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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-30 |
Determining the Biological Features of Aggressive Meningioma Growth with Transcriptomic Profiling
2025-Oct-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17203324
PMID:41154381
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示侵袭性脑膜瘤生长的生物学特征 | 首次结合RNA-seq和scRNA-seq数据解析脑膜瘤的细胞组成和肿瘤微环境变化,发现代谢重编程、离子转运紊乱等新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 识别与脑膜瘤分级相关的基因表达特征并评估其功能相关性 | 脑膜瘤组织样本 | 生物信息学 | 脑膜瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组化 | NA | 转录组数据 | 60例脑膜瘤样本(19例脑膜上皮型,11例纤维型,18例非典型型,12例间变型) | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-30 |
Kdm7aa Orchestrates an Immunomodulatory Cardiomyocyte Program to Enable Zebrafish Heart Regeneration
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010044
PMID:41155336
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现组蛋白去甲基化酶Kdm7aa在斑马鱼心脏再生过程中协调免疫调节性心肌细胞程序 | 首次发现Kdm7aa作为再生诱导的表观遗传调控因子,连接组蛋白去甲基化与趋化因子信号通路 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的直接应用仍需验证 | 阐明斑马鱼心脏再生的分子机制,探索促进哺乳动物心脏修复的潜在治疗策略 | 斑马鱼心室心肌细胞,新生小鼠和成年小鼠及人类心脏组织 | 发育生物学,再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑,bulk RNA测序,药理学抑制 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-30 |
Transcriptomic Signatures in IgA Nephropathy: From Renal Tissue to Precision Risk Stratification
2025-Oct-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262010055
PMID:41155346
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综述 | 本文综述了转录组学在IgA肾病分子特征解析和精准风险分层中的应用进展 | 首次整合了bulk RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学和无创转录组特征,将分子特征直接与临床风险分层和精准治疗联系起来 | 存在标准化、队列规模和临床部署方面的挑战 | 探讨转录组学在IgA肾病分子特征解析和患者风险分层中的应用 | IgA肾病患者的肾脏组织、尿液和血液样本 | 数字病理 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、基因表达谱分析 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2025-10-30 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
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研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程,用于探索结肠癌肿瘤微环境中金属-基因相互作用 | 首次将元素成像与空间转录组学整合,实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅基于单个样本的初步概念验证研究,需要更大患者队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属依赖性信号传导及其与基因表达的关联 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像, 空间转录组学, 多模态整合分析 | 空间相关分析 | 元素成像数据, 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织病理学特征 | 1例结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-30 |
Immunometabolic Dysregulation in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing: Perspectives on Subtypes and Potential Therapeutic Targets
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209996
PMID:41155287
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示B细胞急性淋巴细胞白血病中的免疫代谢失调,识别亚型特征和潜在治疗靶点 | 首次在B-ALL中系统描绘免疫代谢失调特征,开发基于代谢特征的机器学习分型模型,识别关键转录因子和靶向药物 | 样本量有限(17例患者和13例对照),需要更大规模验证 | 阐明B-ALL的免疫代谢失调机制并识别潜在治疗靶点 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和健康对照的骨髓样本 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 17例B-ALL患者和13例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
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研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析,发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例),空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本,包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,RNA测序 | CAF算法,空间分析,Cox回归分析 | 多通道图像数据,单细胞数据,RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例,验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |
| 67 | 2025-10-30 |
RNA-Seq and Single-Cell RNA-Seq Analyses of Tilapia Head Kidney in Response to Streptococcus agalactiae and Aeromonas hydrophila
2025-Oct-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15202951
PMID:41153878
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学和单细胞RNA测序技术分析罗非鱼头肾对不同病原菌的免疫应答机制 | 首次在罗非鱼中应用单细胞RNA测序技术揭示非特异性细胞毒性细胞和单核/巨噬细胞对不同病原菌的差异化免疫应答 | 研究仅关注头肾组织,未涉及其他免疫器官;病原菌种类有限 | 探究罗非鱼对不同病原菌的免疫应答机制 | 罗非鱼头肾组织 | 转录组学 | 细菌感染 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-10-30 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2025-Oct-10, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
|
研究论文 | 本研究探索EED226通过靶向关键免疫基因抑制中华半滑舌鳎脾细胞中LPS诱导的免疫反应 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能,发现跨物种保守的EED靶向治疗潜力 | 研究局限于中华半滑舌鳎这一特定鱼种,未验证其他硬骨鱼类的适用性 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫应答中的调控作用 | 中华半滑舌鳎脾细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,转录组分析,定量RT-PCR,系统发育分析 | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-10-30 |
Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
PMID:41142910
|
研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-30 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
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研究论文 | 开发了一种结合统计和机制模型的混合建模方法,通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合,通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题,需要克服这一挑战 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学,仿真推断,多模态Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型,线性稀疏回归模型 | 基因表达数据,电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2025-10-30 |
Cold Exposure Induces Swine Brown Adipocytes to Display an Island-like Distribution with Atypical Characteristics
2025-Oct-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209871
PMID:41155166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现猪体内存在棕色脂肪细胞,并揭示其在冷暴露条件下呈现岛状分布的非典型特征 | 首次在猪体内鉴定出棕色脂肪细胞,发现其岛状分布模式和不同于典型棕色脂肪细胞的分子特征 | UCP2/3蛋白含量未显著增加,需重复实验以提高蛋白表达水平 | 确认猪体内棕色脂肪细胞的存在及其在冷暴露条件下的特征 | 猪脂肪组织、小鼠棕色脂肪组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序, 染色质可及性分析, ceRNA网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 72 | 2025-10-30 |
Identification and Validation of Iron Metabolism-Related Biomarkers in Endometriosis: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Study
2025-Oct-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47100831
PMID:41150779
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学识别并验证子宫内膜异位症中铁代谢相关生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞转录组学技术系统研究子宫内膜异位症中铁代谢相关基因的因果关联和细胞特异性表达 | 研究样本量有限,需要更大规模的研究验证生物标志物的临床适用性 | 识别和验证子宫内膜异位症中铁代谢相关生物标志物 | 子宫内膜异位症患者样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个GSE数据集(GSE86534, GSE105764, GSE213216) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-30 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-Oct-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过CD4+ T细胞特异性PKCλ/ι条件性敲除小鼠模型,揭示了该蛋白在血吸虫感染诱导肝纤维化中的免疫调节机制 | 首次证明PKCλ/ι缺失通过抑制Tfh细胞分化、促进Tfr功能并激活IL-10产生型Breg细胞来减轻肝纤维化 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导肝纤维化中的免疫调节作用 | 日本血吸虫感染的小鼠模型 | 免疫学 | 肝纤维化 | 流式细胞术, RT-qPCR, ELISA, 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 野生型和条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-30 |
Preclinical Diagnosis of Type 1 Diabetes: Reality or Utopia
2025-Oct-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13102444
PMID:41153727
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综述 | 本文评估了1型糖尿病经典与新兴生物标志物的研究现状,重点关注早期诊断的潜力与挑战 | 系统整合了从传统生物标志物到新兴技术(如单细胞转录组、FTIR光谱)在1型糖尿病早期诊断中的应用前景 | 许多新兴生物标志物证据基础不足,仍局限于研究环境,尚未在临床诊断中广泛应用 | 评估1型糖尿病生物标志物研究现状,推动早期诊断方法开发 | 1型糖尿病生物标志物(传统与新兴) | 生物信息学 | 1型糖尿病 | NGS, GWAS, 单细胞转录组, scRNA-seq, FTIR光谱 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 光谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-30 |
Harpagide Confers Protection Against Acute Lung Injury Through Multi-Omics Dissection of Immune-Microenvironmental Crosstalk and Convergent Therapeutic Mechanisms
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101494
PMID:41155609
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了钩果草苷通过调节免疫-微环境相互作用对急性肺损伤的保护作用 | 首次采用单细胞转录组学、血液蛋白质组学和肺组织蛋白质组学的整合多组学策略,发现钩果草苷直接结合HIF-1α并通过多通路调节发挥保护作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;样本量相对有限(n=6) | 探索钩果草苷对急性肺损伤的保护机制及多通路调节作用 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 多组学分析 | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,表面等离子共振,细胞热位移分析,分子动力学模拟 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,分子相互作用数据 | 6只小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-30 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals a Multi-Compartmental Cellular Cascade Underlying Elahere-Induced Ocular Toxicity in Rats
2025-Oct-04, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101492
PMID:41155607
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了Elahere在大鼠中诱导眼部毒性的多区室细胞级联机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统解析ADC药物Elahere诱导眼部毒性的细胞类型特异性分子机制 | 研究仅使用大鼠模型,与人类病理生理存在物种差异 | 阐明Elahere诱导眼部毒性的细胞特异性分子机制 | Sprague-Dawley大鼠角膜细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 47,606个角膜细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统 |
| 77 | 2025-10-30 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Oct-02, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的差异脂肪沉积特征 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术揭示不同脂肪组织的细胞类型特异性基因表达模式 | 仅针对2周龄鸡只进行单细胞测序分析,未覆盖其他发育阶段 | 阐明家禽脂肪沉积的组织特异性机制 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2至22周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-10-30 |
Exploring the Abnormal Characteristics of the Ovaries During the Estrus Period of Kazakh Horses Based on Single-Cell Transcriptome Technology
2025-Oct-02, Biology
DOI:10.3390/biology14101351
PMID:41154754
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研究论文 | 基于单细胞转录组技术探索哈萨克马发情期卵巢异常特征 | 构建了首个哈萨克马卵巢单细胞转录组图谱,揭示了九种卵巢细胞类型及其亚型的基因表达特征 | 研究仅针对哈萨克马特定品种,结果可能不适用于其他马种 | 探究马科动物发情期卵巢功能衰退的分子机制 | 哈萨克马卵巢组织 | 单细胞转录组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 112,861个细胞(来自含卵泡和无卵泡卵巢) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-30 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达,并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-30 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Oct, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群,包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接,需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |