单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-19	Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex 2025-05-28, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110792 PMID:40497968	研究论文	该研究探讨了胰岛素降解酶（Ide）在mRNA处理和蛋白质稳态中的潜在作用	发现Ide可能与CCR4-NOT复合体相互作用，共同调控基因表达	提出的模型是推测性的，需要进一步实验验证	阐明Ide在细胞生理学和蛋白质稳态中的更广泛功能	人和小鼠的胰岛细胞	分子生物学	NA	蛋白质组学、转录组学、邻近生物素化技术	NA	蛋白质组数据、转录组数据	NA
62	2025-06-19	Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization 2025-05-27, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110788 PMID:40497964	研究论文	通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠下丘脑室旁核在发育过程中内源性大麻素信号传导的分子指纹	首次描述了内源性大麻素信号在下丘脑室旁核神经元发育过程中的纳米级结构，并提供了2-AG和AEA信号传导的时空图谱	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证	探索下丘脑室旁核在发育过程中内源性大麻素信号传导的分子机制	小鼠下丘脑室旁核的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、原位杂交、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、图像数据	小鼠胎儿和出生后发育阶段的样本
63	2025-06-19	The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy 2025-05-25, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110778 PMID:40497954	综述	本文综述了cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的关键作用及其潜在治疗靶点	整合了人类单细胞RNA测序数据和系统文献综述，识别了现有的分子干预措施并突出了有前景的治疗靶点	cGAS/STING通路在心肌病相关炎症中的精确分子机制仍不清楚且存在争议，未来研究需验证这些发现并促进其临床转化	探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的作用及其潜在治疗策略	心肌病中的cGAS/STING信号通路	分子生物学	心血管疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	scRNA-seq数据和临床样本	公开可用的人类scRNA-seq数据和临床样本
64	2025-06-19	Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development 2025-05-24, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110774 PMID:40497950	研究论文	本研究探讨了细胞极性基因Dchs1在心脏发育过程中的动态表达及其功能意义	首次生成了Dchs1-HA敲入小鼠模型，揭示了Dchs1在非心肌细胞系中的动态表达模式及其在细胞间通讯中的潜在作用	Dchs1在心脏发育中的具体分子机制尚未完全阐明	阐明Dchs1在心脏发育过程中的表达模式和功能	Dchs1基因及其在心脏发育中的作用	发育生物学	心血管疾病	免疫组化、Western blotting、单细胞转录组学	Dchs1-HA敲入小鼠模型	基因表达数据、蛋白质数据	不同发育阶段的小鼠心脏组织样本
65	2025-06-19	A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography 2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.23.655666 PMID:40475598	研究论文	该研究构建了一个高分辨率的多模态人类成人肺部空间和表观基因组图谱，用于解析肺部疾病的易感空间区域	整合了单核RNA测序和染色质可及性测序技术，首次在单核分辨率下构建了人类肺部的高分辨率多模态图谱，并鉴定了新的转录调控因子	研究仅基于11名健康成年人的样本，可能无法完全代表肺部疾病的多样性	构建高分辨率的人类肺部参考图谱，以解析肺部疾病的发病机制	人类成人肺部组织	数字病理学	肺部疾病	snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光	NA	单核RNA测序数据、染色质可及性数据、空间转录组数据、免疫荧光图像	49个肺部组织块，746,047个细胞核，来自11名健康成年人
66	2025-06-19	Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models 2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.05.17.654526 PMID:40475625	研究论文	通过在人源化小鼠模型中进行单细胞RNA测序，探索胶质母细胞瘤的免疫环境	建立了一种独特的人源化GBM小鼠模型，利用患者来源的异种移植（PDX）和人源化小鼠，增强了肿瘤多样性，特别是神经前体样细胞的比例	可用的动物GBM肿瘤模型有限，尤其是具有独特免疫学特征的耐药性和复发性模型	分析胶质母细胞瘤的肿瘤免疫景观并评估新疗法，特别是免疫疗法	人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、免疫组织化学	人源化小鼠模型	RNA测序数据	两种免疫缺陷小鼠模型，接受人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞进行人源化
67	2025-06-19	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	研究论文	本研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌性扰动如何诱导姐妹细胞不对称性和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑技术同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞系，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞系	细胞生物学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	单细胞数据	追踪了最多四代的细胞系
68	2025-06-19	Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets 2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.04.30.651101 PMID:40475445	研究论文	本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提高胰腺胰岛中异构体的检测能力	优化了5'端文库制备协议，并展示了胰岛素转录本的靶向耗竭策略在提高信息读取检测中的效用	技术挑战包括读长不足和较高的错误率，以及高丰度转录本可能掩盖低丰度转录本的识别	优化单细胞长读长测序技术，以更准确地检测胰腺胰岛中的剪接变体	胰腺胰岛中的单细胞RNA	基因组学	糖尿病	单细胞长读长测序	NA	RNA序列数据	NA
69	2025-06-19	Tyrosinase in melanoma inhibits anti-tumor activity of PD-1 deficient T cells 2025-May-15, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-025-02237-4 PMID:40375241	研究论文	该研究探讨了黑色素瘤中酪氨酸酶如何抑制PD-1缺陷T细胞的抗肿瘤活性	首次发现酪氨酸酶在黑色素瘤中抑制T细胞的抗肿瘤活性，并通过CRISPR/Cas9技术敲除酪氨酸酶基因，揭示了其对肿瘤免疫微环境的影响	研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探究黑色素瘤抵抗免疫治疗的分子机制	B16黑色素瘤模型和PD-1缺陷小鼠	肿瘤免疫学	黑色素瘤	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序	B16黑色素瘤模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用小鼠模型进行研究
70	2025-06-19	Single-cell transcriptome atlas of spontaneous dry age-related macular degeneration in macaques 2025-May, Fundamental research IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.fmre.2023.02.028 PMID:40528953	研究论文	构建了自发性干性年龄相关性黄斑变性（SD-AMD）老年非人灵长类动物的单细胞视网膜转录图谱，揭示了SD-AMD的分子机制	首次在非人灵长类模型中构建SD-AMD的单细胞转录图谱，发现铁稳态破坏和铁死亡促进SD-AMD发病的新机制	研究主要基于非人灵长类模型，结果向人类转化的有效性需要进一步验证	探究自发性干性年龄相关性黄斑变性的发病机制	老年非人灵长类动物的视网膜组织	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	老年非人灵长类动物视网膜组织
71	2025-06-19	CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis 2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202402024RRR PMID:40172996	研究论文	本研究揭示了CAF来源的外泌体通过传递lncRNA LINC01711，激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞的糖酵解作用	发现CAF来源的外泌体中LINC01711通过miR-4510/NELFE轴激活TXN，促进糖酵解作用的新机制	研究未涉及LINC01711在其他类型癌症中的作用，且临床样本量有限	探索CAF来源的外泌体在乳腺癌进展中的作用机制	乳腺癌细胞及CAF来源的外泌体	肿瘤生物学	乳腺癌	单细胞测序、降维分析、聚类分析、细胞注释	NA	单细胞测序数据	GEO数据库中的乳腺癌单细胞测序数据
72	2025-06-19	RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition 2025-Apr, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-08542-2 PMID:39910313	研究论文	该研究揭示了RUNX2在肺纤维化中通过肺泡到病理性成纤维细胞的转变促进纤维化的机制	发现LEPR成纤维细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是病理性成纤维细胞的主要来源，并确定RUNX2是纤维化基因表达的关键调控因子	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足	探索肺纤维化中病理性成纤维细胞生成的关键调控机制	小鼠模型中的LEPR成纤维细胞和SCUBE2肺泡成纤维细胞	分子生物学	肺纤维化	scRNA-seq, scATAC-seq	NA	基因表达数据	两种小鼠肺纤维化模型
73	2025-06-19	An Improved, High-Yield Method for Isolating Nuclei from Individual Zebrafish Embryos for Single-Nucleus RNA Sequencing 2025-Apr, Zebrafish IF:1.4Q2 DOI:10.1089/zeb.2024.0175 PMID:40040474	研究论文	本文介绍了一种改进的高效方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以进行单核RNA测序	通过珠磨均质化在裂解缓冲液中高效分离细胞核，相比酶解方法有显著改进，并适用于广泛的发育阶段	NA	开发一种高效的方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以支持单细胞测序研究	斑马鱼胚胎	基因组学	NA	单核RNA测序(snRNA-seq)	NA	RNA序列数据	在96孔板格式中处理的斑马鱼胚胎
74	2025-06-19	Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation 2025-Mar-24, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008 PMID:40139307	研究论文	本研究揭示了转录因子OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路在皮质星形胶质细胞成熟中的协同作用	首次发现OLIG1和OLIG2通过直接结合Bmp7增强子抑制其表达来调控星形胶质细胞成熟	研究主要聚焦于皮质星形胶质细胞，其他脑区星形胶质细胞的成熟机制仍需进一步探索	阐明调控皮质星形胶质细胞成熟的分子机制	皮质星形胶质细胞	神经科学	神经系统疾病	单细胞RNA测序、基因敲除、体内过表达	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，使用基因工程小鼠模型
75	2025-06-19	Copper Metabolism-Related Genes as Biomarkers in Colon Adenoma and Cancer 2025, International journal of general medicine IF:2.1Q2 DOI:10.2147/IJGM.S521512 PMID:40524750	研究论文	本研究通过生物信息学分析探讨铜代谢在结肠腺瘤进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点	首次将铜代谢相关基因与结肠腺瘤和结直肠癌的进展联系起来，并利用多种机器学习算法识别出五个潜在生物标志物	需要进一步的临床验证	阐明铜代谢在结肠腺瘤向结直肠癌进展中的作用，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点	结肠腺瘤和结直肠癌患者	生物信息学	结直肠癌	GEO数据库分析、ssGSEA、scRNA-seq、qPCR	五种机器学习算法	基因表达数据	来自GEO数据库的结肠腺瘤样本和正常对照样本
76	2025-06-19	A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis 2025-Jan, Experimental dermatology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/exd.70026 PMID:40525602	research paper	本研究探讨了S100A11在系统性硬化症（SSc）皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用	首次发现S100A11在SSc皮肤成纤维细胞中高表达，并与细胞衰老相关基因共表达，同时发现血清S100A11水平与SSc皮肤厚度评分和间质性肺病参数显著相关	研究样本量未明确说明，功能机制尚未完全阐明	探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的病理生理作用	系统性硬化症患者皮肤样本和血清	医学研究	系统性硬化症	免疫组织化学染色（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、酶联免疫吸附试验（ELISA）	NA	组织样本、血清样本、基因表达数据	未明确说明患者和对照组的具体样本量
77	2025-06-19	Single-cell sequencing reveals cellular differences and potential mechanisms in congenital pulmonary airway malformation 2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2025.1548177 PMID:40529122	研究论文	通过单细胞测序技术分析先天性肺气道畸形（CPAM）病变组织与正常组织的细胞差异，揭示关键细胞类型和功能	首次使用单细胞测序技术深入分析CPAM病变组织与正常组织的细胞差异，发现与CPAM病理过程相关的关键细胞类型、基因和信号通路	未提及样本量大小或研究人群的详细信息，可能影响结果的普遍性	更好地理解CPAM的病理过程并识别潜在治疗靶点	先天性肺气道畸形（CPAM）病变组织与正常组织	数字病理学	肺病	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	NA
78	2025-06-19	Research advances in the study of traditional Chinese medicine formula granules on signaling pathway-mediated disease mechanisms 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1609211 PMID:40529488	综述	本文系统回顾了中药配方颗粒在信号通路介导的疾病机制研究中的进展，并展望了其在现代精准医学中的应用前景	整合多组学技术探索复方混合物的超分子协同效应，并提出大规模临床试验验证其在精准医学中的潜力	当前研究面临单一成分分析、复方混合物协同机制不明确以及转化应用临床证据不足等挑战	探讨中药配方颗粒通过信号通路介导的疾病治疗机制及其在现代精准医学中的应用	中药配方颗粒及其活性代谢物	中医药研究	炎症、肿瘤、代谢紊乱、纤维化、骨关节炎和骨质疏松等复杂疾病	多组学技术（如代谢组学、空间转录组学）	NA	NA	NA
79	2025-06-19	Cancer-Derived Exosomal LINC01615 Induces M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages via RBMX-EZH2 Axis to Promote Colorectal Cancer Progression 2025, International journal of nanomedicine IF:6.6Q1 DOI:10.2147/IJN.S499381 PMID:40529536	研究论文	本文研究了结直肠癌来源的外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴诱导肿瘤相关巨噬细胞M2极化以促进结直肠癌进展的机制	首次揭示了LINC01615通过外泌体从结直肠癌细胞转运至肿瘤相关巨噬细胞，并作为支架介导RBMX与EZH2 mRNA及启动子的结合，从而促进EZH2表达和M2极化	未探讨LINC01615在其他癌症类型中的作用，且临床样本量有限	探究结直肠癌来源的外泌体lncRNA在巨噬细胞M2极化中的具体作用及其分子机制	结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)	肿瘤生物学	结直肠癌	单细胞RNA测序、透射电子显微镜、纳米颗粒追踪分析、Cre-LoxP系统、RNA免疫沉淀、RNA pull-down、截断实验、双荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀、qRT-PCR、Western blot	NA	RNA测序数据、蛋白质表达数据	NA
80	2025-06-19	Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma 2024-09-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52067-1 PMID:39266532	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、DNA测序等技术，探索了人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的细胞起源和克隆演化	首次鉴定了肿瘤脂肪干细胞（ASC）群体，并揭示了其与白色脂肪组织中脂肪基质祖细胞的相似性，以及这些祖细胞在DDLPS肿瘤克隆演化中的作用	研究样本仅限于原发性DDLPS肿瘤，未涉及转移性肿瘤或其他肉瘤亚型	阐明去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制	人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的肿瘤细胞及其微环境	肿瘤生物学	脂肪肉瘤	单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能实验	NA	单细胞转录组数据, DNA序列数据, 免疫荧光图像数据	配对的WD和DD成分的原发性DDLPS肿瘤样本