单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-05 |
Fibroblasts as regulators of lung immunity, repair and fibrosis
2026-Jun, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-026-01268-4
PMID:41680464
|
综述 | 探讨成纤维细胞在肺部免疫、修复和纤维化中的调节作用，重点关注单细胞测序技术揭示的成纤维细胞异质性和功能多样性 | 整合免疫学、力学和代谢调节因子对成纤维细胞功能的影响，揭示慢性炎症、免疫功能障碍、组织生物力学改变和代谢应激如何破坏基质调节平衡导致进行性纤维化 | 未提供 | 研究成纤维细胞在纤维化间质性肺病中的调节机制及其在健康与疾病状态下的核心调控程序 | 成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 62 | 2026-06-05 |
Vascular basement membrane laminins modulate functional zonation of cerebral microvessels
2026-Jun, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251410040
PMID:41696806
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究血管基底膜层粘连蛋白对脑微血管功能区域化的调控作用 | 首次揭示层粘连蛋白α4和α5缺失对脑微血管内皮细胞动脉标记物表达及毛细血管后微静脉特性的调控效应，并发现层粘连蛋白α5的补偿性上调增强血管连接蛋白表达和收缩性 | NA | 探究基底膜层粘连蛋白是否影响脑血管的区域差异性，并揭示其分子机制 | 缺乏主要血管层粘连蛋白（层粘连蛋白α4和α5）的小鼠及其野生型同窝对照的脑血管 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 缺乏层粘连蛋白α4和α5的小鼠及其野生型同窝对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-06-05 |
Spatiotemporal role of GLI2 in driving SHH-medulloblastoma tumorigenesis
2026-Jun-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag033
PMID:41706711
|
研究论文 | 本研究探讨了GLI2在驱动SHH型髓母细胞瘤发生发展中的时空作用 | 首次通过小鼠模型揭示了GLI2扩增在SHH-MB中作为主要致癌驱动因子的作用，并明确了胚胎期Math1+颗粒细胞前体细胞对GLI2诱导肿瘤发生的高度易感性窗口 | 未明确提及，但可能涉及小鼠模型与人类肿瘤的完全一致性有待进一步验证 | 阐明GLI2扩增在SHH型髓母细胞瘤中的致癌机制及发育起源 | GLI2扩增型SHH髓母细胞瘤小鼠模型及人类肿瘤组织 | 机器学习 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 小鼠模型样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序分析 |
| 64 | 2026-06-05 |
Oncolytic zika virus therapy leverages CCR2+ monocytes to boost anti-glioblastoma T cell responses
2026-Jun-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag037
PMID:41729934
|
研究论文 | 本研究探讨了溶瘤寨卡病毒通过CCR2+单核细胞促进抗胶质母细胞瘤CD8+ T细胞反应的机制 | 首次揭示溶瘤寨卡病毒通过激活和招募CCR2+单核细胞来增强抗肿瘤CD8+ T细胞反应的机制，突出了单核细胞-T细胞相互作用在克服胶质母细胞瘤免疫抑制中的治疗潜力 | NA | 研究溶瘤寨卡病毒如何通过单核细胞驱动胶质母细胞瘤的疗效 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤浸润CD8+ T细胞与CCR2+单核细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 65 | 2026-06-05 |
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2639364
PMID:41782555
|
研究论文 | 通过多组学数据整合WGCNA、机器学习与实验验证，揭示MAP3K6在脊髓损伤组织中高表达并促进神经元凋亡 | 首次结合WGCNA、随机森林和单细胞RNA测序鉴定出MAP3K6作为脊髓损伤的关键调控因子，并通过体外实验验证其促凋亡功能 | 未报告 | 探究脊髓损伤的分子机制并鉴定潜在生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织及小鼠脊髓神经元细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE226238数据集（含SCI和对照组样本）及GSE151371验证数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-06-05 |
Toward a multiomics framework for understanding symbiotic nitrogen fixation
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.008
PMID:41820103
|
综述 | 总结多组学方法在共生固氮研究中的应用，并提出人工智能引导的作物改良路线图 | 整合端粒到端粒基因组、泛基因组、单细胞与空间转录组、表观基因组及3D基因组图谱等多种组学数据，提出人工智能引导的策略来优先筛选调控元件并指导非豆科作物的细胞类型特异性改造 | 文章中未明确提及该方法在非豆科作物中的实际验证数据，且共生固氮途径的复杂性可能限制直接转化 | 建立多组学框架以理解共生固氮，并探索将固氮能力扩展到主要非豆科作物的可能性 | 豆科植物及相关固氮共生系统（包括放线菌共生系统） | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组序列、染色质可及性数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-06-05 |
DNA methylation profiling reveals a novel subtype harboring IDH mutation in H3-altered gliomas
2026-Jun-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag054
PMID:41832962
|
研究论文 | 通过DNA甲基化分析揭示H3突变胶质瘤中IDH突变的亚型，并基于表观遗传分类重新定义该疾病 | 识别出IDH/H3_comut这一新型亚型，该亚型同时携带IDH和H3突变，表现出全基因组DNA高甲基化和显著改善的生存期；建立了基于甲基化的胶质瘤分类系统，超越了当前WHO分级 | 样本量相对较小（49例），验证数据来自TCGA，可能未涵盖所有H3突变胶质瘤的异质性 | 通过DNA甲基化谱分析揭示H3突变胶质瘤的分子异质性和临床多样性 | H3突变胶质瘤患者（375例队列中的49个代表性病例） | 数字病理学 | 胶质瘤 | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 空间转录组学 | 无监督聚类 | 甲基化数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 49个代表性病例（来自375例H3突变胶质瘤队列） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-06-05 |
RENAL-CHIP: Rejection Evaluation via Non-Invasive Analysis of Circulating Podocytes With Herringbone-Chip Isolation Platform
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520426
PMID:41849694
|
研究论文 | 开发了一种基于磁控人字形微流控芯片的循环足细胞（CPCs）非侵入性检测方法，用于评估肾移植排斥反应 | 首次将供体来源的循环足细胞作为急性排斥反应的血液替代标志物，并利用磁控人字形微流控芯片实现高效捕获释放，结合单细胞RNA-seq揭示排斥相关基因通路 | 样本量仅65例，且依赖活检确认的排斥标准，可能需更大规模验证；单细胞RNA-seq仅分析10个CPCs，细胞数量有限可能影响结果代表性 | 开发一种无创、精准的肾移植排斥反应检测方法 | 肾移植患者外周血中的循环足细胞（CPCs） | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 微流控芯片捕获、荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 65名参与者（包括接受活检确认排斥反应的移植受者） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA-seq |
| 69 | 2026-06-05 |
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524397
PMID:41869876
|
研究论文 | 本研究提出scResponse算法，通过单细胞数据量化细胞状态对免疫治疗反应的影响 | 开发了一种基于秩的方法scResponse，能够捕捉不同细胞亚型和状态对免疫治疗疗效的微妙影响，并在跨癌种分析中发现关键代谢通路（如乙醛酸和二元羧酸代谢及视黄醇代谢）的相反作用 | 本文未明确说明方法的局限性 | 识别与免疫治疗反应相关的细胞状态，揭示细胞状态如何影响治疗效果 | 肿瘤细胞、血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞、成纤维细胞等多种细胞类型及其状态 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | 基于秩的算法 | 单细胞数据 | 跨癌种整合分析及体内小鼠模型验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-06-05 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Jun, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析过敏性鼻炎合并哮喘患者气道不同区域的细胞图谱 | 首次在明确的上、下气道微解剖区域对过敏性鼻炎合并哮喘患者的刷取样本进行单细胞RNA谱分析 | 未提及具体限制 | 探究过敏性鼻炎合并哮喘患者上、下气道沿线的细胞群体分布和转录变化 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻部和支气管刷取细胞 | 机器学习 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻部和支气管刷取样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-04-12 |
Expanding plant single-cell transcriptomics toward the analysis of cell-type-specific isoforms
2026-Jun, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.008
PMID:41963136
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2026-06-05 |
Ustekinumab resistance in individuals with ulcerative colitis is associated with an alteration of a subset of proinflammatory mucosal regulatory T cells
2026-Jun-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag059
PMID:41984825
|
研究论文 | 探讨乌司奴单抗治疗溃疡性结肠炎患者耐药性与黏膜调节性T细胞亚群改变的关系 | 通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、多参数流式细胞术和空间转录组学等多模态方法，首次揭示了黏膜调节性T细胞表型和转录特征与乌司奴单抗治疗响应性的关联，并鉴定出OX40、GITR、GPR15和PIM2等关键分子作为潜在生物标志物 | 样本量较小，亚组分析中仅部分患者进行了多参数流式细胞术和空间转录组学检测，研究仅在单中心进行，需要更大规模多中心队列验证 | 阐明与乌司奴单抗治疗响应性相关的黏膜免疫变化，为治疗决策提供指导 | 接受乌司奴单抗治疗的溃疡性结肠炎患者 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，多参数流式细胞术，空间转录组学，免疫组化 | NA | 基因表达数据，图像 | 接受乌司奴单抗治疗的患者队列，包括响应者和非响应者，具体数量未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'文库制备和测序，10x Visium空间转录组学分析 |
| 73 | 2026-06-05 |
A velocity-informed framework for resolving functional stratification in rare human stem cells
2026-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02956-9
PMID:42014860
|
研究论文 | 本研究提出一种速度信息框架，通过整合单细胞RNA测序与RNA速度分析，解析超罕见干细胞（如人脐带血中极小胚胎样干细胞VSELs）的功能分层，鉴定出两种动力学不同的亚群 | 创新性地将RNA速度动力学建模应用于极稀有静止干细胞群的功能分层分析，突破了传统分析方法受低细胞数和功能不可及性限制的局限 | 未提及框架在其他超罕见干细胞类型中的验证效果以及潜在的技术噪声对结果的影响 | 开发可推广的动力学分析框架，以解析传统方法难处理的稀有干细胞异质性和状态转变 | 人脐带血中的极小胚胎样干细胞（VSELs），包括CD34⁺和CD133⁺亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 人脐带血样本中的超罕见VSELs（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-06-05 |
Eosinophils drive intestinal remodelling and innate defence in reproduction
2026-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10531-6
PMID:42129565
|
研究论文 | 本研究揭示了嗜酸性粒细胞在生殖过程中驱动肠道重塑和先天防御的新角色 | 首次发现嗜酸性粒细胞在无感染或炎症的情况下于妊娠期至哺乳期在小肠中积累，以干细胞内在方式促进杯状细胞分化和黏液产生，从而增强先天防御 | 未提及具体局限性，但可能包括研究主要基于小鼠模型，对人类生殖过程的直接适用性需进一步验证 | 探究生殖过程中母体肠道屏障组织的免疫适应机制 | 母体小肠及嗜酸性粒细胞在生殖周期中的功能 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、类器官培养、遗传和药理学扰动 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型，具体样本数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 75 | 2026-06-05 |
Accurate delineation of cellular niches via integrated spatial transcriptomics and histological imaging with SYMOL
2026-Jun-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281603.125
PMID:42134991
|
研究论文 | 提出了SYMOL框架，通过整合空间转录组学与组织学图像实现细胞微环境的精确描绘 | 首次构建统一的自监督多模态框架SYMOL，整合空间坐标、基因表达和多种组织学图像（多通道IHC和H&E），并利用预训练大视觉模型提取特征进行协同跨模态学习 | 未明确说明局限性，但可能依赖公开数据集且对组织学图像质量敏感 | 开发一种能有效整合空间转录组学和组织学图像的多模态方法，以提升细胞微环境识别和跨模态表征学习 | 肺组织肿瘤微环境和小鼠脑组织的细胞微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 自监督多模态框架（SYMOL） | 图像（多通道IHC和H&E）和基因表达数据 | 多个公开空间转录组数据集（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-06-05 |
Polyclonal selection of immune checkpoint mutations in thyroid autoimmunity
2026-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10493-9
PMID:41981327
|
研究论文 | 通过全外显子测序和靶向NanoSeq技术，在自身免疫性甲状腺疾病中发现大量B细胞克隆获得免疫检查点基因TNFRSF14和CD274的功能丧失性突变 | 首次通过高精度单分子DNA测序技术NanoSeq，系统揭示了自身免疫性甲状腺疾病中免疫检查点基因的多克隆体细胞突变，并发现突变克隆通过多克隆体细胞进化级联逃避耐受检查点 | 每个突变克隆仅占细胞的一小部分（通常低于1%），可能限制了突变功能影响的直接评估 | 探究体细胞突变如何使自身反应性淋巴细胞绕过免疫耐受检查点，导致自身免疫性疾病 | 自身免疫性甲状腺疾病患者组织样本中的B细胞克隆 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 全外显子测序、靶向NanoSeq、激光显微切割、甲基化测序、空间转录组学、免疫染色、单核DNA测序、抗体合成 | NA | DNA测序数据、空间转录组数据、图像数据 | 多例自身免疫性甲状腺疾病患者的活检组织样本 | Illumina | 全外显子测序、靶向测序 | Illumina NovaSeq | 全外显子测序和靶向NanoSeq的高精度单分子DNA测序协议 |
| 77 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示人支气管上皮细胞类型对氯化镉的差异化反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术在高分辨率下解析人支气管上皮不同细胞类型对有毒化合物氯化镉的急性反应，发现了传统批量分析无法捕捉的细胞类型特异性转录特征 | 未提及具体局限性 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织对有毒化合物急性反应中的附加价值 | 人支气管上皮细胞（纤毛细胞、分泌细胞、基底细胞） | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自3名独立供体的完全分化黏膜纤毛上皮，共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-06-05 |
Glutathione peroxidase 3 preserves hepatocyte mitochondrial quality control to enhance macrophage pro-regenerative phenotype during liver regeneration
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70695
PMID:42216503
|
研究论文 | 该研究探讨了谷胱甘肽过氧化物酶3（GPX3）在肝脏再生中的作用机制 | 首次发现GPX3通过抑制VDAC1寡聚化维持线粒体质量控制，从而促进肝脏再生，并揭示了GPX3缺陷导致mtDNA释放激活cGAS-STING通路影响巨噬细胞功能的新机制 | NA | 研究肝细胞GPX3在肝脏再生中的作用及其分子机制 | 小鼠70%部分肝切除模型中的肝细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝脏组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 79 | 2026-06-05 |
Epigenetically controlled endothelial promyelocytic leukemia drives liver inflammation and fibrosis
2026-Jun-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196730
PMID:41842990
|
研究论文 | 发现表观遗传调控的LSEC中PML/BRD4通过相分离驱动促炎信号，促进肝脏炎症和纤维化 | 首次鉴定表观遗传异常的LSEC通过PML/BRD4相分离激活超级增强子，放大促炎血管分泌信号，启动肝脏炎症与纤维化级联反应 | 未提及具体限制 | 阐明肝脏损伤初期触发免疫细胞募集的特定分子事件 | 肝脏窦内皮细胞及单核细胞来源的巨噬细胞 | NA | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠纤维化肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-06-05 |
Identification of Polyamine Metabolism-Related Biomarkers in Psoriasis: A Study Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2026-Jun, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70289
PMID:42223029
|
研究论文 | 本研究整合转录组学与单细胞RNA测序技术，鉴定与多胺代谢相关的银屑病生物标志物，并阐明其作用机制 | 首次通过整合转录组学和单细胞测序数据，系统性鉴定出5个与多胺代谢相关的银屑病生物标志物（PSME2、PSMB5、PSMC4、PSMB10和SMOX），并揭示成熟树突细胞（mDC）在银屑病进展中的动态分化轨迹 | 样本来源有限，主要依赖公共数据库（GSE13355），且未进行临床队列验证；单细胞测序分析未涵盖所有可能相关的细胞亚群 | 鉴定银屑病中与多胺代谢相关的生物标志物，探索其在炎症和角质形成细胞异常增殖中的作用机制 | 银屑病患者的皮肤组织样本及正常对照样本 | 生物信息学， 转录组学， 单细胞测序， 机器学习 | 银屑病 | RNA测序， 单细胞RNA测序， 差异表达分析， 机器学习算法， 受试者工作特征曲线分析， 蛋白质印迹 | 机器学习模型（三种算法） | 基因表达数据， 单细胞测序数据 | 公开数据集（GSE13355）中的银屑病及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |