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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-11-08 |
Single-cell multi-omics analysis revealed the expansion of age-associated B cells in the pancreas of type 1 autoimmune pancreatitis patients
2025-Nov-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01567-w
PMID:41188893
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺中年龄相关B细胞的扩增现象 | 首次在AIP胰腺中发现IgD-年龄相关B细胞(ABCs)的扩增,并揭示了CXCL9+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴招募ABCs以及Tfh细胞通过IL-21与ABCs相互作用的新机制 | 样本量有限,仅基于活检样本分析,需要更大规模研究验证 | 表征1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺的局部免疫特征 | 1型自身免疫性胰腺炎患者的胰腺活检组织 | 单细胞组学 | 自身免疫性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫受体组库测序,空间转录组测序,流式细胞术,多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫受体序列数据 | AIP患者胰腺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞免疫受体组库测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 782 | 2025-11-08 |
PA2G4 in CAFs promotes biochemical recurrence of prostate cancer via H3K18la
2025-Nov-04, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01485-9
PMID:41189032
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定前列腺癌相关成纤维细胞乳酸代谢特征并建立预后指数 | 首次发现CAFs通过乳酸代谢影响前列腺癌进展,建立新型乳酸代谢相关临床预后指数LMCAFCPI,并揭示PA2G4通过抑制H3K18la调控前列腺癌增殖转移的新机制 | NA | 探索前列腺癌相关成纤维细胞通过乳酸代谢影响前列腺癌进展的机制并开发预后工具 | 前列腺癌相关成纤维细胞和前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习,CUT-TAG测序 | 机器学习模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2025-11-08 |
Loss of Actrt1 in non-hematopoietic stroma suppresses pathological angiogenesis and tumor progression
2025-Nov-04, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152916
PMID:41197408
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研究论文 | 本研究揭示了Actrt1通过非造血基质细胞促进肿瘤血管生成和肿瘤进展的新机制 | 首次发现Actrt1在肿瘤微环境中通过非造血内皮细胞调控病理性血管生成,而不影响发育性血管生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性有待进一步验证 | 探究Actrt1在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤血管生成的影响 | B16F1和MC38肿瘤模型小鼠、骨髓嵌合体、主动脉环、后肢缺血模型 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、骨髓移植、主动脉环分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像数据 | 多种小鼠肿瘤模型和实验体系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 784 | 2025-11-08 |
A new model of gastric pre-neoplasia induced by aberrant ADAR1-mediated double-stranded RNA signaling
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101673
PMID:41197768
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研究论文 | 本研究通过构建胃壁细胞特异性敲除ADAR1的小鼠模型,揭示了异常双链RNA信号传导在胃前瘤形成中的作用机制 | 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号异常驱动的胃前瘤形成新遗传模型,并发现线粒体双链RNA在此过程中的富集现象 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 明确双链RNA反应失调在胃上皮细胞中对胃前瘤形成的影响 | ADAR1基因敲除小鼠的胃组织 | 分子病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫电子显微镜,免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,组织学图像,免疫学数据 | 多种基因型小鼠的胃组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2025-11-08 |
Heterogeneity of acute myeloid leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Nov-04, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2025.195119
PMID:41197948
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性 | 首次结合单细胞数据和单样本网络分析方法,在细胞类型特异性水平上揭示AML患者的基因调控异质性 | 样本量有限,网络推断方法的一致性有待进一步验证 | 探索急性髓系白血病在基因调控水平的异质性,为个性化治疗提供依据 | 急性髓系白血病患者和健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3, LIONESS | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2025-11-08 |
IGF1-mediated mesenchymal-endothelial transition as a potential regulatory target in calcific aortic valve disease
2025-Nov-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04433-z
PMID:41184837
|
研究论文 | 本研究首次证实主动脉瓣间质细胞在钙化条件下具有向内皮细胞转分化的能力 | 首次发现并证实主动脉瓣间质细胞可通过间质-内皮转分化获得内皮细胞功能,揭示了IGF1-PI3K-AKT-HIF信号通路在此过程中的关键作用 | 研究样本量有限,主要基于动物模型和体外实验,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究钙化性主动脉瓣疾病中瓣膜间质细胞向内皮细胞转分化的机制及其治疗潜力 | 人类钙化主动脉瓣组织、猪主动脉瓣原代细胞、Col1a2-CreERT:R26R-tdTomato基因工程小鼠 | 心血管疾病研究 | 钙化性主动脉瓣疾病 | 免疫荧光分析、转录组测序、Western blot、qPCR、单细胞测序数据分析 | NA | 组织切片图像、基因表达数据、蛋白质印迹数据 | 16例CAVD患者钙化主动脉瓣、猪主动脉瓣原代细胞、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 787 | 2025-11-08 |
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07174-y
PMID:41184884
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过调控LDHA表达促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现NETs通过PI3K/AKT通路调控糖代谢关键酶LDHA表达促进结直肠癌转移 | NA | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌肝转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞、裸鼠肝脏异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 788 | 2025-11-08 |
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07140-8
PMID:41184982
|
研究论文 | 本研究探讨FMR1基因通过c-MYC信号通路促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的机制 | 首次揭示FMR1在胃癌中通过稳定c-MYC蛋白促进肿瘤恶性表型的新机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析,需要更多体内实验验证 | 阐明FMR1基因在胃癌发生发展中的作用机制 | 胃癌细胞系和临床胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 单细胞转录组学, 免疫共沉淀, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和临床样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | TIMER2.0平台, TISIDB数据库, inferCNV分析工具 |
| 789 | 2025-11-08 |
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3572383
PMID:40402695
|
研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的GCNLA网络架构,用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | GCNLA不仅能学习细胞的空间结构,还能捕获远端细胞间的相互作用信息,注意力模块进一步提取和增强与细胞间相互作用相关的特征 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | 细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN), 长短期记忆网络(LSTM) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH, MERFISH | NA |
| 790 | 2025-11-08 |
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002
PMID:40603206
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研究论文 | 本研究通过循环原位杂交技术结合空间转录组学,在系统性硬化症皮肤中发现并表征了新型成纤维细胞亚群及其致病作用 | 首次在单细胞分辨率下实现原位深度转录谱分析,发现SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周成纤维细胞两个新型亚群 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 通过空间转录组学技术研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的分布特征和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 循环原位杂交,单细胞RNA测序 | BANKSY聚类算法 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 791 | 2025-11-08 |
Discovering Heterogeneous Leukocytes Subsets Associated With Alcoholic Steatohepatitis by scRNAseq Analysis
2025-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70448
PMID:41190282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与酒精性脂肪性肝炎相关的异质性白细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统分析酒精性脂肪性肝炎中免疫白细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究酒精性肝病中免疫细胞类型的特异性反应 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠的免疫白细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, SingleR | 单细胞转录组数据 | 酒精诱导和健康对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2025-11-08 |
Matrix stiffness regulates profibrotic fibroblast differentiation and fibrotic niche activation in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.016
PMID:40579317
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研究论文 | 本研究探讨基质硬度如何调节系统性硬化症中促纤维化成纤维细胞分化和纤维化生态位激活 | 首次揭示基质硬度通过机械转导驱动PI16+前体细胞向SFRP2+COMP+PU.1+肌成纤维细胞分化的机制 | 研究主要基于体外3D培养系统,需进一步体内验证 | 探究基质硬度对成纤维细胞转录状态和谱系分化的影响 | 系统性硬化症患者和健康人皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | SSc患者和健康人皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 793 | 2025-11-08 |
Diamond-Inspired DNA Hydrogel Based on Tetrahedral Framework Nucleic Acids for Burn Wound Healing
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202509727
PMID:40817796
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研究论文 | 本研究开发了一种基于四面体框架核酸的钻石启发DNA水凝胶,用于促进烧伤创面愈合 | 首次利用四面体框架核酸构建具有钻石结构的DNA水凝胶,显著提升了机械强度并具备多重功能特性 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在更大动物模型或临床试验中验证 | 开发一种具有增强机械性能和多重功能的新型DNA水凝胶用于烧伤创面治疗 | 烧伤创面愈合过程中的免疫微环境和细胞相互作用 | 组织工程与再生医学 | 烧伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 794 | 2025-11-08 |
Single-Cell Immune Signature and Response to Neoadjuvant Chemotherapy in BRCA1/2-Mutated Breast Cancer
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00349
PMID:41197086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征,并开发预测新辅助化疗反应的BRCA-IM模型 | 首次在单细胞水平揭示BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境图谱,并建立基于单细胞和bulk RNA-seq数据的免疫特征预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 探索BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征及其与新辅助化疗反应的关系 | BRCA1/2突变乳腺癌患者和BRCA野生型乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学 | BRCA-IM预测模型 | 基因表达数据, 病理数据 | 80例BRCA1/2携带者(新辅助化疗队列),40例BRCA1/2携带者和56例非携带者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 795 | 2025-11-08 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
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综述 | 本文综述了空间转录组学在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和当前挑战 | 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新突破,强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织的空间结构和细胞微环境 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 796 | 2025-11-08 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-Oct-30, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
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研究论文 | 本研究揭示SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次结合转录组测序和单细胞转录组分析揭示SerpinB2通过Wnt/β-catenin通路调控胶质瘤细胞周期的具体机制 | 研究主要聚焦于细胞周期调控机制,对其他潜在信号通路探索不足 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子调控机制 | 胶质瘤细胞系和荷瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 转录组测序,单细胞转录组分析,CCK-8,伤口愈合实验,流式细胞术,q-PCR,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 胶质瘤组织样本和细胞系,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 797 | 2025-11-08 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞具有分化延迟和休眠特征 | 首次在单细胞水平鉴定了胎儿肝脏造血干细胞的区分特征,包括分化延迟、细胞分裂对称性和生物合成休眠特征 | 研究主要基于体外培养平台,可能无法完全模拟体内真实微环境 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 活细胞成像, 移植实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2025-11-08 |
CCL26 and CXCL12 preserve insulin-sensitizing macrophages in subcutaneous adipose tissue in obesity
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116450
PMID:41100258
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研究论文 | 本研究揭示了皮下脂肪组织通过CCL26和CXCL12信号通路维持胰岛素敏感巨噬细胞的新机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞释放的小细胞外囊泡具有改善胰岛素敏感性的功能,并阐明CCL26和CXCL12信号通路在维持巨噬细胞稳态中的作用 | 研究主要聚焦于肥胖模型,其他代谢疾病状态下的机制尚需进一步验证 | 探究皮下脂肪组织在肥胖中抵抗胰岛素抵抗的保护机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞、小细胞外囊泡、脂肪细胞及其前体细胞 | 代谢疾病研究 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序, 体内外细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2025-11-08 |
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2025-Oct-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.068
PMID:41167419
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研究论文 | 本研究揭示了组成型20S蛋白酶体在小鼠精原细胞维持和分化中的关键作用 | 首次证明组成型20S蛋白酶体对精原细胞维持和分化至关重要,并发现s20S蛋白酶体可补偿c20S功能缺失 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证 | 阐明组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 | 小鼠雄性生殖细胞 | 生殖生物学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 800 | 2025-11-08 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Oct, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00022-2025
PMID:40675771
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,揭示了PAK激酶作为特发性肺纤维化中成纤维细胞灶和致密纤维化的治疗靶点 | 首次发现一种新型肌成纤维细胞群体在成纤维细胞灶和致密纤维化区域富集,并证实PAK激酶在这些纤维化区域被激活 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索特发性肺纤维化中纤维化进展的分子机制和潜在治疗靶点 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本和博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 空间转录组学,单细胞分析 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |