单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 8001 - 8020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8001 | 2024-09-28 |
Single-cell profiling reveals immune disturbances landscape and HLA-F-mediated immune tolerance at the maternal-fetal interface in preeclampsia
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1234577
PMID:37854606
|
研究论文 | 研究揭示了子痫前期中母胎界面免疫紊乱的图谱以及HLA-F介导的免疫耐受 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了子痫前期中母胎界面免疫紊乱的图谱，并探讨了HLA-F在母胎免疫耐受中的作用 | 研究主要集中在细胞水平，未涉及更广泛的临床数据或动物模型 | 探讨子痫前期中母胎界面免疫紊乱的机制及HLA-F的作用 | 子痫前期的母胎界面免疫状态及HLA-F的功能 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 101,250个细胞样本 |
| 8002 | 2024-09-28 |
Integrating Single-Cell Transcriptome and Network Analysis to Characterize the Therapeutic Response of Chronic Myeloid Leukemia
2022-Nov-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms232214335
PMID:36430822
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和网络分析，研究了慢性髓性白血病（CML）对酪氨酸激酶抑制剂（TKI）治疗的反应机制 | 本文首次结合单细胞RNA测序和转录调控网络分析，揭示了CML干细胞对TKI治疗的不同反应机制，并识别了新的治疗反应基因标记 | 本文主要集中在CML干细胞的研究，未涵盖其他类型的白血病细胞 | 研究CML患者对TKI治疗的反应机制，识别新的治疗反应基因标记 | CML干细胞及其对TKI治疗的反应 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | CML患者的干细胞样本 |
| 8003 | 2024-09-28 |
A strategy to quantify myofibroblast activation on a continuous spectrum
2022-07-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-16158-7
PMID:35851602
|
研究论文 | 本文开发了一种基于显微成像和机器学习方法的策略，用于在体外连续量化肌成纤维细胞的激活状态 | 本文首次提出了一种基于显微成像和机器学习的方法，用于在连续谱上量化肌成纤维细胞的激活状态 | 本文的研究仅限于体外实验，尚未在体内验证该方法的有效性 | 开发一种方法来量化肌成纤维细胞在连续谱上的激活状态 | 肌成纤维细胞的激活状态 | 数字病理学 | NA | 显微成像、机器学习、单细胞RNA测序 | 自监督机器学习 | 图像、转录组数据 | 超过1000个心肌成纤维细胞 |
| 8004 | 2024-09-28 |
Deconvolution of the hematopoietic stem cell microenvironment reveals a high degree of specialization and conservation
2022-May-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104225
PMID:35494238
|
研究论文 | 本文开发了一种定制的生物信息学管道，整合了公共和专有的单细胞RNA测序数据，以揭示造血干细胞微环境的复杂性和特异性 | 首次鉴定了14种中间细胞状态和11个分化阶段，提供了迄今为止最全面的鼠类造血干细胞调节微环境描述，并推测了人类和鼠类之间微环境调节的保守特征 | NA | 理解正常和恶性人类造血的调控机制 | 造血干细胞的调节微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 8005 | 2024-09-28 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals a pan-cancer stemness signature predicting immunotherapy response
2022-04-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01050-w
PMID:35488273
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了一个泛癌症干细胞特征，该特征能够预测免疫治疗反应 | 开发了一种新的干细胞特征（Stem.Sig），并在多个癌症数据集中验证了其预测免疫治疗反应的能力，相较于其他特征表现出更好的预测性能 | NA | 揭示癌症干细胞与免疫治疗抵抗之间的关系，并开发一种新的特征用于预测免疫治疗反应 | 癌症干细胞特征与免疫治疗反应之间的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 包括34个单细胞RNA测序数据集、TCGA泛癌症队列和10个免疫治疗转录组队列 |
| 8006 | 2024-09-28 |
Multi-Modal Single-Cell Sequencing Identifies Cellular Immunophenotypes Associated With Juvenile Dermatomyositis Disease Activity
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.902232
PMID:35799782
|
研究论文 | 研究使用多模态单细胞测序技术，分析了与青少年皮肌炎疾病活动相关的细胞免疫表型 | 首次通过多模态单细胞测序技术，揭示了青少年皮肌炎患者中不同细胞类型的免疫表型和基因表达特征，为该疾病的研究提供了新的资源 | 研究样本量较小，仅包括4名未治疗患者和4名治疗后疾病不活跃的患者 | 探讨青少年皮肌炎疾病活动相关的免疫表型和细胞特异性基因 | 未治疗和治疗后疾病不活跃的青少年皮肌炎患者的PBMCs | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和蛋白质测序 | NA | 单细胞RNA和蛋白质数据 | 4名未治疗患者和4名治疗后疾病不活跃的患者，共分析了55,564个细胞 |
| 8007 | 2024-09-28 |
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell Transcriptomic Data Using Bidirectional RNN
