单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28975 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-06-24 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70485
PMID:40546220
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高海拔脑水肿后认知下降中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 | 首次揭示了PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴和Tnfrsf21-App作为新型调控因子在高海拔脑水肿后认知下降中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索高海拔脑水肿导致认知下降的细胞和分子机制 | 高海拔脑水肿小鼠模型中的少突胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 高海拔脑水肿 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学(ST) | 小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本数量，但包含3天和7天暴露后的数据 |
| 62 | 2025-06-24 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 通过多组学分析，研究唐氏综合症患者肝脏代谢的变化及其与饮食的关系 | 首次在唐氏综合症患者和小鼠模型中发现了胆汁酸代谢的改变及肝脏功能障碍的蛋白质特征，并探讨了饮食脂肪对基因表达和肝脏病理的影响 | 研究样本量虽然较大（超过400人），但未明确说明样本的具体来源和多样性 | 探讨唐氏综合症患者肝脏代谢的变化及其潜在机制 | 唐氏综合症患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合症 | 多组学分析、RNA测序、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA测序数据 | 超过400人的血浆样本及小鼠模型 |
| 63 | 2025-06-24 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了白色和棕色前脂肪细胞，揭示了它们共有的纤维-脂肪祖细胞群 | 发现了棕色脂肪组织中存在纤维-脂肪祖细胞样细胞（FAPLs），扩展了祖细胞群的已知范围 | 研究仅基于体外培养的细胞模型，可能无法完全反映体内情况 | 研究脂肪组织异质性及其在生理和病理生理学中的功能 | 白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 |
| 64 | 2025-06-24 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
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研究论文 | 本研究首次识别了颞下颌关节（TMJ）中的滑膜淋巴系统，并揭示了其在关节炎和疼痛中的作用 | 首次发现TMJ中的滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动TMJ关节炎和疼痛 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织，可能需要进一步验证在人类中的适用性 | 探索TMJ关节炎中淋巴系统的调控和功能 | 颞下颌关节（TMJ）的淋巴系统 | 生物医学研究 | 关节炎 | 基因报告小鼠、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据 | 基因报告小鼠和人类组织 |
| 65 | 2025-06-24 |
Eriodictyol from Scutellariae Barbata alleviates inflammation and necrosis via ZBP1-dependent signaling in acute pancreatitis
2025-May-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156926
PMID:40544733
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研究论文 | 本研究探讨了黄芩中活性成分圣草酚通过ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死 | 首次揭示了圣草酚通过靶向ZBP1依赖性信号通路减轻急性胰腺炎的炎症和坏死 | 研究未涉及圣草酚在人体中的安全性和有效性验证 | 探究黄芩及其活性成分圣草酚对急性胰腺炎的治疗机制 | 急性胰腺炎模型动物及266-6细胞 | 药理学 | 急性胰腺炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、分子对接、动态分子模拟、细胞热位移分析、药物亲和响应靶标稳定性分析、mtDNA分析 | NA | RNA-seq数据、蛋白质相互作用网络数据 | 未明确说明样本数量 |
| 66 | 2025-06-24 |
sciLaMA: A Single-Cell Representation Learning Framework to Leverage Prior Knowledge from Large Language Models
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.28.635153
PMID:40501921
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研究论文 | 提出了一种名为sciLaMA的单细胞表示学习框架，通过整合多模态大型语言模型的静态基因嵌入与scRNA-seq表格数据，提升单细胞数据分析的性能 | sciLaMA通过结合多模态大型语言模型的基因嵌入与单细胞RNA测序数据，解决了现有方法在整合外部生物知识方面的不足，同时保持了计算效率 | NA | 开发一个高效且统一的单细胞数据分析框架，用于提升下游任务的性能，如批次效应校正、细胞聚类和基因模块识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 配对变分自编码器（paired-VAE） | 表格基因表达数据 | NA |
| 67 | 2025-06-24 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
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研究论文 | 介绍了一种名为MIC-Drop-seq的新技术，用于在斑马鱼胚胎中进行大规模单细胞表型分析 | 结合了高通量基因破坏和多重单细胞RNA测序技术，实现了在脊椎动物发育中大规模基因功能图谱的绘制 | 技术目前仅应用于斑马鱼胚胎，尚未在其他生物体或更复杂的系统中验证 | 开发一种可扩展的平台，用于在脊椎动物发育中以细胞分辨率绘制基因功能 | 斑马鱼胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、多重混合CRISPR液滴技术 | NA | 基因表达数据 | 1000个斑马鱼胚胎，靶向50个转录调节因子 |
| 68 | 2025-06-24 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655632
PMID:40501660
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research paper | 该研究通过多模式单细胞测序和刺激实验，定义了人类巨噬细胞在不同组织中的特征 | 揭示了人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性基因和蛋白质特征，这些特征与小鼠巨噬细胞具有同源性 | 研究样本来源于器官捐赠者，可能无法完全代表所有人群的巨噬细胞特征 | 研究人类巨噬细胞在不同组织中的转录特征及其在稳态和激活状态下的变化 | 人类巨噬细胞，包括来自肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结的样本 | 免疫学 | NA | 多模式单细胞测序，刺激实验 | NA | 单细胞测序数据 | 来自多个器官捐赠者的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结样本 |
| 69 | 2025-06-24 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
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研究论文 | 利用空间转录组学技术对小鼠肾脏冷缺血损伤进行时空转录组分析，揭示特定区域的分子变化 | 首次使用空间转录组学技术全面表征冷缺血损伤的时空转录组变化，并开发了计算工作流程以识别特定区域的病理生理变化 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类 | 揭示冷缺血损伤对肾脏移植预后的分子机制 | 小鼠肾脏 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠肾脏样本（冷缺血损伤0-48小时） |
| 70 | 2025-06-24 |
miR-190 is a Key Regulator in Establishing Cell Polarity and Specification in the Drosophila Nervous System
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656688
PMID:40501908
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研究论文 | 本文发现miR-190在果蝇神经系统细胞极性和分化中的关键调控作用 | 首次揭示miR-190通过调控Par复合体和基底决定因子的定位来影响神经母细胞极性和命运决定 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 探究miR-190在神经母细胞不对称分裂和细胞命运决定中的分子机制 | 果蝇胚胎神经母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、qPCR | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | NA |
| 71 | 2025-06-24 |
Multitissue single-cell analysis reveals differential cellular and molecular sensitivity between fructose and high-fat high-sucrose diets
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115690
PMID:40349341
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研究论文 | 通过多组织单细胞分析揭示了果糖和高脂高糖饮食在细胞和分子敏感性上的差异 | 首次在单细胞水平上比较了高脂高糖饮食与果糖饮食对不同组织细胞类型的影响，并发现mt-Rnr2作为共同调节因子可减轻饮食诱导的代谢综合征 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明不同饮食条件下各组织和细胞类型在代谢综合征中的作用 | 小鼠的下丘脑、肝脏、脂肪组织和小肠 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠组织样本（具体数量未明确说明） |
| 72 | 2025-06-24 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）中非恶性B细胞和肿瘤细胞共有的克隆特征 | 首次在T-PLL中发现非恶性B细胞和克隆性T细胞共有的突变特征，并揭示了诊断与复发间克隆演变的多样性模式 | 样本量较小（16例患者），且仅对19个基因进行了测序 | 阐明T-PLL的克隆起源和进化动力学 | 16名T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 基因组学 | 白血病 | 靶向NGS、液滴数字PCR、单细胞多组学分析（Mission Bio Tapestri Platform） | NA | 基因组DNA数据 | 16名T-PLL患者的配对诊断和复发样本 |
| 73 | 2025-06-24 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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research paper | 该论文提出了一种名为Perturb-STNet的新框架，用于识别和分析单细胞扰动数据中的时空调控网络 | Perturb-STNet结合了基于网络的时空模型，能够量化复杂多细胞或多组织系统中的动态影响，特别是在具有时空分辨率的单细胞数据中 | NA | 识别和分析单细胞扰动数据中的时空调控网络，以支持个性化医疗 | 单细胞数据中的时空调控网络 | digital pathology | lung cancer, melanoma, colitis | CODEX single-cell imaging, MERFISH spatial transcriptomics | network-based spatiotemporal models | single-cell data with spatial and temporal resolution | synthetic data, epithelial-to-mesenchymal transition lung cancer data, murine melanoma model, colitis data |
| 74 | 2025-06-24 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.650107
PMID:40492199
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研究论文 | 介绍了一个名为SCassist的R包，利用大型语言模型（LLM）来简化和增强单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析流程 | 首次将大型语言模型（LLM）集成到scRNA-seq数据分析的关键步骤中，提供智能化的参数推荐和结果解释 | 未提及模型在特定数据集上的性能评估或与其他工具的对比结果 | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低技术门槛 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | LLM（包括Gemini、GPT和Llama3） | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 75 | 2025-06-24 |
Uncovering somatic genetic drivers in prostate cancer through comprehensive genome-wide analysis
2025-Mar-29, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01623-8
PMID:40156736
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研究论文 | 通过全基因组分析揭示前列腺癌中的体细胞遗传驱动因素 | 识别了150个与前列腺癌有因果关联的基因，其中67.33%具有蛋白编码功能，且MSMB基因在所有四项评估中均表现出与前列腺癌的强关联 | 仅44.67%的基因在TCGA数据集中与孟德尔随机化分析结果一致，表明部分发现可能需要进一步验证 | 探索散发性前列腺癌的体细胞遗传驱动因素 | 前列腺癌相关基因 | 基因组学 | 前列腺癌 | eQTL分析、孟德尔随机化(MR)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、表达数据 | UK Biobank（9131病例和173,493对照）、PRACTICAL研究（79,148病例和61,106对照）、FinnGen队列（13,216病例和119,948对照） |
| 76 | 2025-06-24 |
Immunosuppressive microenvironment of liver restrains chemotherapeutic efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010871
PMID:40050043
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）肝转移灶化疗效果较差的免疫微环境机制 | 首次揭示肝转移灶中CD8+T细胞浸润受阻与巨噬细胞活化降低的关联机制，并提出NET抑制剂与巨噬细胞激活剂的联合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究TNBC肝转移灶化疗敏感性降低的免疫微环境机制 | 三阴性乳腺癌肝转移灶与原发灶 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、伤口愈合实验、集落形成实验 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据、图像数据、流式数据 | 公共数据库单细胞数据及实验小鼠模型 |
| 77 | 2025-06-24 |
Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics
2025-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.01.002
PMID:39889540
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综述 | 本文深入探讨了单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的最新进展和应用 | 综述了单细胞和空间多组学方法的最新技术进展，并系统整理了它们在胚胎发育领域的应用 | 未提及具体的技术限制或研究不足 | 探讨单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的应用和潜力 | 胚胎发育过程中的细胞分化和基因表达变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA |
| 78 | 2025-06-24 |
SenSkin™: a human skin-specific cellular senescence gene set
2025-Feb-25, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01568-y
PMID:39998731
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research paper | 该研究开发并验证了一个人类皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™，用于提高皮肤衰老细胞检测的敏感性和特异性 | 开发了首个针对人类皮肤的细胞衰老特异性基因集SenSkin™，相比非组织特异性基因集能更有效地检测皮肤中的衰老细胞 | 研究主要基于现有文献和有限的数据集验证，可能需要更多独立数据集的进一步验证 | 开发并验证一个针对人类皮肤的细胞衰老特异性基因集 | 人类皮肤细胞 | 生物医学 | 皮肤衰老 | RNA-seq（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个RNA-seq数据集（具体数量未明确说明） |
| 79 | 2025-06-24 |
Transcriptomic profiling of senescence effects on blood-brain barrier-related gene expression in brain capillary endothelial cells in a mouse model of paclitaxel-induced chemobrain
2025-Feb-20, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01561-5
PMID:39976844
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了紫杉醇诱导的脑毛细血管内皮细胞衰老对血脑屏障相关基因表达的影响 | 首次揭示了紫杉醇通过诱导内皮细胞衰老导致血脑屏障功能障碍的转录组学机制，并发现VTN和PTN通路在衰老状态中的富集 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何影响血脑屏障完整性的基因表达模式 | 紫杉醇处理的小鼠脑毛细血管内皮细胞 | 转录组学 | 化疗引起的认知障碍(CICI) | scRNA-seq | 小鼠模型 | 转录组数据 | 紫杉醇处理组和对照组小鼠脑组织样本 |
| 80 | 2025-06-24 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-Feb-11, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
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研究论文 | 本研究通过结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，描绘了小鼠年轻和老年卵巢的单细胞多组学图谱，揭示了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性分子特征 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性数据，系统分析了小鼠卵巢衰老过程中的细胞类型特异性分子变化，并鉴定了调控这些变化的顺式/反式调控元件 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类仍需进一步验证 | 探究卵巢衰老的分子机制，为理解女性年龄相关性生育功能障碍提供依据 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 年轻和老年小鼠卵巢组织（具体数量未提及） |