本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-17 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Salivary Epithelial Cells Reveals Large-Scale Dysregulation in Bitter Taste Dysfunction
2026-Mar-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27072953
PMID:41977143
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析唾液上皮细胞,揭示了长期COVID患者苦味功能障碍的大规模分子失调机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究长期COVID患者的唾液上皮细胞,揭示苦味功能障碍与细胞骨架动力学、味觉细胞-神经突触组装及微生物防御标志物下调的关联 | 研究样本可能有限,且未明确因果关系,主要基于相关性分析 | 阐明长期COVID患者苦味功能障碍的细胞和分子基础 | 长期COVID患者的唾液上皮细胞 | 数字病理学 | 长期COVID | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-04-17 |
Palmatine ameliorates MASLD in type 2 diabetes by modulating hepatic apoptosis and inflammation
2026-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45476-3
PMID:41865191
|
研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析和实验验证,揭示了黄连素通过调控ADRB2、BCL3等五个核心靶点抑制肝细胞凋亡,从而改善2型糖尿病相关代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 首次采用顺序性多组学生物信息学工作流程生成可验证的机制假说,并成功鉴定出黄连素作用的五个核心靶点网络,通过单细胞测序技术将这些靶点定位到特定肝细胞类型 | 研究仅在动物模型中进行验证,尚未进行人体临床试验;多组学分析基于预测和动物数据,人类临床相关性有待进一步证实 | 阐明黄连素改善2型糖尿病相关MASLD的分子机制 | 2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序,多组学分析,分子对接,机器学习 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 基因表达数据,蛋白质结构数据,单细胞测序数据 | 大鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-04-17 |
Hyperinnervation inhibits organ-level regeneration in mammalian skin
2026-Mar-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.027
PMID:41864207
|
研究论文 | 本研究探讨了哺乳动物皮肤器官水平再生的机制,发现产后伤口中成纤维细胞驱动的过度神经支配是再生的关键障碍 | 首次揭示产后伤口特异性成纤维细胞(PWF)通过Timp1、Cxcl12和Ccl7基因导致过度神经支配,从而抑制器官水平再生,并证明通过减少神经支配可恢复再生能力 | 研究主要基于小鼠模型,未涉及人类皮肤再生,且具体分子通路机制有待进一步阐明 | 探究哺乳动物皮肤器官水平再生的调控机制及产后再生能力丧失的原因 | 小鼠胚胎及产后皮肤伤口愈合过程,包括上皮、间充质、神经元和血管组织 | 发育生物学与再生医学 | 皮肤损伤与再生障碍 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及胚胎和产后不同时间点的皮肤伤口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-04-17 |
Glioma-Immune crosstalk in the tumor microenvironment: mechanistic insights and therapeutic translation
2026-Mar-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-026-03239-0
PMID:41817826
|
综述 | 本文综述了胶质瘤肿瘤微环境中胶质瘤细胞与免疫细胞之间的动态相互作用,探讨了其对肿瘤进展、治疗反应的影响以及治疗转化的意义 | 强调了空间转录组学和蛋白质组学在揭示胶质瘤分子区域异质性方面的进展,并指出从诊断到复发过程中肿瘤微环境的演变是预测免疫治疗反应的关键挑战 | 当前研究主要集中于肿瘤相关巨噬细胞,对其他免疫细胞亚群的研究尚不充分,且标准疗法对免疫细胞动态的重塑及其在治疗抵抗中的作用仍未完全阐明 | 深入理解胶质瘤肿瘤微环境中肿瘤与免疫的相互作用机制,以指导更有效的个性化免疫治疗策略的开发 | 胶质瘤(特别是胶质母细胞瘤)及其肿瘤微环境中的免疫细胞(如调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2026-04-17 |
CD19+Ki67+B cells regulated by NAMPT as key modulators in triple-negative breast cancer with brain metastasis
2026-Mar-09, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02251-6
PMID:41803986
|
研究论文 | 本研究揭示了CD19+Ki67+ B细胞通过激活NAMPT/ITGA5/ITGB1通路驱动三阴性乳腺癌脑转移的机制 | 首次通过单细胞RNA测序分析发现循环B细胞(CD19+Ki67+)在三阴性乳腺癌脑转移中显著富集,并阐明了其通过NAMPT/ITGA5/ITGB1信号通路调控肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限(15例单细胞测序患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究三阴性乳腺癌脑转移的免疫调控机制 | 三阴性乳腺癌患者样本、肿瘤类器官、B细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 类器官共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA-seq数据, 组织图像数据 | 15例患者(8例转移,7例非转移)进行单细胞测序;两个独立RNA-seq队列(TCGA, GSE65194);湘雅真实世界队列;74例患者样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-04-17 |
Single-cell and multi-omics analysis identifies mitophagy-related biomarkers and therapeutic targets in ischemic stroke
2026-Mar-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43377-z
PMID:41792398
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学分析,识别了缺血性卒中中与线粒体自噬相关的生物标志物和治疗靶点 | 整合了bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合WGCNA和机器学习模型,首次在缺血性卒中中鉴定出五个核心线粒体自噬相关基因生物标志物,并揭示了小胶质细胞亚群中线粒体自噬活性的动态变化 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qPCR,缺乏体内功能验证,且样本来源和规模可能限制结果的普适性 | 探究线粒体自噬相关基因在缺血性卒中中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 缺血性卒中患者或模型中的基因表达数据,特别是线粒体自噬相关基因 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qPCR, 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-03-07 |
Identification and validation of prognostic genes associated with M2 macrophage and heme metabolism in lung adenocarcinoma through bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Mar-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04742-6
PMID:41787185
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2026-04-17 |
Neutrophil extracellular traps-associated candidate genes in IgA vasculitis: an exploratory multi-omics analysis integrating transcriptomics and Mendelian randomization
2026-Mar-05, Pediatric rheumatology online journal
DOI:10.1186/s12969-026-01197-5
PMID:41787453
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和孟德尔随机化方法,探索了IgA血管炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的候选基因 | 首次采用多组学整合方法(包括转录组学、孟德尔随机化和单细胞RNA测序)系统性地识别IgA血管炎中NET相关的候选基因,并进行了细胞类型特异性分析 | 这是一项探索性研究,样本量有限,结果需要在更大队列和功能研究中进一步验证 | 探索IgA血管炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的候选基因及其在免疫细胞特异性背景下的作用 | IgA血管炎患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | IgA血管炎 | 转录组学分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 基因集富集分析、基因集变异分析、转录组范围关联研究 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及IgA血管炎患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-04-17 |
FFAR4 negatively regulates colorectal cancer growth via blocking oxidative phosphorylation
2026-Mar-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07942-4
PMID:41787450
|
研究论文 | 本研究探讨了FFAR4在结直肠癌中的抑制作用,通过多组学方法发现FFAR4表达降低与不良预后相关,并通过激活FFAR4抑制肿瘤生长,机制涉及线粒体呼吸和细胞代谢的调控 | 首次将FFAR4鉴定为结直肠癌的关键候选基因,并揭示其通过阻断氧化磷酸化负调控肿瘤生长的机制,为结直肠癌的诊断和治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限,且未深入探讨FFAR4在不同亚型结直肠癌中的异质性作用 | 阐明FFAR4在结直肠癌中的功能及其作为诊断生物标志物和治疗策略的潜力 | 结直肠癌组织、CRC细胞系和MC38同基因肿瘤模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、转录组学、免疫荧光、代谢分析、细胞外通量分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、代谢数据 | 临床CRC组织样本、CRC细胞系、MC38小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-04-17 |
A hormetic transcriptional program coregulates invasion, proliferation and dormancy to define metastatic potential
2026-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70242-4
PMID:41781391
|
研究论文 | 本文通过整合空间转录组学与单细胞基因表达及染色质谱分析,揭示了转录因子Prrx1作为扩散主调控因子的作用,并探讨了其表达水平与转移潜能之间的非线性关系 | 发现Prrx1通过调节侵袭、增殖和休眠程序,以非线性方式影响转移潜能,揭示了转移能力在细胞离开原发肿瘤时已预设 | 研究主要基于乳腺癌临床前模型和队列,可能不适用于其他癌症类型,且具体分子机制需进一步验证 | 探究决定癌症转移能力和其获取时间的因素 | 人类乳腺癌队列和临床前模型中的癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 单细胞基因表达谱, 染色质谱分析 | NA | 转录组数据, 染色质数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-04-17 |
From Immunobiology to Clinical Application: Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma
2026-Mar-03, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm16030147
PMID:41893014
|
综述 | 本文是一篇关于肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤中的生物学作用、预后预测价值以及基于TIL的过继细胞疗法应用的叙述性综述 | 系统性地整合了TIL生物学、预后标志物作用及TIL-ACT疗法在晚期黑色素瘤中的应用现状与未来方向,特别是在免疫检查点抑制剂失败后的治疗策略 | 作为一篇叙述性综述,其结论基于现有文献的综合分析,而非原始数据研究,可能存在发表偏倚 | 综述肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤免疫生物学中的作用及其向临床应用(特别是过继细胞疗法)的转化 | 黑色素瘤患者、肿瘤浸润淋巴细胞、基于TIL的过继细胞疗法 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、显微镜检查 | NA | 文本(文献数据) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2026-04-17 |
Oncolytic HSV-1-Mediated JAG1 Blockade Induces Glioma Senescence-Associated Secretory Phenotype to Increase Macrophage Activation and Cetuximab-Mediated Senolysis
2026-Mar-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1402
PMID:41411618
|
研究论文 | 本研究开发了一种拮抗JAG1的溶瘤HSV-1病毒(OD-0J1),并揭示了其通过诱导胶质瘤细胞衰老、改变肿瘤微环境中的巨噬细胞表型,并与西妥昔单抗联合增强抗肿瘤疗效的机制 | 首次将溶瘤病毒与JAG1阻断策略结合,并发现诱导的细胞衰老表型可被西妥昔单抗靶向清除,为联合治疗提供了新思路 | 研究主要在临床前动物模型中进行,其人体有效性和安全性尚需进一步验证 | 探究JAG1介导的信号在胶质瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中的作用,并开发新的联合治疗策略 | 胶质瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、溶瘤HSV-1病毒工程改造体 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、激酶组分析、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、细胞表型数据 | 无胸腺裸鼠和人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-04-17 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
|
研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术,揭示了宫颈癌中代谢与免疫相互作用的分子机制,并探索了苦参碱的潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术,系统性地构建了宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络,并探索了天然产物苦参碱的多靶点抗肿瘤机制 | 苦参碱的具体作用机制尚未完全明确,体外实验和分子对接结果仅为初步验证,需要进一步的体内实验和临床研究证实 | 阐明宫颈癌的分子机制,评估苦参碱干预的潜力,为宫颈癌治疗提供新的研究方向和治疗靶点 | 宫颈癌组织、TCGA数据库中的宫颈癌数据、苦参碱 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、空间转录组、生物信息学分析、分子对接、体外实验 | CIBERSORT算法、ESTIMATE算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 74 | 2026-04-17 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证,识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点,并揭示了蒜素(allicin)的治疗机制 | 整合了多组学数据、机器学习算法(随机森林和LASSO)、单细胞RNA测序分析以及反向药物筛选,首次系统性地识别了CXCL10、ISG15和IFI27作为银屑病和银屑病关节炎的共有免疫治疗靶点,并通过分子对接、动力学模拟和实验验证了蒜素通过抑制NF-κB信号通路调控这些靶点的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证部分可能受样本量和体外实验模型的限制,蒜素在体内的药效和安全性仍需进一步临床研究证实 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点,预测潜在治疗药物,并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物蒜素及其活性成分蒜素 | 生物信息学, 机器学习 | 银屑病, 银屑病关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-04-17 |
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09921-z
PMID:41501470
|
研究论文 | 本研究揭示了TRPV1痛觉感受器与上皮簇细胞之间的神经-上皮回路在启动2型炎症和肠道免疫中的关键作用 | 首次发现TRPV1痛觉感受器通过化学感觉上皮簇细胞启动级联组织反应,驱动2型炎症,揭示了神经-上皮簇细胞回路作为2型免疫和组织适应的上游决定因素 | NA | 探究不同类型感觉输入(上皮、神经元和免疫细胞)如何协调和整合以驱动2型炎症和肠道免疫 | TRPV1痛觉感受器、上皮簇细胞、肠道上皮细胞、蠕虫感染模型 | NA | 蠕虫感染、过敏炎症 | 空间转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-04-17 |
Diversity and immune dynamics of choroid plexus macrophages are shaped by distinct developmental origins
2026-Mar, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02158-z
PMID:41566006
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合谱系和空间追踪方法,揭示了脉络丛巨噬细胞的发育起源、生态位特化和免疫动态 | 首次识别出三种生物学上不同的脉络丛巨噬细胞亚群,并阐明了它们由不同造血波产生、占据不同解剖位置、依赖不同生存因子以及TGFβ信号在维持其组织特异性身份中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本分析相对有限,且未深入探讨这些巨噬细胞亚群在特定疾病中的功能差异 | 探究脉络丛巨噬细胞的多样性、发育起源及其在神经炎症中的免疫动态 | 小鼠和人类脉络丛中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经炎症相关疾病 | 单细胞转录组学,谱系追踪,空间追踪 | NA | 转录组数据,空间数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠和人类脉络丛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-04-17 |
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013610
PMID:41871169
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了HDAC抑制剂诱导EB病毒裂解异质性在B淋巴母细胞中的作用,定义了流产性和难治性状态 | 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EB病毒裂解异质性的机制,并识别了NF-κB下游基因和CD137/CD137L信号轴在阻止成功裂解再激活中的关键作用 | 研究仅基于四种EBV阳性细胞系,且裂解再激活仅在少数细胞中成功,可能限制了结果的普适性 | 探究HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤细胞裂解再激活的影响,并识别宿主因子在阻止成功裂解中的作用 | 四种EBV阳性细胞系:P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 | 单细胞测序 | EBV相关恶性肿瘤(包括伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌和胃癌) | 单细胞RNA测序,Cas9-RNP功能验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四种EBV阳性细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-17 |
Multimodal bioinformatic analyses of genome-scale expression beyond gene-centric differential expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag152
PMID:41978384
|
综述 | 本文综述了基因组规模基因表达分析的概念和方法学进展,超越传统的病例对照比较和基因中心差异表达分析 | 强调使用转录组和多模态组学数据阐明基因表达多样机制,包括基因共表达和调控网络推断、上下文特异性网络模型及机器学习方法 | 作为综述文章,未进行原始研究,主要总结现有进展,未提出具体实验验证 | 提高对先进网络分析的认识并鼓励其应用,以探索基因表达调控的多因素性质 | 基因组规模基因表达数据,包括转录组和多模态组学数据 | 生物信息学 | NA | 转录组学、多模态组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习方法、网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-04-17 |
BCRInsight: an antibody language model to decode biological signals from BCR sequences
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag154
PMID:41978383
|
研究论文 | 本文介绍了BCRInsight,一种基于Transformer架构和表型感知对比学习的抗体特异性预训练语言模型,用于从B细胞受体序列中解码生物信号 | BCRInsight整合了Transformer架构与表型感知对比学习,通过自监督学习从8000万个人类BCR序列中学习生物上下文表示,实现了在多个下游任务中的最先进性能,并展示了基于注意力的结构可解释性 | 未明确提及具体限制,但暗示单细胞测序的可扩展性和成本仍是主要障碍,且传统生物信息学方法难以建模抗体序列中的高阶非线性语义依赖 | 解码B细胞受体序列中嵌入的复杂序列语义,以阐明免疫动态并加速抗体发现 | 人类B细胞受体序列,包括健康、肿瘤和病毒感染状态下的单细胞免疫队列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | Transformer | 序列数据 | 8000万个人类BCR序列 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2026-04-17 |
Analysis of microsatellite instability intensity in single-cell resolution with scMnT reveals tumor heterogeneity in colorectal cancer
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag156
PMID:41978385
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为scMnT的生物信息学方法,用于在单细胞分辨率下识别微卫星不稳定(MSI)细胞并量化MSI强度,揭示了结直肠癌中MSI强度的异质性及其与免疫治疗反应的相关性 | 首次在单细胞水平上量化MSI强度,突破了传统二元分类的局限,揭示了MSI在肿瘤内的异质性连续谱 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性,尚未在更大规模或更多癌种中进行验证 | 开发单细胞水平的MSI强度量化方法,探究MSI异质性在结直肠癌中的临床意义 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 生物信息学分析方法(scMnT) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |