单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 34772 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-12-22 |
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-Dec-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07365-7
PMID:41408564
|
研究论文 | 本研究聚焦于机械力相关基因，对特发性肺纤维化进行分子分型与预后评估 | 首次将机械力相关基因评分应用于IPF，识别出与机械力相关的核心基因和分子亚型，并通过单细胞RNA测序和CMap分析揭示了潜在的致病机制与治疗靶点 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列验证核心基因的预后价值 | 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用，并进行分子分型与预后评估 | 特发性肺纤维化患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，机器学习算法，Cox回归分析，Connectivity Map分析 | 机器学习算法，Cox回归模型，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，临床病理数据 | IPF样本与对照样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-12-22 |
Revealing the anti-tumor mechanisms of aromatic oil from Amomum villosum through integrated network pharmacology, bioinformatics, machine learning, single-cell sequencing, and cell experiments
2025-Dec-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153153
PMID:41421224
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学、机器学习、单细胞测序和细胞实验，揭示了砂仁芳香油的抗肿瘤机制，特别是其通过HMOX1靶点抑制胃癌的作用 | 首次采用整合方法（包括响应面设计、GC-MS驱动的网络药理学、机器学习、单细胞测序及分子对接）系统解析砂仁芳香油及其主要化合物乙酸龙脑酯的抗胃癌分子机制，并确定HMOX1为关键免疫调节靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟，缺乏体内动物模型验证；单细胞测序数据可能来自公共数据集，样本来源和数量未明确说明 | 探究砂仁芳香油及其活性成分的抗胃癌潜力与分子机制 | 砂仁（Amomum villosum）的芳香油、其化合物（如乙酸龙脑酯）、胃癌细胞系（HGC27和AGS）及HMOX1靶点 | 机器学习 | 胃癌 | 气相色谱-质谱联用、转录组学、单细胞测序、分子对接、动力学模拟 | 机器学习算法（具体类型未指定） | 化学化合物数据、转录组数据、单细胞测序数据、临床相关性数据 | 涉及HGC27和AGS胃癌细胞系，但具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 783 | 2025-12-22 |
Dynamic release of extracellular particles after opening of the blood-brain barrier predicts glioblastoma susceptibility to paclitaxel
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65681-4
PMID:41402297
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于捕获胶质母细胞瘤患者循环细胞外囊泡和颗粒的微流控装置，并发现血脑屏障打开后这些颗粒的释放动态可预测患者对紫杉醇的治疗反应 | 首次将血脑屏障开放与循环细胞外颗粒释放动态相结合，作为预测胶质母细胞瘤对紫杉醇治疗反应的实时生物标志物，并开发了专用的ExoChip微流控捕获平台 | 研究为探索性临床试验的次要目标，样本量有限，未来需要前瞻性验证 | 探索血脑屏障开放后循环细胞外颗粒作为胶质母细胞瘤治疗反应生物标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 微流控技术、纳米颗粒跟踪分析、蛋白质组学、Western blot、扫描电子显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、影像数据 | 一期临床试验患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 784 | 2025-12-22 |
Cellular and molecular determinants of lymph node metastasis in papillary thyroid carcinoma: Integrated multi-omics profiling and machine learning models
2025-Dec-15, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大块转录组数据，系统解析了甲状腺乳头状癌淋巴结转移的细胞与分子决定因素，并构建了基于随机森林的预测模型 | 首次整合多组学数据揭示PTC淋巴结转移的免疫微环境特征、恶性细胞发育轨迹及FN1-SDC4轴的关键调控作用，并开发了17个关键基因的预测签名 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内模型验证；样本量可能有限；临床转化潜力需进一步评估 | 阐明甲状腺乳头状癌淋巴结转移的机制并开发预测工具 | 甲状腺乳头状癌的原发灶和转移灶组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 大块转录组测序 | 随机森林 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 大块转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 大块RNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2025-12-22 |
Aspartame promotes ovarian cancer progression: A multi-omics study integrating mendelian randomization, network toxicology, and in vitro validation
2025-Dec-12, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2025.115901
PMID:41391619
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法探究了人工甜味剂阿斯巴甜与卵巢癌之间的因果关系及其潜在机制 | 首次整合孟德尔随机化、网络毒理学、机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林）、分子对接模拟及体外实验，系统揭示了阿斯巴甜通过上调AURKA、CCND1和RAD51等关键基因表达促进卵巢癌进展的潜在机制 | 研究主要基于观察性数据和体外实验，因果关系的确立仍需更多前瞻性队列研究和体内实验验证 | 探究人工甜味剂阿斯巴甜与卵巢癌之间的因果关系及其分子机制 | 卵巢癌（OC） | 机器学习 | 卵巢癌 | 孟德尔随机化分析、网络毒理学、机器学习算法（LASSO、SVM、随机森林）、分子对接模拟、体外细胞实验 | LASSO、SVM、随机森林 | 多组学数据（包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据） | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2025-12-22 |
Emerging technologies in poultry genomics: Unlocking innovation for the future of sustainable production
2025-Dec-10, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106240
PMID:41421305
|
综述 | 本文综述了家禽基因组学领域新兴的技术与工具，旨在推动可持续家禽生产 | 强调了从统计关联转向生物学因果关系和育种应用的新兴工具，包括功能注释、CRISPR编辑、单细胞RNA测序和多组学整合框架 | 仍面临统计效力、组织与发育阶段特异性背景以及将发现转化为基因组预测的挑战 | 推动可持续家禽生产，通过基因组学工具提高生产效率、抗逆性和动物福利 | 家禽（鸡） | 基因组学 | NA | CRISPR编辑，单细胞RNA测序，多组学整合（基因组学、转录组学、表观基因组学、3D染色质数据） | NA | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据，3D染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 787 | 2025-12-22 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中与年龄相关的免疫动态变化 | 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，纵向追踪96名成年人两年，首次系统描绘了年龄相关的T细胞转录重编程及其功能影响 | 研究主要关注外周血免疫细胞，未涉及组织特异性免疫变化；样本量虽大但年龄范围有限（25-90岁），且仅针对流感疫苗响应 | 探究健康成年人免疫系统随年龄变化的动态过程及其机制 | 300多名健康成年人（25-90岁）的外周血单个核细胞，重点关注T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，其中96人进行为期两年的纵向追踪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 788 | 2025-12-22 |
Anti-progestin therapy targets hallmarks of breast cancer risk
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09684-7
PMID:41193807
|
研究论文 | 本研究评估了抗孕激素药物醋酸乌利司他通过12周治疗，对24名绝经前女性乳腺癌风险标志物的影响，发现其能减少上皮增殖、基质重塑和管腔祖细胞活性 | 首次在临床试验中结合多层组学、活细胞方法、临床成像和组织微力学，揭示抗孕激素治疗通过胶原VI重塑和SOX9管腔祖细胞定位关联，抑制乳腺癌风险 | 样本量较小（仅24名绝经前女性），治疗周期较短（12周），且为早期阶段试验，长期效果和安全性需进一步验证 | 评估抗孕激素疗法是否通过减少乳腺癌风险标志物，实现绝经前乳腺癌的预防 | 24名绝经前女性乳腺癌风险患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、组织学、原子力显微镜、MRI成像 | NA | 组学数据、图像、微力学数据 | 24名绝经前女性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 789 | 2025-12-22 |
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0453OC
PMID:40540688
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者支气管上皮细胞中细胞衰老的机制，并探讨了IFN通路在其中的作用 | 首次在COPD中结合单细胞RNA测序技术，系统分析了支气管上皮细胞亚型中的衰老标记分布，并发现I/II型干扰素介导的衰老表型，以及JAK-STAT和cGAS-STING通路抑制剂对衰老的缓解作用 | 研究样本量有限，且主要基于体外培养细胞和组织学分析，未涉及长期体内干预效果验证 | 阐明COPD中支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 | COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞及肺组织 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织学图像 | COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 790 | 2025-12-22 |
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013810
PMID:41397026
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架，通过细胞-基因注意力模块整合细胞外部相互作用与内部基因调控，用于从空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 | 开发了细胞-基因注意力模块，将细胞环境与内部基因活动在统一表示中连接，克服了现有方法将两者分离处理的限制 | 未明确提及 | 从空间转录组数据中准确推断细胞间相互作用网络 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 多视图图自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 791 | 2025-12-22 |
Hypoxia-induced secretory autophagy in cancer-associated fibroblasts promotes ECM remodelling through serglycin secretion in oral squamous cell carcinoma
2025-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70556
PMID:41410182
|
研究论文 | 本研究揭示了口腔鳞状细胞癌中，缺氧通过诱导癌症相关成纤维细胞（CAFs）以分泌性自噬途径分泌serglycin（SRGN），从而驱动细胞外基质重塑并促进肿瘤侵袭的新机制 | 首次发现缺氧条件下CAFs通过非常规的分泌性自噬途径分泌SRGN，并阐明SRGN与MMP2/9相互作用驱动细胞外基质重塑，这为高侵袭性WPOI的组织学表现提供了分子机制解释 | 研究样本量较小（6个OSCC样本），且主要基于体外和动物模型，其临床转化价值仍需进一步验证 | 探究口腔鳞状细胞癌中最差侵袭模式（WPOI）的潜在分子机制，特别是缺氧微环境中CAFs分泌SRGN的调控及其在肿瘤进展中的作用 | 口腔鳞状细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞、serglycin蛋白、细胞外基质 | 单细胞组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，Western blot，qRT-PCR，免疫荧光，CRISPR-Cas9敲除，Co-IP，异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，图像数据 | 6个口腔鳞状细胞癌样本（WPOI 1-3和4-5各3个） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 792 | 2025-12-22 |
Identification of intestinal enteroendocrine cell subtypes and their associated hormones in zebrafish
2025-Dec, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003522
PMID:41411332
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱分析，鉴定了斑马鱼肠道内分泌细胞的亚型及其相关激素，并揭示了其分化机制 | 首次在斑马鱼中系统鉴定肠道内分泌细胞亚型，发现神经生成素3（neurog3）和胃饥饿素阳性细胞作为不同亚型的前体细胞，并识别出新的斑马鱼分泌素同源物 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物，且神经生成素3在斑马鱼中的作用与哺乳动物存在差异 | 探究斑马鱼肠道内分泌细胞亚型的分化、激素产生及其发育生物学机制 | 斑马鱼的肠道内分泌细胞及其亚型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | RNA测序数据, 质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2025-12-22 |
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2025-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686400
PMID:41280052
|
研究论文 | 本研究首次证明，通过吸烟或鼻吸方式摄入可卡因的个体，其口腔微生物群失调，并存在选择性口腔-血液微生物易位 | 首次在人体中证实可卡因使用障碍（COC）患者存在口腔微生物群失调及选择性口腔-血液微生物易位，并揭示了相关免疫激活机制 | 样本量较小（10名COC患者，24名对照），为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究可卡因使用障碍是否导致口腔成为循环微生物DNA易位的来源，并阐明其与免疫激活的关系 | 可卡因使用障碍（COC）患者及人口统计学匹配的非药物使用对照者 | 微生物组学与免疫学 | 物质使用障碍（可卡因使用障碍） | 16S rRNA V4区测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 微生物DNA序列数据，单细胞基因表达数据 | 10名可卡因使用障碍患者，24名对照者，均提供配对唾液和血液样本 | NA | 16S rRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 794 | 2025-12-22 |
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689845
PMID:41332587
|
研究论文 | 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember，用于分析单细胞RNA测序数据，并应用于小鼠和人类数据集 | 基于公理化方法定义了基因特异性测量的四个关键属性，并开发了唯一满足这些属性的ember方法 | 未明确讨论方法在复杂生物系统或大规模数据集中的计算效率或可扩展性限制 | 识别单细胞基因组学数据中基因对生物类别或实验条件的特异性 | 小鼠八个组织的基因表达数据及人类PBMC样本 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 八个小鼠组织及255名个体的人类PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 795 | 2025-12-22 |
Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.688607
PMID:41332620
|
研究论文 | 本文介绍了一个基于Bioconductor在R中用于空间转录组学数据分析的开源在线书籍，包含可复现的代码示例、数据集和工作流讨论 | 提供了一个自由访问、开源、持续更新和测试的在线资源，整合了空间组学数据分析的多步骤工作流，并支持与Python的互操作性 | NA | 简化和标准化空间转录组学数据的分析流程，促进可复现性研究 | 空间转录组学数据及其分析工作流 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 796 | 2025-12-22 |
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.11.18.25340286
PMID:41332840
|
研究论文 | 本研究探讨了血清降钙素原（PCT）作为纤维板层肝细胞癌（FLC）新型肿瘤生物标志物在诊断和治疗监测中的潜在作用 | 首次发现并验证了PCT在FLC患者血清和肿瘤组织中特异性高表达，可作为区分FLC与其他原发性肝癌的敏感且特异的生物标志物 | 样本量相对较小（18例FLC患者），且研究为观察性研究，需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 | 评估PCT作为FLC诊断和随访生物标志物的潜力 | 纤维板层肝细胞癌（FLC）患者、肝细胞癌（HCC）患者、胆管癌（CCA）患者、肝硬化患者及相关肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 血清样本、肿瘤组织样本 | 34份血清样本（来自18例FLC患者）、64例HCC患者、24例CCA患者、20例肝硬化患者；27例FLC肿瘤组织、331例HCC肿瘤组织、39例CCA肿瘤组织等 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 797 | 2025-12-22 |
Insights into the relevance of targeting fibroblasts to control cancer
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102395
PMID:41187743
|
综述 | 本文总结并讨论了以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的新进展，并探讨了其异质性对未来治疗策略的影响 | 探讨了利用单细胞RNA测序等高通量技术结合AI平台解析CAF异质性，并前瞻性地讨论了针对CAF复杂起源的个性化治疗需求 | NA | 探讨靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞以控制癌症的潜力和策略 | 癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 798 | 2025-12-22 |
Virus envelope glycoprotein targeting bispecific T cell engager protects mice from lethal severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102458
PMID:41260206
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术数据，揭示了T细胞缺陷与功能障碍在严重发热伴血小板减少综合征（SFTS）致死病例中的关键作用，并设计了一种靶向病毒包膜糖蛋白的双特异性T细胞衔接器（BiTE）抗体，在小鼠模型中有效治疗了致命的SFTSV感染 | 首次利用单细胞RNA测序和流式细胞术数据，系统分析了SFTS患者中T细胞（特别是CD4 T细胞）的细胞毒性受损和耗竭状态与致死后果的关联，并创新性地设计了靶向SFTSV包膜糖蛋白Gn的BiTE抗体，成功在小鼠模型中实现了对致命感染的救援 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行临床试验，且BiTE抗体的长期安全性和有效性需进一步评估 | 开发针对SFTSV的有效治疗干预措施，通过增强T细胞介导的免疫反应来消除病毒感染细胞 | SFTS患者和小鼠模型中的T细胞（特别是CD4和CD8 T细胞）以及SFTSV感染的细胞 | 免疫学与传染病学 | 严重发热伴血小板减少综合征（SFTS） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2025-12-22 |
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.584829
PMID:41332518
|
研究论文 | 本文研究了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何通过髓系细胞-肿瘤相互作用促进肿瘤生长 | 首次将肿瘤糖基化（Tn糖抗原）与CD301b凝集素信号传导联系起来，揭示了CD301b在调节乳腺癌免疫微环境中的关键作用，并指出其作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，缺乏直接的功能验证；未探讨CD301b在其他癌症类型中的普适性 | 探究糖基化-凝集素相互作用在乳腺癌进展中的具体机制，并识别潜在的免疫治疗靶点 | 小鼠三阴性乳腺癌模型和人类乳腺癌样本中的免疫细胞（特别是CD301b/CLEC10A表达的髓系细胞） | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，表型分析 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 800 | 2025-12-22 |
Genetic Convergence Analysis of CRISPR Perturbations Deciphers Gene Functional Similarity
2025-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.13.688060
PMID:41292726
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为XConTest的两步交叉验证方法，用于评估CRISPR扰动之间的遗传收敛性，以量化基因功能相似性 | 提出了一种统计方法来量化CRISPR扰动之间的相似性，解决了现有方法大多启发式的问题，通过近似标准正态的检验统计量评估扰动对细胞表达谱的正交影响 | 未明确提及具体样本量或实验平台细节，可能依赖于现有数据集 | 开发统计方法以量化CRISPR扰动之间的遗传收敛性，从而解读基因功能相似性 | CRISPR扰动、基因功能相似性、下游基因表达 | 机器学习 | 自闭症、免疫相关疾病 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序（Perturb-seq） | 统计检验方法（XConTest） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |