单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-04 |
Identification of keratinocyte-associated genes for immune characterization and drug response prediction in oral squamous cell carcinoma
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19953
PMID:41180476
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据识别口腔鳞状细胞癌中角质形成细胞相关基因，并评估其诊断价值和免疫特征 | 首次系统分析角质形成细胞在OSCC中的作用，鉴定出KRT16、CSTA和CSTB等新型生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于体外模型 | 识别角质形成细胞相关基因用于OSCC的免疫特征分析和药物反应预测 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析 | 诊断模型, 列线图 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的OSCC单细胞和批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-04 |
PTGDS: As a Specific Biomarker for Septic Cardiomyopathy
2025, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S554915
PMID:41180608
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研究论文 | 本研究通过RNA测序筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，发现PTGDS作为潜在核心基因 | 首次将脓毒症差异表达基因与心脏特异性表达基因交集分析，鉴定PTGDS作为脓毒症心肌病的新型诊断标志物 | 基于初步概念验证队列，样本量有限 | 筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，为早期识别和预后评估提供研究靶点 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 生存分析，ROC曲线分析 | 基因表达数据 | 20例脓毒症患者和10例健康志愿者 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-11-04 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cell landscape and gene signatures associated with granulomatous lobular mastitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1624640
PMID:41181111
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肉芽肿性小叶性乳腺炎的细胞景观和基因特征 | 首次对肉芽肿性小叶性乳腺炎进行单细胞RNA测序研究，鉴定了11种主要细胞群体并发现M1巨噬细胞在疾病免疫病理中的核心作用 | 样本量较小（3例患者和3例对照），需要更大规模研究验证发现 | 系统比较GLM与健康乳腺组织的免疫微环境差异，揭示疾病相关细胞亚群和关键失调基因 | 肉芽肿性小叶性乳腺炎患者和健康对照者的乳腺组织样本 | 单细胞组学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 3例GLM患者和3例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-04 |
Correlation of immune cell subsets in the tumor microenvironment and peripheral blood with immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1633748
PMID:41181122
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析食管鳞癌肿瘤微环境和外周血中免疫细胞亚群与免疫治疗反应的相关性 | 首次系统鉴定TIM3+ CD8+ T细胞作为食管鳞癌免疫治疗疗效预测的生物标志物 | 样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索食管鳞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 食管鳞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集和接受免疫治疗患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-11-04 |
Subtype-specific NK cell-TAM interactions drive a novel prognostic signature in HNSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1676878
PMID:41181127
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了头颈鳞状细胞癌中NK细胞与肿瘤相关巨噬细胞亚型特异性相互作用模式及其预后意义 | 首次系统揭示了HNSCC中NK细胞与TAM的亚型特异性相互作用网络，并构建了基于23个基因的NK-TAM相互作用特征预后模型 | 样本量相对有限（58例），需要在更大队列中进一步验证 | 探究头颈鳞状细胞癌免疫微环境中NK细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用机制及预后价值 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理 | 头颈鳞状细胞癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 多组学分析 | LASSO Cox回归 | 图像, 基因表达数据, 空间位置数据 | 58例HNSCC组织样本，并使用公共数据库（TCGA-HNSC, GSE65858）和免疫治疗队列验证 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-04 |
Gut microbiome as a potential mediator linking sexual behaviors to immune profiles in HIV-negative men who have sex with men: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659556
PMID:41181130
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研究论文 | 通过多组学研究探讨男男性行为者中肠道微生物组如何介导性行为与免疫特征之间的联系 | 首次在HIV阴性MSM人群中整合肠道微生物组与免疫系统多组学数据，揭示性行为通过肠道微生物影响免疫特征的潜在机制 | 研究样本仅限于HIV阴性MSM人群，结果可能不适用于其他人群 | 探究性行为如何通过肠道微生物组影响男男性行为者的免疫特征 | HIV阴性的男男性行为者 | 多组学研究 | HIV感染 | 16S rRNA基因测序, 单细胞转录组测序, 批量RNA测序 | 贝叶斯Prism算法, 因果中介分析 | 粪便样本, 外周血单核细胞 | HIV阴性男男性行为者队列 | NA | 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-11-04 |
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698088
PMID:41181126
|
综述 | 总结TGF-β驱动的T细胞排斥在卵巢癌中的作用机制及单细胞与空间转录组学的研究进展 | 整合单细胞RNA/ATAC测序与空间转录组数据解析TGF-β信号通路，提出结合PD-1疗法与TGF-β轴靶向治疗的精准免疫策略 | 存在部位特异性异质性、检测标准化不足及预测指标稀缺等临床转化挑战 | 探讨TGF-β信号通路在卵巢癌免疫低应答状态中的作用及精准免疫治疗策略 | 上皮性卵巢癌的肿瘤微环境（成纤维细胞、肿瘤细胞、免疫细胞） | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-04 |
The effects of cryopreservation on PBMCs transcriptome profile
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690316
PMID:41181136
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估冷冻保存对PBMCs转录组谱的影响 | 首次使用scRNA-seq技术系统评估长期冷冻保存对PBMCs转录组谱的影响，并优化了冷冻保存和复苏程序 | 仅评估了6个月和12个月两个时间点，未涵盖更短或更长的冷冻保存时间 | 评估优化后的冷冻保存和复苏程序对PBMCs细胞活力、种群组成和转录组谱的影响 | 外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,台盼蓝染色,碘化丙啶染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 新鲜PBMCs和冷冻保存6个月、12个月的PBMCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-04 |
B cell subpopulations and their role in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: insights from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665086
PMID:41181153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发干燥综合征患者B细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS中系统鉴定B细胞亚群并揭示I型干扰素信号通路、BCR克隆性改变和基因重排异常在发病机制中的关键作用 | 样本量较小（3例pSS患者和3例健康对照），需更大规模研究验证 | 探讨B细胞在原发干燥综合征发病机制中的潜在作用 | 原发干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，GO和KEGG通路富集分析，转录因子分析，拟时序分析，细胞通讯分析，BCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞测序：3例pSS患者和3例健康对照；qRT-PCR验证：22例pSS患者和22例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-04 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals key B-cell genes and immune microenvironment regulation in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600254
PMID:41181151
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示膀胱癌中B细胞关键基因及其在肿瘤免疫微环境中的调控作用 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序多组学分析策略，系统鉴定膀胱癌B细胞关键基因标志物 | 样本量相对有限（8例患者肿瘤样本和4例正常样本） | 探索膀胱癌B细胞关键基因特征及其在肿瘤免疫微环境调控中的作用 | 膀胱癌患者肿瘤组织中的B细胞群体 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，体外实验验证 | 多组学分析 | 转录组数据 | 8例膀胱癌患者肿瘤样本和4例正常样本，共84,967个细胞（其中10,967个B细胞） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-11-04 |
Lactylation-Related Gene CALM1 Promotes Aortic Dissection via Immune Microenvironment Remodeling: Insights from Bioinformatics and Clinical Evidence
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S539938
PMID:41181366
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和临床证据揭示乳酰化相关基因CALM1通过免疫微环境重塑促进主动脉夹层发生 | 首次系统研究乳酰化相关基因在主动脉夹层中的作用，发现CALM1作为潜在诊断标志物 | 仅验证了CALM1在临床样本中的表达差异，PARP1和PTBP1未显示显著差异 | 探索乳酰化相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和健康个体的主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 两个AD相关数据集（GSE 52093和GSE 98770）及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-11-04 |
Gastric metastasis of renal cell carcinoma: features, mechanisms, and insights from existing literature
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656858
PMID:41181710
|
综述 | 本文综述肾细胞癌胃转移的临床特征、分子机制及治疗策略 | 系统整合胃转移的分子机制与临床管理策略，强调多组学技术和单细胞测序在解析器官特异性趋向中的应用前景 | 基于回顾性病例系列数据，缺乏前瞻性研究验证 | 探讨肾细胞癌胃转移的病理特征、发生机制及治疗进展 | 肾细胞癌胃转移患者 | 肿瘤学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 临床病例数据、分子机制研究 | 多中心病例系列（发病率0.2%-0.8%） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-04 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
|
研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学分析，揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用 | 首次在ACM中发现炎症-纤维化空间生态位，并证实靶向IL-1β可改善疾病表型 | 动物模型结果需在人类患者中进一步验证 | 探索致心律失常性心肌病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | ACM患者和对照供体的心肌样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 74 | 2025-11-04 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中通过同聚物引物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次评估亲和性碱基化学测序技术准确通过单细胞RNA-seq文库中同聚物引物区域的能力，并开发改进的适配器修剪和比对流程 | 与单端比对相比，配对端比对并未持续提高读段映射率，且未排除其他新兴平台可能具有类似性能 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和性测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti亲和性测序系统，标准单细胞RNA-seq协议 |
| 75 | 2025-11-03 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
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综述 | 本章提供了免疫学研究中使用生物信息学工具分析转录组数据的全面指南 | 系统整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序在免疫肿瘤学中的生物信息学分析方法 | NA | 促进免疫学数据分析和解读，帮助理解免疫反应机制 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式、免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-11-03 |
Differentiation Trajectory of Virus-Induced Tumour Cells in Rice Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70267
PMID:40693410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示水稻中病毒诱导肿瘤细胞的分化轨迹 | 首次构建水稻病毒感染的细胞类型特异性图谱，揭示水稻黑条矮缩病毒诱导肿瘤细胞从维管薄壁细胞分化的过程 | 仅针对水稻黑条矮缩病毒，未涵盖其他植物病毒 | 研究植物病毒感染引起的宿主细胞异常分化和发育机制 | 水稻叶片鞘细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 106,973个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-03 |
Ki-67 in meningioma: distribution and implications
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS25438
PMID:40712166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析脑膜瘤中Ki-67表达的细胞来源与分布特征及其临床意义 | 首次在单细胞水平揭示脑膜瘤中Ki-67表达的多细胞来源特征，发现不同WHO分级中Ki-67+细胞组成差异 | 样本量相对有限（32例单细胞分析），需要更大规模研究验证 | 解析脑膜瘤微环境中Ki-67表达的细胞来源、分布特征及其临床基因组学关联 | 脑膜瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞数据, 基因组数据, 临床数据 | 32例脑膜瘤（单细胞分析）, 448例脑膜瘤（验证队列） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | CyTOF | 质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序技术 |
| 78 | 2025-11-03 |
Use of integrated spatial transcriptomics and histopathological analysis in adamantinomatous craniopharyngiomas to identify stromal cells as a new cellular source of leukemia inhibitory factor
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS243146
PMID:40749237
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和组织病理学分析，鉴定牙釉质瘤型颅咽管瘤中基质细胞是白血病抑制因子的新细胞来源 | 首次确认牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF主要来源于肿瘤微环境基质细胞，发现基质细胞是LIF产生的新细胞来源 | 样本量相对有限（39例），需要进一步验证LIF/LIFR信号通路在肿瘤进展中的具体机制 | 研究牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF的空间分布、细胞来源及其生物学功能 | 39例牙釉质瘤型颅咽管瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 免疫荧光分析 | NA | 转录组数据, 图像数据, 临床数据 | 39例ACP肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-11-03 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
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研究论文 | 本研究首次揭示肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作，促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞通过ET-1/EDNRA信号轴进行交流，并阐明该通路通过调控HIF-1α促进糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用机制及其在肠道炎症调控中的作用 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-11-03 |
Endothelial βII Spectrin Deletion Exacerbates Inflammation and Impairs Tissue Regeneration in Ischemic-Diabetic Skin Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70103
PMID:41157851
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞βII血影蛋白在糖尿病缺血性皮肤伤口愈合中的作用机制 | 首次发现βII血影蛋白通过调节炎症反应而非血管生成影响糖尿病伤口愈合 | 研究仅使用小鼠模型和HUVECs细胞，尚未在人体组织验证 | 阐明βII血影蛋白在糖尿病伤口愈合中的分子机制 | 糖尿病小鼠模型和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，组织染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |