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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8041 | 2025-10-06 |
Exploring the "chemo" in chemoimmunotherapy for triple-negative breast cancer
2025-Mar-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.02.016
PMID:40068590
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较三阴性乳腺癌患者接受PD-L1抑制剂atezolizumab联合不同紫杉醇类药物治疗后的免疫细胞动态变化 | 发现nab-紫杉醇联合治疗组中肥大细胞在免疫激活中的独特作用,以及不同的T细胞活化模式 | NA | 探索三阴性乳腺癌化学免疫治疗中化疗药物的免疫调节作用 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8042 | 2025-10-06 |
PRMT5 highly expressed on CD16 + CD56- natural killer cells is correlated with NK cells exhaustion in colorectal cancer mesenchyme
2025-Mar-08, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03981-w
PMID:40056169
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研究论文 | 本研究探讨结直肠癌间质中自然杀伤细胞表型变化与免疫检查点表达的关系 | 首次发现PRMT5在CD16+CD56- NK细胞中高表达与NK细胞耗竭相关 | 样本量有限(194例),未涉及机制深入研究 | 研究结直肠癌微环境中NK细胞表型变化与免疫检查点的关系 | 结直肠癌患者的肿瘤间质和自然杀伤细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色、多重免疫组化、单细胞测序 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 194例结直肠癌患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
8043 | 2025-10-06 |
Microbial metabolites control self-renewal and precancerous progression of human cervical stem cells
2025-Mar-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57323-6
PMID:40057497
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸杆菌代谢产物通过PI3K-AKT通路和YAP1调控宫颈干细胞自我更新及癌前病变的机制 | 首次发现微生物代谢产物乳酸对宫颈干细胞的调控作用,并阐明D-乳酸与L-乳酸在正常和癌前类器官中的差异性生长抑制效应 | 宫颈干细胞分离富集方法仍需优化,调控机制研究尚未覆盖所有潜在信号通路 | 探究宫颈干细胞的调控机制及其在宫颈癌发生发展中的作用 | 人类和小鼠宫颈干细胞、正常及癌前宫颈类器官 | 单细胞生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,类器官培养,舌下移植系统 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8044 | 2025-10-06 |
IL-19 as a promising theranostic target to reprogram the glioblastoma immunosuppressive microenvironment
2025-Mar-08, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-025-01126-w
PMID:40057744
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研究论文 | 本研究识别IL-19作为胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的关键调控因子,并开发靶向IL-19的诊疗一体化纳米颗粒 | 首次发现IL-19/WISP1信号通路在胶质母细胞瘤侵袭中的作用,开发了新型CHOL-PEG-SPIO-IL-19纳米颗粒实现诊疗一体化 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索IL-19在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中的作用并开发靶向治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者样本、TMZ敏感和耐药GBM细胞系、Il-19基因敲除小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞因子阵列, CRISPR基因编辑, 动态光散射, 透射电镜, 傅里叶变换红外光谱, 普鲁士蓝染色, 磁共振成像 | 动物模型, 细胞模型 | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据 | 台湾GBM队列和TCGA数据库患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 磁共振成像 | NA | NA |
8045 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicular delivery of ceramides from pulmonary macrophages to endothelial cells facilitates chronic obstructive pulmonary disease
2025-Mar-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02125-y
PMID:40055817
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研究论文 | 本研究揭示了肺巨噬细胞通过细胞外囊泡向内皮细胞递送神经酰胺在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的新作用 | 首次发现神经酰胺可作为细胞间信号分子通过细胞外囊泡从肺巨噬细胞传递至内皮细胞,介导COPD的发病过程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证仍需进一步研究 | 探究神经酰胺在慢性阻塞性肺疾病中作为细胞间信号分子的作用机制 | 肺巨噬细胞、内皮细胞、慢性阻塞性肺疾病患者和小鼠模型 | 单细胞组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、质谱脂质组学、透射电子显微镜、纳米颗粒追踪分析 | NA | 转录组数据、脂质组数据、图像数据 | 人类肺组织样本、COPD患者肺泡巨噬细胞、香烟烟雾暴露小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
8046 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria
2025-Mar-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.01.020
PMID:39970911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示非洲富拉尼族和莫西族儿童对恶性疟疾免疫反应的民族差异 | 首次在单细胞分辨率下比较不同民族群体对疟疾的免疫反应,发现民族特异性免疫特征和表达数量性状位点 | 样本仅来自布基纳法索农村地区,可能无法完全代表其他地理区域的种群差异 | 探究民族差异对恶性疟疾免疫反应的影响机制 | 126名感染和未感染的富拉尼族和莫西族儿童的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析,eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 126名儿童,超过70,000个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8047 | 2025-10-06 |
Bacteroides fragilis Toxin Suppresses METTL3-Mediated m6A Modification in Macrophage to Promote Inflammatory Bowel Disease
2025-Mar-05, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae179
PMID:40065724
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研究论文 | 本研究揭示了脆弱拟杆菌毒素通过抑制METTL3介导的m6A修饰促进炎症性肠病的分子机制 | 首次发现肠道微生物毒素可通过调控宿主m6A表观转录组影响炎症性肠病进展 | 研究主要聚焦于巨噬细胞,其他免疫细胞类型的作用尚未完全阐明 | 探究脆弱拟杆菌毒素与宿主相互作用对mRNA m6A修饰的影响及其机制 | 炎症性肠病患者和葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎小鼠 | 单细胞测序 | 炎症性肠病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 炎症性肠病患者和结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8048 | 2025-10-06 |
HOXA1 Contributes to Bronchial Epithelial Cell Cycle Progression by Regulating p21/CDKN1A
2025-Mar-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052332
PMID:40076953
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研究论文 | 本研究探讨HOXA1基因通过调控p21/CDKN1A在支气管上皮细胞周期进程中的作用 | 首次揭示HOXA1在气道上皮细胞增殖和迁移中的功能,并阐明其通过p21/CDKN1A调控细胞周期的机制 | 研究仅使用细胞系模型,未在体内验证;样本来源单一 | 研究HOXA1基因在气道上皮细胞增殖和迁移中的作用机制 | 支气管上皮细胞系 | 细胞生物学 | 慢性阻塞性肺病 | CRISPR/CAS9基因编辑,单细胞RNA测序,流式细胞术,划痕实验 | 基因敲除细胞模型 | 基因表达数据,细胞图像,流式细胞数据 | HOXA1敲除和野生型支气管上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8049 | 2025-10-06 |
TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073
PMID:40065693
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研究论文 | 提出一种名为TrAGEDy的新方法,用于对齐单细胞转录组测序中的独立轨迹,避免误差较大的整合步骤 | 能够处理不对称生物过程的轨迹对齐,在模拟和真实数据中均优于现有工具 | NA | 开发单细胞转录组数据中独立轨迹对齐的新方法 | T细胞和布氏锥虫血流形式的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 轨迹对齐算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8050 | 2025-10-06 |
AJGM: joint learning of heterogeneous gene networks with adaptive graphical model
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf096
PMID:40073230
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研究论文 | 提出一种自适应联合图模型AJGM,用于从具有未知异质性的单细胞或批量数据中估计多个基因网络 | 引入整体网络捕捉所有样本共享的关系,通过自适应权重连接亚型网络与整体网络,更有效地关注跨网络共享的基因关系 | 未明确说明模型对非高斯分布数据的适应性限制 | 从异质性基因表达数据中同时进行亚型分类和基因网络推断 | 基因网络和基因功能关系 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 自适应联合图模型AJGM | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
8051 | 2025-10-06 |
NAD+ Promotes Superovulation of Huaxi Cattle Through Regulation of Cumulus Cell Proliferation and Oocyte Maturation
2025-Mar-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052276
PMID:40076893
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研究论文 | 本研究探讨了NAD+对华西牛超数排卵的促进作用及其机制 | 首次揭示了NAD+通过调控卵丘细胞活性和卵母细胞成熟来提高超数排卵效率的新机制 | 研究仅针对华西牛品种,未在其他牛种中验证 | 提高牛类超数排卵效率和胚胎质量 | 华西牛及其卵丘细胞和卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 血清代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、单细胞转录组数据 | 华西牛群体 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
8052 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-Mar, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70015
PMID:40058366
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研究论文 | 通过单细胞转录组和eQTL整合分析揭示PZP蛋白在衰老和慢性肾病中的作用机制 | 首次发现CD8+中央记忆T细胞在衰老和慢性肾病中的关键作用,并鉴定PZP作为连接两者的重要遗传因子 | 样本来源仅限于外周血,未涉及肾脏组织样本;样本量相对有限 | 探索衰老与慢性肾病相互作用的遗传和免疫机制 | 年轻对照者、老年个体和慢性肾病患者的免疫细胞 | 单细胞组学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 | 年轻对照、老年个体和慢性肾病患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8053 | 2025-10-06 |
Cell type-dependent directional transcription at enhancers
2025-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf007
PMID:40060372
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据发现增强子在单个细胞类型中倾向于单向转录,而非传统认为的平衡双向转录 | 挑战了增强子平衡双向转录的传统观点,首次系统证明增强子在单个细胞类型中主要呈现单向转录特征 | 研究主要基于现有数据库分析,需要更多实验验证增强子转录方向与功能的关系 | 探究增强子转录方向特征及其在细胞类型特异性中的变化 | 增强子及其转录特征 | 基因组学 | NA | CAGE(帽分析基因表达),单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,报告基因检测数据 | FANTOM5和其他深度CAGE转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,深度转录组测序 | NA | NA |
8054 | 2025-10-06 |
HBx/DTL Positive Feedback Loop Promotes HBV-Related Hepatocellular Carcinoma Progression
2025-Mar, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70284
PMID:40062428
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研究论文 | 本研究揭示了HBx/DTL正反馈环路在HBV相关肝细胞癌进展中的关键作用机制 | 首次发现HBx与DTL之间的正反馈调控机制,并阐明DTL通过稳定HBx蛋白和调节肿瘤免疫微环境促进肝癌发展 | 研究主要基于实验模型,需要进一步临床验证DTL作为生物标志物的价值 | 探究HBV相关肝细胞癌的发病机制,特别是HBx蛋白与DTL的相互作用 | HBV阳性肝细胞癌样本、肝癌细胞系、裸鼠模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,蛋白质印迹分析,染色质免疫沉淀-qPCR,Cut&Tag | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,细胞周期数据 | HBV阳性HCC样本和实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8055 | 2025-10-06 |
Analyze the Diversity and Function of Immune Cells in the Tumor Microenvironment From the Perspective of Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70622
PMID:40062730
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综述 | 从单细胞RNA测序角度分析肿瘤微环境中免疫细胞的多样性和功能 | 通过单细胞RNA测序技术揭示免疫细胞功能异质性及其在肿瘤抗体反应中的作用,构建免疫细胞互作网络 | 存在若干技术挑战,需要进一步改进才能完全整合到临床应用 | 总结肿瘤微环境中免疫细胞的多样性、对患者预后和治疗反应的影响 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8056 | 2025-10-06 |
A functional single-cell metabolic survey identifies Elovl1 as a target to enhance CD8+ T cell fitness in solid tumours
2025-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01233-w
PMID:40065102
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研究论文 | 通过单细胞代谢筛选鉴定Elovl1作为增强CD8+ T细胞在实体瘤中适应性的靶点 | 首次通过CRISPR/Cas9代谢筛选结合单细胞RNA测序系统鉴定Elovl1作为改善T细胞代谢适应性的关键靶点 | 研究主要聚焦于胰腺癌和黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的适用性需进一步验证 | 探索通过代谢重编程增强CD8+ T细胞在实体瘤微环境中适应性的策略 | CD8+ T细胞及其在胰腺癌和黑色素瘤模型中的代谢调控机制 | 单细胞生物学 | 胰腺癌, 黑色素瘤 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8057 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of WES and scRNA-Seq Data Reveals the Genetic Basis of Immune Dysregulation in Unexplained Recurrent Pregnancy Loss
2025-Mar, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70011
PMID:40066928
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研究论文 | 通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序数据,揭示不明原因复发性流产中免疫失调的遗传基础 | 首次将WES与scRNA-seq数据整合分析,系统揭示MUC基因、脂代谢基因和结构基因变异通过破坏黏膜屏障和脂质稳态导致uRPL的分子机制 | 样本量较小(仅13例中国患者),需要更大规模研究验证 | 阐明不明原因复发性流产的遗传基础和免疫失调机制 | 13例中国不明原因复发性流产患者的绒毛膜样本和蜕膜免疫细胞 | 基因组学与转录组学 | 复发性流产 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据 | 13例uRPL患者 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8058 | 2025-10-06 |
Spatial and single-cell transcriptomic analysis reveals fibroblasts dependent immune environment in colorectal cancer
2025 Mar-Apr, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.70012
PMID:40068177
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了结直肠癌中成纤维细胞异质性对免疫微环境和预后的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统分析结直肠癌成纤维细胞异质性,并鉴定出四个与预后相关的成纤维细胞相关基因 | 研究样本量有限,需要更大规模的队列验证研究结果 | 解析结直肠癌中成纤维细胞异质性及其对免疫微环境和预后的影响 | 结直肠癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | Cox回归, 共识聚类, 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
8059 | 2025-10-06 |
Enhancing single-cell classification accuracy using image conversion and deep learning
2025-Mar, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-213
PMID:40068952
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研究论文 | 提出一种创新的单细胞分类方法scIC,通过将单细胞转录组测序数据转换为图像形式并结合深度学习技术进行细胞分类 | 首次将单细胞转录组测序数据转换为图像形式,并应用卷积神经网络和残差网络进行细胞分类 | 仅测试了四种细胞类型的数据集,需要更多样化的数据集验证方法通用性 | 提高单细胞转录组测序数据的分类准确性和可靠性 | 小鼠皮肤基底细胞、小鼠淋巴细胞、人类神经元细胞和小鼠脊髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN, ResNet | 图像 | 四种细胞类型的单细胞转录组测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8060 | 2025-10-06 |
Alterations in PD-L1 succinylation shape anti-tumor immune responses in melanoma
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02077-6
PMID:40069506
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研究论文 | 本研究揭示了PD-L1琥珀酰化通过调控抗肿瘤免疫反应影响黑色素瘤免疫治疗疗效的机制 | 首次发现PD-L1在赖氨酸129位点的琥珀酰化修饰导致其降解,并鉴定CPT1A作为PD-L1的琥珀酰转移酶 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,其他肿瘤类型中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在肿瘤免疫中的作用及PD-L1琥珀酰化对抗肿瘤免疫反应的影响 | 黑色素瘤患者样本和肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、bulk转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学,bulk RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |