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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-06-06 |
Targeting Oncomucin-driven Immunosuppression Improves the Efficacy of K-rasG12D Inhibition in Pancreatic Cancer
2026-May-25, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.041
PMID:42191046
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研究论文 | 研究癌性黏蛋白驱动的免疫抑制如何影响胰腺癌中K-rasG12D抑制剂的疗效,并探索靶向癌性黏蛋白的联合治疗策略 | 首次揭示跨膜癌性黏蛋白通过表皮生长因子受体/Unc-5 Netrin受体B信号通路促进胰腺癌免疫逃逸,并证明靶向癌性黏蛋白可增强K-rasG12D抑制剂的治疗效果,提出癌性黏蛋白作为新型免疫调节因子和治疗靶点 | NA | 评估癌性黏蛋白对胰腺癌肿瘤微环境的患者中心影响,为诊断和治疗策略提供信息 | 胰腺导管腺癌患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重/连续免疫染色, NanoString分析, 基因沉默 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 34例单细胞RNA测序样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 782 | 2026-06-06 |
Targeting LRRC15 in Cancer-Associated Fibroblasts Modifies the Extracellular Matrix and Enhances Tumor Immune Responses to Suppress Lung Cancer Progression
2026-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2871
PMID:41591362
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研究论文 | 本研究识别了LRRC15+癌症相关成纤维细胞是肺癌中肿瘤特异性的CAF亚群,并提出LRRC15作为潜在治疗靶点,通过调节细胞外基质和增强免疫应答抑制肺癌进展 | 首次提出LRRC15作为肺癌治疗靶点,并开发了靶向LRRC15和TGFβ的双特异性抗体,为靶向CAF的癌症治疗提供新策略 | 研究主要在动物模型中进行,未在人类患者中验证其疗效和安全性 | 探索LRRC15在癌症相关成纤维细胞中的作用及其作为肺癌治疗靶点的潜力 | 肺癌相关成纤维细胞(CAF)、小鼠肺癌模型 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠肺癌模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 783 | 2026-06-06 |
Immune dysfunction contributes to comorbid depression in patients with multiple sclerosis
2026-May-15, Journal of affective disorders
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jad.2026.121253
PMID:41605342
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研究论文 | 通过整合基因组和单细胞数据,研究免疫功能障碍在多发性硬化症合并抑郁中的作用 | 首次整合GWAS和单细胞RNA测序数据,发现CD8+ T细胞介导的HLA-B限制性靶向5-HT1F受体神经元可能是MS合并抑郁的机制 | 单细胞数据样本量较小(仅4例MS患者),且未验证因果关系 | 探讨免疫功能障碍是否促进多发性硬化症合并抑郁的发病机制 | 多发性硬化症患者及抑郁患者 | 机器学习 | 多发性硬化症, 抑郁症 | GWAS, 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 4例多发性硬化症患者(2例合并抑郁,2例无抑郁)的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2026-06-06 |
Single-cell and spatial analyses identify a glycolysis-high state driven by STOML2 in epithelial ovarian cancer
2026-May-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115066
PMID:42142700
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示STOML2驱动上皮性卵巢癌中糖酵解高活性恶性表型及其调控机制 | 首次通过单细胞和空间多组学联合分析,发现STOML2作为糖酵解枢纽基因通过AKT/mTOR信号通路驱动卵巢癌代谢重编程,并构建基于STOML2的预后风险模型 | 未明确STOML2直接结合靶点,体内动物模型验证尚缺,临床样本验证队列规模有限 | 阐明上皮性卵巢癌中糖酵解相关恶性上皮状态的调控机制,鉴定可干预的代谢调控枢纽 | 上皮性卵巢癌细胞(A2780和SKOV3细胞系)及临床肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Seahorse细胞外通量分析, 蛋白质免疫印迹 | 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-OV队列及多个独立GEO队列,具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 785 | 2026-06-06 |
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag108
PMID:42215073
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研究论文 | 本文研究了PI3Kδ抑制剂CAL-101在过继性免疫治疗中如何改变CD8 T细胞分化并重编程肿瘤微环境 | 首次揭示PI3Kδ抑制剂通过增强T细胞干性和代谢适应性来抵抗终末耗竭,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析其机制 | 主要基于B16黑色素瘤小鼠模型,临床适用性需进一步验证 | 探索提高过继性细胞治疗在实体瘤中效果的新策略 | CD8 T细胞和B16黑色素瘤肿瘤微环境 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | B16黑色素瘤小鼠肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 786 | 2026-06-06 |
CXCL16 as a potential therapeutic target to limit the activity of asthmatic CD4 memory T cells
2026-May-14, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.05.004
PMID:42134609
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研究论文 | 探讨CXCL16-CXCR6通路在哮喘CD4记忆T细胞活性中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞转录组学揭示CXCR6在哮喘肺CD4记忆T细胞中高表达,并证实阻断CXCL16可显著减少肺CD4记忆效应T细胞积累,减少组织炎症,并具有持续保护效应 | 研究主要在动物模型中进行,人类数据仅基于单细胞RNA测序分析,需进一步验证临床转化效果 | 研究CXCL16-CXCR6相互作用在哮喘相关CD4组织驻留记忆T细胞活性和积累中的作用 | 人和小鼠哮喘肺CD4 T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人和小鼠哮喘肺细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 787 | 2026-06-06 |
Multi-Omics Analysis and In Vitro Experimental Validation Identify Candidate Mechanisms of Baicalein Against Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-11, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31101610
PMID:42197164
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研究论文 | 该研究通过多组学分析和体外实验验证,探讨黄芩素对抗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 | 创新地将多数据集转录组分析、单细胞转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化、分子模拟和虚拟敲除分析等多种方法整合,用于黄芩素治疗COPD的靶点优先排序和机制探索 | 预测的以巨噬细胞为中心的机制尚需在免疫细胞和体内模型中进行专门的验证 | 阐明黄芩素治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在机制 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)和黄芩素 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组学分析、单细胞转录组学、机器学习的特征选择、孟德尔随机化、分子模拟、虚拟敲除分析、体外实验 | LASSO回归、随机森林、支持向量机 | 转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、遗传关联数据 | 260个对照样本和250个COPD样本(来自四个整合的GEO数据集) | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2026-06-06 |
AnnQ: reference-based quantification of cellular abnormality at single-cell resolution
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag278
PMID:42218718
|
研究论文 | 提出AnnQ框架,利用单细胞RNA测序中的注释不确定性作为细胞异常性的定量指标,以检测异常细胞状态 | 将传统上被视为技术伪影的注释不确定性重新定义为衡量细胞异常性的定量指标,并引入多变量不确定性空间中的出参考评分来量化每个细胞的偏差 | NA | 开发一种基于参考的量化方法,在单细胞分辨率下检测细胞异常状态 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2026-06-06 |
scMVAF: a multi-view adaptive fusion clustering approach for single-cell RNA-sequencing data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf169
PMID:42218719
|
research paper | 提出了一种名为scMVAF的多视图自适应融合聚类方法,用于分析单细胞RNA测序数据,通过生成多视图表征并融合特征来提升聚类性能 | 首次引入多视图框架并利用基于去噪零膨胀负二项模型的自动编码器来学习单细胞RNA-seq数据的嵌入表示,并通过多视图融合模块整合不同视图的信息以获取更判别的细胞嵌入 | 可能依赖于降采样特征生成视图的策略,对高维稀疏数据中的零计数处理仍有改进空间,且尚未在更大规模或更复杂的数据集上验证 | 开发一种能够更好地处理单细胞RNA-seq数据高维稀疏性和异质性的聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器(基于去噪零膨胀负二项模型), 多视图融合模块 | 基因表达数据 | 16个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 790 | 2026-06-06 |
USADAE: a deep learning approach to disentangle hidden covariates in RNA-seq data
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag261
PMID:42218722
|
研究论文 | 开发了一种基于对抗学习的自编码器框架USADAE,用于从RNA-seq数据中分离隐藏的协变量 | 首次提出无监督对抗解缠自编码器框架,专门用于分离RNA-seq数据中隐藏的混杂因素与生物学信号,突破了传统方法仅针对已知批次标签的局限 | 未提及具体局限性 | 开发一种深度学习方法,有效解缠RNA-seq数据中的隐藏混杂因素,提升差异表达和eQTL分析的下游校正能力 | RNA-seq数据中的生物学信号和隐藏协变量(如未测量的技术变异和生物-技术变量间的非线性交互作用) | 自然语言处理 | 癌症基因组学 | RNA-seq | 自编码器、对抗学习 | 基因表达数据 | 综合模拟和真实数据应用 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 791 | 2026-06-06 |
Beyond the Cell Atlas: Functional Communities as the Essential Pathologic Units Driving Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001023
PMID:41563353
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综述 | 本文提出‘功能社群’概念作为肾脏疾病的关键病理单元,并探讨其临床应用价值 | 首次系统性地提出‘功能社群’作为肾脏疾病的病理单元,整合空间和多组学技术解析细胞间相互作用 | 该框架仍处于概念阶段,面临技术挑战和临床转化的关键问题 | 提出基于功能社群的新型肾脏病理认知框架并指导下一代诊疗方案开发 | 肾小管损伤修复微环境、促纤维化微环境、免疫破坏微环境等三个典型病理社群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学、多组学技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 792 | 2026-06-06 |
Parasympathetic nerves in the kidney pelvis contribute to blood pressure regulation
2026-May, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2026.01.002
PMID:41565024
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研究论文 | 本研究证实肾盂存在副交感神经支配,并揭示迷走神经肾传入通路参与血压调节 | 首次通过多标记技术确认肾盂存在交感、副交感和感觉神经的多组分支配,并利用光纤光度法检测到肾神经释放乙酰胆碱,通过光遗传学激活证实迷走神经肾传入通路可降低血压 | 未提及具体限制 | 验证肾副交感神经的功能活性及其在血压调节中的生理作用 | 小鼠肾盂的神经支配、乙酰胆碱受体表达及血压调节机制 | 神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应、荧光原位杂交、光纤光度法、光遗传学 | NA | 基因表达数据、生理信号数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2026-06-06 |
Longitudinal spatial transcriptomics reveals the molecular dynamics of pulmonary artery remodeling in pulmonary arterial hypertension
2026-May, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 首次纵向空间转录组分析揭示肺动脉高压患者肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次对同一肺动脉高压患者间隔13年的两次肺移植样本进行纵向空间转录组分析,揭示血管病变的时间动态,并识别出与严重重塑小肺动脉相关的115个基因重塑特征及25个核心基因特征 | 仅基于一名患者的两次移植样本,样本量极小,可能限制结论的普适性 | 探究肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化,识别可用于指导靶向治疗的基因特征 | 肺动脉高压患者肺移植组织中的小动脉(20-500 µm)和大动脉(>500 µm) | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 1名肺动脉高压患者,两次肺移植样本(间隔13年) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 794 | 2026-06-06 |
CXCR2+ Neutrophils Drive Neutrophil Extracellular Traps Formation and Exacerbate Pulpitis in Rats: An In Vitro and In Vivo Laboratory Investigation
2026-May, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70098
PMID:41589026
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研究论文 | 该研究通过转录组分析和单细胞RNA测序揭示了CXCR2+中性粒细胞在牙髓炎中驱动中性粒细胞胞外陷阱形成并加重炎症的机制,并评估了靶向CXCR2的治疗潜力 | 首次在牙髓炎中鉴定出CXCR2+中性粒细胞亚群作为促炎亚型,并阐明其通过巨噬细胞来源的CXCL8-CXCR2信号驱动NETs形成的机制,同时验证了CXCR2抑制剂作为免疫调节靶点的治疗潜力 | 未提及具体的局限性 | 表征牙髓炎中中性粒细胞胞外陷阱的特征及其调控机制,并评估靶向中性粒细胞亚群的治疗潜力 | 牙髓炎组织、HL-60来源的中性粒细胞、THP-1巨噬细胞、人牙髓细胞、Sprague-Dawley大鼠 | 数字病理学 | 牙髓炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫荧光、微CT分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、组织样本数据 | 人类细胞系和大鼠模型(每组5只,7-8周龄雄性Sprague-Dawley大鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分析GSE92681、GSE274562、GSE280528数据集 |
| 795 | 2026-06-06 |
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2026-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000940
PMID:41563399
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研究论文 | 研究表明α-Klotho通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路在常染色体显性多囊肾病中促进细胞死亡并抑制炎症 | 首次阐明α-Klotho在ADPKD中通过与细胞凋亡抑制蛋白1相互作用并使其不稳定,调控TNF依赖性囊性细胞凋亡和炎症的新机制 | 未提及具体局限性 | 研究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的作用及机制 | α-Klotho蛋白、Pkd1突变小鼠模型 | 机器学习 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Pkd1突变小鼠和转基因α-Klotho/Pkd1突变小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 796 | 2026-06-06 |
GPR183 contributes to renal macrophage infiltration and fibrosis in kidney injury
2026-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00037.2026
PMID:41954905
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研究论文 | 探讨GPR183在肾损伤中促进巨噬细胞浸润和纤维化的作用 | 首次揭示GPR183作为氧化固醇受体在肾损伤中调控巨噬细胞表型及纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅通过公开单细胞测序分析,缺乏临床干预验证 | 探究GPR183在肾损伤中的免疫调节作用及其对肾纤维化的影响 | 小鼠肾损伤模型(腺嘌呤饮食诱导慢性肾病及叶酸诱导肾病)及人类慢性肾病患者单细胞数据 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及公开人类单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 797 | 2026-06-06 |
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Apr-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218557
PMID:42069175
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研究论文 | 该研究揭示了BTN3A3通过维持线粒体稳态促进肝细胞癌干性和耐药性的新机制 | 首次发现BTN3A3在肝癌干性中的非免疫学角色,阐明其通过与TOMM22相互作用维持线粒体稳态来驱动干性和耐药性,并发现泛BTN3单克隆抗体5E08有治疗潜力 | 未提及明确局限性 | 探究线粒体功能与肝癌干性之间的精确机制,寻找新的治疗靶点 | 肝细胞癌及其干性相关机制 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 体内原位异种移植模型和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 798 | 2026-06-06 |
Targeting PTDSS1 to modulate GSH synthesis triggers mitophagy and induces ferroptosis in esophageal squamous cell carcinoma cells
2026-Apr-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08702-4
PMID:42026035
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现PTDSS1高表达的恶性上皮亚群与铁死亡和线粒体自噬抵抗相关,并阐明PTDSS1调控谷胱甘肽合成并协调线粒体自噬的机制 | 首次揭示PTDSS1通过TRIM21与SLC3A2相互作用调控GSH合成,进而触发PINK1/Parkin线粒体自噬途径并诱导铁死亡的新机制 | NA | 探究PTDSS1在食管鳞状细胞癌中的调控机制及其治疗潜力 | 食管鳞状细胞癌细胞 | NA | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2026-06-06 |
Geometry-aware graph attention networks to explain single-cell chromatin states and gene expression with SEAGALL
2026-Apr-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04066-2
PMID:42026624
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研究论文 | 提出一种名为SEAGALL的深度学习方法,结合几何正则化自编码器和可解释图注意力网络,量化分子特征对细胞表型的影响,并解析单细胞染色质状态和基因表达 | 创新性地将几何正则化自编码器与可解释图注意力网络结合,实现从高维单细胞数据中提取稳定且特异性的分子特征,超越传统的差异标记基因方法 | 未明确说明 | 开发能解释单细胞染色质状态和基因表达的深度学习方法,揭示驱动细胞身份的分子特征 | 单细胞测序数据中的分子特征(如染色质状态和基因表达)及其与细胞表型的关系 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 图注意力网络, 自编码器 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞组学 | NA | NA |
| 800 | 2026-06-06 |
Single-cell analysis highlights the role of CD4+ IFN-I-related T cells in Behcet's uveitis during Interferonα-2a therapy
2026-Apr-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00810-7
PMID:42021381
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research paper | 通过单细胞分析揭示IFNα-2a治疗过程中CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病葡萄膜炎中的作用 | 首次通过单细胞转录组分析揭示CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病活动期减少及IFNα-2a治疗后的恢复机制,并阐明其通过LLT1-CD161相互作用抑制NK细胞炎症表型 | 未在摘要中明确提及研究局限性 | 研究IFNα-2a通过免疫细胞调节对贝赫切特病葡萄膜炎的治疗机制 | 贝赫切特病活动性葡萄膜炎患者、经IFNα-2a治疗4个月的患者、活动期贝赫切特病患者及健康对照者的外周血单核细胞和CD4+ T细胞 | machine learning | 贝赫切特病 | 单细胞RNA测序、bulk mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含活动期贝赫切特病葡萄膜炎患者、治疗4个月后患者、活动期患者及健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |