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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7981 | 2025-10-06 | Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis 
          2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202405914
          PMID:39985260
         | 研究论文 | 本研究通过整合多种转录组技术揭示了多房棘球蚴感染过程中的时空免疫景观动态变化 | 首次构建了多房棘球蚴感染灶的高分辨率空间图谱,揭示了中性粒细胞、Spp1巨噬细胞和成纤维细胞在疾病进展中的功能作用 | 研究仅使用小鼠肝脏样本,未涉及人类临床样本验证 | 揭示宿主对多房棘球蚴的免疫应答机制 | 多房棘球蚴感染的小鼠肝脏组织 | 空间转录组学 | 多房棘球蚴病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 感染后多个时间点(最长15个月)的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 7982 | 2025-10-06 | PLXDC1+ Tumor-Associated Pancreatic Stellate Cells Promote Desmoplastic and Immunosuppressive Niche in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 
          2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202415756
          PMID:40091495
         | 研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的异质性及其在形成促纤维增生和免疫抑制微环境中的关键作用 | 首次系统鉴定胰腺星状细胞亚群并发现PLXDC1+肿瘤相关胰腺星状细胞在免疫抑制微环境形成中的核心作用 | 研究样本量有限,需要进一步验证PLXDC1+胰腺星状细胞作为治疗靶点的临床价值 | 探究胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌进展和治疗抵抗中的详细功能 | 胰腺星状细胞和胰腺导管腺癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序, ATAC-seq, 单细胞转录组, 空间转录组, 原位测序 | NA | 基因组, 转录组, 表观基因组数据 | 来自癌旁正常组织和PDAC组织的分选胰腺星状细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, ATAC-seq | NA | NA | 
| 7983 | 2025-10-06 | DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells 
          2025-May, EMBO molecular medicine
          
          IF:9.0Q1
          
         
          DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
          PMID:40119174
         | 研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者鼻细胞的DNA甲基化和单细胞转录组,揭示了急性期DNA甲基化变化与长期转录调控异常之间的关联 | 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与长达12个月的长期转录失调联系起来,并发现纤毛功能基因的持续抑制现象 | 样本量相对较小(急性期n=19,随访样本更少),且仅关注上呼吸道上皮细胞 | 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制 | COVID-19患者和对照组的鼻上皮细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | DNA甲基化测序,单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据,单细胞转录组数据 | 急性期:COVID-19患者19例(单细胞RNA-seq 14例),对照组14例(单细胞RNA-seq 10例);随访:感染后3个月7例,12个月5例;验证队列:感染后6个月15例 | NA | 单细胞RNA-seq,DNA甲基化测序 | NA | NA | 
| 7984 | 2025-10-06 | Single-cell transcription reveals hepatocyte-to-cholangiocyte reprogramming and biliary gene profile in biliary atresia 
          2025-May-01, Hepatology communications
          
          IF:5.6Q1
          
         
          DOI:10.1097/HC9.0000000000000710
          PMID:40366121
         | 研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示胆道闭锁中肝细胞向胆管细胞的重编程过程及胆道基因特征 | 首次在胆道闭锁中发现肝细胞向胆管细胞的重编程现象,并识别出特异性胆道标志物和转录因子 | 样本量较小(4例BA患者和3例正常对照) | 解析胆道闭锁中胆管反应的细胞来源和功能 | 胆道闭锁患者的肝组织上皮细胞 | 单细胞测序 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 4例胆道闭锁患者和3例正常对照肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7985 | 2025-10-06 | Development and validation of tryptophan metabolism-related risk model and molecular subtypes for predicting postoperative biochemical recurrence in prostate cancer 
          2025-Apr-30, Translational andrology and urology
          
          IF:1.9Q3
          
         
          DOI:10.21037/tau-2025-39
          PMID:40376539
         | 研究论文 | 开发并验证了基于色氨酸代谢的风险模型和分子亚型,用于预测前列腺癌患者术后生化复发 | 首次将色氨酸代谢相关基因与前列腺癌术后生化复发预测相结合,建立了风险评分模型和分子亚型分类系统 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证模型普适性 | 预测前列腺癌患者根治性前列腺切除术后生化复发风险 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 差异表达分析、单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归、一致性聚类、免疫组化、单细胞测序 | Cox回归风险模型、聚类分析 | 基因表达数据、临床数据 | TCGA-PRAD数据集421例前列腺癌患者,高风险组211例,Cluster 1亚型261例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 7986 | 2025-10-06 | Cold-Induced DHRS4 Promotes Thermogenesis via Enhanced Fatty Acid β-Oxidation in Porcine Subcutaneous Adipocytes 
          2025-Apr-22, Animals : an open access journal from MDPI
          
          IF:2.7Q1
          
         
          DOI:10.3390/ani15091190
          PMID:40362005
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了猪皮下脂肪细胞中冷诱导DHRS4通过增强脂肪酸β-氧化促进产热的新机制 | 首次在缺乏经典棕色脂肪组织的大型哺乳动物(猪)中发现DHRS4作为表观遗传-代谢开关调控冷适应机制 | 研究主要聚焦于猪模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究大型哺乳动物脂肪组织在冷应激下的代谢重编程表观遗传机制 | 猪皮下脂肪组织 | 表观遗传学 | 代谢适应 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 冷暴露猪模型的皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 7987 | 2025-10-06 | Integrative single-cell analysis reveals transcriptional and epigenetic regulatory features of human developmental dysplasia of the hip 
          2025-Mar-26, Osteoarthritis and cartilage
          
          IF:7.2Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.joca.2025.02.788
          PMID:40154730
         | 研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和染色质可及性分析揭示人类发育性髋关节发育不良的转录和表观遗传调控特征 | 首次在DDH软骨中发现具有独特分子特征的炎症性软骨细胞群体,并重建了软骨细胞的分化轨迹 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 | 理解DDH发展中的特定软骨细胞组成,识别有效的生物标志物,阐明驱动DDH进展的基因调控元件 | 人类发育性髋关节发育不良患者的软骨组织 | 数字病理学 | 发育性髋关节发育不良 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学检测 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA | 
| 7988 | 2025-10-06 | Continuous replenishment of the dysfunctional CD8 T cell axis is associated with response to chemoimmunotherapy in advanced breast cancer 
          2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
          
         
          DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101973
          PMID:39983715
         | 研究论文 | 通过单细胞测序技术分析晚期乳腺癌患者对化疗免疫联合治疗的免疫应答机制 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序揭示化疗免疫治疗应答患者的CD8 T细胞动态变化特征 | 样本量较小(27例患者),仅针对三阴性乳腺癌 | 探究肿瘤免疫微环境如何影响晚期乳腺癌患者对化疗免疫联合治疗的应答 | 27例转移性三阴性乳腺癌患者的40份活检样本 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 27例患者的40份活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA | 
| 7989 | 2025-10-06 | Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage Dynamics During MASH in Leptin-Deficient Rats 
          2025-01-10, Cells
          
          IF:5.1Q2
          
         
          DOI:10.3390/cells14020096
          PMID:39851524
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示瘦素缺陷大鼠MASH模型中肝脏巨噬细胞的动态变化 | 首次在大鼠MASH模型中系统研究肝脏巨噬细胞的异质性和动态变化,发现独特的M1向M2表型转换特征 | 研究仅针对瘦素缺陷大鼠模型,结果在人类和其他物种中的普适性需要进一步验证 | 解析代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中巨噬细胞的动态变化和细胞间通讯 | 瘦素缺陷大鼠的肝脏组织 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16周龄瘦素缺陷大鼠肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7990 | 2025-10-06 | Immune Gene Expression Profiling in Individuals with Turner Syndrome, Graves' Disease, and a Healthy Female by Single-Cell RNA Sequencing: A Comparative Study 
          2025-01-10, Cells
          
          IF:5.1Q2
          
         
          DOI:10.3390/cells14020093
          PMID:39851522
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较特纳综合征患者、健康女性和Graves病患者的免疫基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析特纳综合征患者抗原特异性CD4(+) T细胞的免疫基因表达谱,并与健康对照和自身免疫疾病患者进行比较 | 样本量较小(仅3个个体),需要更大规模研究验证结果 | 探究特纳综合征患者免疫相关基因表达特征及其与自身免疫疾病的差异 | 特纳综合征患者、健康女性、Graves病女性患者 | 单细胞基因组学 | 特纳综合征, Graves病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3个个体(1名TS患者,1名健康女性,1名Graves病患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7991 | 2025-10-06 | Temporal evolution of fibroblast responses following salivary gland ductal ligation injury 
          2025, Frontiers in dental medicine
          
          IF:1.5Q3
          
         
          DOI:10.3389/fdmed.2025.1581376
          PMID:40375832
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析唾液腺导管结扎损伤后成纤维细胞的时序性反应 | 首次在唾液腺损伤模型中鉴定出三种独特的成纤维细胞亚群及其动态响应模式,并确定主要损伤响应性纤维化细胞类型 | 研究仅关注7天内的时间进程,未探讨长期慢性纤维化过程 | 阐明成纤维细胞在唾液腺损伤响应中的时序性变化机制 | 小鼠唾液腺导管结扎损伤模型中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 唾液腺疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的唾液腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7992 | 2025-10-06 | Integrative single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing reveals the characteristics of glutathione metabolism and protective role of GSTA4 gene in pancreatic cancer 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1571431
          PMID:40375987
         | 研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,揭示了胰腺癌中谷胱甘肽代谢特征及GSTA4基因的保护作用 | 首次在胰腺癌中系统分析谷胱甘肽代谢相关基因的预后价值,并通过实验验证GSTA4基因的抑癌功能 | 研究主要基于回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探究谷胱甘肽代谢相关基因在胰腺癌中的预后意义并识别关键分子靶点 | 胰腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外功能实验 | 预后分子分类器 | 转录组数据 | 930例胰腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA | 
| 7993 | 2025-10-06 | Integrating single-cell sequencing and transcriptome analysis to unravel the mechanistic role of sialylation-related genes in sepsis-induced acute respiratory distress syndrome 
          2025, Frontiers in immunology
          
          IF:5.7Q1
          
         
          DOI:10.3389/fimmu.2025.1528769
          PMID:40375981
         | 研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析,揭示了唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的机制作用 | 首次系统鉴定CD19和GPR65作为脓毒症诱导ARDS的关键唾液酸化相关基因,并通过单细胞RNA测序确定CD14单核细胞为关键细胞类型 | 研究基于公共数据库数据,临床样本验证规模有限,机制研究仍需进一步实验验证 | 探讨唾液酸化相关基因在脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征中的分子机制 | 脓毒症诱导的急性呼吸窘迫综合征患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习 | 列线图模型, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE32707, GSE66890, GSE151263)和临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 7994 | 2025-10-06 | Integrative multi-omics and Mendelian randomization analysis reveal SPP1+ tumor-associated macrophage-driven prognostic signature for hepatocellular carcinoma 
          2025, Frontiers in molecular biosciences
          
          IF:3.9Q2
          
         
          DOI:10.3389/fmolb.2025.1594610
          PMID:40376263
         | 研究论文 | 本研究通过整合多组学和孟德尔随机化分析,开发了基于SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的肝细胞癌预后预测模型 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,识别SPP1+肿瘤相关巨噬细胞相关基因并构建预后预测模型 | 研究结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 | 开发肝细胞癌患者的生存预后预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, LASSO回归 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7995 | 2025-10-06 | Tumor-microenvironment and molecular biology of classic Hodgkin lymphoma in children, adolescents, and young adults 
          2025, Frontiers in oncology
          
          IF:3.5Q2
          
         
          DOI:10.3389/fonc.2025.1515250
          PMID:40376590
         | 综述 | 总结儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境特征及分子生物学研究进展 | 揭示了不同年龄段cHL患者肿瘤微环境组成和功能的年龄相关差异,并开发了年龄特异性预后指标 | NA | 解析cHL肿瘤微环境的作用机制及年龄相关差异,推动生物标志物驱动的靶向治疗发展 | 儿童、青少年和年轻成人经典霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤生物学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞测序,多重空间成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7996 | 2025-10-06 | Identifying Fibrogenic Cells Following Salivary Gland Obstructive Injury 
          2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2023.03.09.531751
          PMID:36945483
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1谱系追踪技术系统分析唾液腺纤维化过程中的细胞动态变化 | 研究仅使用小鼠模型,Gli1信号通路在纤维化中的作用相对有限 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 胚胎期16天和成年小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7997 | 2025-10-06 | Identifying fibrogenic cells following salivary gland obstructive injury 
          2023, Frontiers in cell and developmental biology
          
          IF:4.6Q1
          
         
          DOI:10.3389/fcell.2023.1190386
          PMID:37287453
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1-CreER谱系追踪技术,系统分析唾液腺损伤后纤维化反应中的基质细胞异质性和Gli1信号的作用 | Gli1信号和Gli1细胞对机械损伤诱导的唾液腺纤维化改变贡献较小,且仅少数基质细胞亚群表达典型纤维化标志物 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺和胚胎期E16小鼠 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | Gli1-CreER; ROSA26tdTomato谱系追踪小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 雌性小鼠颌下唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 7998 | 2025-10-06 | Comprehensive characterization of the molecular feature of T cells in laryngeal cancer: evidence from integrated single-cell and bulk RNA sequencing data using multiple machine learning approaches 
          2025-Dec, Annals of medicine
          
          IF:4.9Q1
          
         
          DOI:10.1080/07853890.2025.2477287
          PMID:40179028
         | 研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,结合多种机器学习方法,全面表征喉癌中T细胞的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下系统研究喉癌中T细胞相关分子特征,并开发了基于10种机器学习方法的TCRG分类器 | 样本量有限(仅3例喉癌组织),需要更大规模验证 | 阐明喉癌中T细胞相关分子的临床相关性并开发预后预测模型 | 喉癌组织和匹配的癌旁正常组织 | 生物信息学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习 | 多种机器学习方法(10种) | RNA测序数据 | 3例喉癌组织及匹配癌旁组织,TCGA和GEO数据库数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 | 
| 7999 | 2025-05-17 | miR142 silencing alleviates retinal inflammation by impairing mitochondrial function and reprogramming metabolism of CD4+ T cells via targeting MTFR1 
          2025-Jun-05, International immunopharmacology
          
          IF:4.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.intimp.2025.114727
          PMID:40334625
         | 研究论文 | 研究miR-142在自身免疫性葡萄膜炎中的作用及其通过靶向MTFR1调控CD4+ T细胞线粒体功能和代谢重编程的机制 | 揭示了miR-142通过靶向MTFR1调控T细胞线粒体功能和代谢重编程的新机制,为自身免疫性葡萄膜炎的治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明miR-142在葡萄膜炎发病中的作用及其分子机制 | 自身免疫性葡萄膜炎患者外周血单核细胞和实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | 分子免疫学 | 葡萄膜炎 | 流式细胞术、单细胞测序、Seahorse能量代谢分析、线粒体染色、电子显微镜分析、荧光素酶报告基因检测、Western blot | miR-142基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 葡萄膜炎患者外周血单核细胞和EAU小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | 
| 8000 | 2025-05-17 | Inhibition of CTSC contributes to psoriasis inflammation and keratinocyte hyperproliferation by NF-κB signaling pathway 
          2025-Jun-05, International immunopharmacology
          
          IF:4.8Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.intimp.2025.114808
          PMID:40339488
         | 研究论文 | 本研究探讨了CTSC在银屑病中的作用及其机制,发现抑制CTSC可通过NF-κB信号通路促进炎症和角质形成细胞过度增殖 | 首次揭示CTSC抑制通过NF-κB通路促进银屑病炎症和角质形成细胞过度增殖的机制 | 研究主要基于体外细胞和小鼠模型,临床样本验证有限 | 探究CTSC在银屑病中的作用及分子机制 | 银屑病患者皮肤组织、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型、HaCaT细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | scRNA-seq、siRNA敲降 | IMQ诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 银屑病患者皮肤组织、小鼠模型和HaCaT细胞 | NA | NA | NA | NA |