单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Exhausted-like effector CD8 T cells mediate immune-stromal interactions at mucosal Chronic Graft-versus-Host Disease onset
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.11.675642
PMID:41000699
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了耗竭样效应CD8 T细胞在口腔黏膜慢性移植物抗宿主病发病机制中的关键作用 | 首次在口腔黏膜cGVHD发病时鉴定出两个具有不同功能的CD8 T细胞亚群，并揭示了它们通过CXCL9-CXCR3相互作用与基质细胞共同参与组织损伤的新机制 | 样本量有限，且Treg功能受损的具体机制尚未完全阐明 | 探究慢性移植物抗宿主病在口腔黏膜发病的免疫机制 | 异基因造血干细胞移植后发生口腔黏膜cGVHD的患者口腔黏膜活检组织 | 免疫学 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序，伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | cGVHD发病时和移植后6个月的口腔黏膜活检样本 |
| 62 | 2025-10-05 |
Astrocytic glutamate regulation is shaped by adversity and glucocorticoid signalling
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600362
PMID:41000899
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研究论文 | 本研究通过单核和空间转录组学分析人类皮质星形胶质细胞，揭示其在精神疾病和逆境暴露中的分子变化 | 首次在人类中系统揭示星形胶质细胞的分子和空间多样性，并证明糖皮质激素信号直接调控谷氨酸信号 | 样本来源和数量有限，动物模型与人类系统的直接转化仍需验证 | 探究逆境暴露和糖皮质激素信号如何影响星形胶质细胞的谷氨酸调控功能 | 人类皮质星形胶质细胞、精神疾病患者、人类多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 神经科学 | 精神疾病 | 单核转录组学、空间转录组学、组织学定量、干细胞模型 | NA | 转录组数据、组织学图像 | 约145,000个人类皮质星形胶质细胞，组织学定量超过20,000个星形胶质细胞 |
| 63 | 2025-10-05 |
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182880
PMID:40763040
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研究论文 | 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 | 首次发现p53通过调控内皮细胞亚群动态平衡在肺毛细血管修复中的关键作用，并识别出与人类BPD相关的过渡性内皮细胞状态 | 研究主要聚焦于内皮细胞特异性机制，对其他细胞类型在BPD中的作用探讨有限 | 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中的功能机制 | 新生儿高氧损伤模型中的肺毛细血管内皮细胞亚群 | 发育生物学与呼吸系统疾病 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型和人类BPD样本 |
| 64 | 2025-10-05 |
Intestinal epithelial Ceacam1 deficiency prevents steroid-refractory acute gut graft-versus-host disease
2025-Sep-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186984
PMID:40923321
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现肠道上皮细胞CEACAM1缺失可有效预防类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病 | 首次揭示肠道上皮细胞CEACAM1在SR-Gut-aGVHD中的关键作用机制，并证明其缺失可调节免疫细胞平衡和肠道菌群 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究肠道上皮细胞CEACAM1在类固醇难治性急性肠道移植物抗宿主病发病机制中的作用 | 小鼠模型和人类样本中的肠道上皮细胞及免疫细胞 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序与ATAC测序联合分析、高维流式细胞术 | NA | 图像数据、单细胞测序数据、流式细胞数据 | 小鼠模型和人类样本（具体数量未明确说明） |
| 65 | 2025-10-05 |
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.010
PMID:40499782
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研究论文 | 本研究通过构建肾单位特异性Flcn基因敲除小鼠模型，揭示了卵泡蛋白缺失通过异常TFEB激活导致亨利氏袢囊性病变的机制 | 首次证明Flcn缺失通过异常TFEB（而非TFE3）激活导致整个肾单位囊性病变，特别是在亨利氏袢区域 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明卵泡蛋白在肾单位发育中的具体作用及其与Birt-Hogg-Dubé综合征肾脏病变的关系 | 肾单位特异性Flcn基因敲除小鼠模型 | 分子病理学 | Birt-Hogg-Dubé综合征 | 单细胞RNA测序、基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织形态学数据 | 多种基因敲除小鼠品系（包括Flcn单敲除、Flcn/Tfe3双敲除、Flcn/Tfeb双敲除） |
| 66 | 2025-10-05 |
Single-Cell Profiling of Pediatric High-Grade Gliomas Reveals OPC-Like Subpopulations Driving Tumorigenic Lineage Transitions
2025-Sep, Pediatric discovery
DOI:10.1002/pdi3.70027
PMID:41036308
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童高级别胶质瘤，揭示少突胶质前体细胞样亚群在肿瘤发生谱系转化中的关键作用 | 首次在儿童高级别胶质瘤中发现具有独特干性特征的OPC样亚群，特别是EGFR表达的OPC样细胞可能是弥漫中线胶质瘤的肿瘤发生起源 | 研究排除了婴儿型半球胶质瘤，且样本来源有限 | 探究儿童高级别胶质瘤的肿瘤微环境特征和肿瘤细胞谱系转化机制 | 儿童高级别胶质瘤肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、下一代测序(NGS)、多重免疫荧光分析 | Monocle2、CytoTRACE2、SCENT | 基因表达数据 | NA |
| 67 | 2025-10-05 |
Delving Into the Dialogue between Epigenetic Modifications and Immunometabolism in Cancer
2025-Sep, Advanced genetics (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/ggn2.202500034
PMID:41036475
|
综述 | 探讨肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰之间的相互作用及其在肿瘤微环境重塑中的机制 | 系统阐述代谢产物作为表观遗传调节因子调控免疫细胞功能的新机制，并引入单细胞测序等新兴技术解决该领域的复杂性挑战 | 肿瘤微环境的细胞复杂性、动态相互作用和时空异质性对当前研究构成重大挑战 | 深入探讨肿瘤免疫代谢与表观遗传修饰的对话机制，推动该领域的机制认知和治疗创新 | 肿瘤微环境中的免疫细胞及其表观遗传调控 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序、空间组学、人工智能 | NA | 组学数据 | NA |
| 68 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals a Distinct Monocyte MIF/ANXA1 Signature Associated With Poor Responsiveness to ICS
2025-Sep, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2025.17.5.658
PMID:41044838
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示哮喘患者对吸入糖皮质激素反应不佳的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平识别出与ICS反应不佳相关的单核细胞MIF/ANXA1特征信号 | 样本量较小（16例），需要更大规模研究验证 | 探究哮喘患者对吸入糖皮质激素治疗反应差异的细胞分子机制 | 哮喘患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例样本（6例健康对照，6例ICS应答者，4例ICS反应不佳者） |
| 69 | 2025-10-05 |
Targeting Ferroptosis Restores the Antiviral Activity of CD8+ T Cells During Chronic Hepatitis B Virus Infection
2025-Aug-11, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101612
PMID:40803501
|
研究论文 | 本研究揭示了铁死亡在慢性乙型肝炎病毒感染的CD8+ T细胞功能障碍中的作用机制 | 首次发现HBV特异性CD8+ T细胞会发生铁死亡，并阐明棕榈酸和TGF-β1通过调控CD36和GPX4协同促进铁死亡的分子机制 | 研究样本仅限于慢性乙型肝炎患者，需要进一步验证在其他慢性病毒感染中的普适性 | 探究HBV特异性CD8+ T细胞是否发生铁死亡及其与T细胞功能障碍的关系 | 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞，特别是HBV特异性CD8+ T细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 流式细胞术、电子显微镜、单细胞RNA测序、MHC I四聚体技术 | NA | 细胞样本、基因表达数据 | 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞样本 |
| 70 | 2025-10-05 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-07, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
|
综述 | 总结Snail1作为癌症相关成纤维细胞关键预后生物标志物在乳腺癌中的作用 | 揭示了Snail1相关基因特征在CAFs中的预后潜力，并强调了表达Snail1的成纤维细胞的纤维化和免疫抑制作用 | NA | 探讨CAF生物标志物在癌症预后中的价值，特别关注Snail1转录因子的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 71 | 2025-10-05 |
Non-disruptive 3D profiling of combinations of epigenetic marks in single cells
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659535
PMID:40666962
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研究论文 | 开发了一种基于图像的非破坏性单细胞空间表观遗传分析技术Epi-PHR，能够在保持基因组3D结构的同时检测多种表观遗传标记的组合 | 首次实现了在单细胞水平同时检测数百个基因位点的多种表观遗传标记组合，同时保留基因组的三维空间结构 | 技术仍处于开发阶段，尚未在大规模样本中得到验证 | 开发能够解析单细胞三维表观基因组空间组织的新技术 | 海马体组织切片中的单细胞 | 空间表观遗传学 | NA | Epi-PHR（表观遗传邻近杂交反应）、染色质追踪 | NA | 图像数据、空间表观遗传数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及海马体组织切片中的单细胞分析 |
| 72 | 2025-10-05 |
RetiGene, a comprehensive gene atlas for inherited retinal diseases (IRDs)
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.653722
PMID:40661613
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研究论文 | 开发了一个用于遗传性视网膜疾病的专家策划基因图谱RetiGene | 整合了变异数据、批量与单细胞RNA测序数据及功能注释的综合性基因图谱 | NA | 解决遗传性视网膜疾病基因目录不完整的问题，支持候选基因优先排序、功能研究和治疗开发 | 遗传性视网膜疾病相关基因 | 生物信息学 | 遗传性视网膜疾病 | RNA测序（批量与单细胞）、功能注释 | NA | 基因组数据、转录组数据、功能注释数据 | NA |
| 73 | 2025-10-05 |
Comparison of Lean, Obese, and Weight-Loss Models Reveals TREM2 Deficiency Attenuates Breast Cancer Growth Uniquely in Lean Mice and Alters Clonal T-cell Populations
2025-Apr-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3511
PMID:39841585
|
研究论文 | 通过比较瘦型、肥胖型和减重型小鼠模型，研究TREM2缺陷在不同体重历史条件下对绝经后乳腺癌生长的影响 | 首次揭示TREM2缺陷仅在瘦型小鼠中抑制乳腺癌生长，并发现体重历史影响TREM2抑制和抗PD-1疗法的疗效 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床环境中验证 | 探讨肥胖与乳腺癌关联的机制及减重的潜在益处 | 绝经后乳腺癌小鼠模型 | 癌症免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，可变区多样性连接测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据，免疫细胞数据 | 瘦型、肥胖型和减重型小鼠模型 |
| 74 | 2025-10-05 |
Artificial variables help to avoid over-clustering in single-cell RNA sequencing
2025-Apr-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.014
PMID:40081375
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研究论文 | 提出一种名为'recall'的方法，通过引入人工变量来防止单细胞RNA测序数据分析中的过度聚类问题 | 开发了能够控制'双重使用'数据影响的新方法，可应用于多种聚类算法，在个人笔记本电脑上也能快速分析大规模单细胞RNA测序数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中过度聚类导致的误导性结果问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 校准聚类算法 | 基因表达数据 | 使用真实和模拟数据进行分析 |
| 75 | 2025-10-05 |
A platform for multimodal in vivo pooled genetic screens reveals regulators of liver function
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.624217
PMID:39605605
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研究论文 | 开发了一种结合成像和测序的多模态平台，用于在组织中构建大规模基因型-表型图谱 | 首次将成像技术与测序方法相结合，能够在单个细胞水平同时识别遗传扰动、测量基因表达和观察亚细胞形态 | NA | 解析遗传控制对多样细胞和组织表型的基础，研究肝脏功能的遗传调控机制 | 小鼠肝脏中的数百种遗传扰动 | 生物医学工程 | 肝脏疾病 | 配对成像和测序方法、单细胞测序、遗传扰动筛选 | NA | 图像、基因表达数据、转录组数据 | 数百种小鼠肝脏遗传扰动样本 |
| 76 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Adventitial Fibroblast Alterations during Mouse Atherosclerosis
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616802
PMID:39868275
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞中的差异表达及其功能影响 | 研究仅使用雄性Ldlr -/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本由三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、GWAS分析、体外基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 雄性Ldlr -/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合组成） |
| 77 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics analysis of single-cell and spatial transcriptomics reveals distinct hpv-associated immune microenvironment features and prognostic signatures in cervical cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612623
PMID:41035636
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学分析，揭示HPV阳性和阴性宫颈癌免疫微环境的差异特征并构建预后标志物 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模RNA测序，系统解析不同HPV状态宫颈癌的免疫微环境空间异质性 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探究HPV阳性和阴性宫颈癌免疫微环境的异质性特征及其临床意义 | 宫颈癌患者组织样本 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光分析、Cox回归、LASSO回归 | 风险评分模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA测序数据 | 收集的宫颈癌样本（具体数量未明确说明）和TCGA数据集 |
| 78 | 2025-10-05 |
Cancer-Associated Fibroblast-Derived GDF15 Induces Oxidative Stress and Neutrophil Infiltration in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma through the PI3K/AKT/STAT3 Axis Cascade
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0901
PMID:41035818
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研究论文 | 本研究揭示了头颈鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞通过GDF15-GFRAL信号轴诱导氧化应激和中性粒细胞浸润的分子机制 | 首次发现GDF15通过PI3K/AKT/STAT3通路级联反应调控氧化应激失衡，并通过TNF-α激活ERK1/2通路促进中性粒细胞浸润 | NA | 阐明头颈鳞状细胞癌中肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 头颈鳞状细胞癌肿瘤细胞、癌症相关成纤维细胞、中性粒细胞 | 肿瘤生物学 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组测序、单细胞RNA测序、分子动力学模拟、流式细胞术、动物实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA |
| 79 | 2025-10-05 |
Decoding Fibroblast Heterogeneity in Osteoarthritis: Identification of a Fibrosis-Associated Subtype and Novel Diagnostic Biomarkers
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/7066432
PMID:41035938
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析骨关节炎中成纤维细胞的异质性，识别出纤维化相关亚型并发现新型诊断生物标志物 | 首次在骨关节炎中系统鉴定成纤维细胞功能亚型，发现Fibroblast subtype 3与纤维化通路密切相关，并筛选出四个具有强诊断性能的新型生物标志物 | 研究基于公共数据库的样本数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 解析骨关节炎中成纤维细胞的异质性特征及其在疾病发展中的作用 | 骨关节炎组织样本中的成纤维细胞亚型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因集富集分析(GSEA)、伪时间轨迹分析 | Seurat、Monocle2 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的骨关节炎单细胞RNA测序数据集和两个独立验证数据集 |
| 80 | 2025-10-05 |
Data-driven discovery of cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.09.627436
PMID:39713353
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法发现方法 | 开发了整合单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录的数据驱动方法，首次发现来曲唑和伊立替康的联合治疗方案 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类患者中进行进一步验证 | 开发针对阿尔茨海默病的细胞类型导向联合疗法 | 神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、药物扰动分析、单核RNA测序 | 数据驱动发现框架 | 转录组数据、临床记录 | AD小鼠模型 |