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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
781 2026-05-31
The MCP-1/CCR2-CD16⁺ monocyte axis drives thrombus fibrosis in Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension
2026-May-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合多中心临床队列、单细胞转录组学和体内模型,揭示了MCP-1/CCR2-CD16⁺单核细胞轴在慢性血栓栓塞性肺动脉高压中驱动血栓纤维化的机制 首次识别MCP-1/CCR2-CD16⁺单核细胞轴作为CTEPH纤维化血栓重塑的核心驱动因素,并提供了连接急性血栓形成与慢性血管闭塞的机制框架 研究样本量较小,且主要在动物模型中验证,需要更大规模临床研究进一步确认靶向该通路的治疗潜力 探讨MCP-1/CCR2轴失调和CD16⁺单核细胞扩增是否构成急性肺栓塞与CTEPH慢性纤维化血管闭塞之间的机制联系 CTEPH患者、健康对照者、急性肺栓塞血栓患者以及静脉血栓小鼠模型 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 32名CTEPH患者、20名健康对照者、5名急性肺栓塞患者(共24,399个细胞) NA 单细胞RNA测序 NA NA
782 2026-05-31
An integrated peripheral immune circuit of inflammation and dysfunction underlies drug resistance in pediatric drug-resistant epilepsy
2026-May-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序分析儿童耐药性癫痫患者外周血免疫细胞的动态变化,揭示炎症与功能障碍的整合外周免疫回路在耐药性中的作用 首次对儿童耐药性癫痫、药物有效和健康对照组的外周血单核细胞进行单细胞RNA测序分析,识别出与耐药性癫痫强烈相关的VCAN+Mono亚群及其促炎特性 样本量较小可能影响统计效力,导致部分结果不可靠 系统研究不同临床表型下外周免疫细胞组成和功能的动态变化,检测导致耐药性癫痫的重要免疫亚群和调控网络 儿童耐药性癫痫患者、药物有效患者和健康对照者的外周血单核细胞 机器学习 癫痫 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3例耐药性癫痫患者,2例药物有效患者,2例健康对照者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
783 2026-05-31
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-May-28, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究利用foxp3a缺陷斑马鱼模型,揭示了foxp3a在肠道-肝脏-性腺轴中性别特异性免疫-代谢重塑中的作用 首次在斑马鱼中鉴定foxp3a为哺乳动物FOXP3的功能同源物,并通过多组学分析揭示了性别依赖性免疫-代谢协调机制 斑马鱼与哺乳动物免疫系统的差异可能限制结果直接外推至人类,且未深入探讨微生物群变化的因果关系 探究foxp3a在性别差异黏膜免疫调节中的作用及其对肠道-肝脏-性腺轴免疫-代谢协调的影响 foxp3a缺陷斑马鱼模型及其肠道、肝脏、性腺组织 机器学习和数字病理学中的多组学分析 NA 单细胞RNA测序、转录组分析、多组学整合分析 NA 基因表达数据、微生物组数据 不同性别和年龄的foxp3a缺陷斑马鱼及其野生型对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
784 2026-05-31
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-May-28, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了生物钟紊乱通过TREM2+巨噬细胞加剧牙周炎的机制 首次发现生物钟调控因子BMAL1通过节律性结合TREM2启动子调控其表达,生物钟紊乱导致TREM2持续过表达并驱动牙周骨吸收 基于小鼠模型,结论需在人源样本中验证;具体信号通路下游机制尚不明确 探究生物钟紊乱加重牙周炎中巨噬细胞介导的骨吸收机制 小鼠牙周组织及巨噬细胞亚群 机器学习 牙周炎 单细胞RNA测序,CUT&Tag测序 NA 基因表达数据 CRD加重牙周炎小鼠模型的牙龈组织样本 NA 单细胞RNA测序,CUT&Tag测序 NA NA
785 2026-05-31
Hypoxia Drives ANGPTL4 Expression in Tumor-Associated Macrophages and Promotes Intrahepatic Cholangiocarcinoma Intrahepatic Metastasis
2026-May-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和多组学分析,揭示了缺氧驱动的肿瘤相关巨噬细胞中ANGPTL4表达促进肝内胆管癌肝内转移的机制 首次发现缺氧通过CEBPB转录因子激活肿瘤相关巨噬细胞中ANGPTL4表达,并通过Integrin α5β1/FAK/Src/GSK3β/β-catenin信号通路促进肝内胆管癌细胞上皮-间充质转化和转移 研究样本量有限(15例iCCA样本),且未详细说明ANGPTL4阻断剂的具体类型和安全性评估 阐明肝内胆管癌肝内转移的肿瘤微环境驱动机制 肝内胆管癌肿瘤相关巨噬细胞和恶性上皮细胞 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 15例肝内胆管癌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
786 2026-05-31
Immune cell imaging in the glioma microenvironment
2026-May-27, Brain research IF:2.7Q3
综述 综述了胶质瘤微环境中免疫细胞的成像技术进展及其在诊断和免疫治疗中的应用潜力 整合了多模态成像、放射性示踪剂及空间转录组学等方法,系统描绘了胶质瘤微环境中免疫细胞的分布与功能状态,并为个性化治疗策略提供了新途径 血脑屏障通透性、示踪剂特异性以及监管障碍仍是主要挑战 探讨免疫细胞成像在胶质瘤微环境中的现状及未来发展方向,以增强诊断、指导免疫治疗并改善患者预后 胶质瘤微环境中的免疫细胞(肿瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞、T细胞等)及其成像靶点 数字病理学 胶质瘤 磁共振成像、正电子发射断层扫描、光学成像、放射性示踪剂 NA 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
787 2026-05-31
Spatial multi-omics reveals region-specific redox dysregulation in chronic aristolochic acid I-induced nephrotoxicity
2026-May-27, Free radical biology & medicine
研究论文 整合空间代谢组学、空间转录组学和区域定量分析,揭示慢性马兜铃酸I暴露引起的肾脏区域特异性氧化还原失调 首次建立慢性AAN大鼠模型,结合空间代谢组学、空间转录组学与区域LC-MS/MS定量分析,阐明毒物累积与代谢功能障碍的空间关联 未提及 阐明慢性马兜铃酸I暴露引起的区域特异性代谢功能障碍及其与毒物累积的空间关系 慢性马兜铃酸肾病大鼠模型 数字病理学 肾病 空间代谢组学、空间转录组学、AFADESI-MSI、LC-MS/MS NA 代谢组学数据、转录组学数据 慢性AAN大鼠模型,12周口服AAI(1和10 mg/kg/天) NA 空间代谢组学、空间转录组学 AFADESI-MSI AFADESI-MSI用于空间代谢组学分析
788 2026-05-31
Time-Dependent Gene Expression Patterns in Epidermal Wound Healing: Mechanistic Insights into Cayratia japonica Hydrogel Intervention After Anal Fistula Surgery
2026-May-27, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过开发优化的Cayratia japonica水凝胶并整合多组学分析,揭示了其在肛瘘术后皮肤伤口愈合中的时间依赖性基因表达模式及分子机制 首次结合时间序列多组学分析、临床随机对照试验和体外实验,系统阐明了C. japonica水凝胶通过Luteolin 7-glucuronide靶向BMP4蛋白促进成纤维细胞增殖的阶段特异性修复机制 未明确提及限制 开发优化的C. japonica水凝胶并通过多组学整合分析阐明其在皮肤伤口愈合中的分子机制 C. japonica水凝胶、肛瘘术后患者、体外成纤维细胞、公共转录组数据集 数字病理学 肛瘘 RNA-seq, 单细胞RNA测序, UPLC-ESI-Q-TOF-MS/MS, GNPS, 分子对接 加权基因共表达网络分析, 时间序列聚类 基因表达数据, 质谱数据, 临床数据 81例患者(临床随机对照试验),公共数据集(GSE28914, GSE241132) Illumina RNA-seq, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
789 2026-05-31
Single cell sequencing in acute myeloid leukemia: Linking genotype to functional phenotype for precision risk stratification and treatment decisions
2026-May-27, Human pathology IF:2.7Q2
