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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-28 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation†
2026-02-18, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
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研究论文 | 利用输卵管异位妊娠患者的单细胞RNA测序数据构建胚胎着床模型,研究早期妊娠过程中母胎界面的滋养层-上皮细胞互作 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为替代工具,结合公共数据库中正常宫内妊娠数据,系统解析了早期着床过程中滋养层细胞与上皮细胞的双向配体-受体通讯网络 | 基于异位妊娠模型推断正常着床机制可能存在局限性,且缺乏体内直接验证;研究依赖公共数据库数据,样本量和异质性可能影响结论的普适性 | 阐明人早期胚胎着床过程中母胎界面的细胞互作分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的着床部位组织样本 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-28 |
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2026-02-18, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf245
PMID:41206649
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综述 | 欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的创新进展综述 | 总结了欧洲在辅助生殖技术、高通量单细胞RNA测序和合成胚胎模型方面的前沿贡献,揭示了胚胎发育中保守和物种特异性分子途径 | 实现可重复性和更稳健的植入模型方面仍存在挑战 | 综述欧洲在生殖生物学和胚胎学领域的研究进展及未来方向 | 人类和动物的胚胎发育、辅助生殖技术及合成胚胎模型 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示芳烃受体激活通过多种途径减轻急性呼吸窘迫综合征的机制 | 首次利用单细胞RNA测序全面揭示芳烃受体激活在急性呼吸窘迫综合征中对多种肺免疫和上皮细胞类型的影响及其分子机制 | 仅在小鼠模型中验证,且使用强效配体TCDD,其临床转化性及潜在毒性需进一步评估 | 探究芳烃受体激活对脂多糖诱导的急性呼吸窘迫综合征小鼠模型的保护作用及细胞机制 | 脂多糖诱导的急性呼吸窘迫综合征小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-28 |
SCALE: unsupervised multiscale domain identification in spatial omics data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1456
PMID:41495880
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研究论文 | 提出一种无监督多尺度空间域识别算法SCALE,用于空间组学数据中功能域的分层检测 | 首次将深度学习图表示学习与熵基搜索算法结合,实现无需预先指定尺度的空间域层次化识别 | 未明确提及局限性,但算法性能可能受数据稀疏性和组织类型差异影响 | 开发能够自动识别空间转录组数据中多尺度功能域的计算方法 | 模拟数据及小鼠脑组织(Xenium和MERFISH平台)与患者肾组织样本 | 计算生物学, 深度学习 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间基因表达数据 | 模拟数据、小鼠脑组织及患者肾组织样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | Xenium, MERFISH | Xenium平台和MERFISH平台用于小鼠脑组织空间转录组数据采集 |
| 65 | 2026-05-28 |
A clinically relevant pan-cancer prognostic signature derived from T-cell activation immune genes: Experimental validation across malignancies with emphasis on breast cancer
2025-12, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.108044
PMID:41274393
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研究论文 | 基于T细胞活化免疫基因建立泛癌预后模型,并在多种恶性肿瘤中实验验证,重点关注乳腺癌 | 创新性建立了一个包含23个T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后特征,并通过单细胞RNA测序发现PTGER4基因主要表达于T细胞,揭示了其在PD-1免疫治疗中的潜在增效作用 | 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏大规模前瞻性临床验证;PTGER4的作用机制仅在动物模型中验证,需进一步在临床样本中确认 | 开发一个基于T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后模型,并探索其在免疫治疗中的潜在应用价值 | 多种恶性肿瘤(泛癌),特别关注乳腺癌 | 机器学习 | 泛癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据 | 泛癌转录组数据来自UCSC Xena数据库,包含多种癌症样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-05-28 |
Decipherment of disulfidptosis-related mutation profile, chemosensitivity, and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-025-02571-8
PMID:40824493
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研究论文 | 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤中二硫化物凋亡相关突变谱、化疗敏感性和预后 | 首次系统分析二硫化物凋亡相关基因在30种肿瘤中的表达模式及其在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的突变谱、预后和化疗敏感性,并构建新的风险评分 | 未提及明确的局限性 | 研究二硫化物凋亡相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的突变、预后及化疗敏感性,构建风险评分以指导预后和治疗 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者及30种肿瘤类型 | 机器学习 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 转录组测序, 体细胞突变测序, 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 转录组数据, 体细胞突变数据, 单细胞RNA测序数据 | 训练和验证队列(具体数量未在摘要中说明) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-05-28 |
Gastric dilation following vertical sleeve gastrectomy reflects adaptive stem cell-driven regeneration without association with weight regain or increased cancer risk
2025-Oct-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123899
PMID:40816501
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型和患者样本,揭示垂直袖状胃切除术后的胃扩张是一种由干细胞驱动的适应性再生反应,与体重反弹或癌症风险增加无关 | 通过单细胞RNA测序首次揭示VSG术后胃扩张的细胞机制,证明其是适应性再生而非病理反应,并发现肿瘤抑制基因上调可能提供抗癌保护 | 未提及 | 探究垂直袖状胃切除术后胃扩张的机制及其与体重反弹和癌症风险的关联 | 饮食诱导的肥胖小鼠模型和接受VSG手术的患者胃体上皮样本 | 机器学习 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及患者胃体上皮样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行胃体上皮细胞测序 |
| 68 | 2026-05-28 |
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-09-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138854
PMID:40499413
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研究论文 | 研究探讨了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 | 首次揭示PM通过m6A甲基化调控STC2表达并激活线粒体自噬加剧哮喘的机制,以及METTL3/YTHDF2在此过程中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制,重点关注m6A甲基化、线粒体自噬及STC2和SQSTM1的调控作用 | 暴露于PM的哮喘小鼠模型以及不同季节的哮喘患者外周血样本 | 机器学习 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及多个季节的哮喘患者外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 69 | 2026-05-28 |
Multiparametric Profiling of Circulating Immune Cells Identifies an Expansion of CD25high Switched Memory B Cells in Osteoarthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43186
PMID:40229860
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研究论文 | 通过多参数分析循环免疫细胞,发现骨关节炎中CD25高表达的记忆B细胞扩增 | 首次在单细胞水平上通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,鉴定出CD25高表达的记忆B细胞作为骨关节炎的潜在细胞生物标志物 | 研究样本量较小,且仅局限于骨关节炎和退行性半月板撕裂患者,结论的普适性需进一步验证 | 探索骨关节炎患者循环免疫细胞的表型特征,寻找可早期诊断的细胞生物标志物 | 健康供体、骨关节炎患者和退行性半月板撕裂患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞免疫表型数据, 单细胞转录组数据 | 21名健康供体,17名骨关节炎患者,10名退行性半月板撕裂患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-28 |
Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis†
2025-08-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf107
PMID:40324205
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研究论文 | 本研究揭示虾青素通过调节线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟 | 首次发现虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的促进作用,并揭示其通过调节线粒体功能和蛋白质稳态的分子机制,结合单细胞转录组测序和微量蛋白质组学技术 | 未提及具体局限性 | 研究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的作用及其分子机制 | 小鼠卵母细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序, 微量蛋白质组学, 激光透明带穿孔 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-05-28 |
Mapping the peripheral immune landscape of Parkinson's disease patients with single-cell sequencing
2025-Aug-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf066
PMID:40417848
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研究论文 | 通过单细胞测序技术绘制帕金森病患者外周免疫图谱,揭示免疫细胞亚型变化和转录组特征 | 首次全面绘制帕金森病患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱,发现AP-1应激反应转录因子复合物在帕金森病中上调,且该信号在非典型帕金森病中缺失 | 样本量较小(10名健康对照和14名帕金森病患者),未进行功能验证,仅描述性分析 | 解析帕金森病患者外周免疫细胞的转录组变化,寻找潜在的生物标志物 | 帕金森病患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 78,876个细胞,来自10名健康对照和14名帕金森病患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-05-28 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
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研究论文 | 通过对感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞进行配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了增强子驱动的基因调控网络,阐明了在肿瘤微环境中调节T细胞适应和分化的转录因子 | 首次通过多组学分析构建增强子驱动的调控子,揭示了KLF2和BATF在终末分化的组织驻留记忆样肿瘤浸润淋巴细胞形成中的拮抗作用 | 主要基于小鼠模型,未在人类肿瘤样本中验证;TGF-β信号和CD103表达对Trm样TIL形成的必要性结论可能受限于体外实验条件 | 阐明肿瘤微环境中组织驻留记忆样CD8 T细胞分化的表观遗传和转录调控机制 | 感染和癌症模型中的CD8 T细胞(特别是肿瘤浸润淋巴细胞) | 机器学习, 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 调控子模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 73 | 2026-05-28 |
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402956
PMID:39909558
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研究论文 | 本研究揭示了Trim71基因敲除小鼠在器官发生初期出现中胚层衍生细胞严重缺陷,导致原始红细胞生成受损、卵黄囊血管发育异常及胚胎致死 | 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制中胚层先锋转录因子Eomes的mRNA表达,阐明其在原肠胚阶段调控基因表达以支持器官发生的机制 | 未深入探究Trim71在特定细胞类型(如内皮祖细胞)中的非细胞自主性作用,且未能完全排除其他潜在靶基因的影响 | 阐明Trim71在胚胎发育从原肠胚到器官发生过渡期中的功能及其分子机制 | Trim71基因敲除小鼠胚胎及其衍生细胞(中胚层细胞、原始红细胞、卵黄囊血管内皮细胞) | 分子生物学与发育生物学 | 发育缺陷相关疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、RNA免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型(全身性及条件性敲除) | 单细胞转录组数据、胚胎表型数据 | E7.5期Trim71全身敲除小鼠胚胎(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-28 |
Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.01.020
PMID:39970911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示富拉尼族与莫西族儿童对恶性疟原虫免疫应答的种族差异 | 首次从单细胞层面系统解析非洲不同种族对疟疾免疫保护的细胞和分子基础,并鉴定出种族特异性的单细胞表达数量性状位点 | 研究中未提及针对机制验证的进一步实验,单细胞数据规模可能未完全覆盖免疫系统的全部异质性 | 探究不同种族人群对恶性疟原虫免疫应答差异的分子和细胞机制 | 布基纳法索农村126名感染和未感染恶性疟原虫的富拉尼族和莫西族儿童的外周血单核细胞 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 126名儿童(感染和未感染的富拉尼族与莫西族)及超过7万个单细胞,涵盖30种亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台对PBMC进行转录组分析 |
| 75 | 2026-05-28 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
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研究论文 | 该研究开发了一种基于机器学习的计算方法(mantis-ml),利用单细胞RNA测序数据与三百种正交特征,预测与神经发育障碍相关的显性和隐性风险基因 | 首次基于单细胞RNA测序数据训练模型,并整合300种正交特征,区分单等位和双等位遗传模式预测神经发育障碍风险基因 | 仅基于计算预测,尚未进行实验验证;模型准确性受限于训练数据的质量和规模 | 加速神经发育障碍风险基因的识别,并强调考虑遗传模式的重要性 | 神经发育障碍,包括自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、机器学习 | 半监督机器学习模型(mantis-ml) | 单细胞RNA测序数据、基因不耐受指标、蛋白质相互作用数据等 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-28 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-02-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
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研究论文 | 发现壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑导致舒张性心力衰竭 | 首次探究壁细胞在射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)中微血管功能障碍的作用,并揭示壁细胞通过TNFα依赖旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞和炎症的新机制 | 未提供明确局限性,但可能包括动物模型的代表性和临床转化潜力未知 | 确定壁细胞功能障碍在HFpEF发展中的作用及其分子机制 | 糖尿病db/db小鼠模型,给予1%盐后诱导舒张功能不全的小鼠心脏组织及壁细胞 | 心血管疾病研究 | 舒张性心力衰竭(HFpEF) | 单细胞RNA测序、NicheNet分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 小鼠模型实验,具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-05-28 |
KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy
2025-02, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.12.010
PMID:39733990
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子KLF2作为心脏肥大的负调控因子,通过直接调节相关基因保护心脏免受病理性肥大的影响 | 首次证明KLF2在心肌细胞中作为心脏肥大的负调控因子,并发现辛伐他汀通过提升KLF2表达缓解心肌细胞肥大 | NA(摘要未明确说明局限性) | 探究转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用及其对心脏肥大的保护机制 | 成年小鼠心脏、新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, CUT&Tag测序 | NA | RNA序列数据 | 雄性C57BL/6J小鼠(横向主动脉缩窄模型及对照组)与体外细胞模型(新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞) | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | NovaSeq 6000平台进行RNA-seq测序 |
| 78 | 2026-05-28 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 通过构建单细胞转录组图谱PanSci,分析了哺乳动物衰老过程中细胞种群动态变化 | 首次构建包含超过2000万个细胞、覆盖多个生命阶段、性别和基因型的综合单细胞转录组图谱,揭示3000多种细胞状态和200多种与衰老相关的细胞群,并识别免疫系统对衰老的调控作用 | 未明确说明局限性 | 阐明哺乳动物衰老过程中与细胞种群动态相关的机制 | 小鼠623个组织的细胞 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞,来自623个小鼠组织,涵盖不同生命阶段、性别和基因型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
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研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中,细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统,研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据,揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统,可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应,以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2026-05-28 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
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综述 | 对商业化单细胞和空间组学技术进行动态综述,涵盖从微流控到成像等多种方法,并讨论其在药物研发中的应用趋势 | 首次以“活综述”形式动态追踪单细胞和空间组学技术的商业化进展,系统整合微流控、组合索引、NGS和成像等多种平台方法,并特别强调新兴技术对药物机制发现的潜在扩展作用 | 文章未对具体平台性能进行量化比较,且作为动态综述可能难以完全覆盖所有最新技术细节 | 系统梳理单细胞和空间组学商业化技术的现状与趋势,为药物研发和学术研究提供资源参考 | 商业化单细胞技术(微流控、板基法、组合索引)和空间组学技术(测序和成像基方法) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、微流控、组合索引、成像技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina, BGI, 布鲁克 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 微流控单细胞平台、基于组合索引的plate-based方法、NGS空间转录组学(如10x Visium)、成像基空间转录组学(如MERFISH) |