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.899825
PMID:35692809
|
研究论文 | 提出了一种名为BiRGRN的新算法，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 利用双向循环神经网络来推断基因调控网络，将基因表达数据的推断转化为回归问题，并采用双向结构和先验知识过滤策略提高算法的准确性和稳定性 | NA | 推断基因调控规则以理解细胞过程 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 双向循环神经网络 | 时间序列数据 | 四个模拟数据集和三个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 8008 | 2024-09-28 |
A Toolkit for Profiling the Immune Landscape of Pediatric Central Nervous System Malignancies
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.864423
PMID:35464481
|
综述 | 本文综述了用于儿童中枢神经系统恶性肿瘤免疫景观分析的技术，并详细介绍了这些技术在不同组织类型和研究中的应用 | 本文首次系统地探讨了儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境（TIME），并提出了通过液体活检评估免疫系统的其他部分在免疫监测研究中的潜力 | 本文主要为综述性质，未提供具体的实验数据或模型 | 旨在深入了解和统一评估儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境和免疫景观，以期将免疫疗法整合到临床实践中 | 儿童中枢神经系统恶性肿瘤的肿瘤免疫微环境 | NA | 中枢神经系统恶性肿瘤 | 免疫组化、流式细胞术、批量和单细胞转录组学、功能性检测 | NA | 组织、脑脊液、血液 | NA |
| 8009 | 2024-09-28 |
MOCA for Integrated Analysis of Gene Expression and Genetic Variation in Single Cells
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.831040
PMID:35432484
|
研究论文 | 本文介绍了MOCA软件，用于联合分析单细胞RNA测序数据中的基因表达和遗传变异 | 提出了MOCA软件，能够同时分析基因表达和遗传变异，揭示基因表达模式与细胞分子进化轨迹的一致性 | NA | 探讨体细胞变异对基因表达模式进化的影响 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达和遗传变异 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 8010 | 2024-09-28 |
Discovering Cellular Mitochondrial Heteroplasmy Heterogeneity with Single Cell RNA and ATAC Sequencing
2021-Jun-05, Biology
DOI:10.3390/biology10060503
PMID:34198745
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术研究细胞线粒体异质性的方法 | 本文首次系统性地综述了单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性方面的应用 | 当前方法在研究线粒体异质性方面存在局限性，未来需要进一步解决 | 探讨单细胞测序技术在研究细胞线粒体异质性中的应用 | 细胞线粒体异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 数千个细胞 |
| 8011 | 2024-09-27 |
Mechanism of multifunctional adaptor protein SHARPIN regulating myocardial fibrosis and how SNP mutation affect the prognosis of myocardial infarction
2024-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167467
PMID:39159699
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研究论文 | 研究SHARPIN蛋白在心肌纤维化中的作用及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | 首次揭示了SHARPIN在心肌纤维化中的分子机制，并探讨了其SNP突变对心肌梗死患者心血管事件的影响 | 研究主要基于小鼠模型和人类心肌组织，需要进一步在临床试验中验证 | 阐明SHARPIN在心肌纤维化中的分子机制及其SNP突变对心肌梗死预后的影响 | SHARPIN蛋白、心肌纤维化、心肌梗死患者 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA干扰、转录组分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | SHARPIN+/-, 野生型小鼠, 人类心肌组织 |
| 8012 | 2024-09-27 |
Dysfunctional β-cell longevity in diabetes relies on energy conservation and positive epistasis
2024-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402743
PMID:39313296
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研究论文 | 研究了PFKFB3表达的β细胞在糖尿病中的功能障碍及其与能量保存和正向上位性的关系 | 揭示了PFKFB3通过与抗凋亡基因的相互作用，促进糖尿病中功能障碍β细胞的长期存活，并提出了通过抑制PFKFB3来清除这些细胞以恢复葡萄糖耐量的方法 | NA | 探讨PFKFB3在糖尿病中如何掩盖功能障碍β细胞的竞争特性 | PFKFB3表达的β细胞及其在糖尿病中的功能障碍 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自nPOD T2D胰腺的PFKFB3阳性β细胞 |
| 8013 | 2024-09-27 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-Nov, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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综述 | 本文综述了通过空间转录组技术揭示卵巢癌肿瘤内异质性的研究进展 | 利用空间转录组技术，本文揭示了卵巢癌肿瘤内异质性和肿瘤微环境组成的详细信息 | NA | 探讨空间转录组技术在揭示卵巢癌肿瘤内异质性和治疗反应预测中的应用 | 卵巢癌的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8014 | 2024-09-27 |
Practical Compass of Single-Cell RNA-Seq Analysis
2024-Oct, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00840-4
PMID:38019344
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综述 | 本文提供了从处理fastq数据集到绘制图表和绘制轨迹的基本过程的逐步指导 | 本文介绍了用户友好的scRNA-seq包，用于配体-受体相互作用和轨迹分析 | 更新最新信息对许多研究人员来说很困难 | 提供单细胞RNA-seq数据分析的实用指南 | 单细胞RNA-seq数据分析的基本过程和工具 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA |
| 8015 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of pemphigus vulgaris and bullous pemphigoid: Insights into pathogenesis and therapy on bullous formation
2024-Oct, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.19924
PMID:38433529
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8016 | 2024-09-27 |
Single-cell RNA sequencing reveals surface markers of primordial germ cells in chicken and zebra finch
2024-Sep-26, Molecular genetics and genomics : MGG
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00438-024-02186-7
PMID:39325237
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的表面标记物 | 发现了鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物NEGR1、SLC34A2和ESYT3，这些标记物在后期发育阶段和生殖组织中持续表达 | 现有的分离方法在效率和适用性方面存在局限，特别是SSEA-1的特异性在后期发育阶段下降 | 揭示鸡和斑胸草雀原始生殖细胞的新型表面标记物，以解决现有分离方法的局限性 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的原始生殖细胞 |
| 8017 | 2024-09-27 |
VisualZoneR: A computational protocol to identify compartmental zones from single-cell spatial transcriptomics using R
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103196
PMID:39067026
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于R语言的技术VisualZoneR，用于从单细胞空间转录组数据中识别分隔区 | 提出了VisualZoneR技术，用于分析Visium或Visium HD技术生成的空间转录组数据，并识别分隔区 | NA | 开发一种计算协议，用于从单细胞空间转录组数据中识别分隔区 | 健康肝脏组织到内部转移区域的区分区，以及转录组变化 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 8018 | 2024-09-27 |
Protocol for analysis of single-cell sequencing data by Seqtometry
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103209
PMID:39096493
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Seqtometry平台的单细胞测序数据分析协议 | Seqtometry平台通过先进的基因签名评分直接分析基因表达和可及性，为单细胞分析提供了一个新的分析平台 | NA | 提供一种用于单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序分析的协议 | 单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | NA |
| 8019 | 2024-09-27 |
Protocol to achieve high-resolution single-cell transcriptomics of cardiomyocytes in multiple species
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103194
PMID:39096494
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研究论文 | 本文提供了一种生成多种物种心肌细胞高分辨率单细胞转录组测序的协议 | 本文提供了一种新的协议，用于生成高分辨率单细胞转录组测序数据，特别是针对稀有的心肌细胞群体 | NA | 开发一种高分辨率单细胞转录组测序协议，以详细了解心肌细胞的转录组信息 | 小鼠、斑马鱼心脏以及诱导多能干细胞中的心肌细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多种物种的心肌细胞 |
| 8020 | 2024-09-27 |
Protocol for preparing mammalian skin samples encompassing hair follicles for spatial transcriptomics
2024-Sep-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103254
PMID:39146191
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研究论文 | 本文介绍了一种用于空间转录组学的哺乳动物皮肤样本（包括毛囊）制备方案 | 提供了一种适用于皮肤样本的空间转录组学制备方法 | 未提及 | 开发适用于皮肤样本的空间转录组学制备方案 | 哺乳动物皮肤样本，包括毛囊 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA | 未提及 |