单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8061 - 8080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8061 | 2025-10-06 |
Spatial and single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblasts dependent immune environment in colorectal cancer
2025 Mar-Apr, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70012
PMID:40068177
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了结直肠癌中成纤维细胞异质性对免疫微环境和预后的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析结直肠癌成纤维细胞异质性，并鉴定出四个与预后相关的成纤维细胞相关基因 | 研究样本量有限，需要更大规模的队列验证研究结果 | 解析结直肠癌中成纤维细胞异质性及其对免疫微环境和预后的影响 | 结直肠癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | Cox回归, 共识聚类, 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8062 | 2025-10-06 |
Enhancing single-cell classification accuracy using image conversion and deep learning
2025-Mar, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-213
PMID:40068952
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研究论文 | 提出一种创新的单细胞分类方法scIC，通过将单细胞转录组测序数据转换为图像形式并结合深度学习技术进行细胞分类 | 首次将单细胞转录组测序数据转换为图像形式，并应用卷积神经网络和残差网络进行细胞分类 | 仅测试了四种细胞类型的数据集，需要更多样化的数据集验证方法通用性 | 提高单细胞转录组测序数据的分类准确性和可靠性 | 小鼠皮肤基底细胞、小鼠淋巴细胞、人类神经元细胞和小鼠脊髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN, ResNet | 图像 | 四种细胞类型的单细胞转录组测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8063 | 2025-10-06 |
Alterations in PD-L1 succinylation shape anti-tumor immune responses in melanoma
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02077-6
PMID:40069506
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L1琥珀酰化通过调控抗肿瘤免疫反应影响黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现PD-L1在赖氨酸129位点的琥珀酰化修饰导致其降解，并鉴定CPT1A作为PD-L1的琥珀酰转移酶 | 研究主要聚焦于黑色素瘤，其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在肿瘤免疫中的作用及PD-L1琥珀酰化对抗肿瘤免疫反应的影响 | 黑色素瘤患者样本和肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、bulk转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学,bulk RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 8064 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics in glomerular diseases
2025-Mar-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae556
PMID:40071426
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综述 | 本文综述空间转录组学技术在肾小球疾病研究中的应用，重点讨论其技术特点、机遇与局限性 | 首次系统评述空间转录组学在肾小球疾病特别是寡免疫性局灶坏死性新月体肾小球肾炎和巨细胞动脉炎中的研究应用 | 方法存在前分析变异和探针相关的人工假象等技术限制 | 探讨空间转录组学技术在自身免疫和炎症性疾病研究中的应用价值 | 肾小球疾病，特别是寡免疫性局灶坏死性新月体肾小球肾炎和巨细胞动脉炎 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，数字空间分析 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8065 | 2025-10-06 |
Identification and Validation of Four Serum Biomarkers With Optimal Diagnostic and Prognostic Potential for Gastric Cancer Based on Machine Learning Algorithms
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70659
PMID:40084401
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别并验证了四种具有最佳胃癌诊断和预后潜力的血清生物标志物 | 整合多组学数据分析并结合机器学习算法首次系统识别出四种胃癌血清生物标志物组合 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步大规模临床验证 | 开发胃癌诊断和预后的生物标志物 | 胃癌患者 | 机器学习 | 胃癌 | scRNA-seq, RT-PCR, ELISA | LASSO, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8066 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptome and single-cell RNA sequencing reveal the molecular basis of cotton fiber initiation development
2025-Mar, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70064
PMID:40084712
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研究论文 | 本研究通过空间转录组和单细胞RNA测序揭示了棉花纤维起始发育的分子基础 | 首次构建棉花胚珠空间转录组图谱并整合单细胞RNA测序数据，发现SVB和SVBL基因在纤维起始中的功能冗余 | 仅分析了-1 DPA、0 DPA和1 DPA三个时间点，未覆盖更完整的纤维发育过程 | 解析棉花纤维起始发育的分子机制 | 棉花胚珠和纤维细胞 | 植物发育生物学 | NA | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 三个发育时间点的棉花胚珠样本(-1 DPA, 0 DPA, 1 DPA) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8067 | 2025-10-06 |
InfoScan: A New Transcript Identification Tool Based on scRNA-Seq and Its Application in Glioblastoma
2025-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052208
PMID:40076844
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的转录本识别工具InfoScan，并应用于胶质母细胞瘤研究 | 开发了新型生物信息学工具InfoScan，能够识别未注释转录本和罕见细胞群体，并在胶质母细胞瘤中发现具有癌症干细胞特征的'肿瘤干细胞样'亚群 | NA | 开发单细胞RNA测序数据分析工具并探索胶质母细胞瘤的转录组特征 | 胶质母细胞瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8068 | 2025-10-06 |
stAI: a deep learning-based model for missing gene imputation and cell-type annotation of spatial transcriptomics
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf158
PMID:40057378
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的模型stAI，用于空间转录组数据的缺失基因插补和细胞类型注释 | 首次提出同时解决空间转录组数据中缺失基因插补和细胞类型注释的深度学习模型，采用联合嵌入和双编码器-解码器模块 | NA | 解决单细胞空间转录组技术中全转录组水平表征和细胞类型全面注释的挑战 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习，编码器-解码器 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8069 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing: Genomic and Transcriptomic Approaches in Cancer Cell Biology
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052074
PMID:40076700
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在癌症生物学研究中的基因组和转录组学方法及其影响 | 整合单细胞测序与多组学数据提供癌症细胞状态和调控机制的多维视角，结合人工智能和机器学习解析海量数据 | NA | 探讨单细胞测序技术对癌症生物学研究的推动作用 | 癌症细胞生物学 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学，原位测序 | 机器学习，人工智能 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 8070 | 2025-10-06 |
Comprehensive SHAP Values and Single-Cell Sequencing Technology Reveal Key Cell Clusters in Bovine Skeletal Muscle
2025-Feb-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052054
PMID:40076676
|
研究论文 | 通过SHAP值和单细胞测序技术揭示牛骨骼肌中关键细胞群及其基因调控机制 | 首次结合SHAP值分析和单细胞测序构建476个关键基因的交互网络，成功绘制骨骼肌单细胞图谱并识别肌纤维细胞的核心地位 | 研究仅聚焦牛和猪的跨物种比较，未涵盖更多物种；样本规模未明确说明 | 解析牛骨骼肌中不同细胞群的重要性排序及其在肌肉发育中的调控机制 | 牛骨骼肌组织中的细胞群体（特别是肌纤维细胞和中性粒细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序，SHAP值分析，蛋白质语言模型 | 机器学习模型（具体类型未明确），蛋白质语言模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8071 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Genes Related to Cell Senescence and Lipid Metabolism in Glioblastoma Based on Transcriptome and Single-Cell RNA-Seq Data
2025-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051875
PMID:40076502
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据识别与细胞衰老和脂质代谢相关的胶质母细胞瘤预后基因 | 首次整合细胞衰老和脂质代谢相关基因构建胶质母细胞瘤预后模型，并通过单细胞分辨率分析基因表达动态 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 改善胶质母细胞瘤的预后预测和治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, Cox回归分析 | 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 8072 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analysis of Surgical Resection Specimens of Primary Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Treated with Afatinib in a Window-of-Opportunity Study (EORTC90111-24111)
2025-Feb-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051830
PMID:40076457
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析阿法替尼治疗的头颈部鳞状细胞癌手术标本，探索抗HER治疗下的肿瘤演变和组成 | 首次在窗口期临床试验中结合空间转录组学和RNA测序分析阿法替尼诱导的头颈部鳞癌肿瘤微环境变化 | 样本量较小，仅分析了三个患者的标本 | 探索抗HER治疗下头颈部鳞状细胞癌的肿瘤演变和微环境组成变化 | 头颈部鳞状细胞癌患者的手术标本和肿瘤活检组织 | 空间转录组学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学, RNA测序 | NA | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 3例患者手术标本（ID08, ID15, ID30） | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8073 | 2025-10-06 |
The establishment of the anther somatic niche with single-cell sequencing
2025-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.11.004
PMID:39547468
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究玉米花药体细胞微环境的发育过程 | 首次建立玉米花药体细胞微环境的单细胞RNA测序数据集，揭示了体细胞类型从减数分裂前到减数分裂后的发育轨迹 | 研究聚焦于玉米特定物种，结果在其他植物中的普适性需要进一步验证 | 解析开花植物花药体细胞微环境的发育机制和细胞类型特异性基因表达 | 玉米(Zea mays)花药的体细胞微环境 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8074 | 2025-10-06 |
Left/right asymmetrically expressed ephrin and Flamingo proteins regulate lateralized axon growth in C. elegans
2025-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.09.014
PMID:39341445
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研究论文 | 本研究通过候选基因方法和单细胞RNA测序分析，发现EFN-2和FMI-1是HLH-16的下游靶标，在秀丽隐杆线虫AIY神经元谱系中左右不对称表达，并协同调控轴突生长的左右不对称性 | 首次在线虫神经系统中鉴定出ephrin蛋白EFN-2和Flamingo蛋白FMI-1的左右不对称表达，并揭示它们通过L1CAM家族受体SAX-7非经典通路协同调控轴突生长 | 研究主要聚焦于AIY神经元谱系，其他神经元类型中的分子不对称性尚未系统探索 | 探究左右不对称表达的分子机制及其在神经系统发育中的功能意义 | 秀丽隐杆线虫的AIY神经元谱系 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，候选基因方法 | NA | 基因表达数据，显微成像数据 | 秀丽隐杆线虫AIY神经元谱系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8075 | 2025-10-06 |
Pronounced early differentiation underlies zebra finch gonadal germ cell development
2025-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.006
PMID:39214328
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了鸡和斑胸草雀生殖细胞发育的种间差异 | 首次在斑胸草雀中发现两种不同的早期生殖细胞类型，并揭示其表达斑胸草雀特有的生殖限制染色体基因 | 研究仅比较了两种鸟类物种，可能无法完全代表所有鸟类的生殖细胞发育多样性 | 探究鸟类生殖细胞发育的种间差异，特别是新鸟下纲物种的生殖细胞发育特征 | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎性腺组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎性腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8076 | 2025-10-06 |
Cellular and molecular determinants mediating the dysregulated germinal center immune dynamics in systemic lupus erythematosus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530327
PMID:40070830
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多重成像技术揭示系统性红斑狼疮淋巴结滤泡中免疫细胞动态失调的分子机制 | 首次结合空间转录组学与多重成像技术系统揭示SLE滤泡内TFH细胞分化失调、Bcl6hi细胞减少及自身反应性ABC细胞富集的空间分子特征 | 样本来源限于淋巴结组织，未涉及其他免疫器官；机制研究主要基于相关性分析 | 探究系统性红斑狼疮滤泡免疫微环境中细胞和分子决定因素 | 系统性红斑狼疮患者的淋巴结滤泡组织 | 空间转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 空间转录组学，多重成像 | NA | 空间转录组数据，多重成像数据 | SLE患者与对照组的淋巴结样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8077 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment characteristics between ocular adnexal mucosa-associated lymphoid lymphoma and IgG4-related ophthalmic disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1508559
PMID:40078987
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术比较眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病的细胞异质性和免疫微环境特征 | 首次对眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病进行单细胞转录组测序比较分析，揭示了两种疾病的细胞组成和免疫微环境差异 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证 | 探究眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病的分子发病机制差异 | 眼附属器泪腺区域组织样本 | 单细胞测序分析 | 眼附属器淋巴瘤, IgG4相关眼病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光检测 | 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例MALT淋巴瘤，3例IgG4-ROD） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8078 | 2025-10-06 |
Development of a tertiary lymphoid structure-based prognostic model for breast cancer: integrating single-cell sequencing and machine learning to enhance patient outcomes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534928
PMID:40078998
|
研究论文 | 开发基于三级淋巴结构的乳腺癌预后模型，整合单细胞测序和机器学习技术 | 首次将三级淋巴结构与单细胞测序和机器学习结合构建乳腺癌预后模型 | 基于回顾性队列研究，需要前瞻性验证 | 开发乳腺癌预后预测模型以改善患者结局 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | 机器学习预测模型 | 转录组数据，基因组数据 | 9,551名患者来自13个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8079 | 2025-10-06 |
The sentinels of coronary artery disease: heterogeneous monocytes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1428978
PMID:40079002
|
综述 | 探讨冠状动脉疾病中单核细胞异质性的作用及其临床意义 | 提出单核细胞作为冠状动脉疾病的“哨兵”角色，系统阐述其异质性在疾病不同亚型和病理阶段的特征 | NA | 探索单核细胞异质性在冠状动脉疾病中的作用机制和临床价值 | 冠状动脉疾病患者的单核细胞 | 免疫学 | 冠状动脉疾病 | 高参数流式细胞术、单细胞测序 | NA | 临床数据、分子表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 8080 | 2025-10-06 |
Analysis of single-cell and spatial transcriptomics in TNBC cell-cell interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521388
PMID:40079015
|
综述 | 概述单细胞RNA测序和空间转录组学在TNBC肿瘤微环境细胞相互作用研究中的应用 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统揭示TNBC肿瘤异质性和细胞间相互作用 | NA | 增强对三阴性乳腺癌细胞水平的理解以开发有效治疗靶点 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、T细胞、B细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |