单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32658 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-17 |
Novel Taxol-Derivative, STO-1, Induces Selective Anti-Tumor Immunity and Sustained Remission of Glioblastoma Without Triggering Autoimmune Reactions
2025-Oct-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211703
PMID:41227348
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型前药STO-1，通过选择性重编程肿瘤相关巨噬细胞实现胶质母细胞瘤的持续缓解且不引发自身免疫反应 | 通过紫杉醇与姜黄素的可裂解共价连接创建新型前药STO-1，实现选择性肿瘤相关巨噬细胞重编程而不引发系统性自身免疫反应 | 研究样本量较小（仅6只原位胶质母细胞瘤小鼠），缺乏人类临床试验验证 | 开发安全有效的胶质母细胞瘤免疫治疗方法 | 胶质母细胞瘤小鼠模型和肿瘤相关微glia及巨噬细胞 | 癌症免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，高分辨率离体T2加权MRI | NA | 基因表达数据，医学影像数据 | 6只原位胶质母细胞瘤荷瘤小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-17 |
Recent advances and applications of single-cell sequencing in insects
2025-Oct-29, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101455
PMID:41173389
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在昆虫科学中的最新进展与应用 | 展示了单细胞多组学技术如何将昆虫研究从基础描述转向功能机制研究，并展望了高通量空间转录组学的潜力 | NA | 总结单细胞基因组学在昆虫生物学中的最新进展并探讨未来发展方向 | 昆虫生理学、发育、免疫和进化研究 | 基因组学 | NA | 单细胞测序，空间转录组学 | 深度学习算法 | 转录组、表观基因组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2025-11-17 |
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies SRI as a Critical Target Promoting Gastric Cancer Progression and Associated with Poor Prognosis
2025-Oct-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213483
PMID:41228276
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证，识别了促进胃癌进展并与不良预后相关的关键分子靶点SRI | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合，识别出胃癌恶性上皮亚群C5和五基因预后特征，并实验验证SRI的关键功能 | 研究样本量有限，需要在更多独立队列中验证预后特征的普适性 | 识别胃癌进展和不良预后的关键分子驱动因素 | 胃癌患者样本和肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,功能验证实验 | LASSO Cox回归模型,多变量Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床数据 | 多个队列的胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-17 |
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110467
PMID:41226506
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类骨髓造血干细胞和祖细胞，揭示衰老过程中淋巴系发育轨迹的异常变化 | 首次发现衰老人类骨髓中积累具有B细胞分化缺陷的淋巴祖细胞和记忆样自然杀伤细胞祖细胞群 | 样本量相对有限(15例)，年龄跨度较大(19-74岁) | 探究人类骨髓造血系统衰老过程中淋巴系发育轨迹的变化特征 | 人类骨髓造血干细胞和祖细胞(HSPCs, CD34+) | 单细胞基因组学 | 衰老相关血液系统变化 | 单细胞RNA测序, 功能转录组分析, 发育轨迹研究 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名健康人类受试者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-11-17 |
Multi-Omics discovery and clinical validation of IGFBP2, B2M, and CST3 as a serum biomarker panel for diabetic kidney disease progression
2025-Oct-28, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149858
PMID:41167578
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法鉴定出IGFBP2、B2M和CST3作为糖尿病肾病进展的血清生物标志物组合 | 首次整合单细胞RNA测序与血清蛋白质组学数据，系统识别并验证了糖尿病肾病进展的新型血清生物标志物组合 | 样本量相对有限（人类组织30例，临床血清样本139例），需要更大规模的前瞻性研究验证 | 开发糖尿病肾病进展的非侵入性生物标志物组合 | 人类肾脏组织、小鼠糖尿病肾病模型、临床血清样本 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 分子对接, LASSO模型 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 临床数据 | 人类肾脏组织30例（18健康+12糖尿病肾病），临床血清样本139例，小鼠模型16例 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-17 |
CD5 Expression in CTCL and Its Implications for Anti-CD5 CAR T-Cell Therapy
2025-Oct-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110411
PMID:41226451
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析蕈样肉芽肿中CD5表达模式，评估其作为CAR-T细胞治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平揭示CTCL中CD5表达的动态变化及其与病变类型的关联 | 样本量有限，需要更多研究阐明临床意义 | 评估CD5在皮肤T细胞淋巴瘤中的表达特征及其治疗靶点价值 | 蕈样肉芽肿患者皮肤活检组织中的CD4 T细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例斑片/斑块期MF活检、8例肿瘤期MF活检、8例健康对照活检 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-11-17 |
Emerging Roles of Megakaryocytes in Immune Regulation and Potential Therapeutic Prospects
2025-Oct-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211677
PMID:41227322
|
综述 | 本文系统阐述了巨核细胞在免疫调节中的新兴功能及其治疗潜力 | 突破传统认知，揭示巨核细胞具有血小板生成之外的免疫功能，包括参与先天与适应性免疫、调节造血干细胞微环境等 | NA | 探讨巨核细胞的非经典功能及其在治疗应用中的潜力 | 巨核细胞及其异质性群体 | NA | 自身免疫疾病, 血液系统疾病 | 单细胞转录组学, 成像技术, 异种移植策略 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-11-17 |
The Anti-Cancer Potential of Genistein: Single-Cell RNA Sequencing Analysis and Spatial Transcriptome Reveal That Genistein Targets HSD17B1 to Inhibit the Progression of Gastric Adenocarcinoma
2025-Oct-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110369
PMID:41226409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示金雀异黄素通过靶向HSD17B1抑制胃腺癌进展的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术系统解析金雀异黄素在胃腺癌中的'药物-基因-细胞'互作网络 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接验证，缺乏体内外实验进一步验证机制 | 探究金雀异黄素在胃腺癌治疗中的分子靶点及作用机制 | 胃腺癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-17 |
Single-Cell Heterogeneity of Epigenetic Factor Regulation Deciphers Alteration of RNA Metabolism During Proliferative SHH-Medulloblastoma
2025-Oct-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213424
PMID:41228218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析髓母细胞瘤中表观遗传调控因子的表达异质性，揭示其在RNA代谢和肿瘤进展中的作用 | 首次在单细胞水平系统分析髓母细胞瘤表观遗传调控因子的表达异质性，并开发与预后相关的表观遗传评分 | 研究基于现有数据库和两个独立队列，样本来源有限 | 探究表观遗传调控在髓母细胞瘤分子异质性和临床预后中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 两个独立队列（PBTA和Williamson队列） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-11-17 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Immune Remodeling in Lungs of β-Carotene Oxygenase 2 Knockout Mice with Improved Antiviral Response
2025-Oct-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213329
PMID:41228402
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现β-胡萝卜素加氧酶2敲除小鼠肺部免疫重塑并增强抗病毒反应 | 首次揭示BCO2在肺部免疫架构和抗病毒反应中的调控作用，发现其缺失导致免疫细胞组成改变和细胞状态重编程 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究BCO2缺失对肺部免疫细胞组成和抗病毒反应的影响 | BCO2敲除小鼠和C57BL/6J野生型小鼠的肺部组织 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，免疫印迹，基因集变异分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质数据 | BCO2敲除和野生型小鼠肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-17 |
Enthesis-related progenitors recruited from the subacromial bursa contribute to rotator cuff healing in rats
2025-Oct-08, Journal of shoulder and elbow surgery
IF:2.9Q1
DOI:10.1016/j.jse.2025.08.016
PMID:41072716
|
研究论文 | 本研究探索了肩袖愈合过程中表达scleraxis和Sox9的附着点相关祖细胞的特性，并评估了肩峰下滑囊保留对祖细胞募集及术后愈合的影响 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定肩袖愈合过程中的细胞亚群，并揭示肩峰下滑囊是Scx+/Sox9+祖细胞的重要来源 | 研究仅在动物模型中进行，样本量相对有限，且仅观察了术后6周内的短期效果 | 探索肩袖肌腱-骨愈合过程中附着点相关祖细胞的来源和调控机制 | 斯普拉格-道利大鼠和ScxGFP转基因大鼠的肩袖组织 | 组织工程与再生医学 | 运动系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 组织学分析, 生物力学测试 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 力学性能数据 | 71只野生型大鼠和6只转基因大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-17 |
TGFB1/SMAD3-driven macrophage-myofibroblast transition promotes fibrosis progression in endometriosis
2025-Oct-02, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf051
PMID:41056423
|
研究论文 | 本研究揭示TGFB1/SMAD3信号通路驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症纤维化进展的新机制 | 首次发现巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症中肌成纤维细胞的新来源，并阐明TGFB1/SMAD3信号通路的调控作用 | NA | 探索子宫内膜异位症纤维化进展的细胞来源和调控机制 | 人类子宫内膜样本和子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，组织学分析，超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 人类子宫内膜样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-17 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nucleus RNA Sequencing Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf077
PMID:40857558
|
研究论文 | 系统评估单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确度 | 首次系统评估sc/snRNA-seq数据的定量精确度和准确度，建立了数据驱动的研究设计阈值，并开发了VICE工具评估数据质量 | 研究主要基于单核吞噬细胞数据，可能不适用于所有细胞类型 | 提高单细胞/单核RNA测序研究的可靠性和可重复性 | 单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞来自339个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-17 |
LncCE: Landscape of Cellularly-elevated lncRNAs in Single Cells Across Normal and Cancer Tissues
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf069
PMID:40833782
|
研究论文 | 开发了LncCE资源，系统探索正常和癌组织中单细胞水平细胞高表达lncRNAs的表达图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统构建跨正常和癌组织的细胞高表达lncRNAs资源库 | 基于现有单细胞RNA测序数据集分析，未包含所有可能的细胞类型和组织 | 构建单细胞水平lncRNAs表达图谱资源 | 长链非编码RNAs在正常和癌组织中的表达模式 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 181个单细胞RNA测序数据集，包含20个胎儿正常组织、59个成人正常组织、32个成人癌症类型和5个儿童癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-11-17 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
|
研究论文 | 通过单血管空间转录组分析揭示毛细血管畸形的病理特征及NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 | 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱，发现NR2F2是调控平滑肌细胞表型获得的关键因子 | 研究样本量有限，主要依赖诱导多能干细胞模型验证机制 | 探究毛细血管畸形的血管发病机制和病理重塑过程 | 毛细血管畸形病变组织及诱导多能干细胞分化的血管细胞 | 空间转录组学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 免疫荧光染色 | 基因扰动分析, iPSC分化模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 磷酸化蛋白质组数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学 | GeoMx | 空间全转录组分析平台 |
| 76 | 2025-11-17 |
ZEB1 promotes chemo-immune resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Sep-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
|
研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗抵抗的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16表达促进胰腺癌化疗免疫抵抗，并证实靶向ZEB1可增强多种免疫疗法疗效 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证 | 探究胰腺癌化疗免疫治疗抵抗的表观遗传机制 | 胰腺癌模型（患者来源类器官、异种移植和原位模型） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 患者来源模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-17 |
Epiblast-derived CX3CR1+ progenitors generate cardiovascular cells during cardiogenesis
2025-Aug, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00488-z
PMID:40551012
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪揭示了胚胎CX3CR1+细胞作为多能性上胚层来源祖细胞群，在心脏发育过程中生成心肌细胞、内皮细胞和巨噬细胞 | 首次发现CX3CR1+细胞起源于E6.5上胚层细胞，并证实其通过新生分化和细胞融合双重机制生成心血管细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需验证 | 阐明CX3CR1+细胞在心脏发育过程中的起源和命运 | 小鼠胚胎和成年心脏中的CX3CR1+细胞及其谱系细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、胚胎干细胞分化 | NA | 基因表达数据、细胞谱系数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段（E6.5-E9.5）及成年心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-17 |
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
|
研究论文 | 开发了一个多尺度生成和预测模型Spatia，用于整合细胞形态、基因表达和空间背景的表示学习 | 首次提出能够融合细胞形态、基因表达和空间背景的统一表示学习方法，并具备生成高分辨率细胞图像的能力 | NA | 学习整合细胞形态、基因表达和空间背景的统一表示，以理解组织功能 | 空间转录组学数据中的细胞、生态位和组织 | 数字病理学 | 多种疾病 | 空间转录组学 | Transformer, 扩散模型, 交叉注意力 | 图像, 基因表达数据 | 1700万细胞-基因对，100万生态位-基因对，1万组织-基因对，来自49名捐赠者，17种组织类型，12种疾病状态 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-11-17 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040
PMID:40029262
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了尤文肉瘤肿瘤的转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境特征 | 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序技术，发现肿瘤内转录异质性、克隆进化模式，并鉴定出循环肿瘤细胞中TSPAN8作为潜在治疗靶点 | 样本量较小（7例未治疗患者），循环肿瘤细胞验证使用独立队列 | 探索尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化，寻找新的治疗靶点 | 尤文肉瘤患者原发肿瘤、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 7例未治疗尤文肉瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptomic data reveal the cellular heterogeneity of glutamine metabolism in gastric premalignant lesions and early gastric cancer
2025-Apr-23, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025061
PMID:40264416
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据揭示了胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胃部癌前病变和恶性病变中的谷氨酰胺代谢特征，并鉴定ERO1LB作为关键调控因子 | NA | 探究胃部癌前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性特征 | 慢性萎缩性胃炎和早期胃癌病变组织 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22511个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |