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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7981 | 2025-05-17 |
Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808
PMID:40339488
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研究论文 | 本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制,发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖 | 首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制 | 研究主要基于体外细胞和小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制 | 银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | scRNA-seq、siRNA敲降 | IMQ诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7982 | 2025-05-17 |
TGF-β1 induces autophagy and mediates the effect on macrophages differentiation in primary liver cancer
2025-Jun-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114799
PMID:40339499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的异质性和分化谱,并探讨了TGF-β1通过自噬信号调控TAMs表型转换的机制 | 首次在原发性肝癌中鉴定出四种不同的TAMs亚群,并发现TGF-β1通过自噬信号驱动TAMs表型转换的新机制 | 样本量相对较小(19例患者),且需要进一步验证TGF-β1调控TAMs分化的具体分子机制 | 探究原发性肝癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其分化机制 | 原发性肝癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),Ingenuity通路分析(IPA) | NA | 单细胞转录组数据 | 19例原发性肝癌患者的单细胞数据,TCGA数据库中428例患者的生存数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7983 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis identifies subclusters and signature with N-glycosylation in endometrial cancer
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03802-z
PMID:39589706
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定子宫内膜癌中N-糖基化相关的亚群和特征 | 首次在子宫内膜癌中通过单细胞RNA测序结合非负矩阵分解识别N-糖基化相关细胞亚型,并整合多种机器学习算法构建预后特征 | 样本量较小(仅5例患者),数据来源于公共数据库缺乏实验验证 | 阐明N-糖基化相关基因在子宫内膜癌细胞异质性、预后和免疫治疗反应中的作用 | 子宫内膜癌患者细胞 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,非负矩阵分解,机器学习算法 | 非负矩阵分解,集成机器学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 5例子宫内膜癌患者,30,233个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7984 | 2025-10-06 |
EXPLORING THE POTENTIAL OF BEND7 AS AN IMMUNOMODULATORY BIOMARKER IN SEPSIS THROUGH INTEGRATIVE GENOMIC AND TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS
2025-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002529
PMID:39617402
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研究论文 | 通过整合基因组和转录组分析探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力 | 首次通过整合GWAS和eQTL数据识别脓毒症相关基因,并利用单细胞RNA测序揭示BEND7在血小板中的特异性表达及其与免疫细胞的相互作用机制 | 需要进一步实验验证BEND7的功能机制,样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 探索脓毒症的遗传基础并识别潜在的免疫调节生物标志物 | 脓毒症相关基因和血小板 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基于汇总数据的孟德尔随机化,全基因组关联研究,表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 来自Gene Expression Omnibus的转录组数据集和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7985 | 2025-10-06 |
Diverse RNA methylation patterns in neutrophils: key drivers in hepatocellular carcinoma
2025-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03756-2
PMID:39621240
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌中的单细胞测序数据,揭示了中性粒细胞RNA甲基化模式与肿瘤微环境异质性的关系 | 首次发现中性粒细胞中TRPM3特异性表达可能调控RNA修饰,并建立了新型中性粒细胞RNA甲基化评分系统 | 研究基于单细胞测序数据的生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索中性粒细胞RNA甲基化在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, LASSO Cox回归, 共识聚类 | 预后评分模型, nomogram | 单细胞测序数据, lncRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7986 | 2025-05-17 |
Novel approaches to CAR T cell target identification in acute myeloid leukemia
2025-Jun, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2025.102524
PMID:40311558
|
review | 本文综述了急性髓系白血病(AML)中CAR T细胞靶点识别的新方法 | 介绍了结构表面组学识别肿瘤特异性蛋白构象,以及AI驱动的单细胞RNA测序整合多源数据以确定最佳靶点 | NA | 提高CAR T细胞的特异性并减少对正常组织的副作用,为AML及更广泛的癌症治疗提供更安全有效的途径 | 急性髓系白血病(AML) | 肿瘤免疫治疗 | 急性髓系白血病 | 结构表面组学,AI驱动的单细胞RNA测序,细胞表面捕获技术 | NA | RNA测序数据,蛋白质构象数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7987 | 2025-05-17 |
Dissecting Autophagy Gene Expression in Endothelial Cells of Pulmonary Arterial Hypertension at Single-Cell Resolution
2025-Jun, Cardiology research
IF:1.4Q3
DOI:10.14740/cr2055
PMID:40370624
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了肺动脉高压(PAH)内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并鉴定了DDIT4作为潜在的生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下解析PAH内皮细胞中自噬相关基因的表达特征,并发现DDIT4作为新的PAH生物标志物 | 研究主要基于体外模型和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探究肺动脉高压内皮细胞中自噬相关基因的表达特征及其在疾病进展中的作用 | 肺动脉高压患者的内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | scRNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA), 蛋白质印迹(Western blotting) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7988 | 2025-05-17 |
Deficiency of NPR-C triggers high salt-induced thoracic aortic dissection by impairing mitochondrial homeostasis
2025-May-16, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf085
PMID:40377018
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研究论文 | 本研究探讨了NPR-C在胸主动脉夹层(TAD)发病中的作用及其分子机制 | 揭示了NPR-C通过调节线粒体稳态在TAD中的保护作用,并提出了NPR-C激活和亚精胺(SPD)补充作为新的TAD预防和治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究NPR-C在TAD发病中的作用及潜在治疗策略 | 人类TAD患者和小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | RNA测序、单细胞测序 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 人类TAD患者样本和BAPN处理的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 7989 | 2025-10-06 |
Acute kidney injury triggers hypoxemia by lung intravascular neutrophil retention that reduces capillary blood flow
2025-May-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI186705
PMID:40048367
|
研究论文 | 本研究揭示了急性肾损伤通过肺血管内中性粒细胞滞留导致低氧血症的机制 | 发现AKI诱导的远程肺部炎症中中性粒细胞在肺泡毛细血管内滞留而不外渗,通过减少肺毛细血管血流导致低氧血症 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证需要进一步研究 | 探究急性肾损伤引发低氧血症的细胞机制 | 小鼠和人类的中性粒细胞、单核细胞和肺泡巨噬细胞 | 病理生理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7990 | 2025-05-17 |
CD49d promotes T-cell senescence in chronic lymphocytic leukaemia
2025-May-15, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20135
PMID:40375447
|
research paper | 该研究探讨了CD49d在慢性淋巴细胞白血病(CLL)中对T细胞衰老的影响 | 揭示了CD49d在CLL患者T细胞衰老中的新作用,并提出了针对CD49d依赖性衰老途径可能逆转T细胞功能障碍的治疗策略 | 研究未涉及CD49d如何具体调控T细胞衰老的分子机制 | 探究CD49d对CLL患者T细胞生物学的影响 | CLL患者和健康捐赠者的CD4+和CD8+ T细胞 | 免疫学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞数据和基因表达数据 | 未明确提及样本数量,但包括CLL患者和健康捐赠者的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7991 | 2025-05-17 |
Deciphering the Immunomodulatory Function of GSN+ Inflammatory Cancer-Associated Fibroblasts in Renal Cell Carcinoma Immunotherapy: Insights From Pan-Cancer Single-Cell Landscape and Spatial Transcriptomics Analysis
2025-May-15, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70062
PMID:40375605
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析,探讨了GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在肾细胞癌免疫治疗中的免疫调节功能 | 首次利用泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析GSN iCAFs的亚型及其在ICI治疗中的空间分布特征,并开发了预测ICI反应的Caf.Sig模型 | 研究主要基于体外和动物模型实验,临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探究GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的作用机制 | 泛癌患者样本和肾透明细胞癌(ccRCC)样本 | 癌症免疫治疗 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学测序(ST-seq)、机器学习 | Caf.Sig模型 | RNA测序数据 | 泛癌患者样本和ccRCC样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 7992 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02562-24
PMID:39611685
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析致死性球孢子菌感染中肺部免疫反应的时空动态 | 首次在致死性球孢子菌感染模型中结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了单核来源表达巨噬细胞在组织重塑和纤维化中的关键作用 | 研究聚焦于致死性感染模型,可能无法完全代表所有临床感染情况 | 深入理解致死性球孢子菌感染中的肺部免疫反应机制 | 球孢子菌感染小鼠模型的肺部免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7993 | 2025-10-06 |
Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03873-24
PMID:40192290
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤内微生物群与乳腺癌发展的关系,重点关注Pseudoalteromonas elyakovii在肿瘤微环境代谢重编程中的作用 | 首次发现Pseudoalteromonas elyakovii能够代谢重编程肿瘤微环境并促进乳腺导管癌进展 | 样本量相对有限(102例),且研究聚焦于特定类型的乳腺癌 | 探究肿瘤内微生物群在乳腺癌发生发展中的作用机制 | 乳腺导管癌患者肿瘤样本及肿瘤内微生物 | 肿瘤微生物组学 | 乳腺癌 | 双免疫荧光染色、SweAMI探针杂交、scRNA-seq、qRT-PCR | NA | 微生物组数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 102例样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7994 | 2025-05-17 |
Comprehensive single-cell transcriptomic reveals different destinies of melanocytes and dynamic changes of immune microenvironment in a psychological stress-induced leukoderma and leukotrichia mouse model
2025-May-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01236-z
PMID:40361040
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research paper | 通过单细胞转录组学分析心理压力诱导的白癜风和白毛小鼠模型中黑色素细胞的不同命运及免疫微环境的动态变化 | 发现了两种具有不同命运的黑色素细胞簇以及CXCL16-CXCR6轴激活的促炎微环境,为压力诱导的白癜风发病机制提供了新见解 | 研究仅基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心理压力诱导的白癜风和白毛的发病机制 | C57BL/6 J小鼠模型中的黑色素细胞和免疫微环境 | digital pathology | vitiligo | single-cell RNA sequencing, immunohistochemistry | chronic unpredictable mild stimulation (CUMS) mouse model | RNA-seq data, immunohistochemistry data | C57BL/6 J小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 7995 | 2025-05-17 |
Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01338-24
PMID:40366160
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research paper | 该研究介绍了一种双氧-缺氧共培养(DOAC)方法,用于研究厌氧菌与宿主细胞在气道上皮界面的相互作用 | 开发了一种新的双氧-缺氧共培养(DOAC)平台,能够在维持宿主细胞氧供的同时,研究厌氧菌与上皮细胞的相互作用 | 共培养时间限制在约48小时,可能无法完全模拟长期相互作用 | 研究厌氧菌与宿主细胞在气道疾病病理生理学中的相互作用机制 | 厌氧菌和气道上皮细胞 | 微生物学与细胞生物学 | 气道疾病 | 双氧-缺氧共培养(DOAC)、bulk RNAseq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7996 | 2025-05-17 |
Potential mechanisms of epigenetic regulation in diabetic retinopathy from the perspectives of multi-omics
2025-May-14, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-01723-7
PMID:40369608
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research paper | 本研究通过多组学数据探索了糖尿病视网膜病变(DR)的表观遗传调控机制 | 构建了DR相关的全面表观遗传调控网络,并鉴定了关键调控基因 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行实验验证 | 探索糖尿病视网膜病变的表观遗传调控机制 | 糖尿病视网膜病变(DR)相关的表观遗传修饰 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | DNA甲基化分析、mRNA和miRNA表达分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | 包括10,716个差异甲基化基因、1,181个差异表达mRNA和615个差异表达miRNA | NA | NA | NA | NA |
| 7997 | 2025-05-17 |
Microglia transcriptional states and their functional significance: Context drives diversity
2025-May-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.009
PMID:40328255
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综述 | 探讨小胶质细胞在不同环境下的转录状态多样性及其功能意义 | 综述了单细胞测序技术揭示的小胶质细胞转录状态多样性,并评估非稳态条件如何诱导特定环境下的转录特征 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于现有研究的总结 | 理解小胶质细胞转录状态与功能的关系,并推动针对小胶质细胞的治疗策略 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7998 | 2025-05-17 |
Combining spatial transcriptomics with tissue morphology
2025-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58989-8
PMID:40360467
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review | 本文介绍了一种将空间转录组学与组织形态学相结合的框架,重点讨论了将形态学特征转化为或整合到空间转录组学中的方法 | 提出了一个分类框架,用于结合空间转录组学和组织形态学,包括转化和整合两种方法 | NA | 探索空间转录组学与组织形态学相结合的方法及其应用 | 空间转录组学数据和组织形态学特征 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics, imaging AI | NA | gene expression data, morphological features | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7999 | 2025-05-17 |
TAT-CRE inhalation enables tumor induction corresponding to adenoviral Cre-recombinase in a lung cancer mouse model
2025-May-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08146-0
PMID:40360735
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research paper | 该研究比较了TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导小鼠肺癌模型中的效果,发现TAT-CRE是一种安全且有效的替代方法 | 提出TAT-CRE作为一种生物安全级别S1的替代方法,用于诱导肺癌,并可能应用于其他癌症模型 | 研究中发现的TAT-CRE诱导的肺肿瘤在微血管和巨噬细胞方面存在差异,可能影响某些研究结果 | 比较TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导肺癌模型中的效果,寻找更安全的基因工程方法 | 小鼠肺癌模型 | 癌症研究 | 肺癌 | 计算机断层扫描、单细胞RNA测序、免疫组织化学和流式细胞术 | NA | 图像、RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8000 | 2025-05-17 |
Arginine methylation modulates tumor fate and prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2025-May-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02505-3
PMID:40360844
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research paper | 该研究探讨了精氨酸甲基化相关基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的预后价值,并开发了一个基于精氨酸甲基化的预后模型 | 首次系统地评估了精氨酸甲基化相关基因在ccRCC中的预后意义,并构建了一个具有临床指导价值的预后特征模型 | 需要进一步的临床验证来确认模型的预测准确性,并且未涉及实验验证 | 评估精氨酸甲基化相关基因在ccRCC中的预后价值并开发预后模型 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | digital pathology | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据 | 来自TCGA、E-MTAB-1980和ICGC数据库的公共数据集 | NA | NA | NA | NA |