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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-05-15 |
Nested co-expression network analysis identifies compact gene clusters in a black box
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag167
PMID:41934621
|
研究论文 | 提出Nested-WGCNA算法，用于识别粗粒度和细粒度基因模块，并在免疫治疗响应数据中揭示预测和预后生物标志物 | 通过两阶段无监督网络分析算法，首次实现了在转录组数据中同时识别广域和嵌套的基因模块，能够捕捉到传统方法遗漏的、对应于特化细胞类型亚过程的紧凑基因集 | NA | 开发一种能够同时识别广域和嵌套基因模块的数字分析方法，以揭示生物系统中的功能异质性 | 基因共表达网络及免疫治疗响应数据集 | 机器学习 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | Nested-WGCNA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2026-05-15 |
Belimumab modulates type I interferon signalling in the treatment of systemic lupus erythematosus
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/03t59o
PMID:41328601
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研究论文 | 贝利木单抗通过调节I型干扰素信号通路治疗系统性红斑狼疮的免疫图谱变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示贝利木单抗对SLE患者免疫图谱的调控机制，特别是对IFN刺激基因活性和特定免疫细胞亚群的抑制作用 | 样本量较小（仅6名患者），且对照组仅接受常规治疗，可能存在混杂因素影响结果解释 | 研究贝利木单抗对系统性红斑狼疮患者免疫细胞图谱的影响及其作用机制 | 6名活动性系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学， 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名患者（3名接受贝利木单抗联合常规治疗，3名仅接受常规治疗） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2026-05-15 |
GatorST: A Versatile Contrastive Meta-Learning Framework for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2026-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202600006
PMID:41947710
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research paper | 提出一种名为GatorST的对比元学习框架，用于空间转录组数据分析，通过整合局部邻域和全局组织上下文生成空间信息表示 | 将图建模与元学习策略相结合，通过双跳子图捕捉细粒度空间上下文，并利用聚类产生伪标签进行弱监督学习，采用情景训练方法增强模型泛化能力 | 未提及具体局限性，但从方法描述看可能依赖邻域图构建的准确性，且伪标签质量可能影响弱监督学习效果 | 开发一种能够有效整合局部和全局空间信息，稳健生成空间转录组数据表示的通用框架 | 空间转录组数据中的基因表达谱及其空间背景信息 | machine learning | NA | 空间转录组学 | 对比学习，元学习，图神经网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 784 | 2026-05-15 |
A single-cell atlas of Toxoplasma sexual development in the feline intestinal tract
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02294-7
PMID:42020723
|
研究论文 | 对弓形虫在猫肠道内进行有性发育的单细胞图谱分析 | 首次通过单细胞转录组学解析弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络，并鉴定出AP2X6为大配子体发育的调控因子 | 数据主要来源于猫肠道样本，可能无法完全反映体外培养条件下的发育过程 | 探究弓形虫在猫肠道中的有性发育基因调控网络 | 从猫肠道中分离的弓形虫细胞 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 Perturb-seq | NA | 基因表达数据 | 2次实验中采集15,068个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2026-05-15 |
Unravelling bacterial complexity at high resolution with single-cell transcriptomics
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02333-3
PMID:42067624
|
综述 | 综述细菌单细胞转录组学的高分辨率研究方法及其在理解细菌异质性、生理、代谢、抗生素耐药、致病性和微生物群落相互作用中的应用 | 系统梳理了细菌单细胞RNA测序的最新进展，包括开发的方法和从应用中获得的见解，强调该领域如何革新对细菌生理学、感染生物学和微生物群落相互作用的认知 | 讨论了技术上和计算上的挑战、标准化的必要性及实现方式 | 总结细菌单细胞RNA测序的最新进展和应用，展望未来发展 | 细菌单细胞转录组学研究 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2026-05-15 |
PEDF Prevents Corneal Endothelial Dysfunction of Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.2
PMID:42080792
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研究论文 | 探索色素上皮衍生因子对Fuchs内皮角膜营养不良角膜内皮的保护作用 | 首次发现PEDF能通过抑制p53、TGF-β和Hippo信号通路预防FECD角膜内皮功能障碍 | 仅限于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏人体临床试验数据 | 研究PEDF对FECD角膜内皮的保护机制 | FECD患者房水、人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | 机器学习 | Fuchs内皮角膜营养不良 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光染色、单细胞RNA测序、RNA测序、定量PCR、自动化简单Western分析 | NA | 图像、文本、数值 | FECD患者房水样本、培养的人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 787 | 2026-05-15 |
Suboptimal Responses to Anti-VEGF in Retinal Neurovascular Diseases: Linking Aging and Alternative Angioinflammatory Pathways
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.4
PMID:42080790
|
研究论文 | 采用系统生物学框架揭示视网膜神经血管疾病中抗VEGF治疗反应不佳的机制，关注衰老与替代性血管生成炎症通路 | 整合多组学数据集、网络机器学习与疾病特异性通路映射，识别了EGFR、HSP90AA1、SIRT1和STAT3作为中心耐药枢纽，并发现21条保守核心信号级联 | 结果需在疾病相关模型中进行验证 | 阐明抗VEGF治疗失败和疾病进展的共同机制 | 糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性、青光眼及衰老相关的眼部疾病 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | 网络机器学习 | 多组学数据 | 14个核心基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | AMD-RPE簇单细胞RNA测序 |
| 788 | 2026-05-15 |
MXRA5 is identified and validated as a key gene related to epithelial-mesenchymal transition in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/dt5mf6
PMID:41105461
|
研究论文 | 通过单细胞分析及机器学习方法识别并验证MXRA5为类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中与上皮-间质转化相关的关键基因 | 首次结合单细胞分析及五种机器学习算法（XGBoost、Boruta、随机森林、LASSO、SVM-RFE）筛选出RA滑膜细胞中与EMT相关的关键基因MXRA5，并通过功能实验验证其作用 | 未提及具体局限性信息 | 利用单细胞分析及机器学习方法识别RA滑膜细胞中与EMT相关的重要基因并进行功能验证 | 类风湿关节炎患者的滑膜细胞，特别是成纤维样滑膜细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | XGBoost，Boruta，随机森林，LASSO，SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2026-05-15 |
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus infection of the male reproductive tract induces pathology and inflammation
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02298-3
PMID:41882300
|
研究论文 | 研究发现严重发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV）感染雄性生殖道，导致病理变化和炎症反应 | 首次揭示SFTSV对雄性生殖器官的广泛趋向性，发现病毒引起睾丸间质细胞凋亡、焦亡和炎症，破坏睾酮生成，并鉴定出CCR2和SPP1巨噬细胞表达的S100A4蛋白是附睾过度炎症和纤维化的关键驱动因子 | 未提及具体局限性 | 探究SFTSV是否感染雄性生殖道及其对生殖健康的影响 | 小鼠模型及感染患者（男性） | 数字病理学 | 发热伴血小板减少综合征 | single-cell RNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠和感染患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chrome单细胞基因表达分析 |
| 790 | 2026-05-15 |
Transcriptional regulators predicted to drive macrophage dysregulation during impaired wound healing in diabetic mice
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719960
PMID:42079057
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序数据，识别驱动糖尿病小鼠伤口愈合过程中巨噬细胞失调的转录调控因子 | 将Lamian框架与伪时间图扩散新方法结合，使用BITFAM模型和CellOracle进行计算机扰动，系统预测调控不同细胞状态转换的转录因子群 | 研究发现主要基于计算机预测，虽然部分结果经实验数据验证，但尚缺乏全面的实验功能验证 | 揭示糖尿病伤口愈合中巨噬细胞失调的转录调控机制 | 非糖尿病和糖尿病小鼠伤口部位的巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型、图扩散模型 | 基因表达数据 | 非糖尿病和糖尿病小鼠的伤口巨噬细胞时间序列单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 791 | 2026-05-15 |
Construction of a Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Based on Cell Death-related Genes and Characterization of Immune Microenvironment
2026-Apr-22, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v25i3.21259
PMID:42130143
|
研究论文 | 基于细胞死亡相关基因构建肝细胞癌预后模型并表征免疫微环境 | 整合25种细胞死亡模式相关基因，通过多步骤分析筛选出6个预后基因并构建风险评分模型和列线图，结合单细胞RNA测序解析关键细胞类型和细胞间通讯 | 研究基于公开转录组数据集，样本规模有限，且单细胞分析结果需进一步实验验证 | 阐明与25种细胞死亡模式相关的基因在肝细胞癌发生发展中的作用，并构建预后模型 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | Cox比例风险模型，多变量回归模型 | 基因表达数据 | 多项公开数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2026-05-15 |
Deep single-cell decoding of human pancreatic islets reveals T2D β-cell gene expression defects
2026-Apr-15, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-026-00744-w
PMID:41986506
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研究论文 | 对人类胰腺胰岛进行深度单细胞解码，揭示了2型糖尿病β细胞基因表达缺陷 | 首次对来自非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态的48名供体的245,878个人类胰岛细胞进行全面的单细胞转录组分析，并识别出14种不同细胞类型，发现T2Dβ细胞中511个差异表达基因，包括维生素A代谢相关基因，并通过多模态功能验证与β细胞活力受损关联；整合T2D遗传学、蛋白质组学和小鼠模型代谢表型，确定了58个候选因果T2D基因 | 可能受限于样本来源和数量，尚未充分验证所有候选基因在T2D病理生理中的具体作用机制 | 揭示2型糖尿病中人类胰岛细胞类型特异性的改变及其基因表达缺陷 | 48名供体的人类胰岛细胞，包括非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 245,878个细胞来自48名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2026-05-15 |
Loss of MITF activity leads to emergent cell states from the melanocyte stem cell lineage
2026-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.695681
PMID:41993564
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研究论文 | 利用斑马鱼模型研究MITF活性缺失对黑素细胞干细胞谱系中细胞状态涌现的影响 | 首次通过活体成像结合单细胞转录组学和谱系追踪，揭示MITF活性缺失导致黑素细胞干细胞在胚胎发育过程中出现异常早期扩张及新的转录细胞状态 | 未明确说明研究的局限性 | 探究MITF在胚胎发育中保护黑素细胞干细胞及其成体色素生成潜能的作用机制 | 斑马鱼黑素细胞干细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据、活体成像数据 | 斑马鱼胚胎及幼体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 794 | 2026-05-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the spatiotemporal trajectory of the small peptide TAP4 in delaying postharvest fruit senescence
2026-Apr-07, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101846
PMID:41947460
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示小肽TAP4延缓采后果实衰老的时空轨迹 | 首次鉴定出胰蛋白酶自溶肽中活性最强的TAP4，并利用单细胞转录组分析揭示其通过调控内果皮细胞分化轨迹和激活特定转录因子（如HuWRKY21-1）来延缓果实衰老的新机制 | 未提及 | 探究胰蛋白酶自溶肽TAP4延缓火龙果采后衰老的分子机制 | 火龙果果实，特别是内果皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，病毒诱导基因沉默（VIGS） | NA | 基因表达数据，序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 795 | 2026-05-15 |
Self-regulating hydrogel for diabetic wound healing: From animal models to a pilot clinical study
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4981
PMID:41920988
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研究论文 | 开发了一种自调节水凝胶GPP@ZnBG，用于糖尿病伤口愈合，并在动物模型和初步临床研究中验证其效果 | 提出了一种自pH调控的离子顺序释放策略，水凝胶能响应糖尿病伤口的高糖和氧化应激环境，先释放锌离子抗菌，后释放锌、钙、硅酸盐离子促进血管生成和组织修复 | 初步临床研究规模较小，且未报告长期随访数据，水凝胶的长期安全性和有效性需进一步验证 | 开发一种能自我调节的伤口敷料，通过响应糖尿病伤口微环境来释放治疗性离子，以促进感染控制和组织再生 | 糖尿病小鼠伤口模型和糖尿病患者的慢性伤口 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠（未指定数量）和初步临床研究中的患者（未指定数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 796 | 2026-05-15 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
|
研究论文 | 本文探讨靶向TPO/MPL信号通路减轻JAK2V617F驱动的心脏微血管疾病 | 首次发现MPL在内皮细胞中表达并介导JAK2V617F相关心血管并发症，且抗MPL抗体能改善心脏病理 | 研究主要基于小鼠模型，人类体内的验证及长期疗效仍需进一步探索 | 阐明JAK2V617F突变血细胞通过TPO/MPL信号导致心脏微血管功能障碍的机制 | JAK2V617F突变血细胞和野生型内皮的嵌合小鼠模型 | 机器学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 嵌合小鼠（数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 797 | 2026-05-15 |
Senescence-associated gene pathways are differentially expressed in equine aging-related osteoarthritis
2026-Apr-01, American journal of veterinary research
IF:1.3Q2
DOI:10.2460/ajvr.25.09.0343
PMID:41468690
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研究论文 | 本研究分析了马骨关节炎中关节和白细胞衰老相关基因的差异表达 | 首次利用单细胞RNA测序和mRNA测序数据，系统地比较了马骨关节炎局部（关节）和全身（外周血单核细胞）的衰老基因表达谱 | 未提及具体限制，但样本量较小，且缺乏功能验证实验 | 探究衰老相关基因在马骨关节炎中的表达模式，为开发针对衰老细胞的治疗策略提供依据 | 马关节滑液细胞和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65个样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 798 | 2026-05-15 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
|
评论 | 本文通过TNF驱动的小鼠模型和单细胞RNA测序数据，揭示了沙眼衣原体通过劫持杯状细胞并激活IDO1/犬尿氨酸通路，促进结肠近端区域特异性炎症的机制 | 首次证明沙眼衣原体作为必要且充分的驱动因子，通过上调杯状细胞中IDO1表达，促进区域限制性肠道炎症，并发现该机制仅发生于近端结肠而非末端回肠 | 研究仅基于小鼠模型和有限的人类数据，需要进一步验证IDO1/犬尿氨酸通路在其他克罗恩病患者群体中的普适性 | 阐明细菌共生体驱动肠道区域特异性炎症的分子机制 | 克罗恩病患者的升结肠区域和TNF驱动的小鼠小肠克罗恩病模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者升结肠的单细胞RNA测序数据集（具体样本量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2026-05-15 |
CD8 TRM-like T cells expressing perforin and IFN-γ define a pediatric activated T-cell acute liver failure endotype
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000926
PMID:41921202
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研究论文 | 该研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序，鉴定了儿童急性肝衰竭的两种不同内型，其中一种与表达穿孔素和IFN-γ的CD8 TRM样T细胞相关 | 首次定义了儿童活化T细胞急性肝衰竭的两种不同内型，并揭示了高穿孔素内型中独特的循环CD8+IFNγ+Trm样细胞群与单核细胞增殖和激活的关联 | 该研究未提及具体限制，但可能包括样本量有限、缺乏长期随访数据等潜在局限性 | 表征儿童活化T细胞急性肝衰竭的免疫病理学特征，并评估T细胞导向治疗的效用以改善无移植生存率 | 儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童以及因其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 机器学习，数字病理学 | 儿科疾病，肝病 | 多参数流式细胞术，3'单细胞RNA测序，Olink炎症I 384蛋白检测 | NA | NA | TRIUMPH临床研究中的儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童及其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 800 | 2026-05-15 |
Compact and informative representation learning for scRNA-seq data clustering with masked information bottleneck
2026-Mar-31, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02590-y
PMID:41917934
|
研究论文 | 提出基于掩蔽信息瓶颈的scMIB框架，用于单细胞RNA测序数据聚类中的鲁棒表示学习 | 首次将掩蔽去噪策略与信息瓶颈目标相结合，通过掩蔽一致性学习机制捕获稳定的基因级模式，有效抑制噪声和冗余信息 | 未提及具体限制，可能在于对超参数敏感或需进一步验证在大规模数据集的扩展性 | 开发一种鲁棒的低维表示学习方法，以改善scRNA-seq数据聚类性能并减轻噪声和稀疏性的影响 | 多个公开scRNA-seq数据集中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | RNA-seq | scMIB | 基因表达数据 | 多个公开scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |