单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28588 篇文献，本页显示第 8081 - 8100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8081 | 2024-11-06 |
Tertiary lymphoid structure-related score as a predictor for survival prognosis and immunotherapy response in head and neck squamous cell carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1483497
PMID:39493749
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研究论文 | 研究构建了一个基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于三级淋巴结构相关基因的评分系统，并验证了其在预测头颈部鳞状细胞癌患者生存预后和免疫治疗反应中的有效性 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，缺乏大规模临床验证 | 研究旨在开发一种新的预测模型，用于评估三级淋巴结构的存在及其在头颈部鳞状细胞癌患者中的预后和免疫治疗反应 | 头颈部鳞状细胞癌患者及其三级淋巴结构 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | 评分模型 | 基因数据、单细胞数据 | 23个三级淋巴结构相关基因，头颈部鳞状细胞癌患者样本 |
| 8082 | 2024-11-06 |
eMCI: An Explainable Multimodal Correlation Integration Model for Unveiling Spatial Transcriptomics and Intercellular Signaling
2024, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0522
PMID:39494219
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研究论文 | 本文介绍了一种名为eMCI的可解释多模态相关性集成模型，用于揭示空间转录组学和细胞间信号传导 | eMCI通过融合单细胞RNA测序和空间转录组数据，实现了对空间表达模式和细胞间通信的复杂关系的全面分析 | NA | 开发一种新的集成分析框架，以更好地解析空间转录组并阐明细胞间信号传导机制 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 数据融合 | 包括斑马鱼黑色素瘤、大豆根瘤成熟和人类胚胎肺在内的3个跨物种数据集 |
| 8083 | 2024-11-06 |
Prognostic and therapeutic potential of gene profiles related to tertiary lymphoid structures in colorectal cancer
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18401
PMID:39494300
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研究论文 | 本研究开发了一种新的三级淋巴结构（TLS）量化系统，用于预测结直肠癌的预后和治疗反应，并全面描绘了TLS的景观 | 首次建立了TLS评分系统，并验证了其在预测免疫治疗效果中的有效性 | NA | 探讨三级淋巴结构在结直肠癌中的预后和治疗潜力 | 结直肠癌患者的三级淋巴结构及相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 1184名结直肠癌患者 |
| 8084 | 2024-11-06 |
Targeting PLCG2 Suppresses Tumor Progression, Orchestrates the Tumor Immune Microenvironment and Potentiates Immune Checkpoint Blockade Therapy for Colorectal Cancer
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.98200
PMID:39494327
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研究论文 | 研究探讨了PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境和增强免疫检查点阻断疗法中的作用 | 首次发现PLCG2可作为预测结直肠癌预后、优化个体化治疗、逆转免疫逃逸和克服免疫检查点阻断疗法耐药性的精确生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探索PLCG2在结直肠癌进展、肿瘤微环境和增强免疫检查点阻断疗法中的作用 | PLCG2在结直肠癌中的表达、预后意义、临床相关性及其生物学功能 | 癌症研究 | 结直肠癌 | RNA-seq, 蛋白质印迹, qRT-PCR, 多色免疫荧光, 多重免疫组化, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA |
| 8085 | 2024-11-06 |
Reconstruction of the Hepatic Microenvironment and Pathological Changes Underlying Type II Diabetes through Single-Cell RNA Sequencing
2024, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.99176
PMID:39494341
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术重建了2型糖尿病小鼠肝脏微环境及其病理变化 | 揭示了肝星状细胞的激活加剧了代谢相关脂肪性肝病向脂肪性肝炎的发展，并发现了新的Kupffer细胞亚群及其在糖尿病小鼠肝脏炎症中的潜在作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨2型糖尿病对肝脏微环境的影响及其病理变化 | 2型糖尿病小鼠的肝脏 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个2型糖尿病小鼠模型 |
| 8086 | 2024-11-06 |
Corrigendum: Integrative analysis of COL6A3 in lupus nephritis: insights from single-cell transcriptomics and proteomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1508292
PMID:39497818
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8087 | 2024-11-06 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway in breast cancer
2023-Dec-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313693120
PMID:38117852
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研究论文 | 研究探讨了ENPP1在乳腺癌中作为cGAMP-STING通路的固有免疫检查点的机制 | 首次揭示了ENPP1通过抑制cGAMP-STING信号通路促进乳腺癌生长和转移的机制 | 研究主要集中在ENPP1的功能和其在乳腺癌中的作用，未涉及其他癌症类型的验证 | 探讨ENPP1在乳腺癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | ENPP1在乳腺癌中的表达及其对cGAMP-STING通路的影响 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及癌症和正常组织的单细胞RNA测序数据 |
| 8088 | 2024-11-06 |
Temporal recording of mammalian development and precancer
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572260
PMID:38187699
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研究论文 | 本文利用NSC-seq平台记录哺乳动物发育和癌前病变中的细胞事件时间顺序 | 开发了一种新的分子时钟方法，结合细胞状态和谱系信息，记录细胞事件的时间和克隆性 | NA | 研究哺乳动物胚胎发育和癌前病变中细胞事件的时间顺序 | 小鼠胚胎发育中的组织特异性细胞扩张和人类癌前病变中的多祖先起源 | 数字病理学 | NA | NSC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 116个scRNA-seq数据集和418个人类息肉样本 |
| 8089 | 2024-11-06 |
STGNNks: Identifying cell types in spatial transcriptomics data based on graph neural network, denoising auto-encoder, and k-sums clustering
2023-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107440
PMID:37738898
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络、去噪自编码器和k-sums聚类的空间转录组数据细胞类型识别方法STGNNks | 首次将图神经网络、去噪自编码器和k-sums聚类结合用于空间转录组数据的细胞类型识别 | NA | 开发一种创新的空间聚类方法，以提高空间转录组数据分析的效率 | 空间转录组数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | 图神经网络、去噪自编码器、k-sums聚类 | 图卷积网络 | 转录组数据 | 六个10x Genomics Visium数据集 |
| 8090 | 2024-11-06 |
Microdissection of cancer-associated fibroblast infiltration subtypes unveils the secreted SERPINE2 contributing to immunosuppressive microenvironment and immuotherapeutic resistance in gastric cancer: A large-scale study integrating bulk and single-cell transcriptome profiling
2023-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107406
PMID:37729702
|
研究论文 | 本研究通过大规模整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了胃癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的不同浸润亚型及其分泌的SERPINE2在免疫抑制微环境和免疫治疗抵抗中的作用 | 首次通过整合bulk和单细胞转录组数据，揭示了CAFs在胃癌中的不同浸润亚型及其分泌的SERPINE2在免疫抑制微环境和免疫治疗抵抗中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏功能实验验证SERPINE2的具体作用机制 | 探讨CAFs及其分泌因子在胃癌免疫抑制微环境和免疫治疗抵抗中的作用，寻找新的免疫治疗靶点 | 胃癌患者样本及其肿瘤微环境中的CAFs和免疫细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 2148名胃癌患者样本，涵盖11个独立数据集 |
| 8091 | 2024-11-06 |
Identification of urinary extracellular vesicles differentially expressed RNAs in diabetic nephropathy via whole-transcriptome integrated analysis
2023-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107480
PMID:37738894
|
研究论文 | 本研究通过全转录组整合分析，识别了糖尿病肾病中尿液外泌体中差异表达的RNA | 首次报道了糖尿病肾病患者尿液外泌体中的全转录组遗传资源 | NA | 研究糖尿病肾病中尿液外泌体中差异表达的RNA及其作为潜在诊断生物标志物的可能性 | 糖尿病肾病患者的尿液外泌体 | 数字病理学 | 糖尿病 | 微阵列分析、下一代测序 | 机器学习模型 | RNA | 24名参与者，包括12名糖尿病肾病患者和12名2型糖尿病患者 |
| 8092 | 2024-11-06 |
Identification of cell-type-specific genes in multimodal single-cell data using deep neural network algorithm
2023-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107498
PMID:37738895
|
研究论文 | 本文利用深度神经网络算法在多模态单细胞数据中识别细胞类型特异性基因 | 本文创新性地使用深度神经网络模型分析CITE-seq数据，成功识别出红细胞祖细胞中的细胞类型特异性基因 | 本文仅使用了Kaggle数据库中的一个CITE-seq数据集，样本量和细胞类型有限 | 旨在通过多模态单细胞数据识别细胞类型特异性基因 | 骨髓干细胞分化过程中的七种细胞类型的CITE-seq数据 | 机器学习 | 血液相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度神经网络（DNN） | RNA和表面蛋白表达数据 | 七种细胞类型的CITE-seq数据集 |
| 8093 | 2024-11-06 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
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研究论文 | 研究探讨了靶向非连接区Claudin-1（CLDN1）的单克隆抗体在肝细胞癌（HCC）治疗中的作用 | 首次探索了非连接区CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力，并展示了其在抑制肿瘤生长和重编程肿瘤微环境中的显著效果 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未进行临床试验 | 研究CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力及其在抑制肿瘤生长和重编程肿瘤微环境中的作用 | 肝细胞癌（HCC）患者来源的细胞系和动物模型 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大量患者来源的细胞系和动物模型 |
| 8094 | 2024-11-06 |
Network analysis between neuron dysfunction and neuroimmune response based on neural single-cell transcriptome of COVID-19 patients
2022-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106055
PMID:36137317
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研究论文 | 研究基于COVID-19患者神经单细胞转录组数据，分析神经元功能障碍与神经免疫反应之间的网络关系 | 首次揭示了星形胶质细胞在COVID-19感染中的免疫相关因子表达，并分析了其与微胶质细胞和兴奋性神经元的相互作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏功能实验验证 | 探讨COVID-19感染引起的神经元功能障碍与神经免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的内侧前额叶皮层单细胞数据 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA-seq和scRNA-seq数据 | 涉及COVID-19患者的外周血和多组织样本 |
| 8095 | 2024-11-06 |
Comparative analysis of transcriptome remodeling in plaque-associated and plaque-distant microglia during amyloid-β pathology progression in mice
2022-Sep-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02581-0
PMID:36153535
|
研究论文 | 本研究通过结合细胞特异性激光捕获显微切割和RNA测序分析，比较了在阿尔茨海默病小鼠模型中，与淀粉样β斑块相关的微胶质细胞（PAM）和远离斑块的微胶质细胞（PCM）在疾病不同阶段的转录组重塑情况 | 本研究首次直接比较了PAM和PCM在阿尔茨海默病进展中的转录组变化，揭示了微胶质细胞在疾病不同阶段的动态变化及其潜在功能 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨微胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的不同作用及其转录组变化 | 与淀粉样β斑块相关的微胶质细胞（PAM）和远离斑块的微胶质细胞（PCM） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的微胶质细胞样本 |
| 8096 | 2024-11-04 |
Deciphering craniopharyngioma subtypes: Single-cell analysis of tumor microenvironment and immune networks
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111068
PMID:39483146
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了颅咽管瘤（包括成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型）的肿瘤微环境和免疫网络 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤的细胞组成、肿瘤组织多样性和细胞间相互作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示颅咽管瘤的细胞组成和免疫网络 | 成釉细胞瘤型和鳞状乳头状型颅咽管瘤 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8097 | 2024-11-04 |
Investigation of human aging at the single-cell level
2024-Nov, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102530
PMID:39395577
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 本文讨论了多种单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用，并探讨了多组学层在单细胞中的结合以及与空间转录组学和质谱等先进方法的整合 | NA | 探讨单细胞测序技术在人类衰老研究中的应用 | 人类衰老的机制和相关疾病 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 8098 | 2024-11-04 |
Revealing molecular mechanisms of early-onset tongue cancer by spatial transcriptomics
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76044-2
PMID:39482351
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了早发性舌癌的分子机制 | 首次成功整合了来自FF和FFPE样本的空间转录组学数据，并揭示了早发性舌癌的独特特征 | 样本量较小，仅包括9名患者 | 探讨早发性舌癌的分子机制及其与老年患者的差异 | 早发性舌癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 9名舌鳞状细胞癌患者，分为年轻组（5名）和老年组（4名） |
| 8099 | 2024-11-04 |
Characterization of metastasis-specific macrophages in colorectal cancer for prognosis prediction and immunometabolic remodeling
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77248-2
PMID:39487182
|
研究论文 | 本研究开发了一种预测结直肠癌肝转移和预后的预测模型，通过识别特定的巨噬细胞亚群 | 首次基于EEF1G+巨噬细胞基因特征构建了8基因风险模型EMGS，用于预测结直肠癌肝转移患者的预后 | 研究主要基于公开数据库的数据，缺乏临床验证 | 预测结直肠癌肝转移患者的预后并识别潜在的治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者的巨噬细胞亚群及其基因特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 使用了GSE231559、TCGA和GEO数据库的数据 |
| 8100 | 2024-11-04 |
Mechanism differences in the start time of sublingual immunotherapy in a mouse allergic airway inflammation model
2024-Nov-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78062-6
PMID:39487347
|
研究论文 | 研究了在过敏性气道炎症小鼠模型中，舌下免疫疗法（SLIT）的启动时间机制差异 | 首次详细研究了SLIT在预防性和治疗性模型中的时机差异及其对免疫耐受的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 评估SLIT在预防性和治疗性模型中的疗效及其机制 | 过敏性气道炎症小鼠模型中的SLIT效果 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和T细胞受体测序 | NA | RNA序列和T细胞受体序列 | 小鼠样本 |