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当前共找到 32278 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-08 |
The multifaceted role of YAP in the tumor microenvironment and its therapeutic implications in cancer
2025-Oct, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01551-9
PMID:41028521
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综述 | 本文综述了YAP/TAZ在肿瘤微环境中的多重作用及其在癌症治疗中的意义 | 系统阐述了YAP/TAZ作为Hippo信号通路关键效应子在肿瘤微环境重塑中的核心调控作用，及其与免疫治疗联合应用的潜力 | 肿瘤选择性和耐药机制等挑战仍然存在 | 探讨YAP在肿瘤微环境中的作用机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的YAP/TAZ信号通路 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2025-11-08 |
Comparative Single-Cell Transcriptome Analysis of c-Met Receptor Expressing and Non-Expressing Projection Neurons in the Developing Frontal and Visual Cortices
2025-Sep-25, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000548617
PMID:40996948
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较发育中前额叶和视觉皮层c-Met受体表达与非表达投射神经元的转录组差异 | 首次在发育阶段系统比较同一投射神经元亚类中Met+和Met-群体的转录组差异，揭示MET受体在皮层回路异步成熟中的作用 | 研究仅关注小鼠发育早期阶段，未涵盖整个发育过程；样本数量相对有限 | 探究发育中皮层投射神经元亚类内转录组异质性的分子基础 | 小鼠视觉和前额叶皮层中的投射神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, smFISH | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 小鼠皮层神经元（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2025-11-08 |
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Sep-17, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105252
PMID:40972808
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学开发了一个30基因分类器，用于区分低风险骨髓增生异常综合征的造血干细胞与健康造血干细胞 | 首次利用单细胞转录组学在LR-MDS中开发了30基因评分系统，并揭示了囊泡运输通路在疾病中的新作用机制 | 研究仅限于低风险MDS患者，未涵盖高风险MDS群体 | 阐明低风险骨髓增生异常综合征的病理生理机制并发现潜在治疗靶点 | 低风险骨髓增生异常综合征患者的造血干细胞和祖细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | 基因评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-11-08 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术分析外阴硬化性苔藓病变组织，揭示角质形成细胞在该疾病发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统揭示外阴硬化性苔藓中角质形成细胞的双重角色及多细胞类型的分子变化特征 | 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 外阴硬化性苔藓患者的病变、非病变皮肤组织及健康外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2025-11-08 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
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研究论文 | 本研究通过时空单细胞分析揭示了人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新型计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析，首次整合混合淋巴细胞反应克隆指纹识别、TCR克隆分型、单细胞RNA/TCR测序和空间转录组学技术 | 样本量相对有限（27名alloHCT受者），研究结果需要在更大队列中验证 | 解析异基因造血细胞移植后T细胞介导的复杂病理机制 | 27名异基因造血细胞移植受者的T细胞 | 单细胞多组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA/TCR测序,空间转录组学,TCR克隆分型,混合淋巴细胞反应 | DecompTCR | 单细胞多组学数据,空间转录组数据 | 27名异基因造血细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-11-08 |
Unveiling and verification of mitochondria-related genes as potential diagnostic biomarkers in ulcerative colitis based on bioinformatics analysis and experimental validation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336224
PMID:41187148
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，构建了基于线粒体相关基因的溃疡性结肠炎诊断模型 | 首次系统性地识别线粒体相关差异表达基因作为溃疡性结肠炎的潜在诊断标志物，并验证ACADM和ACADSB基因在疾病中的重要作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性研究验证诊断模型的临床适用性 | 构建溃疡性结肠炎的诊断模型，阐明线粒体相关基因在疾病发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 诊断模型 | 基因表达数据 | 465名溃疡性结肠炎患者和154名健康对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-11-08 |
Construction and validation of an anoikis-related prognostic model for lung adenocarcinoma based on bulk and single-cell transcriptomic data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335788
PMID:41187171
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研究论文 | 基于批量和单细胞转录组数据构建并验证肺腺癌失巢凋亡相关预后模型 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据，开发了包含7个基因的失巢凋亡相关预后特征，并揭示了TIMP1通过促进Treg细胞活性导致免疫抑制肿瘤微环境的机制 | 模型验证仅限于两个GEO数据库队列，需要更多独立队列验证临床适用性 | 开发并验证肺腺癌失巢凋亡相关预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO数据库肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-08 |
Finding differentially expressed genes between cell fates predicted by image-based deep learning
2025, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v22.0022
PMID:41189733
|
研究论文 | 开发了一种整合基于图像的深度学习细胞命运预测与单细胞转录组分析的方法，用于发现不同预测命运间的差异表达基因 | 首次将图像基深度学习细胞命运预测与单细胞全转录组分析相结合，在转录组谱未显示明显聚类时仍能检测差异表达基因 | 仅作为原理验证应用于热应激诱导的细胞死亡模型，尚未在其他细胞命运决定过程中验证 | 发现细胞命运决定过程中的早期触发基因 | 哺乳动物细胞系（经历热应激后命运不同的细胞） | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 延时成像, 深度学习 | 深度学习模型 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-11-08 |
Single-cell sequencing reveals the response mechanisms of vascular endothelial cells to glucocorticoids in diabetic retinopathy
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334230
PMID:41196918
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究糖皮质激素在糖尿病视网膜病变中对血管内皮细胞的响应机制 | 首次在单细胞水平揭示糖尿病视网膜病变中血管内皮细胞的糖皮质激素活性变化及相关调控网络 | 研究基于公共数据库的单一数据集，需要进一步实验验证 | 阐明糖皮质激素在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用 | 糖尿病视网膜病变组织中的血管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、转录因子分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据集GSE178121 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-08 |
Single-cell transcriptomics in metastatic breast cancer: mapping tumor evolution and therapeutic resistance
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1669741
PMID:41199747
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究中的应用，重点阐述其在描绘肿瘤进化、揭示治疗耐药机制方面的价值 | 通过单细胞分辨率解析转移性乳腺癌的肿瘤异质性、细胞进化轨迹和治疗耐药克隆，整合空间转录组学和多组学平台提供肿瘤生态系统全景视图 | 存在当前技术挑战，临床转化应用仍需进一步探索 | 探索单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究和精准肿瘤学中的应用潜力 | 转移性乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组学，多组学分析 | NA | 单细胞基因表达数据，空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-08 |
Integrative multi-omics identifies MEIS3 as a diagnostic biomarker and immune modulator in hypertrophic cardiomyopathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675467
PMID:41200169
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定MEIS3作为肥厚型心肌病的诊断生物标志物和免疫调节因子 | 首次发现MEIS3在HCM中作为基质中心免疫调节因子的关键作用，并构建了lncRNA-miRNA-MEIS3调控网络 | 样本量较小（HCM患者n=4，健康对照n=3），需要更大规模研究验证 | 表征转录因子MEIS3在肥厚型心肌病中的临床和免疫学作用 | 肥厚型心肌病患者和健康对照者的外周血样本及心肌组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习算法 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据 | 7例样本（4例HCM患者，3例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-11-08 |
Identification and validation of plasma protein biomarkers as therapeutic targets in acute myeloid leukemia: an integrative multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659811
PMID:41200167
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研究论文 | 通过整合多组学方法识别并验证急性髓系白血病中具有因果作用的循环蛋白生物标志物 | 首次提供TNFAIP8、TCL1A、WFDC1和TNFSF8在AML中因果作用的遗传证据，并发现13种靶向这些蛋白的候选治疗药物 | NA | 识别和验证AML中具有致病因果作用的新型循环蛋白生物标志物 | 急性髓系白血病患者和健康对照 | 多组学整合分析 | 急性髓系白血病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,ELISA,药物重定位分析,全表型关联研究 | 孟德尔随机化 | 蛋白质定量性状位点数据,全基因组关联研究数据,单细胞RNA测序数据,血浆蛋白水平数据 | 来自deCODE、UK Biobank Pharma Proteomics Project、FinnGen和UK Biobank多个大型队列的数据 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,基因组关联分析 | NA | NA |
| 73 | 2025-11-08 |
Differential gene expression profiling and machine learning-based discovery of key genetic markers in VTE and CKD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654673
PMID:41200172
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研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析识别静脉血栓栓塞和慢性肾脏病共享的关键基因标记 | 首次通过整合三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别VTE和CKD共享的关键基因HNRNPA0和PI4KA | 研究依赖于公共数据集验证，需要进一步实验验证机制 | 识别连接静脉血栓栓塞和慢性肾脏病的关键基因和分子通路 | 静脉血栓栓塞和慢性肾脏病患者基因表达数据 | 机器学习 | 静脉血栓栓塞,慢性肾脏病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | 多个公共数据集(GSE37171和GSE48000) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-08 |
Immune cell communication networks and memory CD8+ T cell signatures sustaining chronic inflammation in COVID-19 and Long COVID
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689507
PMID:41200182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析COVID-19和长新冠患者的免疫细胞通讯网络和记忆CD8+ T细胞特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示记忆CD8+ T细胞在MHC-I介导的通讯网络中的核心地位及其与慢性炎症的关联 | 样本量相对有限，仅包含73,110个外周血单核细胞 | 探索COVID-19和长新冠中慢性炎症的免疫学机制 | 来自健康、暴露、感染和住院个体的外周血单核细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，机器学习，SHAP分析 | XGBoost等9种机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 73,110个外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-08 |
Identification of immunogenic cell death signature genes in hepatocellular carcinoma: from single-cell transcriptomics to in vitro mechanistic validation and comprehensive prognostic modeling with hundreds of machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649618
PMID:41200185
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和多组学数据，识别肝细胞癌中的免疫原性细胞死亡特征基因，并建立预后模型 | 首次在肝细胞癌中全面表征免疫原性细胞死亡特征，整合单细胞和批量转录组数据，并采用数百种机器学习算法优化预后模型 | 研究样本量相对有限，需要前瞻性验证和伴随诊断开发 | 建立肝细胞癌免疫原性细胞死亡的全面预后框架，为免疫治疗选择提供分层依据 | 肝细胞癌患者样本和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组学，ssGSEA，WGCNA，机器学习算法 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据 | 7个HCC样本(44,461个细胞)，三个独立队列(TCGA-HCC 371例，GSE14520 242例，ICGC 445例) | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-11-08 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示肾移植排斥早期的免疫景观，并确定Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘肾移植急性排斥早期的免疫细胞动态和细胞间通讯网络，发现Isg15+巨噬细胞亚群通过Ccl3-Ccr5轴驱动排斥反应 | 研究基于大鼠模型，需要在人类患者中进一步验证 | 阐明肾移植急性排斥早期的免疫细胞动态和细胞间通讯机制 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，治疗干预实验 | 无监督聚类，细胞轨迹推断，细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像 | 大鼠肾移植后第0、1、3、7天的CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-08 |
CD44 and CLDN3 as immune-metabolic regulators in acute pancreatitis: a multi-modal transcriptomics study and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665200
PMID:41200201
|
研究论文 | 本研究通过多组学转录组分析鉴定CD44和CLDN3作为急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键生物标志物 | 首次揭示CD44和CLDN3在胰腺腺泡细胞与免疫细胞间免疫代谢失调中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探索急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键分子机制 | 急性胰腺炎小鼠模型及公共转录组数据集 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习算法,免疫组织化学 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE65146,GSE109227,GSE279876)及实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-08 |
DOCK3 orchestrates metastasis and immune microenvironment in prostate cancer
2025, Frontiers in urology
DOI:10.3389/fruro.2025.1662692
PMID:41200217
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研究论文 | 本研究探讨DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 首次系统揭示DOCK3在前列腺癌中协调转移和免疫微环境的双重功能，提出其作为新型生物标志物和联合免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于计算分析和现有数据库，缺乏实验验证 | 探究DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 前列腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 多组学分析 | DESeq2, CIBERSORT, ssGSEA, xCell, WGCNA, Harmony, UMAP | 基因组数据, 转录组数据 | TCGA-PRAD: 499个肿瘤/52个正常样本; GEO scRNA-seq: 45,325个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-11-08 |
Preclinical lentiviral hematopoietic stem cell gene therapy corrects Pompe disease-related muscle and neurological manifestations
2024-Nov-06, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.09.024
PMID:39295144
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研究论文 | 本研究通过慢病毒载体介导的造血干细胞基因疗法在临床前小鼠模型中逆转庞贝病的病理效应 | 首次系统性评估慢病毒造血干细胞基因疗法对庞贝病相关肌肉和神经系统表现的矫正效果，并包含整合位点分析和单细胞RNA测序的全面安全性评估 | 研究仅限于临床前小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发治疗庞贝病的下一代基因疗法 | 庞贝病小鼠模型 | 基因治疗 | 庞贝病 | 慢病毒载体基因治疗，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，整合位点分析数据 | 临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-08 |
Advancing bone biology: The mutual promotion of biology and pioneering technologies
2024-Sep-16, The innovation life
DOI:10.59717/j.xinn-life.2024.100078
PMID:41189598
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综述 | 回顾骨生物学发展历程并探讨前沿技术对骨生物学研究的推动作用 | 系统梳理骨生物学历史里程碑，强调多组学方法和人工智能等新兴技术的整合潜力 | NA | 探讨骨生物学发展历程与前沿技术的相互促进作用 | 骨组织生物学研究 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学方法 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |