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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-07-03 |
Dietary carboxymethylcellulose metabolite promotes heart allograft rejection through induction of proinflammatory macrophages via lysophosphatidic acid
2026-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.02.030
PMID:41780895
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研究论文 | 研究发现膳食羧甲基纤维素通过诱导促炎巨噬细胞促进心脏移植排斥反应,其机制涉及肠道菌群代谢物溶血磷脂酸 | 首次揭示食品添加剂羧甲基纤维素通过肠道菌群代谢物溶血磷脂酸激活巨噬细胞糖酵解途径,促进心脏移植排斥反应,并发现LPA受体6作为潜在治疗靶点 | 研究仅在动物模型和患者样本中验证,未进行大规模临床试验;未完全阐明肠道菌群变化的具体菌种及代谢通路 | 探究常见食品乳化剂羧甲基纤维素对移植免疫的影响及其分子机制 | 小鼠心脏移植模型及移植排斥患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 质谱分析, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及移植排斥患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析移植排斥患者样本 |
| 782 | 2026-07-03 |
Selective impact on regulatory T cells with sustained functional phenotypes by the interleukin-2 mutein VIS171 in a nonhuman primate model
2026-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.03.007
PMID:41850490
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研究论文 | 在非人灵长类模型中,白介素-2突变体VIS171通过选择性扩增调节性T细胞并保持其功能性表型的影响 | 首次在非人灵长类模型中评估了经工程改造延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Treg细胞选择性结合和扩增能力的VIS171的效果,并通过单细胞RNA测序揭示了不同的Treg亚群及其转录组特征 | 未提及 | 评估VIS171在非人灵长类中免疫细胞群体的效应,重点研究其选择性扩增Treg细胞的能力及扩增过程中的表型变化 | 非人灵长类(猕猴)的免疫细胞群体 | 机器学习 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 783 | 2026-07-03 |
Seamless vessel-microenvironment bioprinting reveals contact-dependent vascular communications
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.02.003
PMID:41856805
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研究论文 | 开发了一种无界面血管-微环境生物打印系统,用于研究接触依赖性血管通讯 | 首次利用纳米改性胶原构建共质生物墨水-支撑浴系统,实现无界面、仿生细胞外基质连续性的血管-间质建模 | 未提及具体限制 | 研究血管与微环境之间的接触依赖性通讯机制 | 血管-间质相互作用(再生模型和病理肿瘤模型) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 生物打印模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于细胞间通讯分析 |
| 784 | 2026-07-03 |
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Jul-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.023
PMID:41895269
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研究论文 | 通过Ptpn6缺失揭示小胶质细胞介导的对阿尔茨海默病病理的保护作用及对白质的有害影响 | 首次利用全基因组CRISPR筛选鉴定Ptpn6为小胶质细胞存活的关键调节因子,并发现其缺失在阿尔茨海默病模型中既有保护作用(减少淀粉样斑块周围的神经突营养不良)又有有害影响(破坏白质稳态并加剧神经退行性变),揭示了基因剂量敏感性 | 主要基于小鼠模型(TauPS2APP模型)和原代巨噬细胞实验,其结果向人类的转化尚需验证 | 探索调控小胶质细胞相关信号通路的关键因子,并评估其在阿尔茨海默病中的作用 | 小胶质细胞(通过Ptpn6缺失操作) | 机器学习(可能用于CRISPR筛选数据分析) | 阿尔茨海默病 | CRISPR筛选 (全基因组), 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 (scRNA-seq), 图像数据 (CRISPR筛选) | 小鼠原代巨噬细胞(具体数量未提及);小鼠模型(TauPS2APP,具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2026-07-03 |
Circuit and molecular mechanisms underlying incubation of methamphetamine craving in the prelimbic cortex
2026-Jul-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.017
PMID:41895270
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研究论文 | 研究揭示了前边缘皮层中SST和PV中间神经元在甲基苯丙胺渴望孵化中的时间与回路特异性机制 | 首次阐明PL中SST和PV中间神经元在METH渴望孵化中的时间依赖性差异作用,并发现了KCNC2作为潜在治疗靶点 | 未提供明确的局限性信息 | 探究甲基苯丙胺渴望孵化的神经回路和分子机制 | 大鼠前边缘皮层中的SST和PV中间神经元 | 神经科学 | 甲基苯丙胺使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2026-07-03 |
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Jul-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.032
PMID:41918165
|
研究论文 | 探讨过表达α-1抗胰蛋白酶的间充质基质细胞通过促进调节性T细胞相互作用逆转糖尿病自身免疫机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面解析AAT-MSCs通过增强Treg介导的细胞间通讯来重塑胰腺淋巴结和胰岛的免疫微环境 | 仅使用雌性非肥胖糖尿病小鼠模型,未在人类临床样本中验证 | 阐明过表达α-1抗胰蛋白酶的间充质基质细胞调节免疫反应的分子机制 | 非肥胖糖尿病小鼠的CD4和CD8 T细胞、胰腺淋巴结和胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、CellChat分析 | NA | 基因表达数据 | 50%以上新发糖尿病雌性非肥胖糖尿病小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 787 | 2026-07-03 |
The phosphatase DUSP2 constrains lymphoid remodeling and immunotherapy response in lung squamous carcinoma
2026-Jul-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.03.022
PMID:41883167
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺鳞癌患者ICB治疗前后的样本,揭示DUSP2磷酸酶通过IFN-I-DUSP2-NFAT轴限制淋巴组织重塑和免疫治疗效果 | 首次发现DUSP2磷酸酶在肺鳞癌免疫治疗中通过调控NFAT去磷酸化促进T细胞耗竭并抑制Tfh分化,揭示了IFN-I-DUSP2-NFAT轴限制免疫治疗疗效的新机制 | 研究样本量有限,且主要基于小鼠模型验证,临床适用性需进一步验证 | 阐明肺鳞癌中免疫检查点阻断治疗耐受的分子机制 | 肺鳞状细胞癌患者肿瘤组织样本及小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肺鳞癌患者ICB治疗前后的肿瘤样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 788 | 2026-07-03 |
Imputing causality and clonal dynamics from single-cell transcriptomics in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
2026-Jul, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02914-5
PMID:42020783
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析阵发性睡眠性血红蛋白尿症(PNH)中的因果关系和克隆动态 | 首次通过单细胞RNA测序比较不同PNH细胞比例患者的骨髓细胞转录特征,揭示免疫负选择在PNH克隆扩增中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明阵发性睡眠性血红蛋白尿症中PIGA突变造血干细胞的克隆扩增机制 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症(PNH)患者的骨髓细胞 | 自然语言处理 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 | 单细胞RNA测序、纠错DNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、DNA测序数据 | 来自PNH细胞大比例(>50%)和小比例(10-50%)患者群体的骨髓细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2026-07-03 |
Cell type-specific inflammatory response of ischemia-reperfusion injury in lung transplantation
2026-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.02.007
PMID:41921751
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综述 | 综述肺移植缺血再灌注损伤的细胞类型特异性炎症反应 | 以细胞类型特异性方式系统总结肺移植缺血再灌注损伤的炎症机制,重点关注从基础发现向临床应用的转化 | 未明确指出具体局限性 | 探讨肺移植缺血再灌注损伤中细胞类型特异性炎症反应及其临床转化潜力 | 肺移植缺血再灌注损伤中的肺泡巨噬细胞、中性粒细胞、单核细胞、淋巴细胞、肺上皮细胞和内皮细胞 | NA | 肺移植缺血再灌注损伤 | 转录组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 790 | 2026-07-03 |
Deep profiling of lupus nephritis kidneys reveals dynamic changes in myeloid cells associated with disease progression
2026-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.004
PMID:42055919
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研究论文 | 通过深度剖析狼疮肾炎肾脏,揭示与疾病进展相关的髓系细胞动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学对大量人类狼疮肾炎肾脏样本进行综合分析,揭示髓系细胞在疾病不同阶段的动态变化及与组织损伤的关系 | 样本主要来自晚期患者,可能无法完全代表早期疾病变化;空间转录组学基因面板可能遗漏部分罕见细胞亚型 | 阐明狼疮肾炎中髓系细胞的免疫应答及其与疾病组织学异质性的关联 | 狼疮肾炎患者和健康个体的肾脏样本 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | 156名狼疮肾炎患者和30名健康个体的肾脏样本用于单细胞RNA测序;6名狼疮肾炎患者和2名对照的肾脏样本用于空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 使用基因面板设计以捕获单细胞RNA测序数据中所有髓系亚群的空间转录组学 |
| 791 | 2026-07-03 |
Proteolytic remodelling of the extracellular matrix by pericytes
2026-Jul, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70569
PMID:42095275
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综述 | 综述了周细胞在不同生理病理条件下对细胞外基质的合成与重塑作用,并基于转录组学和蛋白质组学数据提供了周细胞基质组的图谱 | 首次综合了周细胞的基质组学图谱,强调了周细胞通过主动合成和降解特定基质成分调节微环境的作用 | 由于周细胞与内皮细胞等其他细胞之间存在物理和旁分泌相互作用,周细胞基质组并非独立存在,这限制了对其单独作用的研究 | 理解周细胞在血管生成和不同病理条件(如中风、阿尔茨海默病和癌症)中的作用 | 周细胞 | 机器学系 | 中风, 阿尔茨海默病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 转录组学数据, 蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2026-07-03 |
IL-22 promotes genesis of small intestinal secretory cells that protect against cholera in mice
2026-Jul, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02375-7
PMID:42236988
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究IL-22促进小肠分泌细胞生成并保护小鼠免受霍乱感染的机制 | 首次揭示IL-22通过诱导肠上皮细胞亚型分化及Reg3β和黏蛋白产生,限制霍乱弧菌定植并预防腹泻死亡 | 基于小鼠模型,人类小肠免疫应答的适用性需进一步验证 | 探究IL-22在小肠抗霍乱先天免疫中的作用及细胞机制 | 新生小鼠小肠上皮细胞和免疫细胞 | 机器学习和单细胞组学 | 霍乱 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 新生小鼠小肠组织样本(具体数量未提) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 793 | 2026-07-03 |
Identification and characterization of CXCL13 producers in bone tissue in response to fasting
2026-Jul-01, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag005
PMID:41614233
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研究论文 | 本研究鉴定了禁食状态下骨组织中CXCL13的细胞来源及其上游调控信号,揭示了成骨间充质基质细胞通过TGF-β和PPAR信号通路调控幼稚B细胞迁移的机制 | 首次明确成骨间充质基质细胞是禁食状态下骨组织中CXCL13的主要来源,并发现TGF-β和PPAR信号通路参与调控其表达 | 未详细阐明TGF-β和PPAR信号通路上下游的具体分子机制,且实验仅在动物模型中进行 | 阐明禁食状态下骨组织中CXCL13的细胞来源及其表达调控机制 | 小鼠骨组织及其中的免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光成像、药理学干预 | NA | 基因表达数据、图像 | 小鼠骨组织样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 794 | 2026-07-03 |
TRIAGE Toolkit: Streamlined Discovery of Regulatory Genes and Elements
2026-Jul, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70413
PMID:42383409
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研究论文 | TRIAGE工具包提供了一组计算流程,用于从多种输入数据中发现调控基因和元件 | 将多种TRIAGE方法集成为统一工具包,支持批量与单细胞RNA-seq分析,并提供跨平台的R和Python实现 | 未明确提及,但仅依赖基因表达和遗传变异数据,可能无法覆盖所有调控机制 | 简化调控基因和元件的发现过程 | 调控基因、调控元件、长非编码RNA、功能遗传变异 | 机器学习 | 不适用 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析 | 不适用 | 基因表达矩阵, 基因列表, 基因组位点 | 不适用 | 不适用 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 不适用 | 不适用 |
| 795 | 2026-07-03 |
Hyperlactataemia in lymphoma-associated haemophagocytic lymphohistiocytosis: Linked to monocytic glycolysis and adverse prognosis
2026-Jul-01, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.70637
PMID:42384015
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示淋巴瘤相关噬血细胞性淋巴组织细胞增多症中单核细胞糖酵解增强与高乳酸血症及不良预后的关联 | 首次通过单细胞RNA测序、代谢组学和临床分析多维度整合,发现LAHS中PTTG1单核细胞亚群特异性的糖酵解增强和高乳酸血症作为独立预后标志物,并揭示血小板反应蛋白信号通路与糖酵解的关联 | 摘要未明确提及研究局限性,可能包括样本量较小(尤其是单细胞测序样本仅9例)和未进行功能验证实验 | 阐明淋巴瘤相关噬血细胞性淋巴组织细胞增多症与非淋巴瘤相关类型的病理差异及其预后标志物 | 新诊断淋巴瘤相关HLH患者、非淋巴瘤相关HLH患者和健康对照的外周血样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、临床生存数据 | 单细胞测序组9例(4例LAHS、3例NLAHS、2例NC);代谢组学39例(21例LAHS、11例NLAHS、7例NC);临床预后分析84例 | NA | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 796 | 2026-07-03 |
Neutrophils From Aged Individuals Release NETs to Impair Oral Wound Healing Through NLRP3 Activation
2026-Jul-01, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70398
PMID:42384429
|
研究论文 | 研究老年个体中性粒细胞胞外陷阱(NETs)通过NLRP3炎症小体激活损害口腔伤口愈合的机制 | 首次揭示NETs通过激活NLRP3炎症小体抑制成纤维细胞功能从而加重老年口腔伤口愈合延迟 | 未明确NETs-NLRP3通路在其他组织老化相关损伤中的普适性 | 探究老年个体口腔伤口愈合受损的机制,重点关注NETs和NLRP3炎症小体的作用 | 年轻与老年小鼠的口腔黏膜及人单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 免疫组化、RNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 年轻和老年小鼠群体及人单细胞RNA测序数据样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 797 | 2026-07-03 |
LOTR-Seq: A protocol for large-scale simultaneous single-cell long-read genotyping of transcripts
2026-Jul-01, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104680
PMID:42384492
|
研究论文 | 提出LOTR-Seq协议,结合短读全转录组分析与长读基因分型,用于大规模同步单细胞长读转录本基因分型 | 首次将短读与长读测序结合用于单细胞转录组变异检测,实现大规模同步分析 | 未提及具体局限性,但可能涉及通量或成本限制 | 开发一种协议,用于单细胞水平上同时进行全转录组分析和突变热点基因分型 | 人类骨髓造血干细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序、长读测序、靶向富集 | NA | RNA序列数据 | 人类骨髓样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq、长读测序 | NA | NA |
| 798 | 2026-07-03 |
stDGCN: A dual-augmentation graph convolutional network for identifying spatial domains with attention mechanism
2026-Jul-01, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3708134
PMID:42384513
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研究论文 | 提出一种双增强图卷积网络stDGCN,结合注意力机制和零膨胀负二项解码器,实现空间转录组数据的稳健空间域识别 | 创新性提出双增强策略,结合空间邻域增强和高斯扰动生成多样化的基因表达视图;采用注意力融合模块自适应整合原始和空间增强嵌入;引入零膨胀负二项解码器处理数据稀疏性和过度离散性 | 未明确说明局限性,但可能涉及计算复杂度较高、对大规模数据集的适用性需进一步验证 | 开发稳健的空间域识别方法,以提高空间转录组数据分析的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据中的空间域区域 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN)、注意力机制、零膨胀负二项解码器 | 基因表达数据、空间坐标数据 | 6个空间转录组数据集,包括人脑、乳腺癌、小鼠视觉皮层、小鼠脑和胚胎数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 799 | 2026-07-03 |
Hypoxia-driven T cell-macrophage-stromal cross-talk sustains fibrosis in preclinical models of cutaneous chronic graft-versus-host disease
2026-Jul, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adx7264
PMID:42384772
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研究论文 | 该研究揭示了缺氧驱动的T细胞-巨噬细胞-基质细胞相互串扰在皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化中的作用机制 | 首次在慢性移植物抗宿主病中发现HIF-1α-PI3Kδ-IL-13信号轴介导的缺氧驱动炎症与纤维化程序 | 未提及具体局限性 | 阐明皮肤慢性移植物抗宿主病纤维化的缺氧驱动机制并探索治疗靶点 | 慢性移植物抗宿主病患者的皮肤组织、人类表皮细胞系、诱导多能干细胞衍生皮肤类器官及小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性移植物抗宿主病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 800 | 2026-07-03 |
Endozoicomonas acroporae enhances coral thermal resilience through host-microbe coordination
2026-Jul-01, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag173
PMID:42384952
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研究论文 | 建立Endozoicomonas acroporae Acr-14T作为珊瑚益生菌,并表征其对造礁珊瑚Stylophora pistillata热耐受性的增强作用及宿主-微生物协调机制 | 首次在体内证明Endozoicomonas acroporae作为珊瑚益生菌能增强宿主热耐受性,并结合染色体级别基因组和单细胞转录组揭示细胞类型特异性的宿主响应机制 | 益生菌处理对机会性微生物相对丰度的降低和潜在有益类群的富集仅基于微生物谱分析,具体因果机制仍需进一步验证 | 阐明益生菌Endozoicomonas acroporae增强珊瑚热胁迫下恢复力的分子机制 | 造礁珊瑚Stylophora pistillata及其共生细菌Endozoicomonas acroporae Acr-14T | 微生物学、生态学 | 珊瑚热应激 | 益生菌处理、基因组组装、单细胞转录组学、微生物谱分析 | 无特定模型 | 基因组序列、单细胞转录组数据、微生物组数据 | Stylophora pistillata珊瑚样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组学用于分析胃皮层细胞的基因表达变化 |