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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8081 | 2025-05-17 | Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients 
          2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
          
         
          DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
          PMID:40367012
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞,揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点,并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小(仅包括患者和一名健康供体),且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞(来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本) | NA | NA | NA | NA | 
| 8082 | 2025-05-17 | The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
          PMID:40370439
         | 研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术,分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征,发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物,并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血,未评估组织中的免疫细胞特征;研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 | NA | NA | NA | NA | 
| 8083 | 2025-05-17 | Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
          PMID:40370447
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用,以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血,未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA | 
| 8084 | 2025-05-17 | Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
          PMID:40370461
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析,探索了促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs)在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群,并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限,且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞(GFs)及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞(PIGFs) | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | 
| 8085 | 2025-05-17 | Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery 
          2025, Frontiers in molecular biosciences
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
          PMID:40370519
         | 研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据,结合机器学习算法,发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来,并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明,且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者(具体样本信息未提供) | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 8086 | 2025-05-17 | Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice 
          2025, Frontiers in pharmacology
          
          IF:4.4Q1
          
         
          DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
          PMID:40371345
         | research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡,从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制,并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA | 
| 8087 | 2025-10-06 | Detecting global and local hierarchical structures in cell-cell communication using CrossChat 
          2024-12-03, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-024-54821-x
          PMID:39627184
         | 研究论文 | 开发CrossChat计算框架用于检测细胞间通讯的全局和局部层次结构 | 提出首个能够同时推断细胞间通讯全局和局部层次结构的计算方法,突破了现有方法仅能在预定义细胞群间分析通讯的局限 | 方法验证仅限于文中提到的四个数据集,需要更多数据验证通用性 | 开发计算框架以揭示细胞间通讯的层次结构 | 细胞间通讯系统 | 生物信息学 | COVID-19, 皮肤发育 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多分辨率聚类, 树检测方法 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 两个非空间scRNA-seq数据集(COVID-19患者和小鼠胚胎皮肤), 两个空间转录组数据集(小鼠胚胎和小鼠创伤皮肤) | 10x Genomics, BGI | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium, Stereo-seq | 10x Visium空间转录组技术, BGI Stereo-seq空间转录组技术 | 
| 8088 | 2025-10-06 | Endothelial Pim3 kinase protects the vascular barrier during lung metastasis 
          2024-12-03, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-024-54445-1
          PMID:39627185
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肺内皮细胞在黑色素瘤转移过程中的转录重编程,揭示了Pim3激酶在保护血管屏障功能中的关键作用 | 首次发现反应性毛细血管内皮细胞簇(rCap)及其标志物Pim3激酶在肺转移微环境中保护血管屏障功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证有限;观察时间点较早(6小时),长期效应尚不明确 | 探究肺转移微环境中内皮细胞的分子调控机制及其在癌症转移中的作用 | 小鼠肺内皮细胞和黑色素瘤细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8089 | 2025-10-06 | Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps 
          2024-11-29, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-024-54685-1
          PMID:39614076
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现GZMK+CD8+ T细胞通过与成纤维细胞相互作用促进鼻息肉中的中性粒细胞炎症 | 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过表达CXCR4与分泌CXCL12的成纤维细胞相互作用,独特地通过GZMK而非其他颗粒酶诱导中性粒细胞趋化因子产生 | NA | 阐明慢性鼻窦炎伴鼻息肉中中性粒细胞炎症的潜在机制 | 鼻息肉组织中的免疫细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞分析,空间转录组学,T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA | 
| 8090 | 2025-10-06 | COVID-19 progression and convalescence in common variable immunodeficiency patients show dysregulated adaptive immune responses and persistent type I interferon and inflammasome activation 
          2024-11-28, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-024-54732-x
          PMID:39609471
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者在COVID-19感染前后的免疫反应特征 | 首次揭示CVID患者在COVID-19康复期仍持续存在I型干扰素特征和炎症小体激活,并发现适应性免疫反应失调的详细机制 | 样本量有限,未明确完整体液免疫在这些过程中的具体调控机制 | 研究CVID患者对SARS-CoV-2感染的免疫反应特征和长期影响 | 普通变异型免疫缺陷病(CVID)患者 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | CVID患者外周血样本(感染前、感染期间和康复期) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8091 | 2025-10-06 | A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging 
          2024-11-18, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
          PMID:39173624
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻与年老小鼠嗅觉上皮,揭示衰老过程中的细胞和分子变化 | 首次在单细胞分辨率下系统绘制哺乳动物嗅觉上皮衰老的转录组图谱,识别了21种细胞类型中的衰老相关差异表达基因 | 研究仅限于小鼠模型,人类嗅觉上皮衰老可能存在物种特异性差异 | 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和年老小鼠的嗅觉上皮组织 | 单细胞组学 | 衰老相关嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老小鼠嗅觉上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8092 | 2025-10-06 | Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion 
          2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
          
          IF:10.0Q1
          
         
          DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
          PMID:38922360
         | 研究论文 | 评估左炔诺孕酮宫内节育器治疗子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌的长期随访结果及复发机制 | 首次使用空间转录组学分析LIUD治疗过程中免疫微环境变化,揭示复发与免疫耗竭相关 | 样本量较小(仅5例患者的纵向活检),需更大规模研究验证 | 探索LIUD治疗AH/G1EEC的长期疗效及复发机制 | 子宫内膜非典型增生和早期子宫内膜癌患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学, 数字空间分析, 细胞类型反卷积分析 | MCP-counter分析 | 组织活检样本 | 43例初始响应患者(其中41例有随访数据),5例患者纵向活检 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX数字空间分析系统 | Nanostring GeoMX数字空间分析 | 
| 8093 | 2025-10-06 | Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation 
          2024-Nov-01, Neurosurgery
          
          IF:3.9Q1
          
         
          DOI:10.1227/neu.0000000000002986
          PMID:38747605
         | 研究论文 | 本研究通过血管内组织采样技术对Galen静脉畸形病变进行原位分析,探索其遗传学和发病机制 | 首次在常规血管内治疗过程中通过线圈获取VOGM原位内皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 样本量较小(6名患者),需要更大规模研究验证发现 | 开发VOGM分子遗传学分类系统并探索个性化治疗策略 | Galen静脉畸形患者的内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序,遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA序列数据 | 6名患者(年龄12天至约6岁),10次ETS操作 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8094 | 2025-10-06 | A spatiotemporal molecular atlas of mouse spinal cord injury identifies a distinct astrocyte subpopulation and therapeutic potential of IGFBP2 
          2024-10-21, Developmental cell
          
          IF:10.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.016
          PMID:39029468
         | 研究论文 | 本研究构建了小鼠脊髓损伤的时空分子图谱,鉴定出表达Igfbp2的星形胶质细胞亚群并揭示其治疗潜力 | 首次在脊髓损伤中识别出从白质迁移至灰质的Astro-GMii星形胶质细胞亚群,并证明IGFBP2蛋白具有促进神经突生长和功能恢复的治疗潜力 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类临床中验证 | 解析脊髓损伤后的时空分子变化机制并探索治疗靶点 | 小鼠脊髓损伤模型 | 空间转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 8095 | 2025-10-06 | Desmosome mutations impact the tumor microenvironment to promote melanoma proliferation 
          2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2023.09.19.558457
          PMID:37786690
         | 研究论文 | 本文发现桥粒基因突变通过改变肿瘤微环境促进黑色素瘤增殖 | 首次揭示桥粒基因突变在角质形成细胞中通过改变微环境促进邻近黑色素瘤细胞增殖的新机制 | 研究主要基于体外共培养实验,体内验证尚不充分 | 探究桥粒基因突变在黑色素瘤发生发展中的作用机制 | 人类黑色素瘤样本和角质形成细胞 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、蛋白免疫荧光、基因敲低、细胞共培养 | 细胞共培养模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确样本数量,但涉及>70%的皮肤黑色素瘤病例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 8096 | 2025-10-06 | scRNA-seq reveals transcriptional dynamics of Encephalitozoon intestinalis parasites in human macrophages 
          2024-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.05.30.596468
          PMID:38853846
         | 研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究人类巨噬细胞中Encephalitozoon intestinalis寄生虫感染的转录动态 | 首次在单细胞分辨率同时分析宿主和寄生虫在感染过程中的转录变化,揭示寄生虫通过避免宿主检测的潜行策略 | 研究仅关注人类巨噬细胞,未涉及其他细胞类型或体内环境 | 探究微孢子虫感染过程中宿主反应和寄生虫发育的转录调控机制 | 人类巨噬细胞和Encephalitozoon intestinalis寄生虫 | 单细胞生物学 | 机会性感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 8097 | 2025-10-06 | Inferring B Cell Phylogenies from Paired H and L Chain BCR Sequences with Dowser 
          2024-May-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
          
         
          DOI:10.4049/jimmunol.2300851
          PMID:38557795
         | 研究论文 | 本研究开发了利用配对重链和轻链BCR序列推断B细胞系统发育树的方法 | 首次系统研究如何整合配对重链和轻链序列构建B细胞系统发育树,发现轻链整合显著提高树准确性和可重复性 | 当部分轻链数据缺失时(如混合单细胞和批量测序数据),许多系统发育方法会估计有偏的枝长 | 研究使用配对重链和轻链BCR序列构建B细胞系统发育树的策略 | B细胞受体(BCR)序列 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序,系统发育分析 | 最大似然法 | 基因序列数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 8098 | 2025-10-06 | Accurate single-molecule spot detection for image-based spatial transcriptomics with weakly supervised deep learning 
          2024-May-15, Cell systems
          
          IF:9.0Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.cels.2024.04.006
          PMID:38754367
         | 研究论文 | 提出Polaris分析流程,通过弱监督深度学习实现图像空间转录组学中的单分子点检测 | 结合深度学习细胞分割与点检测模型及概率基因解码器,为多种空间转录技术提供统一解决方案 | NA | 开发准确量化单细胞基因表达的空间转录组学分析流程 | 图像空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 弱监督深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学,MERFISH,seqFISH,原位RNA测序 | NA | NA | 
| 8099 | 2025-10-06 | Targeting SCD triggers lipotoxicity of cancer cells and enhances anti-tumor immunity in breast cancer brain metastasis mouse models 
          2024-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.05.06.592766
          PMID:38766019
         | 研究论文 | 本研究探讨SCD抑制剂通过诱导癌细胞脂毒性并增强抗肿瘤免疫来治疗乳腺癌脑转移的机制 | 首次揭示SCD抑制剂通过重塑肿瘤脂质组、增强树突细胞抗原呈递和改善T细胞功能来协同抑制乳腺癌脑转移 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对乳腺癌脑转移的新型治疗策略 | 乳腺癌细胞和乳腺癌脑转移小鼠模型 | 癌症研究 | 乳腺癌脑转移 | 脂质组学分析,qPCR,western blot,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 8100 | 2025-10-06 | Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment 
          2024-03-15, STAR protocols
          
          IF:1.3Q4
          
         
          DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
          PMID:38341849
         | 研究论文 | 本文开发了一种从前列腺癌患者临床样本中处理脊柱转移瘤单细胞RNA测序的实验室方案 | 建立了手术室到实验室的单细胞处理流程,专门针对脊柱转移瘤组织异质性高的挑战 | 仅基于单一前列腺癌患者样本,样本量有限 | 开发脊柱转移瘤单细胞测序分析方案,识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌脊柱转移患者的临床组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例前列腺癌脊柱转移患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |