单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8021 - 8040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8021 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies novel Pseudomonas aeruginosa virulence factors
2025-Mar-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100805
PMID:40081336
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术同时捕获铜绿假单胞菌基因和宿主转录组表达，揭示了新型毒力因子PA2590 | 开发了同时捕获病原体和宿主空间转录组的双重组学方法，并首次发现PA2590这一新型毒力介质 | 研究仅使用小鼠眼部感染模型，尚未在其他感染模型或人体中验证 | 研究宿主-病原体相互作用，识别铜绿假单胞菌的新型毒力因子 | 铜绿假单胞菌感染的小鼠角膜组织 | 空间转录组学 | 眼部感染 | 空间转录组学 | 岭回归模型 | 空间转录组数据、图像数据 | 小鼠眼部感染模型的组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8022 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling reveals the intratumor heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in cervical adenocarcinoma
2025-Mar-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97335
PMID:40066698
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了宫颈腺癌的瘤内异性和免疫抑制微环境特征 | 首次在单细胞水平系统比较宫颈腺癌与鳞癌的肿瘤微环境差异，发现Epi_10_CYSTM1上皮细胞亚群通过ALCAM-CD6信号招募Tregs的关键机制 | 样本量相对有限（11例ADC+4例SCC），需更大队列验证 | 探究宫颈腺癌与鳞癌在肿瘤异质性和免疫微环境方面的差异 | 宫颈腺癌和鳞癌患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 15例肿瘤样本（11例ADC，4例SCC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8023 | 2025-10-06 |
Infusing structural assumptions into dimensionality reduction for single-cell RNA sequencing data to identify small gene sets
2025-Mar-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07872-9
PMID:40069486
|
研究论文 | 提出一种结合结构假设的维度降维方法，用于单细胞RNA测序数据中识别小基因集 | 将生物学合理假设融入无监督深度学习，通过提升自编码器选择能解释潜在维度的小基因集合 | NA | 开发能够整合生物学假设的维度降维方法，识别关键基因集 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8024 | 2025-10-06 |
PTN activity in quiescent neural stem cells mediates Shank3 overexpression-induced manic behavior
2025-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57699-5
PMID:40069581
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了Shank3过表达诱导躁狂行为的新机制 | 首次发现静止神经干细胞中多效蛋白(PTN)活性异常是导致躁狂行为的关键因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探索躁狂发病的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | Shank3过表达小鼠模型中的静止神经干细胞 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8025 | 2025-10-06 |
mpECs with high Piezo2 expression promote fracture healing by driving angiogenesis through the Notch signaling pathway
2025-Mar-11, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-025-08476-4
PMID:40069682
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现高表达Piezo2的mpECs通过Notch信号通路促进血管生成从而加速骨折愈合 | 首次揭示mpECs通过Piezo2-Notch信号轴调控血管生成在骨折愈合中的作用机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 探索不同内皮细胞亚群在骨折愈合中的作用及其分子机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和内皮细胞亚群 | 单细胞生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序, shRNA转染, 流式细胞术, CCK-8检测 | NA | 单细胞转录组数据, 体外功能实验数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8026 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis identifies MKI67+ microglia as drivers of neovascularization in proliferative diabetic retinopathy
2025-Mar-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06320-w
PMID:40069725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次鉴定出MKI67+小胶质细胞是增殖性糖尿病视网膜病变中新生血管形成的驱动因素 | 首次识别出MKI67+小胶质细胞这一新型细胞亚群，其特征是乳酸代谢和增殖相关基因的显著上调，并通过SPP1-ITGA4信号通路促进血管生成 | 研究主要基于体外高糖模拟和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的直接相关性 | 阐明乳酸在增殖性糖尿病视网膜病变病理新生血管形成中的作用机制 | PDR患者样本、小胶质细胞培养物、氧诱导视网膜病变小鼠模型 | 单细胞生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 体外细胞培养, 动物模型 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞培养数据, 动物实验数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8027 | 2025-10-06 |
AnomalGRN: deciphering single-cell gene regulation network with graph anomaly detection
2025-Mar-11, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02177-z
PMID:40069807
|
研究论文 | 提出一种名为AnomalGRN的模型，通过图异常检测技术解析单细胞基因调控网络 | 首次将异常检测应用于基因调控网络分析，通过构建基因对网络将调控预测转化为节点预测任务 | NA | 解决单细胞基因调控网络中噪声数据和正负链接不平衡的问题 | 单细胞基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图异常检测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8028 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data have prevalent blood contamination but can be rescued by Originator, a computational tool separating single-cell RNA-seq by genetic and contextual information
2025-Mar-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03495-9
PMID:40069819
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Originator的计算工具，用于解决单细胞RNA测序数据中普遍存在的血细胞污染问题 | 开发了首个基于遗传和背景信息分离单细胞RNA测序数据的计算框架，能够区分血液污染细胞与组织驻留细胞 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的血细胞污染问题并区分不同遗传来源的细胞 | 人类复杂组织中的单细胞RNA测序数据，包括胰腺癌和胎盘样本 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | Originator计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多种人工混合和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8029 | 2025-10-06 |
Young fibroblast-derived migrasomes alleviate keratinocyte senescence and enhance wound healing in aged skin
2025-Mar-11, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03293-2
PMID:40069826
|
研究论文 | 本研究揭示了年轻成纤维细胞来源的迁移体能够减轻角质形成细胞衰老并促进衰老皮肤伤口愈合 | 首次报道细胞衰老与迁移体形成的关系，发现年轻成纤维细胞产生的迁移体具有抗衰老和促进伤口愈合的新功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，在人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 探索细胞衰老与迁移体形成的关系，研究年轻成纤维细胞来源的迁移体对衰老角质形成细胞和衰老皮肤伤口愈合的影响 | 小鼠皮肤组织、成纤维细胞、角质形成细胞（HaCaT细胞） | 细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 透射电子显微镜, 扫描电子显微镜, 小麦胚芽凝集素染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 不同年龄的小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8030 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics analysis reveals that the tumor-infiltrating B cells determine the indolent fate of papillary thyroid carcinoma
2025-Mar-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03341-7
PMID:40069827
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肿瘤浸润B细胞决定乳头状甲状腺癌惰性命运 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较惰性与进展性PTC的肿瘤微环境差异，发现肿瘤浸润B细胞特别是生发中心B细胞在惰性PTC中的关键作用 | 样本量相对有限（10例单细胞测序，25例验证），需要更大规模研究验证 | 识别惰性与进展性PTC的差异，寻找生物标志物和治疗策略新靶点 | 早期乳头状甲状腺癌肿瘤组织 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，细胞共培养，迁移实验，免疫荧光染色，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，临床样本数据 | 10例早期PTC肿瘤（单细胞测序）+25例额外肿瘤（验证） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8031 | 2025-10-06 |
Enhanced mitochondrial function and delivery from adipose-derived stem cell spheres via the EZH2-H3K27me3-PPARγ pathway for advanced therapy
2025-Mar-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04164-1
PMID:40069892
|
研究论文 | 本研究阐明了通过EZH2-H3K27me3-PPARγ通路增强脂肪来源干细胞球体线粒体功能和递送效率的机制 | 首次揭示了组蛋白修饰H3K27me3和PPARγ在调控干细胞球体线粒体功能中的关键作用 | 研究主要聚焦于体外实验，需要进一步体内验证 | 阐明ASC球体形成增强线粒体功能、递送和拯救效率的机制 | 人类脂肪来源干细胞(ASCs) | 再生医学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, Seahorse XF分析, 线粒体追踪染色, ATP发光检测 | 3D球体培养模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8032 | 2025-10-06 |
Modulating lipid metabolism by nanoparticles (NPs)-mediated ACSL3 silencing to inhibit hepatocellular carcinoma growth and metastasis
2025-Mar-10, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02274-1
PMID:40059153
|
研究论文 | 本研究通过纳米颗粒介导ACSL3基因沉默调控脂质代谢，抑制肝细胞癌生长和转移 | 首次揭示ACSL3通过促进POPC合成激活PPARα通路驱动肝癌进展的机制，并开发了pH响应型纳米颗粒递送siACSL3的新策略 | 未明确说明动物模型的具体类型和数量，纳米颗粒的体内安全性需进一步验证 | 探索脂质代谢在肝癌进展中的作用机制并开发靶向ACSL3的治疗策略 | 肝细胞癌患者样本和肝癌细胞 | 癌症代谢研究 | 肝细胞癌 | 蛋白质组测序,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 肝癌患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组测序 | NA | NA |
| 8033 | 2025-10-06 |
Altered inflammatory mucosal signatures within their spatial and cellular context during active ileal Crohn's disease
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171783
PMID:40059828
|
研究论文 | 结合空间转录组学和单细胞转录组学技术研究克罗恩病回肠黏膜的炎症特征 | 首次将空间转录组学与单细胞转录组学结合，在保留空间背景的同时分析克罗恩病炎症特征 | 研究基于手术组织样本，可能无法完全反映疾病早期变化 | 深入了解克罗恩病回肠炎症的特征性分子标志物 | 克罗恩病患者回肠黏膜组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 细胞亚型反卷积分析 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 克罗恩病手术组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8034 | 2025-10-06 |
Integrative single cell transcriptomic analysis reveals 3p deletion associated tumor microenvironment and chemoresistance in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92078-6
PMID:40064955
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示3p缺失与头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境及化疗耐药性的关联 | 首次在单细胞水平系统揭示3p缺失通过重塑肿瘤微环境促进免疫抑制和化疗耐药的新机制 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明3p缺失对头颈鳞状细胞癌肿瘤微环境、免疫细胞浸润和治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-qPCR, Western blotting, CCK8检测 | LASSO算法, Cox回归分析, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8035 | 2025-10-06 |
Investigating ferroptosis-related genes NFE2L2 in neutrophils for ankylosing spondylitis: therapeutic potential of cassia twigs
2025-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88775-x
PMID:40064975
|
研究论文 | 本研究探讨铁死亡相关基因NFE2L2在中性粒细胞中对强直性脊柱炎的作用机制及中药肉桂的治疗潜力 | 首次结合铁死亡机制、单细胞测序和中药治疗，发现NFE2L2基因在AS中性粒细胞中的关键作用及肉桂的治疗靶点 | 未明确样本量大小，缺乏大规模临床验证 | 研究铁死亡与免疫细胞在强直性脊柱炎中的关系及中药肉桂的治疗机制 | 强直性脊柱炎患者临床数据、转录组数据、单细胞测序数据、铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序,转录组分析,机器学习,分子对接,免疫组化 | 逻辑回归,机器学习模型 | 临床数据,转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8036 | 2025-10-06 |
Identification of potential drug targets for pelvic organ prolapse using a proteome-wide Mendelian randomization approach
2025-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92800-4
PMID:40064973
|
研究论文 | 通过蛋白质组范围孟德尔随机化方法识别盆腔器官脱垂的潜在药物靶点 | 首次采用蛋白质组范围孟德尔随机化方法结合单细胞RNA测序数据验证，识别出EFEMP1和MFAP4作为盆腔器官脱垂的新型药物靶点 | 研究主要基于芬兰人群数据，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 探索盆腔器官脱垂的新型治疗靶点 | 盆腔器官脱垂患者及相关蛋白质靶点 | 生物信息学 | 盆腔器官脱垂 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 贝叶斯共定位分析, 分子对接分析 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯统计模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | FinnGen队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8037 | 2025-10-06 |
Transcriptome combined with single-cell sequencing explored prognostic markers associated with T cell exhaustion characteristics in head and neck squamous carcinoma
2025-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91299-z
PMID:40065044
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序探索头颈鳞状细胞癌中与T细胞耗竭特征相关的预后标志物 | 构建了HNSC的单细胞图谱，识别了C2 T细胞亚群的耗竭倾向，并开发了临床预后模型和药物敏感性分析 | T细胞亚群间的相互关系仍不清楚，需要进一步研究具体的生物学过程和分子进化机制 | 探索头颈鳞状细胞癌中T细胞耗竭相关的预后标志物和免疫治疗策略 | 头颈鳞状细胞癌组织和T细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 预后风险模型 | 单细胞测序数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8038 | 2025-10-06 |
Imbalance of bladder neurohomeostasis by Myosin 5a aggravates diabetic cystopathy
2025-Mar-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01140-6
PMID:40065210
|
研究论文 | 本研究探讨Myosin 5a在糖尿病膀胱病变中的调控作用及其对膀胱神经稳态的影响 | 首次揭示Myosin 5a通过影响神经递质相关蛋白表达参与糖尿病膀胱过度活动症的发病机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类样本中验证 | 探究Myosin 5a在糖尿病膀胱病变中的潜在调控作用 | 糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷型DBA小鼠的膀胱组织 | 生物医学研究 | 糖尿病膀胱病变 | 单细胞RNA测序, 尿动力学评估, 免疫组织化学, 基因敲低 | 动物模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 糖尿病大鼠和DBA小鼠的膀胱组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8039 | 2025-10-06 |
Prognostic implications and characterization of tumor-associated tertiary lymphoid structures genes in pancreatic cancer
2025-Mar-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06152-8
PMID:40065365
|
研究论文 | 本研究通过整合胰腺癌患者的转录组和临床数据，构建了基于三级淋巴结构基因的评分系统和风险评估模型 | 首次系统性地表征胰腺癌中肿瘤相关三级淋巴结构基因，并构建了基于TLS基因的预后评分系统 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索三级淋巴结构在胰腺癌中的作用，提高免疫治疗效果 | 310例胰腺导管腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 基因集富集分析 | LASSO回归模型, 共识聚类 | 基因表达数据, 临床数据 | 310例PDAC患者，来自GEO数据库 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 8040 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the aortas of Takayasu arteritis
2025-Mar-10, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03523-w
PMID:40065428
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示大动脉炎患者主动脉组织的细胞异质性 | 首次在大动脉炎患者主动脉组织中鉴定出11种主要细胞类型及其比例差异，并发现外周血T细胞中补体信号通路上调 | 样本量较小（3例TAK患者单细胞分析，8例TAK患者bulk RNA-seq），所有样本来自单一医疗中心 | 揭示大动脉炎的发病机制并发现潜在治疗靶点 | 大动脉炎患者的主动脉组织和外周血T细胞 | 单细胞组学 | 大动脉炎 | 单细胞转录组测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例TAK患者主动脉组织（单细胞分析），8例TAK患者和8例健康志愿者外周血T细胞（bulk RNA-seq） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |