默病单细胞转录组学研究进展 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的尸检脑组织 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 多个研究涉及的尸检脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8113 | 2025-10-06 |
CD8+ T cells in breast cancer tumors and draining lymph nodes: PD-1 levels, effector functions and prognostic relevance
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2502354
PMID:40351118
|
研究论文 | 本研究评估了乳腺癌患者不同组织中CD8 T细胞的PD-1表达水平、功能状态及其预后意义 | 首次在乳腺癌中系统比较肿瘤组织、瘤旁组织和引流淋巴结中CD8 T细胞的耗竭阶段分布特征 | 研究主要聚焦于luminal型乳腺癌，样本来源组织类型有限 | 探究CD8 T细胞在不同组织中的耗竭状态及其临床意义 | 乳腺癌患者的肿瘤组织、瘤旁组织和肿瘤引流淋巴结中的CD8 T细胞 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, TCR-β测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 乳腺癌患者组织样本（肿瘤、瘤旁、引流淋巴结） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8114 | 2025-10-06 |
COL1A1-positive endothelial cells promote gastric cancer progression via the ANGPTL4-SDC4 axis driven by endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Jul-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217731
PMID:40254092
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现COL1A1阳性内皮细胞通过内皮-间质转化驱动的ANGPTL4-SDC4轴促进胃癌进展 | 首次在胃癌中鉴定出COL1A1阳性内皮细胞亚群，揭示其通过EndoMT过程促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仍需进一步扩展 | 探究内皮-间质转化在胃癌进展中的具体作用和机制 | 胃癌患者样本中的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 细胞功能实验 | ssGSEA, Monocle2, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 97个胃癌样本（来自6个单细胞RNA测序队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8115 | 2025-10-06 |
Spatial lipidomics reveals sphingolipid metabolism as anti-fibrotic target in the liver
2025-Jul, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156237
PMID:40127860
|
研究论文 | 本研究通过空间脂质组学等多组学技术揭示了鞘脂代谢在肝脏纤维化中的作用机制 | 首次结合空间脂质组学、转录组学和成像质谱流式技术，系统揭示了鞘脂代谢在肝纤维化中的细胞类型特异性机制 | 研究样本量有限，且动物模型与人类疾病存在差异 | 探索脂肪肝疾病中脂毒性机制和纤维化发生的分子基础 | SLD患者肝组织和3种小鼠模型，以及肝星状细胞和人类精准肝切片 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 空间脂质组学, bulk/spatial转录组学, 成像质谱流式, 单细胞RNA测序 | NA | 脂质组数据, 转录组数据, 图像数据 | SLD患者和3种小鼠模型的肝组织样本 | NA | 空间脂质组学, 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 8116 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis reveals BAF complexes as immune-related biomarkers and validation in triple-negative breast cancer
2025-Jul-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123607
PMID:40194763
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示BAF复合物作为免疫相关生物标志物并在三阴性乳腺癌中进行验证 | 首次构建BAF复合物预后模型并发现ACTL6A在三阴性乳腺癌中作为免疫相关生物标志物和治疗靶点的双重作用 | NA | 解码特定BAF复合物在癌症病理、免疫和靶向治疗中的潜力 | 多种人类癌症，重点关注三阴性乳腺癌 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 预后模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和IMvigor210数据库的多组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8117 | 2025-10-06 |
Fibroblast to macrophage-like cell transition in renal inflammatory injury through the MR/CSF1 pathway induced by aldosterone
2025-Jul-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123627
PMID:40216224
|
研究论文 | 本研究验证了醛固酮通过MR/CSF1通路诱导肾间质成纤维细胞向巨噬细胞样细胞转化的新机制 | 首次发现成纤维细胞可通过MR/CSF1信号通路转化为巨噬细胞样细胞，揭示了肾脏炎症损伤中巨噬细胞的新来源 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，临床样本验证相对有限 | 探究肾脏炎症损伤中巨噬细胞的新来源及其形成机制 | Wistar大鼠、大鼠肾间质成纤维细胞(RKF)、慢性肾脏病患者肾活检样本 | 病理生理学 | 慢性肾脏病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、图像数据 | Wistar大鼠分组研究、体外培养的肾间质成纤维细胞、慢性肾脏病患者肾活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8118 | 2025-10-06 |
IL-4 alters TLR7-induced B cell developmental program in lupus
2025-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110472
PMID:40068727
|
研究论文 | 本研究揭示IL-4通过改变TLR7诱导的B细胞发育程序，抑制系统性红斑狼疮中自身抗体的产生 | 首次发现IL-4能重编程TLR7驱动的B细胞发育轨迹，促进向滤泡B细胞和记忆B细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本验证尚不充分 | 探究IL-4对TLR7诱导的狼疮B细胞发育程序的影响机制 | BXD2自身免疫小鼠和系统性红斑狼疮患者B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 自身免疫小鼠模型和SLE患者B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8119 | 2025-10-06 |
MAP4K4 aggravates microvascular anomalies in diabetic retinopathy in a YTHDF2-dependent manner
2025-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06398-3
PMID:40072537
|
研究论文 | 本研究揭示了MAP4K4通过YTHDF2依赖的方式加重糖尿病视网膜病变中的微血管异常 | 首次发现MAP4K4在糖尿病视网膜病变中通过YTHDF2调控mRNA稳定性，并通过NF-κB信号通路影响内皮细胞功能 | 样本量有限，仅使用db/db小鼠模型和体外细胞实验，缺乏更广泛的临床验证 | 探究MAP4K4在糖尿病视网膜病变微血管异常中的作用机制 | 糖尿病视网膜病变患者纤维血管膜、db/db小鼠、人原代视网膜内皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，蛋白质表达分析，信号通路抑制实验 | 动物模型，细胞模型 | 基因表达数据，蛋白质数据 | 8例增殖性糖尿病视网膜病变患者，11例非糖尿病正常视网膜，db/db小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8120 | 2025-10-06 |
Intrapancreatic adipocytes and beta cell dedifferentiation in human type 2 diabetes
2025-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06392-9
PMID:40072535
|
研究论文 | 本研究探讨胰腺脂肪沉积与2型糖尿病患者β细胞去分化的空间关系及分子机制 | 首次在人类胰腺中揭示脂肪细胞聚集与β细胞去分化的空间关联，并通过单细胞RNA测序发现ALDH1A3标记的表达变化 | 样本量有限（50例器官捐献者），主要依赖相关性分析 | 探究胰腺脂肪含量与胰岛β细胞功能失调的关联机制 | 人类胰腺组织（15例2型糖尿病患者，35例非糖尿病患者） | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 组织学分析，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 伪时间分析 | 组织切片图像，单细胞转录组数据 | 50例器官捐献者（15例糖尿病患者+35例对照），11例糖尿病患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 人类胰腺分析项目数据库 |