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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2025-10-05
Crocin inhibits neutrophil migration and activation to treat hypoxic pulmonary hypertension through targeting HCK
2025-Sep-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示藏红花素通过靶向HCK抑制中性粒细胞迁移和活化,从而治疗缺氧性肺动脉高压 首次发现藏红花素通过直接靶向HCK蛋白抑制中性粒细胞功能,并阐明其在缺氧性肺动脉高压治疗中的新机制 研究主要基于大鼠模型,临床转化价值需进一步验证 探究藏红花素治疗缺氧性肺动脉高压的药理机制 缺氧性肺动脉高压大鼠模型、中性粒细胞、肺动脉平滑肌细胞 单细胞测序 肺动脉高压 单细胞RNA测序, 分子对接, CETSA, DARTS, 共培养系统 NA 单细胞转录组数据 缺氧性肺动脉高压大鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
62 2025-10-05
Urine proteomic signatures of kidney function decline after hospitalization
2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过尿液蛋白质组学分析识别与住院后肾功能下降相关的蛋白质标志物 首次在多个独立队列中系统鉴定与肾功能下降相关的尿液蛋白质标志物,并结合单细胞和空间转录组学确定其在肾脏细胞中的表达定位 样本量相对有限(174例患者),随访时间中位数为5.1年 探索尿液蛋白质组学在预测住院后肾功能下降中的机制和应用价值 急性肾损伤患者和非急性肾损伤患者 生物医学信息学 肾脏疾病 尿液蛋白质组学分析,单细胞转录组学,空间转录组学 加权相关网络分析 蛋白质组数据,转录组数据,临床数据 174例患者(来自ASSESS-AKI队列),4个独立验证队列包括肾脏精准医学项目 Olink 蛋白质组学,单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA Olink蛋白质组分析平台,检测2783种尿液蛋白质
63 2025-10-05
Th17 cells with regulatory phenotype are the main IL-17F and IL-26 producers in palmoplantar pustulosis
2025-Sep-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示掌跖脓疱病中具有调节表型的Th17细胞是IL-17F和IL-26的主要生产者 首次在PPP中发现共表达调节标记(FOXP3, CTLA4, TIGIT)和IL17F/IL26的混合型regTh17细胞群,并揭示其与IL-36G+角质形成细胞的相互作用机制 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究主要基于转录组数据,需要功能实验进一步证实 解析掌跖脓疱病的细胞和空间结构特征,深入了解IL-17通路在该疾病中的作用机制 掌跖脓疱病患者和健康人的肢端皮肤组织(包括病变、非病变和健康皮肤) 单细胞生物学 皮肤炎症性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),空间转录组分析 NA 单细胞转录组数据,空间定位数据 未明确具体样本数量,包括病变、非病变和健康肢端皮肤 NA 单细胞RNA测序 NA NA
64 2025-10-06
A cross model spatial and single-cell atlas reveals the conserved involvement of osteopontin in polycystic kidney disease
2025-Sep-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过构建跨模型空间和单细胞图谱,揭示骨桥蛋白在多囊肾病中的保守作用机制 首次整合多个PKD小鼠模型的单细胞和空间转录组数据,系统揭示SPP1信号通路在疾病进展中的保守作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 阐明多囊肾病进展的细胞和分子机制 多囊肾病小鼠模型 数字病理学 多囊肾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多个PKD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
65 2025-10-05
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了脂氧素B4在眼高压条件下通过调节TRPV4通道减轻Müller细胞胶质增生的作用机制 首次发现Müller细胞是视网膜中脂氧素B4的重要来源,并揭示了TRPV4激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号的双重作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步验证在人类青光眼患者中的适用性 研究脂氧素B4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症反应 小鼠Müller胶质细胞、原代和永生化Müller细胞 神经科学 青光眼 流式细胞术、免疫染色、qPCR、western blotting、LC-MS/MS脂质组学、单细胞RNA-seq、免疫组织化学 小鼠硅油模型诱导的眼高压模型 转录组数据、蛋白质表达数据、脂质代谢物数据 小鼠模型和体外培养的Müller细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA测序 NA NA
66 2025-10-05
Clonal dynamics shaped by diverse drug-tolerant persister states in melanoma resistance
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发MeRLin平台追踪黑色素瘤靶向治疗期间克隆和转录动态,揭示药物耐受持续细胞状态导致耐药性的机制 整合细胞条形码、单细胞转录组学、RNA-FISH和计算分析的高分辨率谱系追踪平台,首次系统揭示黑色素瘤中四种保守的持续细胞状态 基于患者来源的黑色素瘤模型研究,尚未在临床患者中直接验证 解析黑色素瘤靶向治疗耐药机制 患者来源的黑色素瘤模型 单细胞分析 黑色素瘤 单细胞转录组测序, RNA荧光原位杂交, 空间转录组学 计算分析模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 患者来源黑色素瘤模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, RNA-FISH NA MeRLin平台整合细胞条形码、单细胞转录组学和RNA-FISH技术
67 2025-10-05
Integrative Spatial Omics for Systems-Level Mapping of Pathological Niches
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种整合空间组学的多模态分析流程,用于系统级绘制病理微环境 首次整合MALDI成像质谱脂质组学、空间转录组学、多重免疫荧光显微镜和组织病理学染色,实现跨分子类别的空间分子分析 NA 开发空间组学整合方法以揭示疾病微环境中的空间分子特征 阿尔茨海默病的人脑组织和2型糖尿病的人胰腺组织 空间组学 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 MALDI成像质谱, 空间转录组学, 多重免疫荧光显微镜, 组织病理学染色 NA 质谱数据, 转录组数据, 图像数据 NA NA 空间转录组学, 成像质谱, 多重免疫荧光 NA NA
68 2025-10-06
Reference-Informed Spatial Domain Detection Using Weak Supervision for Spatial Transcriptomics
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种参考信息引导的弱监督对比学习模型GraphScrDom,用于空间转录组数据的组织区域分割 首次将专家标注的空间网格/组织学图像涂鸦与参考单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性基因表达谱相结合进行组织分割 仅使用有限的涂鸦标注,可能在某些复杂组织结构中存在分割精度限制 开发空间转录组数据的组织区域检测方法 空间转录组数据中的组织区域 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq 对比学习模型 空间基因表达数据,组织学图像 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
69 2025-10-05
Exhausted-like effector CD8 T cells mediate immune-stromal interactions at mucosal Chronic Graft-versus-Host Disease onset
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了耗竭样效应CD8 T细胞在口腔黏膜慢性移植物抗宿主病发病机制中的关键作用 首次在口腔黏膜cGVHD发病时鉴定出两个具有耗竭样表型的CD8 T细胞亚群,并揭示了它们从炎症前耗竭状态向终末耗竭状态的转变轨迹 样本量有限,Treg功能受损的确切机制尚未完全阐明 探究慢性移植物抗宿主病的免疫发病机制 口腔黏膜活检组织中的免疫细胞和基质细胞 免疫学 慢性移植物抗宿主病 单细胞RNA测序,伪时间分析 NA 单细胞转录组数据 在cGVHD发病时和移植后6个月收集的口腔黏膜活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2025-10-06
Astrocytic glutamate regulation is shaped by adversity and glucocorticoid signalling
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞核和空间转录组学揭示了人类皮质星形胶质细胞的多样性及其在精神疾病和逆境暴露中的分子变化 首次在人类中系统揭示星形胶质细胞分子多样性及其在精神疾病中谷氨酸相关突触功能的特异性改变,并证实糖皮质激素信号直接调控谷氨酸信号 样本数量有限,未完全阐明性别差异的机制 探究逆境暴露和糖皮质激素信号如何通过星形胶质细胞影响精神疾病风险 人类皮质星形胶质细胞、精神疾病患者、人 pluripotent stem cell 来源的星形胶质细胞模型 空间转录组学 精神疾病 单细胞核转录组学, 空间转录组学, 组织学定量 2D和3D细胞模型 转录组数据, 空间定位数据 约145,000个星形胶质细胞, 超过20,000个组织学定量星形胶质细胞 NA 单细胞核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
71 2025-10-05
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 首次发现p53通过调控内皮细胞亚群动态平衡在肺毛细血管损伤修复中的关键作用,并识别出与人类BPD相关的过渡性内皮细胞状态 研究主要聚焦于内皮细胞,其他细胞类型在BPD中的作用可能未被充分探索 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中的分子机制 新生儿高氧损伤模型中的肺毛细血管内皮细胞 生物医学 支气管肺发育不良 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2025-10-05
Intestinal epithelial Ceacam1 deficiency prevents steroid-refractory acute gut graft-versus-host disease
2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现肠道上皮细胞CEACAM1缺失可预防类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病 首次揭示肠道上皮细胞CEACAM1在SR-Gut-aGVHD中的关键作用机制,并证明其缺失可通过调节T细胞亚群、肠道菌群和单核吞噬细胞来预防疾病 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究肠道上皮细胞CEACAM1在类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病发病机制中的作用 小鼠模型和人类样本中的肠道上皮细胞、免疫细胞及肠道菌群 免疫学 移植物抗宿主病 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,ATAC测序,高维流式细胞术 NA 图像,单细胞转录组数据,表观基因组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,多组学分析 NA NA
73 2025-10-05
Single-Cell Profiling of Pediatric High-Grade Gliomas Reveals OPC-Like Subpopulations Driving Tumorigenic Lineage Transitions
2025-Sep, Pediatric discovery
研究论文 通过单细胞RNA测序分析儿童高级别胶质瘤,揭示少突胶质前体细胞样亚群在肿瘤发生和谱系转化中的关键作用 首次在弥漫性中线胶质瘤中发现表达EGFR的OPC样细胞作为潜在肿瘤起源,并鉴定PDGFRA作为DMG特异性分子标志物 研究排除了婴儿型半球胶质瘤,样本来源和数量可能存在限制 探究儿童高级别胶质瘤的肿瘤微环境特征和肿瘤细胞谱系转化机制 儿童高级别胶质瘤肿瘤细胞 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序, 下一代测序, 多重免疫荧光 Monocle2, CytoTRACE2, SCENT, scMetabolism 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
74 2025-10-05
Delving Into the Dialogue between Epigenetic Modifications and Immunometabolism in Cancer
2025-Sep, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
综述 探讨肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰之间的相互作用及其在肿瘤微环境中的调控机制 系统阐述代谢产物作为表观遗传调节因子调控免疫细胞功能的新机制 肿瘤微环境的细胞复杂性、动态相互作用和时空异质性对研究构成重大挑战 解析肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰的对话机制,探索新兴技术在该领域的应用前景 肿瘤微环境中的免疫细胞及其表观遗传调控 肿瘤免疫学 癌症 单细胞测序,空间组学,人工智能 NA 多组学数据 NA NA 单细胞测序,空间组学 NA NA
75 2025-10-05
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals a Distinct Monocyte MIF/ANXA1 Signature Associated With Poor Responsiveness to ICS
2025-Sep, Allergy, asthma & immunology research
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与哮喘患者吸入糖皮质激素治疗反应不良相关的单核细胞MIF/ANXA1特征 首次在单细胞水平识别出ICS治疗反应不良哮喘患者的特异性单核细胞分子特征,发现MIF-ANXA1信号通路失调是关键免疫特征 样本量较小(仅16例),需要更大规模研究验证 探究哮喘患者对吸入糖皮质激素治疗反应差异的细胞和分子机制 哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16例样本(6例健康对照,6例ICS反应者,4例ICS反应不良者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2025-10-05
Targeting Ferroptosis Restores the Antiviral Activity of CD8+ T Cells During Chronic Hepatitis B Virus Infection
2025-Aug-11, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示铁死亡是慢性乙型肝炎病毒感染中CD8+ T细胞功能失调的关键机制,并探索了靶向干预策略 首次发现HBV特异性CD8+ T细胞发生铁死亡,阐明棕榈酸和TGF-β1通过调控CD36和GPX4协同促进铁死亡的分子机制 研究主要基于患者样本分析,具体分子通路机制需要进一步验证 探究慢性HBV感染中CD8+ T细胞铁死亡现象及其与功能失调的关系 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞,特别是HBV特异性CD8+ T细胞 免疫学 乙型肝炎 流式细胞术、电子显微镜、单细胞RNA测序、MHC I四聚体技术 NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、电子显微镜图像 慢性乙型肝炎患者CD8+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
77 2025-10-05
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 本文总结了Snail1作为癌症相关成纤维细胞关键预后生物标志物在乳腺肿瘤中的作用 揭示了Snail1相关基因特征在CAFs中的预后潜力,并强调了表达Snail1的成纤维细胞的纤维化和免疫抑制作用 基于现有研究的综述性分析,缺乏原始实验数据验证 探讨CAF生物标志物在癌症预后中的价值,特别关注Snail1的作用 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
78 2025-10-05
Non-disruptive 3D profiling of combinations of epigenetic marks in single cells
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种非破坏性的基于成像的单细胞空间表观遗传分析技术Epi-PHR,能够在保持基因组3D结构的同时检测多种表观遗传标记的组合 首次实现了在单细胞水平上同时检测多种表观遗传标记的组合,同时保持基因组的三维空间结构 技术仍处于开发阶段,尚未在大规模样本中验证 研究单细胞中表观遗传标记组合的三维空间分布及其与染色质构象的关系 海马体组织切片中的单细胞 空间组学 NA 表观遗传邻近杂交反应(Epi-PHR),染色质追踪 NA 成像数据,空间表观遗传数据 NA NA 单细胞空间表观遗传分析 Epi-PHR 表观遗传邻近杂交反应技术,能够检测数百个单基因靶点的表观遗传标记组合
79 2025-10-05
RetiGene, a comprehensive gene atlas for inherited retinal diseases (IRDs)
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了用于遗传性视网膜疾病的综合基因图谱RetiGene 整合了变异数据、bulk和单细胞RNA测序数据及功能注释的专家策划基因图谱 NA 解决遗传性视网膜疾病基因目录不完整和更新不及时的问题 遗传性视网膜疾病相关基因 生物信息学 遗传性视网膜疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据, 功能注释数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
80 2025-10-05
Comparison of Lean, Obese, and Weight-Loss Models Reveals TREM2 Deficiency Attenuates Breast Cancer Growth Uniquely in Lean Mice and Alters Clonal T-cell Populations
2025-Apr-03, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过比较瘦型、肥胖型和减重后小鼠模型,揭示TREM2缺失在瘦型小鼠中独特抑制乳腺癌生长并改变克隆性T细胞群体 首次证明体重历史条件影响TREM2抑制在乳腺癌中的疗效,并发现瘦型TREM2缺陷小鼠中CD8+ T细胞从耗竭状态向效应记忆状态的转变 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 探讨肥胖与乳腺癌关联的机制及减重潜在益处,评估TREM2缺失对不同体重状态下绝经后乳腺癌的影响 绝经后乳腺癌小鼠模型(瘦型、肥胖型、减重后) 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 可变-多样-连接区测序(VDJ测序) 小鼠模型 基因表达数据, T细胞受体序列数据 多种体重状态的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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