综述 本文综述了单细胞测序技术在急性髓系白血病中的应用,探讨其如何将基因型与功能表型联系起来,以实现精准风险分层和治疗决策 系统总结了单细胞多组学技术在解析AML克隆复杂性、区分残留白血病与克隆性造血方面的最新进展,并展望了空间单细胞技术对骨髓微环境研究的影响 未明确提及该领域当前的技术成本、数据整合复杂性及临床转化中的实际障碍 探讨单细胞测序技术如何改善AML的风险分层和治疗决策 急性髓系白血病(AML)的细胞、血液及骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞测序 NA 基因组、转录组、蛋白质组、表观基因组、代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
790 2026-05-31
SLC39A1 promotes pancreatic cancer metastasis by elevating intracellular zinc and activating the Src/FAK signaling pathway
2026-May-27, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 该研究揭示了SLC39A1通过升高细胞内锌离子水平并激活Src/FAK信号通路促进胰腺癌转移的机制 首次通过单细胞RNA测序分析发现SLC39A1在胰腺癌转移中显著富集,并阐明其通过锌离子调控Src/FAK通路促进转移的新机制 未明确SLC39A1调控锌离子的具体分子机制,且体内实验仅采用小鼠模型,缺乏临床样本验证 探究锌离子稳态及其调控蛋白在胰腺癌转移中的作用和机制 胰腺癌原发灶与转移灶的单细胞转录组数据、胰腺癌细胞系及小鼠模型 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组化、Western blot、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验、3D细胞球形成实验 NA 单细胞转录组数据 从GEO数据库下载胰腺癌原发及转移样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA GEO数据库单细胞RNA测序数据
791 2026-05-31
Asiaticoside alleviates mesothelial cell senescence and peritoneal fibrosis by targeting macrophage-mesothelial communication in single-cell peritoneal landscape
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示积雪草苷通过调控巨噬细胞-间皮细胞通讯缓解间皮细胞衰老和腹膜纤维化的机制 首次在单细胞水平解析腹膜纤维化微环境中的细胞组成和细胞间通讯网络,并阐明积雪草苷通过IGF1信号通路抑制间皮细胞衰老的抗纤维化新机制 未提及在人类样本中的验证,也未探讨长期治疗的安全性 研究腹膜纤维化进展中腹膜细胞成分及其相互作用的变化,探索积雪草苷对抗腹膜纤维化的药理作用和潜在机制 小鼠腹膜纤维化模型及高糖腹膜透析液诱导的腹膜样本 数字病理学 腹膜纤维化、慢性肾病 单细胞RNA测序 无特定模型 基因表达数据 57,032个单细胞,分为7种细胞类型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序
792 2026-05-31
Integrative single-cell analysis reveals Bu-Shen-Huo-Xue Formula rescues iron-overloaded ovarian function via rewiring IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10-driven immune-stromal interactions and BNIP3-mediated mitophagy in endometriosis
2026-May-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 通过整合单细胞分析揭示补肾活血方通过重编程IFN-γ/JAK/STAT/CXCL10驱动的免疫-基质相互作用和BNIP3介导的线粒体自噬,挽救子宫内膜异位症中铁超载的卵巢功能 首次利用整合单细胞RNA测序和Stereo-seq技术,从单细胞分辨率阐明补肾活血方通过双重机制——抑制铁超载诱导的免疫-纤维化微环境及恢复BNIP3-PINK1/Parkin依赖性线粒体自噬——改善卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕症 未在人类样本中验证BNIP3靶向作用及毛蕊异黄酮苷的治疗潜力,缺乏长期生殖结局的随访数据,且未探讨其他潜在活性成分的协同效应 确定补肾活血方如何减轻卵巢子宫内膜异位症相关卵巢损伤和不孕,并识别关键生物活性成分及分子靶点 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, Stereo-seq, 血清药化学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 卵巢子宫内膜异位症小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
793 2026-05-31
Single-cell RNA sequencing reveals cadmium-induced cell-type-specific mechanisms of developmental neurotoxicity in human cortical organoids
2026-May-22, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示镉在人类皮层类器官中诱导细胞类型特异性发育神经毒性的机制 首次在人类皮层类器官模型中利用单细胞RNA测序技术揭示镉暴露引起细胞周期阻滞、锌铜离子稳态失调及抑制性神经元丢失的细胞类型特异性机制 未提供明确局限性信息 评估镉诱导的细胞类型特异性发育神经毒性并阐明分子机制 人类皮层类器官及其中神经细胞(如增殖神经细胞、星形胶质细胞) 单细胞转录组学 发育神经毒性 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 人类皮层类器官样本(未具体说明数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
794 2026-05-31
Functional Heterogeneity of Hepatitis B Virus-Specific CD8+ T Cells Mediates the Clinical Outcomes of Infection
2026-May-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究探讨乙型肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的功能异质性如何介导病毒感染的不同临床结局 首次通过单细胞测序和功能分析将HBV特异性CD8+ T细胞细分为IFNγ+、mTGFβ+和双阴性三个功能亚群,并发现其比例与临床结局密切相关 未提及具体限制,但样本量可能有限且仅针对HBV核心18-27表位 阐明HBV特异性CD8+ T细胞是功能耗竭还是源于初始T细胞库的不完全应答,并探索与临床结局的关系 乙型肝炎病毒特异性CD8+ T细胞及其功能亚群 免疫学 乙型病毒性肝炎 单细胞测序 NA 单细胞转录组和TCR序列数据 包含急性HBV感染已恢复者、非活动性HBV携带者和病毒免疫耐受患者 NA 单细胞测序 NA NA
795 2026-05-31
Macrophage-derived SPP1 promotes subretinal fibrosis by YAP1 phase separation in retinal pigment epithelium
2026-May-19, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 研究巨噬细胞来源的SPP1通过YAP1相分离促进视网膜色素上皮下纤维化的机制 首次发现YAP1-2α的液-液相分离驱动RPE细胞纤维化,揭示了SPP1/CD44/RhoA通路在脉络膜新生血管向纤维化转化中的新机制 未提及明确的研究局限性 探究新生血管性年龄相关性黄斑变性中视网膜下纤维化的病理机制 小鼠巨噬细胞、视网膜色素上皮细胞、激光诱导的CNV和SRF模型 机器学习 老年病 RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq, Co-IP, Western blotting, 荧光恢复光漂白 NA RNA-seq数据、单细胞转录组数据、ATAC-seq数据、图像数据 小鼠巨噬细胞(酸性缺氧条件下琥珀酸盐或乳酸处理)、CNV和SRF模型小鼠 Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq Illumina NovaSeq NA
796 2026-05-31
Single-Cell and Integrative Analyses Uncover Therapeutic Potential of RFX1-Mediated Cuproptosis in PitNETs
2026-May-12, Journal of integrative neuroscience IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞和整合分析揭示RFX1介导的铜死亡在垂体神经内分泌肿瘤中的治疗潜力 首次利用单细胞测序和机器学习方法系统分析铜死亡在PitNETs中的作用,并鉴定RFX1为通过铜死亡抑制肿瘤进展的关键调节因子 未提及明显的局限性 探讨铜死亡在PitNETs中的分子机制及其临床相关性 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs) 机器学习, 数字病理学 垂体神经内分泌肿瘤 单细胞测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 随机森林 随机森林 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
797 2026-05-31
Exploration of the Role of M2 Macrophages in Hepatocellular Carcinoma: Insights into Disulfidptosis and Cellular Interactions
2026-May-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 在单细胞分辨率下系统阐明二硫下垂与肝细胞癌免疫微环境的关系 首次在单细胞水平揭示二硫下垂相关肝癌亚型及其与M2巨噬细胞的双向通讯网络,并发现GPX4-RAC1轴连接二硫下垂与铁死亡 未提及具体局限性 系统阐明二硫下垂与肝细胞癌免疫微环境的关系 肝细胞癌患者肿瘤样本及TCGA队列数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,多组学分析,多重免疫荧光 非负矩阵分解 基因表达数据,单细胞转录组数据,蛋白质共定位数据 TCGA队列315例,21例肝细胞癌单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA测序,多组学 NA NA
798 2026-05-31
Spatially Resolved Microglial State Transitions Govern Strain-Specific Zika Neuropathogenesis
2026-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过整合高分辨率空间转录组学与感染感知细胞类型分析,构建寨卡病毒感染小鼠大脑的时空图谱,揭示小胶质细胞状态转变驱动毒株特异性神经发病机制 首次结合空间转录组学和感染感知细胞分型,在时空维度上对比亚洲和非洲ZIKV毒株的差异,发现毒株特异性小胶质细胞状态转化(如疾病相关小胶质细胞DAM)是感染控制的关键,并阐明Apoe-Trem2信号通路在其中的调控作用 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类感染过程;未深入探讨小胶质细胞状态转变的上下游分子机制;样本量及时间点有限,可能遗漏其他关键细胞类型或信号通路 探究神经性病毒感染如何通过空间、时间和细胞类型间的相互作用影响疾病严重程度,特别是病毒毒株差异如何塑造神经发病机制 寨卡病毒亚洲株和非洲株感染的小鼠大脑 空间转录组学 寨卡病毒感染相关神经疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据(空间转录组)、组织图像 小鼠脑组织样本(多个感染阶段及毒株条件) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台用于捕获小鼠脑组织切片中的mRNA
799 2026-05-31
REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 介绍REACTOR,一种用于检测单细胞RNA测序数据中转录调控因子及其靶基因(调控子)差异活性的计算工具 通过引入稳健的统计检验来检测不同条件(如疾病与对照)下调控子的差异活性,且支持多个重复样本,扩展了现有的调控子分析框架 未明确说明局限性,可能依赖于单细胞数据质量 开发一种计算工具,用于分析单细胞RNA测序数据中转录调控子的差异活性 单细胞RNA测序数据中的转录调控因子及其靶基因(调控子) 机器学习 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 使用公开可用的COVID-19数据集 NA 单细胞转录组学 NA NA
800 2026-05-31
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-May, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 开发了一个名为mosna的Python包,用于分析空间组学数据并整合临床数据,以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的不同细胞互作类型 mosna兼容所有空间组学技术,提供从特征计算到机器学习模型训练的完整分析流程,并能无缝整合临床数据(如治疗反应和生存数据),首次在空间组学分析中系统评估细胞生态位对免疫治疗响应的预测能力 主要依赖空间网络构建的质量,对大规模数据计算资源需求较高,且部分算法性能仅在少数数据集上验证 开发一个易于使用的空间组学分析工具,整合临床数据以识别与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞互作模式 空间蛋白质组和空间转录组数据集中的细胞相互作用模式及组织结构 数字病理学 癌症 空间转录组学, 空间蛋白质组学, MERFISH, seqFISH, Xenium, CODEX, MIBI-TOF, 低多重免疫荧光 机器学习模型 空间组学数据(含图像和表达数据) 三个数据集:两个空间蛋白质组数据集和一个空间转录组数据集 10x Genomics 空间转录组学, 空间蛋白质组学 10x Visium 10x Visium(用于空间转录组);MERFISH, seqFISH, Xenium(亚细胞分辨率转录组);CODEX, MIBI-TOF(蛋白质组);Slide-seq, Stereo-seq(基于点的空间转录组)
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